Heatmap: Cluster_119 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000025.52 (tig00000025_g7955.t1)	0.39	0.41	0.45	0.69	0.9	0.93	0.92	0.87	0.7	0.58	0.59	0.53	0.34	0.59	0.71	0.92	0.57	0.8	0.77	0.45	0.42	0.75	1.0	0.53	0.81	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000042.233 (tig00000042_g15631.t1)	0.6	0.62	0.62	0.64	0.73	1.0	0.99	0.77	0.66	0.51	0.41	0.36	0.38	0.52	0.71	0.83	0.64	0.55	0.82	0.5	0.09	0.36	0.87	0.48	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000157.20 (tig00000157_g9607.t1)	0.35	0.78	0.7	0.67	0.78	0.78	0.79	0.69	0.66	0.58	0.45	0.35	0.3	0.57	0.81	0.83	0.68	1.0	0.9	0.71	0.33	0.81	0.83	0.56	0.48	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000227.48 (tig00000227_g19839.t1)	0.34	0.32	0.42	0.56	0.48	0.91	0.61	0.46	0.4	0.42	0.45	0.63	0.31	0.66	0.57	0.55	0.54	0.85	0.7	0.67	0.25	0.56	1.0	0.46	0.78	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000237.12 (tig00000237_g20461.t1)	0.05	0.15	0.19	0.28	0.52	0.67	0.41	0.4	0.39	0.46	0.31	0.4	0.05	0.29	0.28	0.41	0.36	0.44	0.44	0.38	0.3	0.52	1.0	0.7	0.39	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000241.39 (tig00000241_g20897.t1)	0.17	0.38	0.57	0.54	0.67	0.77	0.6	0.61	0.55	0.58	0.46	0.43	0.1	0.48	0.56	0.74	0.63	0.64	0.74	1.0	0.55	0.2	0.93	0.78	0.54	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000246.9 (tig00000246_g21500.t2)	0.33	0.27	0.26	0.33	0.31	0.27	0.23	0.29	0.29	0.41	0.4	0.37	0.23	0.16	0.3	0.19	0.23	0.49	0.34	0.36	0.73	0.74	1.0	0.47	0.61	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000319.29 (tig00000319_g24142.t1)	0.76	0.83	0.69	0.71	0.85	1.0	0.88	0.84	0.8	0.57	0.57	0.54	0.52	0.53	0.49	0.53	0.57	0.79	0.7	0.49	0.27	0.95	0.9	0.57	0.76	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000385.7 (tig00000385_g24735.t1)	0.38	0.36	0.45	0.44	0.58	0.53	0.77	0.61	0.65	0.55	0.49	0.41	0.35	0.59	0.7	0.67	0.54	0.74	0.82	0.64	0.32	0.51	1.0	0.5	0.47	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000388.64 (tig00000388_g24826.t1)	0.29	0.47	0.54	0.54	0.57	0.77	0.73	0.62	0.74	0.7	0.65	0.77	0.33	0.69	0.65	0.7	0.66	0.72	0.7	0.58	0.91	0.79	0.92	0.89	1.0	0.95
Cpa\|evm.model.tig00000402.73 (tig00000402_g250.t1)	0.51	0.49	0.5	0.58	0.69	0.88	0.86	0.71	0.69	0.6	0.5	0.41	0.45	0.48	0.62	0.54	0.55	0.71	0.76	0.63	0.37	0.65	1.0	0.72	0.52	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000405.66 (tig00000405_g497.t1)	0.04	0.12	0.34	0.46	0.77	0.84	1.0	0.72	0.92	0.69	0.57	0.48	0.07	0.56	0.46	0.62	0.58	0.89	0.8	0.58	0.18	0.64	0.83	0.52	0.56	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000448.83 (tig00000448_g918.t1)	0.39	0.31	0.3	0.44	0.49	0.55	0.57	0.54	0.53	0.44	0.4	0.38	0.3	0.25	0.29	0.32	0.34	0.5	0.4	0.4	0.66	0.58	1.0	0.7	0.66	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000478.16 (tig00000478_g1265.t1)	0.1	0.27	0.3	0.42	0.69	1.0	0.78	0.58	0.49	0.26	0.22	0.2	0.13	0.54	0.46	0.52	0.57	0.72	0.72	0.52	0.07	0.84	0.62	0.36	0.8	