Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000073.17 (tig00000073_g1699.t1)	0.6	0.49	0.61	0.68	0.84	0.72	0.88	1.0	0.86	0.88	0.95	0.97	0.71	0.54	0.56	0.46	0.61	0.66	0.51	0.47	0.39	0.84	0.53	0.58	1.0	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000073.7 (tig00000073_g1689.t1)	0.47	0.32	0.28	0.41	0.53	0.38	0.51	0.58	0.49	0.32	0.42	0.71	0.31	0.5	0.18	0.27	0.13	0.21	0.17	0.21	0.07	1.0	0.69	0.44	0.64	0.77
Cpa\|evm.model.tig00000073.8 (tig00000073_g1689.t1)	0.33	0.28	0.21	0.28	0.32	0.23	0.38	0.28	0.25	0.3	0.4	0.43	0.31	0.33	0.14	0.23	0.12	0.14	0.12	0.13	0.06	1.0	0.5	0.68	0.77	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000076.23 (tig00000076_g2321.t1)	0.44	0.45	0.42	0.51	0.51	0.35	0.44	0.42	0.36	0.3	0.36	0.34	0.24	0.28	0.24	0.21	0.25	0.39	0.28	0.21	0.03	1.0	0.38	0.54	0.81	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000093.124 (tig00000093_g3554.t1)	0.64	0.58	0.54	0.63	0.69	0.6	0.78	0.81	0.85	0.83	0.88	0.83	0.56	0.54	0.43	0.37	0.44	0.65	0.57	0.54	0.58	1.0	0.52	0.7	0.82	0.85
Cpa\|evm.model.tig00000093.125	0.59	0.53	0.62	0.64	0.65	0.52	0.81	0.94	0.88	0.86	1.0	0.84	0.66	0.46	0.33	0.34	0.37	0.53	0.44	0.46	0.52	0.75	0.52	0.64	0.68	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000093.16 (tig00000093_g3453.t1)	0.68	0.67	0.77	0.9	0.77	0.51	0.73	0.92	0.92	1.0	0.89	0.86	0.69	0.34	0.27	0.53	0.5	0.56	0.37	0.72	0.71	0.89	0.56	0.58	0.7	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000113.27 (tig00000113_g5595.t1)	0.18	0.4	0.36	0.35	0.45	0.38	0.62	0.72	0.86	0.97	1.0	0.79	0.23	0.59	0.36	0.71	0.54	0.82	0.57	0.64	0.11	0.79	0.19	0.46	0.58	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000145.42 (tig00000145_g8844.t1)	0.51	0.39	0.38	0.6	0.47	0.38	0.36	0.47	0.46	0.37	0.49	0.35	0.46	0.3	0.22	0.44	0.17	0.25	0.19	0.18	0.09	1.0	0.19	0.3	0.78	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000147.54 (tig00000147_g9494.t2)	0.57	0.53	0.46	0.67	0.65	0.59	0.77	1.0	0.91	0.97	0.95	0.69	0.58	0.6	0.58	0.55	0.7	0.74	0.49	0.38	0.18	0.9	0.37	0.22	0.9	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000158.79 (tig00000158_g10185.t2)	0.68	0.45	0.54	0.68	0.59	0.51	0.56	0.76	0.6	0.67	0.8	0.62	0.53	0.72	0.45	0.49	0.28	0.34	0.29	0.42	0.7	1.0	0.63	0.73	0.73	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000178.26 (tig00000178_g12736.t1)	0.53	0.53	0.64	0.85	0.69	0.63	0.95	0.91	0.69	0.69	0.78	0.78	0.9	0.24	0.18	0.38	0.1	0.28	0.22	0.15	0.55	1.0	0.78	0.52	0.78	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000194.39 (tig00000194_g14767.t1)	0.21	0.23	0.21	0.46	