Heatmap: Cluster_155 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.248 (tig00000042_g15651.t1)	0.23	0.23	0.2	0.37	0.67	0.62	0.43	0.42	0.44	0.47	0.56	0.48	0.35	0.54	0.2	0.19	0.18	0.32	0.38	0.34	0.79	0.54	1.0	0.41	0.87	0.91
Cpa\|evm.model.tig00000076.172 (tig00000076_g2466.t1)	0.07	0.06	0.22	0.45	0.38	0.36	0.46	0.43	0.42	0.4	0.54	0.46	0.11	0.4	0.11	0.4	0.14	0.1	0.12	0.09	0.24	0.32	1.0	0.44	0.52	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000076.173 (tig00000076_g2466.t1)	0.08	0.07	0.2	0.4	0.41	0.32	0.52	0.46	0.34	0.41	0.52	0.46	0.1	0.45	0.13	0.45	0.12	0.12	0.11	0.12	0.22	0.3	1.0	0.43	0.56	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000093.175 (tig00000093_g3612.t1)	0.13	0.07	0.12	0.24	0.19	0.16	0.3	0.36	0.52	0.5	0.66	0.5	0.21	0.5	0.37	0.54	0.23	0.44	0.33	0.26	0.22	0.35	0.83	1.0	0.68	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000093.77 (tig00000093_g3505.t1)	0.33	0.25	0.24	0.27	0.14	0.24	0.31	0.28	0.6	0.49	0.52	0.48	0.38	0.47	0.44	0.39	0.24	0.34	0.22	0.12	0.23	0.34	0.69	1.0	0.76	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000123.1 (tig00000403_g327.t1)	0.1	0.05	0.04	0.07	0.09	0.13	0.37	0.27	0.57	0.52	0.38	0.3	0.1	0.47	0.5	0.33	0.45	0.63	0.39	0.24	0.08	0.54	1.0	0.3	0.67	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000144.101 (tig00000144_g9094.t1)	0.06	0.09	0.1	0.15	0.3	0.46	0.57	0.53	0.7	0.56	0.6	0.45	0.07	0.27	0.25	0.25	0.3	0.32	0.27	0.28	0.48	0.34	1.0	0.4	0.58	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000178.61 (tig00000178_g12773.t1)	0.56	0.41	0.38	0.47	0.4	0.36	0.54	0.63	0.59	0.76	0.77	0.66	0.57	0.64	0.45	0.72	0.49	0.56	0.38	0.47	0.32	0.37	1.0	0.55	0.81	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000241.3 (tig00000241_g20862.t1)	0.08	0.15	0.23	0.37	0.41	0.4	0.54	0.48	0.73	0.5	0.56	0.4	0.05	0.31	0.24	0.37	0.24	0.37	0.28	0.21	0.48	0.54	1.0	0.82	0.52	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000241.44 (tig00000241_g20903.t1)	0.1	0.08	0.2	0.36	0.26	0.19	0.26	0.3	0.33	0.38	0.4	0.44	0.11	0.16	0.14	0.15	0.13	0.17	0.13	0.13	0.46	0.13	1.0	0.31	0.6	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000254.102 (tig00000254_g22557.t1)	0.37	0.25	0.28	0.36	0.44	0.43	0.58	0.56	0.7	0.78	0.86	0.88	0.49	0.61	0.49	0.54	0.33	0.34	0.38	0.32	0.45	0.52	1.0	0.71	0.43	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000572.3 (tig00000572_g2207.t1)	0.36	0.28	0.18	0.15	0.09	0.14	0.33	0.39	0.67	0.53	0.59	0.55	0.35	0.29	0.37	0.41	0.28	0.37	0.25	0.2	0.26	0.05	1.0	0.48	0.42	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000572.4 (tig00000572_g2208.t1)	0.03	0.01	0.07	0.08	0.07	0.07	0.23	0.21	0.65	0.4	0.31	0.21	0.02	0.4	0.43	0.29	0.21	0.23	0.16	0.22	0.19	0.16	1.0	0.32	0.48	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000572.5 (tig00000572_g2208.t1)	0.11	0.11	0.14	0.2	0.12	0.13	0.31	0.35	0.74	0.41	0.41	0.26	0.14	0.43	0.42	0.35	0.22	0.27	0.25	0.14	0.29	0.38	1.0	0.53	0.39	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000581.11 (tig00000581_g2219.t1)	0.11	0.18	0.12	0.17	0.24	0.1	0.27	0.25	0.38	0.44	0.33	0.34	0.16	0.28	0.32	0.31	0.19	0.25	0.2	0.18	0.51	0.92	1.0	0.22	0.53	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000624.11 (tig00000624_g2653.t1)	0.09	0.09	0.07	0.16	0.17	0.21	0.3	0.41	0.74	0.25	0.33	0.13	0.03	0.34	0.3	0.43	0.05	0.26	0.17	0.19	0.06	0.21	1.0	0.28	0.34	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000692.15 (tig00000692_g3209.t1)	0.21	0.2	0.29	0.34	0.4	0.35	0.3	0.27	0.32	0.34	0.44	0.47	0.24	0.32	0.26	0.3	0.2	0.16	0.17	0.22	0.35	0.39	1.0	0.46	0.39	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000711.12 (tig00000711_g3373.t1)	0.29	0.21	0.3	0.36	0.39	0.41	0.52	0.46	0.59	0.49	0.52	0.55	0.22	0.44	0.34	0.5	0.28	0.48	0.41	0.29	0.53	0.52	0.91	0.49	1.0	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000754.4 (tig00020693_g13035.t1)	0.42	0.32	0.3	0.38	0.37	0.26	0.35	0.49	0.42	0.55	0.7	0.61	0.63	0.58	0.25	0.34	0.17	0.25	0.26	0.18	0.49	0.29	0.95	0.52	1.0	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000821.28 (tig00000821_g4488.t1)	0.08	0.26	0.34	0.46	0.61	0.62	0.61	0.58	0.7	0.65	0.67	0.64	0.13	0.47	0.61	0.57	0.34	0.52	0.4	0.26	0.61	0.64	1.0	0.7	0.43	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000900.35 (tig00000900_g5391.t1)	0.19	0.14	0.19	0.32	0.36	0.39	0.45	0.43	0.47	0.46	0.5	0.51	0.21	0.33	0.31	0.23	0.2	0.36	0.29	0.23	0.52	0.39	1.0	0.73	0.53	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000944.3 (tig00000944_g5925.t1)	0.14	0.23	0.24	0.3	0.41	0.43	0.55	0.49	0.5	0.43	0.4	0.38	0.12	0.26	0.32	0.27	0.29	0.38	0.36	0.27	0.44	0.44	1.0	0.56	0.5	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000981.10 (tig00000981_g5865.t1)	0.14	0.04	0.06	0.11	0.19	0.18	0.18	0.18	0.21	0.42	0.57	0.43	0.2	0.53	0.18	0.29	0.01	0.06	0.13	0.1	0.26	0.19	1.0	0.39	0.32	0.61
Cpa\|evm.model.tig00001128.2 (tig00001128_g7167.t1)	0.16	0.23	0.26	0.31	0.39	0.38	0.44	0.47	0.5	0.48	0.56	0.56	0.23	0.49	0.38	0.35	0.3	0.33	0.32	0.23	0.42	0.48	1.0	0.48	0.46	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001208.1 (tig00001208_g7518.t1)	0.19	0.11	0.15	0.25	0.23	0.25	0.33	0.35	0.28	0.46	0.51	0.41	0.38	0.34	0.1	0.33	0.18	0.26	0.18	0.25	0.6	0.08	1.0	0.39	0.47	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001208.4 (tig00001208_g7519.t1)	0.15	0.1	0.13	0.31	0.35	0.29	0.35	0.42	0.3	0.43	0.57	0.33	0.28	0.4	0.17	0.29	0.13	0.38	0.25	0.29	0.45	0.22	1.0	0.4	0.59	0.55