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000545.15 (tig00000545_g1988.t1)	0.11	0.46	0.78	0.79	0.9	0.97	0.79	0.82	0.82	0.79	0.67	0.63	0.09	0.84	0.68	0.81	0.68	1.0	0.97	0.76	0.65	0.71	0.88	0.83	0.74	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000545.9 (tig00000545_g1982.t1)	0.2	0.38	0.35	0.46	0.73	0.99	0.79	0.67	0.67	0.61	0.46	0.36	0.19	0.34	0.48	0.45	0.51	0.68	0.51	0.64	0.1	0.77	0.7	0.64	1.0	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000605.2 (tig00000605_g2468.t1)	0.18	0.33	0.51	0.54	0.59	0.71	0.78	0.68	0.52	0.52	0.49	0.37	0.21	0.6	0.55	0.62	0.45	0.76	0.77	0.55	0.18	0.78	1.0	0.43	0.74	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000615.79 (tig00000615_g2609.t1)	0.33	0.5	0.51	0.48	0.53	0.55	0.59	0.54	0.49	0.42	0.34	0.32	0.29	0.45	0.6	0.61	0.55	0.88	0.67	0.59	0.38	0.51	1.0	0.48	0.5	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000615.86 (tig00000615_g2614.t1)	0.08	0.04	0.2	0.47	0.74	0.93	0.77	0.53	0.54	0.56	0.49	0.46	0.13	0.44	0.44	0.56	0.59	0.33	0.33	0.4	0.51	0.42	1.0	0.68	0.41	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000691.14 (tig00000691_g3164.t1)	0.13	0.38	0.34	0.44	0.65	0.65	0.56	0.5	0.43	0.33	0.23	0.17	0.06	0.32	0.59	0.39	0.33	0.66	0.6	0.42	0.38	0.67	1.0	0.54	0.56	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000691.15 (tig00000691_g3164.t1)	0.09	0.43	0.39	0.58	0.65	0.68	0.67	0.53	0.46	0.37	0.27	0.22	0.05	0.41	0.77	0.6	0.57	1.0	0.83	0.53	0.38	0.69	0.82	0.47	0.49	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000718.48 (tig00000718_g3722.t1)	0.23	0.35	0.46	0.62	0.77	0.95	0.82	0.63	0.77	0.62	0.42	0.41	0.15	0.56	0.33	0.51	0.46	0.93	0.74	0.54	0.59	0.41	1.0	0.99	0.72	0.96
Cpa\|evm.model.tig00000792.61 (tig00000792_g4212.t1)	0.31	0.29	0.35	0.35	0.49	0.59	0.54	0.46	0.46	0.42	0.35	0.38	0.31	0.35	0.33	0.49	0.44	0.57	0.45	0.51	0.52	0.71	1.0	0.94	0.47	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000802.23 (tig00000802_g4274.t1)	0.14	0.21	0.22	0.25	0.28	0.3	0.25	0.19	0.22	0.25	0.28	0.3	0.14	0.21	0.25	0.28	0.27	0.32	0.31	0.24	0.46	0.34	0.55	1.0	0.35	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000842.25 (tig00000842_g4844.t1)	0.37	0.51	0.52	0.49	0.58	0.58	0.61	0.56	0.49	0.45	0.37	0.32	0.33	0.52	0.63	0.83	0.55	1.0	0.68	0.57	0.41	0.8	0.94	0.51	0.45	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000842.60 (tig00000842_g4881.t1)	0.34	0.51	0.57	0.71	0.82	1.0	0.67	0.48	0.61	0.58	0.53	0.52	0.31	0.49	0.58	0.64	0.6	0.78	0.78	0.71	0.25	0.76	0.87	0.72	0.67	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000849.35 (tig00000849_g4776.t1)	0.19	0.35	0.25	0.43	0.66	0.88	0.72	0.64	0.38	0.3	0.3	0.19	0.15	0.36	0.42	0.51	0.3	0.37	0.42	0.39	0.27	0.7	1.0	0.37	0.45	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000865.31 (tig00000865_g5081.t1)	0.41	0.34	0.39	0.47	0.68	0.97	0.87	0.71	0.66	0.51	0.36	0.32	0.4	0.47	0.51	0.51	0.47	0.61	0.61	0.55	0.43	0.28	1.0	0.64	0.37	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000865.35 (tig00000865_g5085.t1)	0.2	0.15	0.33	0.37	0.44	0.51	0.41	0.36	0.33	0.43	0.39	0.43	0.23	0.24	0.27	0.35	0.36	0.33	0.36	0.51	0.42	0.6	1.0	0.68	0.55	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000912.30 (tig00000912_g5435.t1)	0.25	0.43	0.47	0.5	0.69	0.79	0.74	0.68	0.64	0.62	0.6	0.57	0.28	0.49	0.49	0.51	0.64	0.71	0.82	0.75	0.58	0.76	1.0	0.79	0.59	0.67
