Heatmap: Cluster_119 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000025.52 (tig00000025_g7955.t1)
0.39 0.41 0.45 0.69 0.9 0.93 0.92 0.87 0.7 0.58 0.59 0.53 0.34 0.59 0.71 0.92 0.57 0.8 0.77 0.45 0.42 0.75 1.0 0.53 0.81 0.56
Cpa|evm.model.tig00000042.233 (tig00000042_g15631.t1)
0.6 0.62 0.62 0.64 0.73 1.0 0.99 0.77 0.66 0.51 0.41 0.36 0.38 0.52 0.71 0.83 0.64 0.55 0.82 0.5 0.09 0.36 0.87 0.48 1.0 0.76
Cpa|evm.model.tig00000157.20 (tig00000157_g9607.t1)
0.35 0.78 0.7 0.67 0.78 0.78 0.79 0.69 0.66 0.58 0.45 0.35 0.3 0.57 0.81 0.83 0.68 1.0 0.9 0.71 0.33 0.81 0.83 0.56 0.48 0.38
Cpa|evm.model.tig00000227.48 (tig00000227_g19839.t1)
0.34 0.32 0.42 0.56 0.48 0.91 0.61 0.46 0.4 0.42 0.45 0.63 0.31 0.66 0.57 0.55 0.54 0.85 0.7 0.67 0.25 0.56 1.0 0.46 0.78 0.75
Cpa|evm.model.tig00000237.12 (tig00000237_g20461.t1)
0.05 0.15 0.19 0.28 0.52 0.67 0.41 0.4 0.39 0.46 0.31 0.4 0.05 0.29 0.28 0.41 0.36 0.44 0.44 0.38 0.3 0.52 1.0 0.7 0.39 0.33
Cpa|evm.model.tig00000241.39 (tig00000241_g20897.t1)
0.17 0.38 0.57 0.54 0.67 0.77 0.6 0.61 0.55 0.58 0.46 0.43 0.1 0.48 0.56 0.74 0.63 0.64 0.74 1.0 0.55 0.2 0.93 0.78 0.54 0.81
Cpa|evm.model.tig00000246.9 (tig00000246_g21500.t2)
0.33 0.27 0.26 0.33 0.31 0.27 0.23 0.29 0.29 0.41 0.4 0.37 0.23 0.16 0.3 0.19 0.23 0.49 0.34 0.36 0.73 0.74 1.0 0.47 0.61 0.47
Cpa|evm.model.tig00000319.29 (tig00000319_g24142.t1)
0.76 0.83 0.69 0.71 0.85 1.0 0.88 0.84 0.8 0.57 0.57 0.54 0.52 0.53 0.49 0.53 0.57 0.79 0.7 0.49 0.27 0.95 0.9 0.57 0.76 0.62
Cpa|evm.model.tig00000385.7 (tig00000385_g24735.t1)
0.38 0.36 0.45 0.44 0.58 0.53 0.77 0.61 0.65 0.55 0.49 0.41 0.35 0.59 0.7 0.67 0.54 0.74 0.82 0.64 0.32 0.51 1.0 0.5 0.47 0.52
Cpa|evm.model.tig00000388.64 (tig00000388_g24826.t1)
0.29 0.47 0.54 0.54 0.57 0.77 0.73 0.62 0.74 0.7 0.65 0.77 0.33 0.69 0.65 0.7 0.66 0.72 0.7 0.58 0.91 0.79 0.92 0.89 1.0 0.95
Cpa|evm.model.tig00000402.73 (tig00000402_g250.t1)
0.51 0.49 0.5 0.58 0.69 0.88 0.86 0.71 0.69 0.6 0.5 0.41 0.45 0.48 0.62 0.54 0.55 0.71 0.76 0.63 0.37 0.65 1.0 0.72 0.52 0.49
Cpa|evm.model.tig00000405.66 (tig00000405_g497.t1)
