1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000057.2 (tig00000586_g2248.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000093.49 (tig00000093_g3486.t1)
 - - 0.47 1.55 0.37 0.72 0.48 - - 3.36 0.4 0.56 - -0.12 0.38 - - - - - - - - - - 1.05
Cpa|evm.model.tig00000093.59 (tig00000093_g3495.t1)
 - - - - - - - 3.86 - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000114.68 (tig00000248_g21839.t1)
 - - - - 2.51 - - 3.45 - 2.21 2.25 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000117.13 (tig00000117_g6355.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000131.4 (tig00000131_g7474.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000144.139 (tig00000144_g9134.t1)
 -0.76 -0.5 -0.52 - - 0.27 0.92 1.75 2.69 2.05 0.2 0.94 0.94 - - - 0.47 - -0.82 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000157.68 (tig00000157_g9654.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000178.102 (tig00020892_g14908.t1)
 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000179.6 (tig00000179_g13069.t1)
 -0.11 -0.7 - - - -0.82 3.37 - -0.71 3.05 - - 1.39 - - -0.81 - -1.58 - - -2.28 - -0.91 - - -1.34
Cpa|evm.model.tig00000180.14 (tig00000180_g13647.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000180.8 (tig00020904_g15226.t1)
 0.89 -1.14 -1.28 2.06 -1.38 2.08 1.15 -0.22 - 1.71 0.83 1.4 -0.88 -1.87 - - - - -1.35 - - - 1.18 - -1.96 -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000217.3 (tig00021745_g23349.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000248.27 (tig00000248_g21792.t1)
 -1.88 - -1.73 -2.78 -2.84 -0.3 -1.01 - -1.1 1.94 1.53 1.06 0.87 -1.78 0.64 -1.8 - -0.37 -0.18 1.08 1.43 -2.06 0.06 -0.74 -3.35 1.11
Cpa|evm.model.tig00000262.37 (tig00000262_g23089.t1)
 - - - - - 2.31 2.07 3.18 - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000269.46 (tig00000269_g23707.t1)
 1.37 1.41 -0.1 -0.37 0.64 -0.08 -0.32 1.59 -0.28 1.57 1.64 - 0.86 - - - - - 0.9 - -1.32 - 0.79 - - -
Cpa|evm.model.tig00000269.6 (tig00000269_g23679.t1)
 - - - 2.09 - 2.02 - - - 1.9 1.98 - - - - - - - 2.0 - - 1.76 - - 1.4 -
Cpa|evm.model.tig00000292.13 (tig00000292_g23866.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000310.73 (tig00000310_g23998.t1)
 -0.97 - -1.11 - 0.88 0.13 1.49 2.13 1.07 1.0 0.96 2.16 -0.67 - - - 0.11 -1.85 - - 0.96 - - -1.21 - -
Cpa|evm.model.tig00000342.73 (tig00000342_g24262.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000342.75 (tig00021248_g19628.t1)
 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000342.79 (tig00021047_g18139.t1)
 1.96 - 0.24 - - - 2.03 3.45 - 0.12 - - 2.26 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000388.3 (tig00021047_g18148.t1)
 - - 2.83 - - - - 2.81 2.65 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000443.11 (tig00020616_g12297.t1)
 - - - - 1.49 2.37 1.46 0.82 2.71 0.69 0.73 - - 0.92 - - 0.0 -0.35 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000443.18 (tig00000443_g775.t1)
 - - - - - - 2.69 2.9 - 2.57 2.62 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000443.29 (tig00020734_g13565.t1)
 - - - - - - 2.25 2.85 2.91 - 1.25 1.34 - 0.66 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000507.1 (tig00000507_g1754.t1)
 - - - - - - - 3.8 2.11 - - - - - 1.98 - - 1.92 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000540.4 (tig00021494_g21934.t1)
 - - - - - - - 3.75 0.84 0.81 0.78 1.96 0.75 - - - - - - 0.77 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000552.1 (tig00000552_g2053.t1)
 - - - - - - 2.78 2.79 2.7 - 2.51 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000581.26 (tig00000581_g2231.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000605.47 (tig00000605_g2514.t1)