0.36	0.35	0.31	0.37	0.37	0.23	0.21	0.11	0.12	0.09	0.13	0.09	0.1	0.38	0.32	0.19	0.02	1.0	0.28	0.21	0.98	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000215.130 (tig00000215_g18672.t1)	0.4	0.3	0.32	0.36	0.46	0.55	0.41	0.46	0.47	0.44	0.43	0.44	0.44	0.4	0.3	0.3	0.26	0.29	0.28	0.24	0.11	1.0	0.34	0.42	0.47	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000219.84 (tig00000219_g19521.t1)	0.54	0.52	0.44	0.69	0.5	0.35	0.42	0.54	0.51	0.37	0.43	0.38	0.5	0.18	0.15	0.43	0.2	0.49	0.41	0.26	0.05	0.82	0.4	0.31	1.0	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000241.104 (tig00000241_g20969.t1)	0.68	0.55	0.54	0.65	0.63	0.44	0.6	0.59	0.5	0.5	0.47	0.49	0.56	0.38	0.27	0.4	0.22	0.43	0.28	0.3	0.1	1.0	0.55	0.57	0.74	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000269.39 (tig00000093_g3456.t1)	0.16	0.23	0.24	0.34	0.39	0.29	0.61	0.58	0.72	0.93	0.82	0.61	0.24	0.45	0.21	0.37	0.39	0.4	0.23	0.25	0.05	1.0	0.23	0.67	0.6	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000282.11 (tig00000282_g23849.t1)	0.3	0.33	0.26	0.47	0.5	0.55	0.42	0.44	0.48	0.46	0.45	0.33	0.24	0.33	0.32	0.34	0.3	0.28	0.33	0.32	0.07	1.0	0.34	0.35	0.69	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000367.21 (tig00000367_g24457.t1)	0.52	0.44	0.53	0.7	0.74	0.75	0.9	1.0	0.9	0.98	0.83	0.63	0.34	0.47	0.39	0.48	0.25	0.38	0.38	0.37	0.43	0.72	0.5	0.46	0.69	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000385.14 (tig00000385_g24741.t1)	0.45	0.49	0.35	0.52	0.52	0.39	0.61	0.77	0.89	0.82	0.84	0.62	0.37	0.39	0.33	0.34	0.34	0.65	0.48	0.41	0.17	1.0	0.47	0.64	0.95	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000571.26 (tig00000571_g2180.t1)	0.64	0.74	0.5	0.63	0.58	0.55	0.67	0.79	0.95	0.84	0.98	0.87	0.59	0.6	0.37	0.31	0.38	0.61	0.6	0.34	0.52	1.0	0.72	0.84	0.85	0.84
Cpa\|evm.model.tig00000655.61 (tig00000655_g2890.t1)	0.33	0.3	0.29	0.38	0.45	0.44	0.43	0.49	0.49	0.5	0.45	0.46	0.32	0.35	0.26	0.33	0.24	0.29	0.31	0.29	0.16	1.0	0.26	0.38	0.47	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000663.29 (tig00000663_g2961.t1)	0.43	0.42	0.53	0.71	0.63	0.45	0.48	0.56	0.43	0.46	0.52	0.49	0.42	0.44	0.36	0.38	0.31	0.33	0.31	0.34	0.12	1.0	0.43	0.46	0.67	0.74
Cpa\|evm.model.tig00000718.69 (tig00000718_g3741.t1)	0.67	0.42	0.6	0.75	0.86	0.8	0.83	0.79	0.68	0.79	0.69	0.89	0.71	0.69	0.47	0.68	0.55	0.52	0.61	0.44	0.48	1.0	0.75	0.77	0.93	0.86
