Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000073.28 (tig00000073_g1710.t1)	0.27	0.07	0.14	0.27	0.56	0.65	0.96	1.0	0.86	0.63	0.72	0.38	0.27	0.49	0.05	0.25	0.56	0.41	0.33	0.3	0.01	0.03	0.0	0.03	0.33	0.12
Cpa\|evm.model.tig00000076.124 (tig00000076_g2422.t1)	0.3	0.1	0.19	0.29	0.53	0.44	0.58	0.53	0.69	0.86	0.96	1.0	0.56	0.18	0.16	0.14	0.16	0.26	0.26	0.2	0.01	0.03	0.24	0.28	0.25	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000076.125 (tig00000076_g2422.t1)	0.12	0.17	0.25	0.2	0.38	0.41	0.6	0.55	0.61	0.7	0.66	0.96	0.59	0.06	0.13	0.11	0.16	0.24	0.2	0.16	0.04	0.03	1.0	0.08	0.26	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000093.158 (tig00000093_g3587.t1)	0.79	0.69	0.59	0.48	0.5	0.67	0.64	0.69	0.85	0.93	1.0	0.93	0.79	0.63	0.75	0.58	0.79	0.6	0.69	0.67	0.18	0.28	0.97	0.88	0.41	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000123.12 (tig00000123_g6918.t1)	0.5	0.26	0.33	0.39	0.63	0.94	0.89	0.85	0.84	0.98	0.98	1.0	0.56	0.19	0.38	0.57	0.33	0.33	0.41	0.58	0.13	0.16	0.75	0.89	0.33	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000144.40 (tig00000144_g9031.t1)	0.74	0.73	0.71	0.73	0.77	0.74	0.86	0.79	1.0	0.96	0.92	0.89	0.73	0.5	0.49	0.57	0.39	0.45	0.48	0.43	0.17	0.67	0.56	0.44	0.62	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000178.23 (tig00000178_g12734.t1)	0.59	0.4	0.46	0.71	0.72	0.68	0.94	1.0	0.99	0.89	0.92	0.86	0.59	0.39	0.35	0.44	0.38	0.51	0.43	0.31	0.2	0.47	0.43	0.28	0.32	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000190.52 (tig00000190_g13870.t1)	0.23	0.23	0.14	0.18	0.39	0.66	0.73	0.51	1.0	0.77	0.56	0.59	0.18	0.14	0.2	0.26	0.21	0.32	0.37	0.21	0.08	0.25	0.85	0.68	0.23	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000194.72 (tig00000194_g14804.t1)	0.3	0.43	0.5	0.74	0.78	0.78	0.88	0.76	1.0	0.95	0.96	0.97	0.24	0.56	0.54	0.71	0.3	0.38	0.36	0.31	0.12	0.27	0.7	0.8	0.59	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000241.168 (tig00000241_g21034.t1)	0.4	0.15	0.21	0.36	0.47	0.52	0.62	0.57	0.55	0.86	1.0	0.77	0.45	0.11	0.03	0.08	0.01	0.04	0.05	0.1	0.01	0.01	0.45	0.18	0.04	0.09
Cpa\|evm.model.tig00000241.169 (tig00000241_g21035.t1)	0.27	0.13	0.1	0.35	0.44	0.44	0.51	0.48	0.29	0.75	0.85	0.7	0.37	0.12	0.0	0.09	0.0	0.04	0.05	0.08	0.02	0.02	1.0	0.04	0.06	0.1
Cpa\|evm.model.tig00000241.170 (tig00000241_g21036.t1)	0.37	0.16	0.14	0.25	0.33	0.37	0.31	0.46	0.37	0.95	1.0	0.85	0.17	0.31	0.04	0.05	0.0	0.07	0.07	0.04	0.03	0.0	0.65	0.03	0.0	0.03
Cpa\|evm.model.tig00000241.171 (tig00000241_g21037.t1)	0.38	0.09	0.18	0.34	0.44	0.52	0.59	0.55	0.41	0.7	1.0	0.63	0.43	0.14	0.03	0.04	0.01	0.06	0.05	0.15	0.0	0.55	0.58	0.05	0.03	0.11
