Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.53 (tig00000042_g15444.t1)	0.94	1.0	0.89	0.67	0.45	0.42	0.42	0.58	0.55	0.6	0.49	0.63	0.87	0.38	0.57	0.45	0.51	0.52	0.69	0.56	0.03	0.26	0.21	0.3	0.36	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000053.16 (tig00000053_g23499.t1)	1.0	0.89	0.46	0.25	0.06	0.02	0.08	0.19	0.17	0.3	0.41	0.54	0.77	0.29	0.15	0.27	0.32	0.19	0.21	0.15	0.01	0.13	0.08	0.17	0.36	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000053.17 (tig00000053_g23499.t1)	1.0	0.98	0.51	0.23	0.04	0.02	0.06	0.16	0.16	0.3	0.49	0.55	0.72	0.3	0.13	0.27	0.29	0.18	0.19	0.2	0.02	0.16	0.04	0.34	0.37	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000053.18	0.88	0.86	0.3	0.23	0.01	0.03	0.08	0.14	0.16	0.14	0.41	0.35	1.0	0.24	0.1	0.24	0.35	0.17	0.24	0.14	0.03	0.3	0.13	0.15	0.86	0.77
Cpa\|evm.model.tig00000144.22 (tig00000144_g9011.t1)	1.0	0.69	0.5	0.35	0.28	0.29	0.4	0.42	0.37	0.4	0.4	0.46	0.92	0.24	0.33	0.24	0.34	0.41	0.38	0.4	0.09	0.29	0.39	0.29	0.36	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000241.30 (tig00000241_g20888.t1)	0.91	0.9	0.88	0.64	0.56	0.45	0.38	0.39	0.45	0.61	0.63	0.85	1.0	0.37	0.44	0.52	0.63	0.35	0.47	0.68	0.18	0.25	0.43	0.67	0.23	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000402.17 (tig00000402_g194.t1)	1.0	0.7	0.47	0.33	0.16	0.19	0.32	0.49	0.46	0.46	0.51	0.51	0.88	0.17	0.21	0.19	0.21	0.31	0.28	0.28	0.1	0.28	0.46	0.3	0.42	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000403.11 (tig00000403_g265.t1)	1.0	0.92	0.65	0.45	0.28	0.26	0.47	0.68	0.64	0.69	0.74	0.77	0.91	0.28	0.23	0.33	0.35	0.71	0.49	0.46	0.15	0.42	0.27	0.64	0.48	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000430.41 (tig00000430_g628.t1)	1.0	0.67	0.56	0.44	0.27	0.31	0.37	0.51	0.35	0.34	0.36	0.35	0.86	0.24	0.26	0.23	0.24	0.34	0.33	0.37	0.0	0.05	0.12	0.16	0.4	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000459.55 (tig00000459_g1119.t1)	1.0	0.61	0.45	0.42	0.34	0.25	0.3	0.38	0.18	0.2	0.2	0.34	0.91	0.09	0.16	0.12	0.15	0.26	0.27	0.2	0.01	0.1	0.04	0.07	0.25	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000471.15 (tig00000471_g1190.t1)	1.0	0.53	0.24	0.15	0.1	0.16	0.37	0.56	0.47	0.56	0.6	0.62	0.88	0.08	0.1	0.03	0.26	0.43	0.33	0.33	0.01	0.06	0.15	0.25	0.31	0.2
Cpa\|evm.model.tig00000498.40 (tig00000498_g1616.t1)	1.0	0.76	0.56	0.35	0.28	0.29	0.34	0.42	0.39	0.43	0.52	0.58	0.99	0.23	0.22	0.23	0.26	0.31	0.31	0.3	0.01	0.22	0.13	0.28	0.45	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000523.52 (tig00000523_g1875.t1)	0.91	0.49	0.32	0.3	0.22	0.2	0.27	0.33	0.25	0.29	0.38	0.34	1.0	0.14	0.15	0.08	0.15	0.17	0.16	0.15	0.02	0.2	0.11	0.2	0.37	0.24