Cpa\|evm.model.tig00001231.7 (tig00001231_g7654.t1)	0.04	0.05	0.07	0.08	0.23	0.26	0.25	0.12	0.62	0.23	0.33	0.21	0.0	0.25	0.25	0.24	0.12	0.18	0.16	0.06	0.18	0.45	1.0	0.62	0.45	0.36
Cpa\|evm.model.tig00001239.6 (tig00001239_g7762.t1)	0.07	0.04	0.07	0.21	0.21	0.29	0.38	0.3	0.48	0.39	0.47	0.35	0.11	0.6	0.3	0.51	0.25	0.19	0.19	0.15	0.29	0.3	1.0	0.65	0.42	0.65
Cpa\|evm.model.tig00001250.5 (tig00001250_g7795.t1)	0.29	0.14	0.16	0.26	0.24	0.31	0.45	0.49	0.37	0.6	0.52	0.53	0.47	0.57	0.2	0.38	0.25	0.38	0.17	0.22	0.35	0.29	1.0	0.42	0.57	0.47
Cpa\|evm.model.tig00001286.9 (tig00001286_g8026.t1)	0.1	0.29	0.22	0.26	0.26	0.27	0.41	0.41	0.41	0.4	0.4	0.25	0.07	0.45	0.29	0.42	0.22	0.33	0.29	0.14	0.6	0.45	0.71	0.78	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00001333.29 (tig00001333_g8200.t1)	0.19	0.27	0.33	0.39	0.52	0.51	0.54	0.58	0.71	0.71	0.72	0.67	0.22	0.61	0.55	0.65	0.44	0.46	0.39	0.35	0.36	0.39	1.0	0.7	0.57	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001366.9 (tig00001366_g8384.t1)	0.05	0.05	0.06	0.2	0.37	0.51	0.51	0.47	0.71	0.55	0.43	0.29	0.06	0.27	0.26	0.23	0.18	0.36	0.24	0.29	0.35	0.59	1.0	0.55	0.89	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001545.1 (tig00001545_g9332.t1)	0.4	0.46	0.32	0.3	0.23	0.17	0.27	0.42	0.42	0.47	0.49	0.46	0.38	0.42	0.37	0.47	0.33	0.53	0.38	0.3	0.38	0.13	1.0	0.44	0.69	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020510.112 (tig00020510_g9899.t1)	0.03	0.02	0.12	0.24	0.36	0.28	0.36	0.32	0.55	0.5	0.48	0.41	0.03	0.41	0.31	0.39	0.27	0.4	0.23	0.18	0.39	0.54	1.0	0.83	0.45	0.52
Cpa\|evm.model.tig00020553.260 (tig00020553_g10746.t1)	0.09	0.07	0.1	0.16	0.23	0.35	0.53	0.59	0.44	0.45	0.45	0.39	0.15	0.66	0.28	0.42	0.08	0.2	0.2	0.12	0.49	0.46	0.97	0.23	1.0	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020553.261 (tig00021517_g22008.t1)	0.04	0.04	0.09	0.16	0.18	0.21	0.35	0.46	0.29	0.31	0.35	0.25	0.12	0.5	0.24	0.35	0.11	0.15	0.15	0.14	0.31	0.43	1.0	0.24	0.45	0.35
Cpa\|evm.model.tig00020572.60 (tig00020572_g11581.t1)	0.02	0.1	0.2	0.33	0.28	0.26	0.33	0.32	0.48	0.35	0.45	0.42	0.02	0.29	0.31	0.28	0.34	0.32	0.32	0.23	0.47	0.26	1.0	0.45	0.31	0.29