 - - - - - - - - 3.78 3.62 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000629.8 (tig00000629_g2676.t1)
 0.03 - 0.33 0.41 - 0.24 0.54 - - 3.24 - - 1.55 - - 0.48 - -0.21 1.65 - - - 1.0 - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000760.23 (tig00000540_g1929.t1)
 - 2.58 2.33 2.87 - - - 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000889.26 (tig00000889_g5317.t1)
 - 1.67 0.76 - - - - 2.33 0.66 0.45 2.08 0.63 - - 1.44 - 0.51 - - - 0.09 - - - - 1.11
Cpa|evm.model.tig00001021.12 (tig00021468_g21644.t1)
 - - - - - - - 3.23 - - 2.95 - - - - 3.16 - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001127.5 (tig00020723_g13489.t1)
 -1.23 - - - - -1.21 2.23 2.79 1.14 0.98 2.94 - - - - - - - - -1.6 - - -1.88 - - 0.06
Cpa|evm.model.tig00001302.12 (tig00001302_g8098.t1)
 -0.52 -0.52 -0.43 - 0.53 - - 1.76 -0.53 1.81 2.27 1.02 - -0.25 -0.91 -0.77 - - - 0.12 - - 2.18 - -1.33 -
Cpa|evm.model.tig00001718.9 (tig00001718_g9589.t1)
 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020509.9 (tig00020509_g9749.t1)
 1.28 - 0.81 - 1.77 - - 0.6 1.71 2.52 1.54 - - - - - - - - - 0.64 - 1.79 - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.234 (tig00020553_g10721.t1)
 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.98 (tig00020553_g10586.t1)
 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020564.52 (tig00020564_g11455.t1)
 1.23 1.37 - - - - 1.44 2.36 2.32 1.12 - 1.33 - - - - - - - - - - - - - 1.82
Cpa|evm.model.tig00020564.67 (tig00020564_g11470.t1)
 0.05 1.51 - - - 0.07 1.58 - - 2.53 - 2.74 2.27 - - - - - - - - -0.34 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020567.17 (tig00021047_g18149.t1)
 - - - - - 3.44 - 2.57 1.57 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020567.18 (tig00021036_g17376.t1)
 3.42 - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020571.4 (tig00020571_g11478.t1)
 - - 1.07 1.02 - - - 1.09 1.12 3.97 - - 0.96 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020572.86 (tig00000443_g761.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020616.64 (tig00020616_g12296.t1)
 - - - - - - 2.89 - 2.73 3.58 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020629.164 (tig00020567_g11519.t1)
 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020693.47 (tig00000194_g14734.t1)
 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020723.29 (tig00020723_g13450.t1)
 -1.5 - - -1.55 1.04 1.26 -0.04 1.69 1.42 1.44 1.32 1.48 - -0.63 - - 0.08 - -1.99 -0.37 -1.32 - -1.01 0.56 -1.28 -1.05
Cpa|evm.model.tig00020725.27 (tig00020725_g13554.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020734.12 (tig00020941_g16215.t1)
 - - - - - - 1.29 3.36 - 2.78 1.3 - 1.18 - - - - 0.75 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020746.16 (tig00000246_g21518.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020816.136 (tig00021742_g23345.t1)
 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.13 (tig00020824_g14240.t1)
 - - - - - - - 3.78 - 3.21 - - 1.6 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.14 (tig00020824_g14241.t1)
 - - - - - 1.43 1.94 3.02 1.96 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.25 (tig00020824_g14254.t1)
 - - - - - - 1.47 3.14 - 2.93 - - 1.36 - - - - - - - - - - 2.07 - -
Cpa|evm.model.tig00020824.34 (tig00020936_g16185.t2)
 1.39 - - - - 1.27 2.78 1.47 - 2.46 2.54 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.4 (tig00020824_g14229.t1)
 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020830.103 (tig00020830_g14486.t1)
 0.46 1.18 -0.01 -0.18 0.11 -0.54 0.66 -0.62 -0.67 1.98 -1.12 2.4 1.57 -6.95 - -4.5 0.62 -3.03 -2.08 -2.48 - -4.46 - -8.05 -1.71 -0.5
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020855.15 (tig00021036_g17357.t1)