Cpa\|evm.model.tig00000241.172 (tig00020892_g14913.t1)	0.41	0.11	0.26	0.31	0.5	0.43	0.61	0.47	0.38	0.84	1.0	0.72	0.33	0.17	0.01	0.08	0.01	0.07	0.08	0.12	0.0	0.03	0.7	0.06	0.05	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000269.85 (tig00000269_g23741.t1)	0.37	0.27	0.12	0.34	0.52	0.38	0.33	0.37	0.62	0.73	1.0	0.75	0.4	0.09	0.03	0.03	0.12	0.09	0.19	0.15	0.09	0.06	0.34	0.51	0.15	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000310.58 (tig00000310_g23983.t1)	0.38	0.38	0.5	0.59	0.67	0.69	0.74	0.71	0.76	0.9	1.0	0.87	0.44	0.11	0.15	0.08	0.39	0.38	0.3	0.45	0.06	0.2	0.13	0.5	0.39	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000430.36 (tig00000430_g619.t1)	0.18	0.24	0.26	0.31	0.44	0.59	0.66	0.5	1.0	0.59	0.61	0.63	0.17	0.41	0.37	0.29	0.35	0.38	0.38	0.37	0.08	0.16	0.47	0.3	0.35	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000444.4 (tig00000444_g794.t1)	0.65	0.55	0.57	0.74	0.8	0.8	0.92	0.9	1.0	0.9	0.96	0.95	0.6	0.67	0.47	0.65	0.36	0.58	0.44	0.33	0.16	0.74	0.43	0.41	0.42	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000455.30 (tig00000455_g1021.t1)	0.39	0.21	0.23	0.36	0.51	0.48	0.53	0.58	0.63	0.78	0.89	1.0	0.59	0.13	0.16	0.12	0.13	0.18	0.09	0.24	0.15	0.57	0.45	0.45	0.32	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000480.46 (tig00000480_g1314.t1)	0.33	0.09	0.06	0.15	0.19	0.49	0.99	1.0	0.85	0.85	0.72	0.58	0.3	0.14	0.17	0.1	0.23	0.35	0.28	0.29	0.01	0.02	0.17	0.17	0.44	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000507.20 (tig00000507_g1774.t1)	0.11	0.22	0.6	0.64	0.49	0.47	0.6	0.65	0.8	1.0	0.93	0.86	0.12	0.37	0.34	0.31	0.3	0.47	0.43	0.54	0.05	0.35	0.83	0.29	0.8	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000786.2 (tig00000786_g4050.t1)	0.46	0.49	0.41	0.68	0.71	0.54	0.66	0.78	0.93	0.99	0.96	1.0	0.43	0.27	0.35	0.24	0.38	0.47	0.39	0.31	0.01	0.04	0.42	0.32	0.34	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000823.33 (tig00000823_g4559.t1)	0.64	0.56	0.52	0.72	0.89	0.86	0.9	0.74	0.81	0.84	0.87	0.81	0.71	1.0	0.64	0.84	0.51	0.73	0.52	0.6	0.04	0.59	0.29	0.49	0.62	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000912.48 (tig00000912_g5452.t1)	0.13	0.06	0.03	0.04	0.19	0.77	1.0	0.77	0.99	0.75	0.57	0.35	0.21	0.16	0.17	0.07	0.22	0.2	0.24	0.25	0.08	0.14	0.35	0.22	0.23	0.11