Cpa\|evm.model.tig00000545.43 (tig00000545_g2018.t1)	0.98	0.71	0.69	0.67	0.49	0.36	0.32	0.42	0.47	0.57	0.81	0.85	1.0	0.03	0.11	0.09	0.25	0.35	0.33	0.39	0.02	0.29	0.21	0.18	0.48	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000555.20 (tig00000523_g1875.t1)	0.92	0.59	0.3	0.28	0.25	0.27	0.36	0.33	0.25	0.27	0.32	0.33	1.0	0.18	0.23	0.11	0.23	0.22	0.19	0.17	0.01	0.21	0.07	0.1	0.32	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000605.31 (tig00000605_g2497.t1)	1.0	0.84	0.74	0.63	0.35	0.26	0.37	0.61	0.26	0.31	0.32	0.32	0.79	0.25	0.19	0.37	0.24	0.29	0.26	0.37	0.01	0.11	0.07	0.12	0.33	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000640.4 (tig00000640_g2758.t1)	0.99	0.6	0.44	0.27	0.14	0.12	0.23	0.32	0.35	0.42	0.46	0.52	1.0	0.38	0.5	0.35	0.28	0.46	0.34	0.37	0.15	0.08	0.42	0.27	0.45	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000655.22 (tig00000655_g2847.t1)	0.86	1.0	0.71	0.36	0.19	0.2	0.34	0.46	0.56	0.67	0.66	0.74	0.76	0.5	0.48	0.46	0.45	0.5	0.47	0.47	0.09	0.19	0.25	0.49	0.48	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000658.25 (tig00000658_g2915.t1)	1.0	0.75	0.68	0.58	0.45	0.37	0.4	0.45	0.34	0.31	0.35	0.44	0.95	0.21	0.17	0.25	0.22	0.31	0.26	0.31	0.08	0.2	0.17	0.15	0.27	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000711.67 (tig00000711_g3429.t1)	1.0	0.57	0.3	0.2	0.18	0.25	0.4	0.55	0.41	0.45	0.5	0.58	0.84	0.08	0.09	0.08	0.28	0.38	0.26	0.28	0.05	0.03	0.45	0.26	0.46	0.22
Cpa\|evm.model.tig00000789.12 (tig00000789_g4105.t1)	1.0	0.6	0.37	0.25	0.16	0.16	0.38	0.53	0.46	0.53	0.6	0.57	0.75	0.14	0.21	0.13	0.34	0.46	0.33	0.37	0.01	0.17	0.23	0.29	0.51	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000792.56 (tig00000792_g4206.t1)	1.0	0.76	0.57	0.35	0.32	0.42	0.46	0.56	0.44	0.42	0.46	0.59	0.92	0.25	0.22	0.27	0.33	0.41	0.33	0.39	0.03	0.05	0.33	0.22	0.46	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000870.34 (tig00000870_g5150.t1)	1.0	0.88	0.74	0.44	0.11	0.05	0.15	0.37	0.29	0.2	0.23	0.25	0.94	0.11	0.16	0.12	0.18	0.29	0.25	0.34	0.01	0.08	0.06	0.05	0.4	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000870.9 (tig00000870_g5127.t1)	1.0	0.88	0.74	0.67	0.45	0.38	0.53	0.62	0.43	0.39	0.4	0.42	0.8	0.29	0.29	0.34	0.34	0.48	0.47	0.44	0.02	0.06	0.25	0.24	0.4	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000944.16 (tig00000944_g5937.t1)	0.96	0.92	0.72	0.49	0.23	0.11	0.16	0.25	0.18	0.25	0.31	0.38	1.0	0.12	0.07	0.1	0.16	0.26	0.18	0.4	0.0	0.08	0.02	0.07	0.26	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000955.26 (tig00000955_g5802.t1)	0.95	1.0	0.64	0.52	0.12	0.04	0.12	0.27	0.23	0.35	0.56	0.65	0.83	0.22	0.05	0.07	0.04	0.37	0.16	0.23	0.01	0.07	0.12	0.15	0.52	0.37