Cpa\|evm.model.tig00000788.2 (tig00000788_g4064.t1)	0.3	0.38	0.34	0.47	0.56	0.46	0.68	0.77	0.95	0.92	1.0	0.67	0.32	0.66	0.33	0.45	0.43	0.7	0.63	0.45	0.2	0.92	0.54	0.51	0.71	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000796.17 (tig00000796_g4239.t1)	0.59	0.35	0.34	0.56	0.56	0.45	0.58	0.62	0.35	0.24	0.36	0.3	0.37	0.17	0.15	0.17	0.18	0.36	0.42	0.28	0.08	1.0	0.5	0.38	0.86	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000865.60 (tig00000865_g5111.t1)	0.08	0.24	0.39	0.45	0.58	0.63	0.73	0.67	0.81	0.97	1.0	0.98	0.18	0.73	0.62	0.46	0.78	0.73	0.56	0.67	0.26	0.7	0.37	0.81	0.57	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000900.34 (tig00000900_g5390.t1)	0.59	0.43	0.44	0.67	0.55	0.44	0.54	0.63	0.56	0.54	0.65	0.63	0.59	0.44	0.36	0.45	0.22	0.31	0.33	0.25	0.11	1.0	0.4	0.72	0.93	0.9
Cpa\|evm.model.tig00000923.4 (tig00000923_g5466.t1)	0.31	0.43	0.44	0.47	0.49	0.59	0.44	0.49	0.59	0.54	0.57	0.43	0.18	0.36	0.37	0.34	0.4	0.46	0.47	0.35	0.06	1.0	0.38	0.61	0.73	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000955.8 (tig00000955_g5780.t1)	0.33	0.14	0.07	0.34	0.33	0.17	0.21	0.21	0.14	0.17	0.21	0.15	0.25	0.11	0.06	0.11	0.07	0.13	0.02	0.11	0.01	1.0	0.06	0.29	0.63	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000989.30 (tig00000989_g6103.t1)	0.89	0.59	0.58	0.68	0.43	0.27	0.62	0.79	0.64	0.67	1.0	0.58	0.92	0.14	0.15	0.1	0.11	0.49	0.32	0.2	0.28	0.25	0.22	0.49	0.71	0.47
Cpa\|evm.model.tig00001001.18 (tig00001001_g6209.t1)	0.23	0.21	0.17	0.32	0.4	0.34	0.47	0.53	0.54	0.48	0.47	0.28	0.13	0.13	0.1	0.12	0.22	0.45	0.43	0.32	0.01	1.0	0.38	0.48	0.8	0.4
Cpa\|evm.model.tig00001001.19 (tig00001001_g6211.t1)	0.51	0.32	0.41	0.63	0.63	0.46	0.78	0.81	0.75	0.62	0.58	0.44	0.5	0.4	0.33	0.7	0.41	0.44	0.43	0.39	0.08	1.0	0.54	0.63	0.88	0.52
Cpa\|evm.model.tig00001030.23 (tig00001030_g6463.t1)	0.44	0.4	0.43	0.49	0.59	0.49	0.61	0.6	0.55	0.5	0.47	0.33	0.37	0.42	0.29	0.44	0.37	0.47	0.44	0.39	0.17	1.0	0.42	0.49	0.81	0.49
Cpa\|evm.model.tig00001041.33 (tig00001041_g6575.t1)	0.49	0.65	0.67	0.69	0.56	0.45	0.51	0.56	0.51	0.55	0.61	0.57	0.54	0.52	0.43	0.54	0.35	0.61	0.43	0.43	0.13	1.0	0.54	0.5	0.75	0.79
Cpa\|evm.model.tig00001056.22 (tig00001056_g6645.t1)	1.0	0.84	0.55	0.66	0.73	0.64	0.8	0.84	0.77	0.94	0.96	0.86	0.86	0.34	0.36	0.5	0.37	0.57	0.43	0.28	0.47	0.62	0.46	0.48	0.68	0.59
Cpa\|evm.model.tig00001067.20 (tig00001067_g6778.t1)	0.56	0.64	0.75	0.64	0.5	0.36	0.39	0.48	0.57	0.54	0.51	0.47	0.69	0.51	0.49	0.33	0.38	0.64	0.45	0.4	0.13	0.86	0.62	0.41	0.73	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001073.18 (tig00001073_g6826.t1)	0.41	0.38	0.37	0.54	0.57	0.51	0.58	0.63	0.61	0.68	0.61	0.56	0.35	0.34	0.43	0.41	0.4	0.64	0.53	0.45	0.11	1.0	0.36	0.62	0.77	0.56