 - - - - - 2.64 - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020930.38 (tig00020930_g16045.t1)
 - 0.35 1.1 1.12 2.22 0.11 0.31 2.87 0.15 - 1.11 - - - - - - 0.43 - - - - 0.59 - - -
Cpa|evm.model.tig00020938.32 (tig00020938_g16160.t1)
 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020938.34 (tig00020941_g16198.t1)
 - - - - - - - 4.09 - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020939.3 (tig00021248_g19639.t1)
 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020939.9 (tig00020939_g16060.t1)
 1.86 - - - - - - 4.26 - - - - - - - - - - 1.66 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020941.11 (tig00020941_g16203.t1)
 - - - - 1.06 2.49 1.36 3.05 1.48 1.24 - - - - - - - 1.2 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020941.14 (tig00020941_g16207.t1)
 0.4 0.21 -0.59 -1.64 -0.0 0.17 2.35 0.47 1.07 1.89 0.38 0.83 1.35 - - -0.65 - - - 0.71 - - - - -2.21 -
Cpa|evm.model.tig00020941.6 (tig00020941_g16199.t1)
 - - - - - - 0.74 3.71 - 0.61 3.0 0.82 - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020951.1 (tig00020951_g16396.t1)
 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020951.2 (tig00020951_g16397.t1)
 - - - - - 2.59 2.08 2.79 2.72 0.17 0.22 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021013.5 (tig00021047_g18154.t1)
 - - - - - - - - - 4.23 - 2.85 - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.29 (tig00021038_g17520.t1)
 1.17 1.05 - - - - - - - 2.94 3.02 - 1.91 - - - - - - - - 1.08 - - - -
Cpa|evm.model.tig00021070.55 (tig00021070_g17858.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021071.5 (tig00021072_g17981.t1)
 - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - 3.38 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021073.75 (tig00021073_g18086.t1)
 - - - - - 3.72 - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021108.72 (tig00021108_g18366.t1)
 3.69 - - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021111.15 (tig00021111_g18396.t1)
 - - 2.51 - - - - - - 2.4 - 2.62 2.41 - - - - - - - - - - - 1.84 -
Cpa|evm.model.tig00021137.38 (tig00021745_g23358.t1)
 - - - - - 3.87 - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021137.42 (tig00021745_g23355.t1)
 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021248.26 (tig00020939_g16052.t1)
 - - - - - - - 4.13 2.38 - - - - - - - - - - - - - - - 1.72 -
Cpa|evm.model.tig00021275.1 (tig00021275_g19865.t3)
 -2.01 -2.46 -1.59 -1.04 0.85 0.64 -1.7 0.6 -0.04 1.84 1.55 1.56 0.69 0.23 0.04 -1.06 -2.48 -0.82 -1.72 -2.79 -0.47 - 0.09 -2.81 -1.74 0.51
Cpa|evm.model.tig00021282.6 (tig00021282_g19947.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021339.9 (tig00021339_g20385.t1)
 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021366.2 (tig00021366_g20836.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021532.5 (tig00021532_g22185.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021586.20 (tig00000217_g19140.t1)
 1.68 1.94 1.69 - - 1.7 - 1.71 - 2.57 1.7 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021745.15 (tig00021745_g23359.t1)
 - - - - - - - 3.26 - 2.93 - 3.14 - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021745.2 (tig00000367_g24441.t1)
 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021745.31 (tig00021251_g19653.t1)
 - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - 2.96 - -
Cpa|evm.model.tig00021761.1 (tig00021761_g23438.t1)
 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021762.2 (tig00021586_g22680.t1)
 2.08 - - - - - 2.1 2.12 2.22 1.98 - 2.18 - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00022104.14 (tig00022104_g23830.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.