0.04 0.12 0.34 0.46 0.77 0.84 1.0 0.72 0.92 0.69 0.57 0.48 0.07 0.56 0.46 0.62 0.58 0.89 0.8 0.58 0.18 0.64 0.83 0.52 0.56 0.41
Cpa|evm.model.tig00000448.83 (tig00000448_g918.t1)
0.39 0.31 0.3 0.44 0.49 0.55 0.57 0.54 0.53 0.44 0.4 0.38 0.3 0.25 0.29 0.32 0.34 0.5 0.4 0.4 0.66 0.58 1.0 0.7 0.66 0.49
Cpa|evm.model.tig00000478.16 (tig00000478_g1265.t1)
0.1 0.27 0.3 0.42 0.69 1.0 0.78 0.58 0.49 0.26 0.22 0.2 0.13 0.54 0.46 0.52 0.57 0.72 0.72 0.52 0.07 0.84 0.62 0.36 0.8 0.53
Cpa|evm.model.tig00000545.15 (tig00000545_g1988.t1)
0.11 0.46 0.78 0.79 0.9 0.97 0.79 0.82 0.82 0.79 0.67 0.63 0.09 0.84 0.68 0.81 0.68 1.0 0.97 0.76 0.65 0.71 0.88 0.83 0.74 1.0
Cpa|evm.model.tig00000545.9 (tig00000545_g1982.t1)
0.2 0.38 0.35 0.46 0.73 0.99 0.79 0.67 0.67 0.61 0.46 0.36 0.19 0.34 0.48 0.45 0.51 0.68 0.51 0.64 0.1 0.77 0.7 0.64 1.0 0.55
Cpa|evm.model.tig00000605.2 (tig00000605_g2468.t1)
0.18 0.33 0.51 0.54 0.59 0.71 0.78 0.68 0.52 0.52 0.49 0.37 0.21 0.6 0.55 0.62 0.45 0.76 0.77 0.55 0.18 0.78 1.0 0.43 0.74 0.5
Cpa|evm.model.tig00000615.79 (tig00000615_g2609.t1)
0.33 0.5 0.51 0.48 0.53 0.55 0.59 0.54 0.49 0.42 0.34 0.32 0.29 0.45 0.6 0.61 0.55 0.88 0.67 0.59 0.38 0.51 1.0 0.48 0.5 0.38
Cpa|evm.model.tig00000615.86 (tig00000615_g2614.t1)
0.08 0.04 0.2 0.47 0.74 0.93 0.77 0.53 0.54 0.56 0.49 0.46 0.13 0.44 0.44 0.56 0.59 0.33 0.33 0.4 0.51 0.42 1.0 0.68 0.41 0.36
Cpa|evm.model.tig00000691.14 (tig00000691_g3164.t1)
0.13 0.38 0.34 0.44 0.65 0.65 0.56 0.5 0.43 0.33 0.23 0.17 0.06 0.32 0.59 0.39 0.33 0.66 0.6 0.42 0.38 0.67 1.0 0.54 0.56 0.41
Cpa|evm.model.tig00000691.15 (tig00000691_g3164.t1)
0.09 0.43 0.39 0.58 0.65 0.68 0.67 0.53 0.46 0.37 0.27 0.22 0.05 0.41 0.77 0.6 0.57 1.0 0.83 0.53 0.38 0.69 0.82 0.47 0.49 0.56
Cpa|evm.model.tig00000718.48 (tig00000718_g3722.t1)
0.23 0.35 0.46 0.62 0.77 0.95 0.82 0.63 0.77 0.62 0.42 0.41 0.15 0.56 0.33 0.51 0.46 0.93 0.74 0.54 0.59 0.41 1.0 0.99 0.72 0.96
Cpa|evm.model.tig00000792.61 (tig00000792_g4212.t1)
0.31 0.29 0.35 0.35 0.49 0.59 0.54 0.46 0.46 0.42 0.35 0.38 0.31 0.35 0.33 0.49 0.44 0.57 0.45 0.51 0.52 0.71 1.0 0.94 0.47 0.35
Cpa|evm.model.tig00000802.23 (tig00000802_g4274.t1)