Cpa\|evm.model.tig00001073.23 (tig00001073_g6831.t1)	0.6	0.43	0.36	0.46	0.48	0.36	0.48	0.5	0.32	0.34	0.4	0.37	0.59	0.2	0.21	0.22	0.22	0.32	0.23	0.24	0.12	1.0	0.33	0.32	0.79	0.61
Cpa\|evm.model.tig00001085.14 (tig00001085_g6954.t1)	0.4	0.38	0.49	0.61	0.51	0.4	0.53	0.55	0.48	0.45	0.46	0.44	0.35	0.48	0.36	0.42	0.34	0.46	0.41	0.32	0.09	1.0	0.38	0.53	0.73	0.69
Cpa\|evm.model.tig00001299.3 (tig00001299_g8062.t1)	0.62	0.49	0.52	0.87	0.93	0.78	0.76	1.0	0.93	0.92	0.93	0.81	0.57	0.3	0.21	0.32	0.26	0.35	0.33	0.33	0.49	0.76	0.82	0.61	0.74	0.63
Cpa\|evm.model.tig00001299.4 (tig00001299_g8062.t3)	0.59	0.65	0.66	0.92	0.87	0.63	0.91	1.0	0.85	0.89	0.9	0.77	0.54	0.45	0.34	0.46	0.43	0.53	0.4	0.54	0.46	0.79	0.57	0.6	0.85	0.65
Cpa\|evm.model.tig00001384.4 (tig00001384_g8553.t1)	0.69	0.37	0.26	0.42	0.4	0.33	0.52	0.68	0.54	0.49	0.49	0.33	0.5	0.21	0.17	0.2	0.23	0.41	0.33	0.24	0.06	1.0	0.41	0.4	0.75	0.45
Cpa\|evm.model.tig00001408.3 (tig00001408_g8599.t1)	0.13	0.28	0.31	0.41	0.48	0.54	0.4	0.38	0.34	0.41	0.38	0.32	0.16	0.22	0.27	0.26	0.3	0.38	0.34	0.3	0.13	1.0	0.31	0.43	0.71	0.34
Cpa\|evm.model.tig00001545.4 (tig00001545_g9334.t1)	0.63	0.39	0.37	0.52	0.6	0.62	0.87	0.77	0.68	0.77	0.69	0.65	0.56	0.43	0.32	0.26	0.58	0.59	0.43	0.55	0.03	0.77	0.29	0.24	1.0	0.59
Cpa\|evm.model.tig00001706.4 (tig00000449_g932.t1)	0.32	0.29	0.3	0.34	0.39	0.53	0.43	0.46	0.52	0.42	0.38	0.32	0.27	0.3	0.24	0.24	0.2	0.37	0.35	0.29	0.13	1.0	0.37	0.53	0.33	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020510.156 (tig00020510_g9941.t1)	0.49	0.33	0.39	0.42	0.46	0.42	0.5	0.46	0.41	0.42	0.41	0.4	0.51	0.31	0.22	0.25	0.25	0.49	0.43	0.42	0.05	1.0	0.35	0.47	0.71	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020516.19 (tig00020516_g9967.t1)	0.52	0.57	0.36	0.22	0.16	0.23	0.21	0.35	0.37	0.3	0.34	0.36	0.48	0.18	0.13	0.15	0.24	0.19	0.21	0.19	0.13	0.69	0.4	0.28	1.0	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020531.12 (tig00020531_g10011.t1)	0.58	0.54	0.65	0.73	0.73	0.74	0.86	0.8	0.83	0.8	0.8	0.84	0.77	0.66	0.41	0.63	0.53	0.55	0.57	0.51	0.64	1.0	0.63	0.7	0.76	0.85
Cpa\|evm.model.tig00020537.61 (tig00020537_g10286.t1)	0.47	0.26	0.24	0.47	0.5	0.35	0.46	0.4	0.33	0.33	0.4	0.42	0.53	0.37	0.25	0.35	0.22	0.2	0.15	0.2	0.04	0.9	0.28	0.5	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020537.66 (tig00020537_g10291.t1)	0.61	0.68	0.77	0.93	1.0	0.89	0.93	0.93	0.87	0.83	0.87	0.85	0.67	0.72	0.55	0.53	0.62	0.49	0.63	0.48	0.57	0.94	0.63	0.48	0.9	0.73