Cpa\|evm.model.tig00001155.6 (tig00001155_g7314.t1)	0.78	1.0	0.59	0.34	0.12	0.06	0.13	0.27	0.18	0.24	0.35	0.45	0.82	0.11	0.12	0.16	0.21	0.27	0.24	0.28	0.02	0.06	0.17	0.22	0.2	0.26
Cpa\|evm.model.tig00001299.9 (tig00001299_g8068.t1)	1.0	0.56	0.49	0.49	0.2	0.09	0.17	0.36	0.24	0.3	0.4	0.4	0.92	0.04	0.09	0.05	0.12	0.27	0.17	0.21	0.0	0.14	0.03	0.13	0.32	0.19
Cpa\|evm.model.tig00001368.10 (tig00001368_g8409.t1)	0.86	0.59	0.52	0.24	0.06	0.04	0.18	0.39	0.2	0.3	0.37	0.5	1.0	0.11	0.29	0.2	0.24	0.4	0.36	0.35	0.01	0.05	0.07	0.13	0.44	0.23
Cpa\|evm.model.tig00001368.12 (tig00001368_g8411.t1)	0.84	0.44	0.31	0.11	0.02	0.02	0.07	0.19	0.06	0.1	0.17	0.22	1.0	0.08	0.13	0.09	0.1	0.32	0.35	0.17	0.03	0.07	0.04	0.07	0.28	0.15
Cpa\|evm.model.tig00001368.13 (tig00001368_g8412.t1)	1.0	0.74	0.58	0.47	0.24	0.21	0.38	0.54	0.52	0.59	0.55	0.64	0.92	0.33	0.44	0.42	0.4	0.54	0.5	0.44	0.02	0.18	0.17	0.39	0.58	0.37
Cpa\|evm.model.tig00001388.6 (tig00001388_g8576.t1)	0.64	1.0	0.66	0.34	0.21	0.21	0.35	0.45	0.52	0.47	0.48	0.48	0.55	0.2	0.47	0.14	0.3	0.27	0.25	0.37	0.01	0.17	0.14	0.2	0.26	0.19
Cpa\|evm.model.tig00001408.9 (tig00001408_g8604.t1)	1.0	0.53	0.29	0.24	0.22	0.35	0.53	0.63	0.37	0.39	0.35	0.35	0.88	0.21	0.24	0.18	0.38	0.4	0.42	0.36	0.02	0.08	0.16	0.25	0.3	0.27
Cpa\|evm.model.tig00001576.4 (tig00001576_g9366.t1)	0.99	0.75	0.55	0.44	0.25	0.13	0.3	0.46	0.41	0.45	0.59	0.64	1.0	0.22	0.21	0.19	0.28	0.35	0.26	0.25	0.22	0.44	0.36	0.4	0.38	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020537.19 (tig00020537_g10241.t1)	1.0	0.76	0.37	0.2	0.22	0.29	0.48	0.55	0.47	0.58	0.63	0.69	0.73	0.28	0.1	0.15	0.29	0.33	0.28	0.41	0.01	0.13	0.16	0.31	0.3	0.21
Cpa\|evm.model.tig00020560.24 (tig00020560_g11089.t1)	0.99	0.56	0.52	0.51	0.48	0.46	0.44	0.48	0.51	0.58	0.59	0.59	1.0	0.16	0.33	0.18	0.39	0.45	0.39	0.52	0.04	0.37	0.11	0.2	0.35	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020611.12 (tig00000073_g1745.t1)	1.0	0.34	0.27	0.21	0.15	0.11	0.21	0.34	0.17	0.27	0.34	0.35	1.0	0.11	0.15	0.06	0.26	0.38	0.25	0.2	0.02	0.02	0.27	0.05	0.51	0.16
Cpa\|evm.model.tig00020614.28 (tig00020614_g12138.t1)	1.0	0.45	0.08	0.04	0.05	0.16	0.38	0.4	0.33	0.21	0.22	0.21	0.7	0.09	0.15	0.05	0.17	0.31	0.27	0.17	0.04	0.06	0.07	0.13	0.29	0.09
Cpa\|evm.model.tig00020614.77 (tig00020614_g12191.t1)	0.9	0.89	0.82	0.58	0.43	0.36	0.41	0.5	0.47	0.48	0.49	0.61	1.0	0.39	0.37	0.5	0.41	0.5	0.45	0.42	0.07	0.22	0.36	0.32	0.49	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020660.28 (tig00020660_g12525.t1)	0.94	0.73	0.55	0.41	0.33	0.33	0.44	0.52	0.44	0.52	0.62	0.72	1.0	0.13	0.16	0.16	0.38	0.34	0.26	0.39	0.06	0.1	0.32	0.42	0.56	0.28