0.14 0.21 0.22 0.25 0.28 0.3 0.25 0.19 0.22 0.25 0.28 0.3 0.14 0.21 0.25 0.28 0.27 0.32 0.31 0.24 0.46 0.34 0.55 1.0 0.35 0.31
Cpa|evm.model.tig00000842.25 (tig00000842_g4844.t1)
0.37 0.51 0.52 0.49 0.58 0.58 0.61 0.56 0.49 0.45 0.37 0.32 0.33 0.52 0.63 0.83 0.55 1.0 0.68 0.57 0.41 0.8 0.94 0.51 0.45 0.34
Cpa|evm.model.tig00000842.60 (tig00000842_g4881.t1)
0.34 0.51 0.57 0.71 0.82 1.0 0.67 0.48 0.61 0.58 0.53 0.52 0.31 0.49 0.58 0.64 0.6 0.78 0.78 0.71 0.25 0.76 0.87 0.72 0.67 0.62
Cpa|evm.model.tig00000849.35 (tig00000849_g4776.t1)
0.19 0.35 0.25 0.43 0.66 0.88 0.72 0.64 0.38 0.3 0.3 0.19 0.15 0.36 0.42 0.51 0.3 0.37 0.42 0.39 0.27 0.7 1.0 0.37 0.45 0.41
Cpa|evm.model.tig00000865.31 (tig00000865_g5081.t1)
0.41 0.34 0.39 0.47 0.68 0.97 0.87 0.71 0.66 0.51 0.36 0.32 0.4 0.47 0.51 0.51 0.47 0.61 0.61 0.55 0.43 0.28 1.0 0.64 0.37 0.43
Cpa|evm.model.tig00000865.35 (tig00000865_g5085.t1)
0.2 0.15 0.33 0.37 0.44 0.51 0.41 0.36 0.33 0.43 0.39 0.43 0.23 0.24 0.27 0.35 0.36 0.33 0.36 0.51 0.42 0.6 1.0 0.68 0.55 0.52
Cpa|evm.model.tig00000912.30 (tig00000912_g5435.t1)
0.25 0.43 0.47 0.5 0.69 0.79 0.74 0.68 0.64 0.62 0.6 0.57 0.28 0.49 0.49 0.51 0.64 0.71 0.82 0.75 0.58 0.76 1.0 0.79 0.59 0.67
Cpa|evm.model.tig00000989.4 (tig00000989_g6080.t1)
0.28 0.62 0.49 0.37 0.37 0.33 0.41 0.38 0.29 0.25 0.17 0.14 0.21 0.41 0.49 0.64 0.52 1.0 0.75 0.56 0.22 0.27 1.0 0.22 0.27 0.21
Cpa|evm.model.tig00001001.13 (tig00001001_g6203.t1)
0.27 0.31 0.41 0.47 0.51 0.59 0.89 0.63 0.66 0.36 0.37 0.24 0.15 0.56 0.31 0.54 0.54 0.78 0.7 0.44 0.35 0.99 1.0 0.29 0.6 0.33
Cpa|evm.model.tig00001003.15 (tig00001003_g6272.t1)
0.22 0.3 0.23 0.52 0.7 0.52 0.7 0.63 0.25 0.36 0.32 0.2 0.15 0.27 0.43 0.28 0.47 0.63 0.55 0.57 0.28 0.35 0.67 0.76 1.0 0.59
Cpa|evm.model.tig00001024.7 (tig00001024_g6317.t1)
0.1 0.17 0.22 0.26 0.6 1.0 0.83 0.63 0.43 0.24 0.24 0.17 0.09 0.24 0.29 0.65 0.43 0.4 0.46 0.4 0.42 0.47 0.77 0.61 0.59 0.39
Cpa|evm.model.tig00001029.34 (tig00001029_g6434.t1)
0.25 0.34 0.47 0.57 0.79 1.0 0.78 0.63 0.64 0.61 0.41 0.44 0.21 0.56 0.5 0.48 0.37 0.71 0.58 0.37 0.11 0.51 0.56 0.56 0.49 0.58