Cpa\|evm.model.tig00000989.4 (tig00000989_g6080.t1)	0.28	0.62	0.49	0.37	0.37	0.33	0.41	0.38	0.29	0.25	0.17	0.14	0.21	0.41	0.49	0.64	0.52	1.0	0.75	0.56	0.22	0.27	1.0	0.22	0.27	0.21
Cpa\|evm.model.tig00001001.13 (tig00001001_g6203.t1)	0.27	0.31	0.41	0.47	0.51	0.59	0.89	0.63	0.66	0.36	0.37	0.24	0.15	0.56	0.31	0.54	0.54	0.78	0.7	0.44	0.35	0.99	1.0	0.29	0.6	0.33
Cpa\|evm.model.tig00001003.15 (tig00001003_g6272.t1)	0.22	0.3	0.23	0.52	0.7	0.52	0.7	0.63	0.25	0.36	0.32	0.2	0.15	0.27	0.43	0.28	0.47	0.63	0.55	0.57	0.28	0.35	0.67	0.76	1.0	0.59
Cpa\|evm.model.tig00001024.7 (tig00001024_g6317.t1)	0.1	0.17	0.22	0.26	0.6	1.0	0.83	0.63	0.43	0.24	0.24	0.17	0.09	0.24	0.29	0.65	0.43	0.4	0.46	0.4	0.42	0.47	0.77	0.61	0.59	0.39
Cpa\|evm.model.tig00001029.34 (tig00001029_g6434.t1)	0.25	0.34	0.47	0.57	0.79	1.0	0.78	0.63	0.64	0.61	0.41	0.44	0.21	0.56	0.5	0.48	0.37	0.71	0.58	0.37	0.11	0.51	0.56	0.56	0.49	0.58
Cpa\|evm.model.tig00001049.3 (tig00001049_g6654.t1)	0.33	0.15	0.08	0.11	0.21	0.39	0.59	0.57	0.53	0.59	0.51	0.41	0.33	0.32	0.25	0.23	0.38	0.7	0.47	0.42	0.64	0.42	0.56	1.0	0.58	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001093.15 (tig00001093_g6892.t1)	0.43	0.52	0.51	0.61	0.8	1.0	0.89	0.86	0.92	0.72	0.79	0.67	0.39	0.52	0.55	0.52	0.49	0.81	0.71	0.6	0.33	0.71	0.79	0.87	0.91	0.55
Cpa\|evm.model.tig00001284.2 (tig00001284_g8000.t1)	0.04	0.31	0.7	0.79	0.8	1.0	0.66	0.6	0.86	0.68	0.56	0.48	0.07	0.44	0.39	0.4	0.5	0.71	0.75	0.68	0.26	0.69	0.54	0.94	0.85	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020531.50 (tig00020531_g10056.t1)	0.56	0.66	0.74	0.71	0.76	0.74	0.8	0.74	0.71	0.69	0.61	0.54	0.55	0.64	0.82	0.81	0.82	1.0	0.98	0.87	0.37	0.65	0.85	0.47	0.56	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020554.134 (tig00020554_g10911.t1)	0.12	0.22	0.41	0.52	0.59	0.64	0.59	0.42	0.33	0.38	0.35	0.41	0.16	0.2	0.32	0.28	0.47	0.49	0.47	0.35	0.44	0.52	1.0	0.6	0.52	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020554.90 (tig00020554_g10868.t1)	0.08	0.44	0.22	0.42	0.68	0.82	0.55	0.55	0.28	0.29	0.29	0.39	0.06	0.2	0.28	0.27	0.36	0.75	0.54	0.71	0.3	0.26	1.0	0.92	0.89	0.92
Cpa\|evm.model.tig00020603.31 (tig00020603_g11763.t1)	0.25	0.32	0.34	0.32	0.45	0.67	0.62	0.47	0.36	0.28	0.25	0.24	0.29	0.52	0.58	0.55	0.51	0.82	0.65	0.54	0.41	0.55	1.0	0.53	0.27	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020603.32 (tig00020603_g11763.t1)	0.33	0.32	0.35	0.34	0.59	0.89	0.62	0.46	0.37	0.28	0.28	0.24	0.26	0.53	0.67	0.62	0.61	0.77	0.73	0.52	0.4	0.5	1.0	0.41	0.31	0.32