Cpa\|evm.model.tig00020539.52 (tig00020539_g10442.t1)	0.44	0.29	0.19	0.25	0.27	0.24	0.43	0.54	0.56	0.62	0.61	0.5	0.47	0.67	0.35	0.28	0.29	0.33	0.24	0.27	0.52	1.0	0.36	0.33	0.58	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020556.6 (tig00020556_g10977.t1)	0.2	0.22	0.24	0.39	0.46	0.36	0.39	0.35	0.38	0.32	0.43	0.38	0.23	0.35	0.32	0.34	0.2	0.26	0.26	0.17	0.03	1.0	0.28	0.4	0.85	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020562.27 (tig00020562_g11153.t1)	0.32	0.2	0.26	0.51	0.41	0.35	0.64	0.67	0.63	0.4	0.37	0.37	0.35	0.35	0.3	0.44	0.39	0.48	0.34	0.31	0.11	1.0	0.5	0.37	0.76	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020685.5 (tig00020685_g12920.t1)	0.38	0.39	0.37	0.63	0.58	0.38	0.65	0.82	0.76	0.82	0.92	0.73	0.37	0.36	0.34	0.29	0.34	0.4	0.39	0.33	0.37	1.0	0.48	0.53	0.75	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020693.39 (tig00020693_g13050.t1)	0.62	0.37	0.29	0.66	0.68	0.46	0.5	0.55	0.62	0.62	0.87	0.8	0.67	0.24	0.17	0.19	0.17	0.23	0.17	0.16	0.55	0.79	0.76	1.0	0.56	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020911.50 (tig00020911_g15753.t1)	0.35	0.39	0.41	0.51	0.59	0.55	0.61	0.63	0.75	0.7	0.68	0.62	0.32	0.35	0.29	0.28	0.33	0.54	0.43	0.39	0.14	1.0	0.3	0.65	0.68	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020912.40 (tig00020912_g15812.t1)	0.81	0.56	0.45	0.9	0.87	0.65	0.9	0.99	0.91	0.88	1.0	0.75	0.73	0.4	0.26	0.35	0.22	0.42	0.33	0.19	0.65	0.96	0.51	0.68	0.56	0.52
Cpa\|evm.model.tig00020961.51 (tig00020961_g16673.t1)	0.45	0.3	0.36	0.55	0.54	0.44	0.65	0.64	0.51	0.4	0.38	0.33	0.4	0.34	0.34	0.43	0.43	0.45	0.45	0.36	0.08	1.0	0.46	0.46	0.81	0.49
Cpa\|evm.model.tig00021043.10 (tig00021043_g17619.t1)	0.46	0.34	0.3	0.44	0.46	0.33	0.43	0.44	0.31	0.32	0.37	0.34	0.45	0.22	0.2	0.29	0.21	0.36	0.33	0.24	0.07	1.0	0.25	0.37	0.77	0.55
Cpa\|evm.model.tig00021105.28 (tig00000158_g10159.t1)	0.53	0.5	0.5	0.82	0.67	0.44	0.73	0.88	0.68	0.75	0.8	0.58	0.5	0.66	0.5	0.54	0.79	0.47	0.39	0.56	0.15	0.81	0.32	0.34	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021133.11 (tig00021133_g18910.t1)	0.42	0.42	0.41	0.5	0.66	0.81	0.61	0.5	0.68	0.6	0.6	0.59	0.42	0.48	0.37	0.46	0.36	0.48	0.33	0.37	0.3	1.0	0.58	0.62	0.41	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021350.18 (tig00021350_g20635.t1)	0.46	0.44	0.4	0.41	0.46	0.56	0.34	0.36	0.47	0.35	0.37	0.28	0.27	0.29	0.25	0.26	0.34	0.31	0.43	0.37	0.13	1.0	0.62	0.29	1.0	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021441.12 (tig00021441_g21556.t1)	0.44	0.42	0.28	0.47	0.57	0.59	0.62	0.66	0.71	0.67	0.77	0.76	0.37	0.44	0.34	0.39	0.31	0.54	0.36	0.37	0.4	0.86	0.56	1.0	0.69	0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)