Cpa|evm.model.tig00001049.3 (tig00001049_g6654.t1)
0.33 0.15 0.08 0.11 0.21 0.39 0.59 0.57 0.53 0.59 0.51 0.41 0.33 0.32 0.25 0.23 0.38 0.7 0.47 0.42 0.64 0.42 0.56 1.0 0.58 0.41
Cpa|evm.model.tig00001093.15 (tig00001093_g6892.t1)
0.43 0.52 0.51 0.61 0.8 1.0 0.89 0.86 0.92 0.72 0.79 0.67 0.39 0.52 0.55 0.52 0.49 0.81 0.71 0.6 0.33 0.71 0.79 0.87 0.91 0.55
Cpa|evm.model.tig00001284.2 (tig00001284_g8000.t1)
0.04 0.31 0.7 0.79 0.8 1.0 0.66 0.6 0.86 0.68 0.56 0.48 0.07 0.44 0.39 0.4 0.5 0.71 0.75 0.68 0.26 0.69 0.54 0.94 0.85 0.67
Cpa|evm.model.tig00020531.50 (tig00020531_g10056.t1)
0.56 0.66 0.74 0.71 0.76 0.74 0.8 0.74 0.71 0.69 0.61 0.54 0.55 0.64 0.82 0.81 0.82 1.0 0.98 0.87 0.37 0.65 0.85 0.47 0.56 0.53
Cpa|evm.model.tig00020554.134 (tig00020554_g10911.t1)
0.12 0.22 0.41 0.52 0.59 0.64 0.59 0.42 0.33 0.38 0.35 0.41 0.16 0.2 0.32 0.28 0.47 0.49 0.47 0.35 0.44 0.52 1.0 0.6 0.52 0.46
Cpa|evm.model.tig00020554.90 (tig00020554_g10868.t1)
0.08 0.44 0.22 0.42 0.68 0.82 0.55 0.55 0.28 0.29 0.29 0.39 0.06 0.2 0.28 0.27 0.36 0.75 0.54 0.71 0.3 0.26 1.0 0.92 0.89 0.92
Cpa|evm.model.tig00020603.31 (tig00020603_g11763.t1)
0.25 0.32 0.34 0.32 0.45 0.67 0.62 0.47 0.36 0.28 0.25 0.24 0.29 0.52 0.58 0.55 0.51 0.82 0.65 0.54 0.41 0.55 1.0 0.53 0.27 0.36
Cpa|evm.model.tig00020603.32 (tig00020603_g11763.t1)
0.33 0.32 0.35 0.34 0.59 0.89 0.62 0.46 0.37 0.28 0.28 0.24 0.26 0.53 0.67 0.62 0.61 0.77 0.73 0.52 0.4 0.5 1.0 0.41 0.31 0.32
Cpa|evm.model.tig00020610.69 (tig00020610_g12013.t1)
0.15 0.17 0.16 0.33 0.23 0.63 0.52 0.31 0.44 0.21 0.17 0.11 0.06 0.34 0.26 0.35 0.33 0.26 0.57 0.46 0.61 0.37 1.0 0.31 0.3 0.18
Cpa|evm.model.tig00020704.62 (tig00020704_g13217.t2)
0.48 0.54 0.77 0.76 0.94 0.98 0.88 0.85 0.9 0.52 0.64 0.52 0.37 0.42 0.61 0.72 0.52 0.75 0.72 0.65 0.13 0.43 1.0 0.72 0.71 0.81
Cpa|evm.model.tig00020746.9 (tig00020746_g13663.t1)
0.11 0.26 0.41 0.47 0.73 0.76 0.66 0.71 0.78 0.85 0.62 0.62 0.1 0.59 0.49 0.29 0.58 1.0 0.91 0.67 0.8 0.8 0.87 0.77 0.8 0.9
Cpa|evm.model.tig00020816.31 (tig00020816_g14118.t1)