Cpa\|evm.model.tig00000955.27 (tig00000955_g5803.t1)	0.28	0.31	0.57	0.42	0.4	0.29	0.39	0.23	0.41	0.59	1.0	0.82	0.3	0.53	0.13	0.09	0.02	0.0	0.05	0.0	0.1	0.53	0.55	0.2	0.37	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000984.24 (tig00000984_g6001.t1)	0.65	0.51	0.55	0.52	0.51	0.6	0.66	0.72	0.8	0.89	0.97	1.0	0.59	0.36	0.56	0.45	0.55	0.63	0.62	0.68	0.24	0.4	0.74	0.84	0.41	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001024.37 (tig00001024_g6345.t1)	0.74	0.36	0.26	0.37	0.53	0.5	0.85	1.0	0.66	0.85	0.96	0.68	0.59	0.14	0.21	0.15	0.27	0.27	0.29	0.23	0.01	0.12	0.16	0.15	0.22	0.12
Cpa\|evm.model.tig00001033.13 (tig00001033_g6492.t1)	0.13	0.2	0.29	0.46	0.67	0.83	0.5	0.58	0.89	0.88	1.0	0.61	0.08	0.2	0.21	0.28	0.28	0.3	0.35	0.39	0.09	0.16	0.79	0.39	0.5	0.31
Cpa\|evm.model.tig00001056.16 (tig00001056_g6639.t1)	0.42	0.27	0.24	0.27	0.31	0.14	0.31	0.19	0.72	0.83	1.0	0.77	0.32	0.4	0.13	0.33	0.05	0.03	0.03	0.05	0.26	0.13	0.65	0.64	0.15	0.38
Cpa\|evm.model.tig00001471.17 (tig00001471_g8879.t1)	0.4	0.43	0.48	0.49	0.58	0.57	0.57	0.66	0.73	0.93	1.0	0.86	0.47	0.29	0.48	0.66	0.36	0.34	0.45	0.43	0.06	0.34	0.76	0.52	0.42	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001600.4 (tig00001600_g9388.t1)	0.31	0.27	0.43	0.57	0.72	0.7	0.75	0.72	0.84	0.85	1.0	0.91	0.37	0.38	0.39	0.4	0.39	0.37	0.42	0.48	0.12	0.33	0.72	0.64	0.4	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020553.142 (tig00020553_g10632.t2)	0.5	0.19	0.13	0.1	0.28	0.57	0.93	1.0	0.8	0.68	0.65	0.43	0.51	0.31	0.13	0.14	0.22	0.26	0.22	0.22	0.0	0.0	0.01	0.06	0.05	0.07
Cpa\|evm.model.tig00020560.18 (tig00020560_g11083.t1)	0.17	0.47	0.28	0.58	0.4	0.46	0.48	0.36	0.42	0.7	1.0	0.83	0.09	0.13	0.12	0.01	0.08	0.15	0.21	0.13	0.22	0.39	0.43	0.42	0.27	0.19
Cpa\|evm.model.tig00020571.23 (tig00020571_g11498.t1)	0.47	0.46	0.59	0.71	0.78	0.75	0.82	0.84	0.97	0.97	1.0	0.99	0.65	0.53	0.48	0.5	0.51	0.56	0.46	0.49	0.1	0.39	0.63	0.53	0.35	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020603.38 (tig00020603_g11769.t1)	0.57	0.56	0.64	0.76	0.89	0.93	0.93	0.89	1.0	0.97	0.9	0.85	0.55	0.98	0.69	0.94	0.59	0.69	0.6	0.59	0.18	0.79	0.44	0.63	0.69	0.7
Cpa\|evm.model.tig00020629.137 (tig00020629_g12466.t1)	0.47	0.46	0.43	0.55	0.83	0.75	0.81	0.77	0.95	1.0	1.0	0.83	0.42	0.92	0.4	0.83	0.4	0.46	0.41	0.47	0.05	0.59	0.37	0.46	0.41	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020816.59 (tig00020816_g14145.t1)	0.12	0.05	0.17	0.14	0.15	0.34	0.51	0.29	0.48	0.82	1.0	0.52	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.19	0.01	0.39	0.0	0.02	0.02
Cpa\|evm.model.tig00020816.82 (tig00020816_g14170.t1)	0.08	0.09	0.01	0.23	0.2	0.14	0.39	0.38	0.36	0.66	1.0	0.58	0.14	0.07	0.01	0.08	0.07	0.02	0.0	0.03	0.16	0.06	0.38	0.56	0.17	0.2