Cpa\|evm.model.tig00020610.69 (tig00020610_g12013.t1)	0.15	0.17	0.16	0.33	0.23	0.63	0.52	0.31	0.44	0.21	0.17	0.11	0.06	0.34	0.26	0.35	0.33	0.26	0.57	0.46	0.61	0.37	1.0	0.31	0.3	0.18
Cpa\|evm.model.tig00020704.62 (tig00020704_g13217.t2)	0.48	0.54	0.77	0.76	0.94	0.98	0.88	0.85	0.9	0.52	0.64	0.52	0.37	0.42	0.61	0.72	0.52	0.75	0.72	0.65	0.13	0.43	1.0	0.72	0.71	0.81
Cpa\|evm.model.tig00020746.9 (tig00020746_g13663.t1)	0.11	0.26	0.41	0.47	0.73	0.76	0.66	0.71	0.78	0.85	0.62	0.62	0.1	0.59	0.49	0.29	0.58	1.0	0.91	0.67	0.8	0.8	0.87	0.77	0.8	0.9
Cpa\|evm.model.tig00020816.31 (tig00020816_g14118.t1)	0.16	0.4	0.54	0.63	0.81	0.99	0.83	0.84	0.95	0.67	0.59	0.58	0.09	0.56	0.69	1.0	0.59	0.78	0.74	0.65	0.07	0.64	0.58	0.71	0.65	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020830.119 (tig00020830_g14505.t1)	0.13	0.32	0.45	0.6	0.74	0.85	0.91	0.69	0.66	0.39	0.34	0.24	0.06	0.63	0.4	0.66	0.43	0.48	0.48	0.32	0.33	1.0	0.88	0.28	0.65	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020903.11 (tig00020903_g15079.t1)	0.13	0.23	0.28	0.46	0.71	0.78	0.76	0.61	0.48	0.4	0.31	0.22	0.1	0.5	0.57	0.78	0.56	0.72	0.85	0.51	0.29	0.65	1.0	0.48	0.58	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020904.76 (tig00020904_g15209.t1)	0.06	0.11	0.3	0.35	0.61	0.78	0.5	0.36	0.41	0.34	0.27	0.3	0.06	0.39	0.43	0.39	0.52	0.52	0.8	0.56	0.37	0.48	0.78	1.0	0.68	0.77
Cpa\|evm.model.tig00020927.62 (tig00020927_g15993.t1)	0.04	0.07	0.13	0.17	0.4	0.64	0.55	0.47	0.68	0.78	0.6	0.52	0.06	0.35	0.29	0.38	0.6	0.59	0.53	0.74	0.72	0.54	0.85	1.0	0.36	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020961.59 (tig00020961_g16681.t1)	0.69	0.66	0.68	0.75	0.85	0.92	0.9	0.85	0.83	0.7	0.61	0.55	0.59	0.54	0.58	0.62	0.63	0.74	0.66	0.7	0.35	0.74	1.0	0.6	0.67	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020961.65 (tig00020961_g16687.t1)	0.03	0.17	0.18	0.24	0.45	0.69	0.56	0.49	0.25	0.18	0.09	0.08	0.02	0.18	0.3	0.76	0.38	0.51	0.43	0.4	0.22	0.49	1.0	0.34	0.34	0.19
Cpa\|evm.model.tig00021108.18 (tig00021108_g18309.t1)	0.3	0.47	0.56	0.62	0.81	1.0	0.8	0.73	0.72	0.6	0.58	0.52	0.36	0.59	0.51	0.65	0.45	0.65	0.57	0.45	0.32	0.58	0.87	0.4	0.43	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021179.26 (tig00021179_g19241.t1)	0.25	0.29	0.3	0.28	0.27	0.28	0.24	0.23	0.33	0.33	0.42	0.44	0.24	0.21	0.23	0.39	0.31	0.39	0.3	0.3	0.46	0.64	0.52	1.0	0.47	0.3
Cpa\|evm.model.tig00021179.72 (tig00021179_g19286.t1)	0.53	0.54	0.57	0.7	0.79	0.81	0.81	0.7	0.73	0.52	0.49	0.48	0.45	0.45	0.48	0.55	0.52	0.68	0.57	0.62	0.49	0.72	0.75	0.63	1.0	0.56
Cpa\|evm.model.tig00021318.44 (tig00021318_g20160.t1)	0.14	0.16	0.15	0.31	0.42	0.37	0.39	0.4	0.28	0.26	0.26	0.17	0.06	0.07	0.09	0.07	0.15	0.4	0.37	0.22	0.53	0.13	1.0	0.48	0.35	0.2
Cpa\|evm.model.tig00021493.67 (tig00021493_g21905.t1)	0.07	0.15	0.29	0.3	0.31	0.41	0.56	0.65	0.77	0.85	0.87	0.65	0.09	0.46	0.3	0.39	0.44	0.76	0.71	0.65	0.84	0.59	1.0	0.81	0.86	0.83

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)