Cpa\|evm.model.tig00020607.2 (tig00020607_g11915.t1)	0.07	0.12	0.29	0.44	0.44	0.42	0.81	0.58	0.75	0.66	0.68	0.66	0.11	0.39	0.32	0.33	0.34	0.38	0.36	0.25	0.48	0.43	1.0	0.65	0.97	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020610.49 (tig00020610_g11988.t1)	0.08	0.31	0.4	0.57	0.59	0.59	0.77	0.69	0.83	0.86	0.82	0.75	0.11	0.53	0.51	0.64	0.45	0.63	0.5	0.46	0.51	0.72	1.0	0.78	0.76	0.57
Cpa\|evm.model.tig00020616.35 (tig00020616_g12271.t1)	0.14	0.2	0.3	0.45	0.41	0.36	0.43	0.45	0.47	0.51	0.59	0.54	0.2	0.2	0.19	0.21	0.25	0.29	0.26	0.28	0.41	0.36	1.0	0.59	0.64	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020629.143 (tig00020629_g12471.t1)	0.05	0.04	0.03	0.1	0.13	0.11	0.23	0.21	0.39	0.35	0.38	0.23	0.06	0.36	0.21	0.67	0.25	0.17	0.15	0.12	0.43	0.51	1.0	0.55	0.37	0.28
Cpa\|evm.model.tig00020684.5 (tig00020684_g12852.t1)	0.33	0.34	0.27	0.35	0.4	0.36	0.39	0.46	0.67	0.64	0.71	0.51	0.3	0.64	0.43	0.67	0.41	0.35	0.37	0.36	0.4	0.63	1.0	0.48	0.66	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020875.8 (tig00020875_g14885.t1)	0.13	0.21	0.24	0.32	0.26	0.29	0.38	0.41	0.39	0.42	0.46	0.46	0.14	0.38	0.25	0.33	0.29	0.5	0.29	0.34	0.4	0.22	1.0	0.42	0.41	0.44
Cpa\|evm.model.tig00020903.58 (tig00020903_g15128.t1)	0.06	0.17	0.19	0.28	0.34	0.26	0.45	0.35	0.49	0.47	0.46	0.39	0.09	0.49	0.26	0.45	0.32	0.38	0.35	0.21	0.43	0.33	1.0	0.56	0.45	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020904.42 (tig00020904_g15175.t1)	0.33	0.33	0.22	0.57	0.45	0.32	0.59	0.58	0.7	0.74	0.9	0.95	0.37	0.61	0.42	0.6	0.4	0.39	0.25	0.32	0.4	0.48	1.0	0.43	0.78	0.59
Cpa\|evm.model.tig00020927.26 (tig00020927_g15955.t1)	0.24	0.29	0.29	0.38	0.45	0.35	0.38	0.35	0.53	0.49	0.57	0.43	0.13	0.35	0.38	0.26	0.18	0.5	0.29	0.23	0.69	0.26	1.0	0.57	0.81	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020961.8 (tig00020961_g16630.t1)	0.76	0.44	0.21	0.15	0.16	0.35	0.74	0.76	0.79	0.82	0.82	0.9	0.57	0.82	0.4	0.5	0.56	0.49	0.42	0.44	0.3	0.55	1.0	0.81	0.99	0.66
Cpa\|evm.model.tig00021038.74 (tig00021038_g17564.t1)	0.28	0.27	0.23	0.31	0.31	0.3	0.43	0.55	0.5	0.55	0.53	0.56	0.42	0.51	0.4	0.53	0.35	0.53	0.41	0.38	0.31	0.3	1.0	0.62	0.53	0.43
Cpa\|evm.model.tig00021293.13 (tig00021293_g20007.t1)	0.2	0.2	0.26	0.41	0.42	0.39	0.5	0.47	0.6	0.53	0.51	0.52	0.18	0.58	0.38	0.52	0.36	0.37	0.34	0.27	0.55	0.69	1.0	0.61	0.64	0.52
Cpa\|evm.model.tig00021350.24 (tig00021350_g20641.t1)	0.23	0.12	0.11	0.2	0.28	0.37	0.37	0.39	0.3	0.28	0.24	0.17	0.19	0.09	0.07	0.08	0.08	0.23	0.26	0.25	0.41	0.15	1.0	0.46	0.38	0.34
Cpa\|evm.model.tig00021489.58 (tig00021489_g21702.t1)	0.21	0.04	0.06	0.1	0.08	0.05	0.16	0.23	0.35	0.58	0.61	0.48	0.23	0.21	0.1	0.15	0.06	0.12	0.11	0.12	0.45	0.29	1.0	0.53	0.57	0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)