Cpa\|evm.model.tig00020848.33 (tig00020848_g14560.t1)	0.44	0.22	0.34	0.58	0.69	0.73	0.86	0.9	1.0	0.97	0.92	0.78	0.45	0.51	0.44	0.55	0.42	0.54	0.5	0.44	0.12	0.24	0.48	0.49	0.48	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020849.21 (tig00020571_g11500.t1)	0.37	0.44	0.54	0.77	0.87	0.77	0.91	0.82	0.78	0.84	1.0	0.99	0.68	0.42	0.37	0.99	0.37	0.52	0.35	0.38	0.06	0.54	0.54	0.37	0.5	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020892.17 (tig00020892_g14919.t1)	0.58	0.7	0.76	0.84	0.9	0.84	0.91	0.82	0.96	0.88	0.84	0.71	0.53	0.39	0.41	1.0	0.45	0.55	0.48	0.54	0.12	0.79	0.34	0.44	0.79	0.69
Cpa\|evm.model.tig00020911.63 (tig00020911_g15767.t1)	0.14	0.25	0.21	0.39	0.52	0.5	0.57	0.47	0.67	0.75	1.0	0.59	0.09	0.08	0.09	0.24	0.06	0.21	0.04	0.11	0.03	0.02	0.76	0.21	0.31	0.17
Cpa\|evm.model.tig00020912.55 (tig00020912_g15827.t1)	0.71	0.5	0.54	0.69	0.81	0.75	0.97	0.86	1.0	0.9	0.9	0.81	0.78	0.38	0.49	0.46	0.36	0.39	0.38	0.37	0.16	0.61	0.55	0.49	0.53	0.52
Cpa\|evm.model.tig00020912.62 (tig00020912_g15833.t1)	0.37	0.35	0.33	0.33	0.43	0.49	0.58	0.57	0.69	0.9	1.0	0.89	0.48	0.17	0.26	0.23	0.18	0.17	0.2	0.26	0.02	0.23	0.3	0.35	0.27	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020943.34 (tig00020943_g16276.t1)	0.22	0.22	0.33	0.19	0.18	0.18	0.2	0.2	0.44	0.61	0.98	1.0	0.22	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.17	0.11	0.02	0.06
Cpa\|evm.model.tig00020951.59 (tig00020951_g16463.t1)	0.34	0.42	0.42	0.41	0.39	0.31	0.48	0.52	0.74	0.96	1.0	0.93	0.44	0.05	0.1	0.06	0.21	0.35	0.24	0.43	0.22	0.36	0.57	0.46	0.27	0.22
Cpa\|evm.model.tig00020952.32 (tig00020952_g16489.t1)	0.41	0.47	0.57	0.79	0.74	0.7	0.81	0.86	0.84	0.76	0.8	0.91	0.53	0.44	0.4	1.0	0.42	0.57	0.39	0.36	0.07	0.65	0.68	0.73	0.47	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021015.24	0.69	0.51	0.36	0.47	0.54	0.5	0.67	0.69	0.77	0.88	1.0	0.85	0.81	0.1	0.13	0.17	0.08	0.14	0.09	0.08	0.04	0.04	0.27	0.62	0.13	0.14
Cpa\|evm.model.tig00021319.6 (tig00021319_g20201.t1)	0.17	0.23	0.31	0.49	0.7	0.85	0.96	0.84	0.93	0.94	1.0	0.85	0.16	0.95	0.73	0.72	0.54	0.48	0.39	0.35	0.01	0.53	0.14	0.26	0.6	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021339.56 (tig00021339_g20444.t1)	0.18	0.38	0.28	0.39	0.46	0.44	0.54	0.54	0.75	0.89	1.0	0.98	0.24	0.04	0.05	0.04	0.14	0.1	0.07	0.09	0.07	0.0	0.24	0.72	0.27	0.21
Cpa\|evm.model.tig00021569.20 (tig00021569_g22351.t1)	0.25	0.3	0.3	0.28	0.24	0.17	0.08	0.17	0.24	0.55	1.0	0.97	0.15	0.0	0.02	0.05	0.0	0.08	0.08	0.1	0.25	0.01	0.15	0.11	0.14	0.04
Cpa\|evm.model.tig00022075.80 (tig00022075_g23641.t1)	0.41	0.29	0.3	0.42	0.66	0.64	0.81	0.78	1.0	0.86	0.71	0.56	0.39	0.32	0.24	0.31	0.28	0.41	0.38	0.44	0.06	0.03	0.66	0.43	0.62	0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)