0.16 0.4 0.54 0.63 0.81 0.99 0.83 0.84 0.95 0.67 0.59 0.58 0.09 0.56 0.69 1.0 0.59 0.78 0.74 0.65 0.07 0.64 0.58 0.71 0.65 0.62
Cpa|evm.model.tig00020830.119 (tig00020830_g14505.t1)
0.13 0.32 0.45 0.6 0.74 0.85 0.91 0.69 0.66 0.39 0.34 0.24 0.06 0.63 0.4 0.66 0.43 0.48 0.48 0.32 0.33 1.0 0.88 0.28 0.65 0.54
Cpa|evm.model.tig00020903.11 (tig00020903_g15079.t1)
0.13 0.23 0.28 0.46 0.71 0.78 0.76 0.61 0.48 0.4 0.31 0.22 0.1 0.5 0.57 0.78 0.56 0.72 0.85 0.51 0.29 0.65 1.0 0.48 0.58 0.47
Cpa|evm.model.tig00020904.76 (tig00020904_g15209.t1)
0.06 0.11 0.3 0.35 0.61 0.78 0.5 0.36 0.41 0.34 0.27 0.3 0.06 0.39 0.43 0.39 0.52 0.52 0.8 0.56 0.37 0.48 0.78 1.0 0.68 0.77
Cpa|evm.model.tig00020927.62 (tig00020927_g15993.t1)
0.04 0.07 0.13 0.17 0.4 0.64 0.55 0.47 0.68 0.78 0.6 0.52 0.06 0.35 0.29 0.38 0.6 0.59 0.53 0.74 0.72 0.54 0.85 1.0 0.36 0.34
Cpa|evm.model.tig00020961.59 (tig00020961_g16681.t1)
0.69 0.66 0.68 0.75 0.85 0.92 0.9 0.85 0.83 0.7 0.61 0.55 0.59 0.54 0.58 0.62 0.63 0.74 0.66 0.7 0.35 0.74 1.0 0.6 0.67 0.63
Cpa|evm.model.tig00020961.65 (tig00020961_g16687.t1)
0.03 0.17 0.18 0.24 0.45 0.69 0.56 0.49 0.25 0.18 0.09 0.08 0.02 0.18 0.3 0.76 0.38 0.51 0.43 0.4 0.22 0.49 1.0 0.34 0.34 0.19
Cpa|evm.model.tig00021108.18 (tig00021108_g18309.t1)
0.3 0.47 0.56 0.62 0.81 1.0 0.8 0.73 0.72 0.6 0.58 0.52 0.36 0.59 0.51 0.65 0.45 0.65 0.57 0.45 0.32 0.58 0.87 0.4 0.43 0.39
Cpa|evm.model.tig00021179.26 (tig00021179_g19241.t1)
0.25 0.29 0.3 0.28 0.27 0.28 0.24 0.23 0.33 0.33 0.42 0.44 0.24 0.21 0.23 0.39 0.31 0.39 0.3 0.3 0.46 0.64 0.52 1.0 0.47 0.3
Cpa|evm.model.tig00021179.72 (tig00021179_g19286.t1)
0.53 0.54 0.57 0.7 0.79 0.81 0.81 0.7 0.73 0.52 0.49 0.48 0.45 0.45 0.48 0.55 0.52 0.68 0.57 0.62 0.49 0.72 0.75 0.63 1.0 0.56
Cpa|evm.model.tig00021318.44 (tig00021318_g20160.t1)
0.14 0.16 0.15 0.31 0.42 0.37 0.39 0.4 0.28 0.26 0.26 0.17 0.06 0.07 0.09 0.07 0.15 0.4 0.37 0.22 0.53 0.13 1.0 0.48 0.35 0.2
Cpa|evm.model.tig00021493.67 (tig00021493_g21905.t1)
0.07 0.15 0.29 0.3 0.31 0.41 0.56 0.65 0.77 0.85 0.87 0.65 0.09 0.46 0.3 0.39 0.44 0.76 0.71 0.65 0.84 0.59 1.0 0.81 0.86 0.83

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)