Cpa\|evm.model.tig00020684.39 (tig00020684_g12887.t1)	1.0	0.73	0.53	0.32	0.18	0.18	0.29	0.38	0.35	0.42	0.47	0.52	0.83	0.32	0.44	0.32	0.29	0.57	0.5	0.37	0.11	0.07	0.3	0.35	0.45	0.35
Cpa\|evm.model.tig00020816.66 (tig00020816_g14154.t1)	1.0	0.55	0.33	0.26	0.3	0.38	0.42	0.44	0.5	0.49	0.47	0.43	0.8	0.16	0.26	0.14	0.3	0.34	0.3	0.28	0.02	0.4	0.29	0.19	0.41	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020825.7 (tig00020825_g14288.t1)	1.0	0.51	0.34	0.37	0.3	0.28	0.19	0.29	0.13	0.1	0.1	0.1	0.91	0.09	0.04	0.03	0.03	0.12	0.13	0.1	0.02	0.02	0.07	0.04	0.23	0.26
Cpa\|evm.model.tig00020904.57 (tig00020904_g15189.t1)	1.0	0.69	0.43	0.26	0.19	0.22	0.51	0.65	0.49	0.5	0.5	0.53	0.9	0.24	0.25	0.2	0.36	0.46	0.37	0.33	0.01	0.1	0.19	0.13	0.32	0.23
Cpa\|evm.model.tig00021038.90 (tig00021038_g17579.t1)	1.0	0.38	0.29	0.29	0.36	0.35	0.53	0.61	0.49	0.48	0.49	0.43	0.98	0.39	0.34	0.33	0.37	0.52	0.49	0.41	0.01	0.1	0.25	0.22	0.27	0.29
Cpa\|evm.model.tig00021127.122 (tig00021127_g18802.t1)	0.93	0.66	0.58	0.51	0.43	0.45	0.46	0.53	0.34	0.33	0.36	0.37	1.0	0.25	0.31	0.28	0.39	0.33	0.35	0.4	0.13	0.42	0.28	0.2	0.57	0.37
Cpa\|evm.model.tig00021127.194 (tig00021127_g18880.t1)	1.0	0.63	0.71	0.56	0.35	0.25	0.34	0.52	0.35	0.38	0.43	0.54	0.89	0.35	0.26	0.43	0.33	0.34	0.29	0.42	0.01	0.12	0.07	0.22	0.29	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021318.25 (tig00021318_g20145.t1)	1.0	0.84	0.58	0.38	0.17	0.12	0.22	0.35	0.22	0.26	0.3	0.34	1.0	0.11	0.19	0.15	0.26	0.29	0.25	0.27	0.0	0.01	0.1	0.22	0.6	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021374.15 (tig00021374_g21097.t1)	0.82	0.55	0.44	0.38	0.27	0.2	0.25	0.37	0.36	0.44	0.54	0.64	1.0	0.17	0.25	0.19	0.27	0.24	0.32	0.17	0.02	0.18	0.24	0.33	0.58	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021463.12 (tig00021463_g21620.t1)	0.96	0.78	0.66	0.41	0.34	0.28	0.42	0.45	0.36	0.39	0.45	0.52	1.0	0.23	0.35	0.28	0.32	0.43	0.52	0.47	0.01	0.16	0.14	0.23	0.33	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021517.10 (tig00021517_g21995.t1)	1.0	0.51	0.26	0.16	0.15	0.23	0.46	0.51	0.41	0.46	0.44	0.42	0.84	0.2	0.25	0.2	0.35	0.49	0.39	0.38	0.01	0.14	0.19	0.23	0.27	0.17
Cpa\|evm.model.tig00021532.17 (tig00021532_g22197.t1)	1.0	0.56	0.35	0.31	0.24	0.27	0.46	0.61	0.35	0.22	0.32	0.33	0.75	0.09	0.11	0.05	0.13	0.28	0.2	0.19	0.11	0.1	0.3	0.32	0.28	0.22
Cpa\|evm.model.tig00022080.15 (tig00022080_g23799.t1)	0.83	1.0	0.72	0.48	0.28	0.23	0.26	0.37	0.48	0.46	0.56	0.69	0.82	0.37	0.4	0.48	0.38	0.38	0.48	0.38	0.09	0.23	0.24	0.45	0.16	0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)