Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.21 0.3 0.29 0.36 0.19 0.17 0.2 0.26 0.2 0.23 0.21 0.33 0.25 0.17 0.23 0.16 0.23 0.39 0.15 0.25 0.47 0.4 0.28 0.31 1.0 0.71
0.29 0.2 0.28 0.27 0.32 0.37 0.23 0.1 0.23 0.12 0.16 0.08 0.3 0.21 0.14 0.08 0.26 0.51 0.49 0.19 1.0 0.82 0.53 0.2 0.91 0.76
Cpa|evm.model.tig00000113.62 (tig00000113_g5639.t1)
0.95 0.85 0.65 0.64 0.55 0.35 0.41 0.4 0.38 0.39 0.45 0.55 1.0 0.7 0.27 0.63 0.48 0.43 0.28 0.37 0.35 0.47 0.32 0.45 0.71 0.49
Cpa|evm.model.tig00000133.20 (tig00000133_g7681.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.33
Cpa|evm.model.tig00000142.17 (tig00000142_g8652.t1)
0.67 0.42 0.33 0.22 0.2 0.13 0.2 0.23 0.08 0.11 0.12 0.2 0.75 0.14 0.1 0.17 0.11 0.2 0.25 0.15 0.36 0.05 0.16 0.07 1.0 0.34
Cpa|evm.model.tig00000204.22 (tig00000204_g17691.t1)
0.75 0.45 0.43 0.45 0.36 0.37 0.33 0.46 0.33 0.35 0.54 0.87 0.96 0.29 0.24 0.41 0.28 0.36 0.25 0.28 0.77 0.37 0.8 0.74 1.0 0.59
Cpa|evm.model.tig00000237.6 (tig00000237_g20455.t1)
0.6 0.38 0.29 0.26 0.23 0.17 0.19 0.24 0.13 0.09 0.17 0.28 0.69 0.21 0.17 0.31 0.16 0.18 0.13 0.1 0.77 0.38 0.25 0.31 1.0 0.34
Cpa|evm.model.tig00000241.151 (tig00000241_g21016.t1)
0.43 0.43 0.43 0.48 0.39 0.32 0.28 0.32 0.24 0.22 0.28 0.28 0.51 0.24 0.23 0.26 0.36 0.39 0.26 0.27 0.48 1.0 0.53 0.36 0.95 0.83
Cpa|evm.model.tig00000262.25 (tig00000262_g23078.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 1.0 0.52
Cpa|evm.model.tig00000310.54 (tig00020592_g11660.t2)
0.25 0.2 0.22 0.26 0.29 0.2 0.25 0.25 0.3 0.32 0.34 0.37 0.3 0.41 0.23 0.3 0.2 0.35 0.24 0.18 0.44 0.79 0.37 0.75 1.0 0.59
Cpa|evm.model.tig00000350.54 (tig00000350_g24352.t1)
0.95 0.41 0.28 0.32 0.19 0.09 0.1 0.23 0.11 0.21 0.37 0.39 0.92 0.27 0.23 0.31 0.11 0.49 0.33 0.39 0.17 0.72 0.17 0.57 1.0 0.6
Cpa|evm.model.tig00000405.49 (tig00000405_g481.t1)
0.12 0.25 0.29 0.4 0.37 0.37 0.49 0.46 0.49 0.45 0.4 0.37 0.07 0.33 0.22 0.26 0.27 0.43 0.25 0.27 0.38 0.58 0.75 0.41 1.0 0.64
0.45 0.36 0.35 0.4 0.36 0.33 0.42 0.43 0.38 0.45 0.43 0.53 0.53 0.5 0.36 0.41 0.23 0.46 0.36 0.27 0.35 0.97 0.54 0.69 1.0 0.64
Cpa|evm.model.tig00000448.58 (tig00020592_g11660.t2)
0.26 0.24 0.17 0.21 0.22 0.15 0.24 0.25 0.25 0.29 0.27 0.33 0.32 0.32 0.18 0.28 0.17 0.35 0.27 0.13 0.26 0.61 0.29 0.31 1.0 0.49
Cpa|evm.model.tig00000480.34 (tig00000480_g1303.t1)
0.49 0.43 0.49 0.51 0.53 0.6 0.62 0.69 0.71 0.63 0.62 0.62 0.45 0.43 0.43 0.37 0.43 0.65 0.53 0.53 0.47 0.9 0.8 0.94 1.0 0.94
Cpa|evm.model.tig00000498.69 (tig00000310_g23978.t1)
0.26 0.29 0.21 0.18 0.23 0.2 0.27 0.22 0.32 0.37 0.39 0.32 0.44 0.32 0.13 0.31 0.17 0.53 0.22 0.23 0.61 0.58 0.8 0.57 1.0 0.55
Cpa|evm.model.tig00000581.23 (tig00000581_g2229.t1)
0.43 0.38 0.32 0.36 0.34 0.26 0.36 0.37 0.32 0.3 0.32 0.32 0.52 0.31 0.3 0.34 0.23 0.4 0.28 0.22 0.43 0.37 0.49 0.37 1.0 0.44
Cpa|evm.model.tig00000586.12 (tig00000670_g3044.t1)
0.03 0.0 0.0 0.15 0.13 0.16 0.0 0.07 0.04 0.11 0.11 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.53 0.09 0.08 0.0 1.0 0.37
Cpa|evm.model.tig00000615.51 (tig00000615_g2581.t1)
0.2 0.23 0.21 0.24 0.18 0.06 0.06 0.12 0.11 0.04 0.11 0.17 0.15 0.05 0.06 0.04 0.11 0.15 0.11 0.09 0.65 0.61 0.17 0.31 0.87 1.0
Cpa|evm.model.tig00000658.13 (tig00000658_g2906.t1)
0.36 0.32 0.25 0.26 0.31 0.45 0.38 0.29 0.3 0.29 0.26 0.33 0.29 0.17 0.18 0.16 0.14 0.42 0.21 0.2 0.59 0.25 0.57 1.0 0.77 0.56
Cpa|evm.model.tig00000704.23 (tig00000704_g3313.t1)
0.84 0.73 0.64 0.59 0.44 0.28 0.34 0.45 0.26 0.26 0.34 0.43 0.97 0.54 0.38 0.44 0.55 0.34 0.37 0.27 0.42 0.5 0.17 0.27 1.0 0.73
Cpa|evm.model.tig00000704.24 (tig00000704_g3314.t1)
0.52 0.47 0.4 0.4 0.27 0.14 0.23 0.3 0.16 0.18 0.22 0.27 0.6 0.36 0.23 0.3 0.36 0.29 0.21 0.17 0.46 0.5 0.18 0.23 1.0 0.62
Cpa|evm.model.tig00000870.30 (tig00000870_g5144.t1)
0.43 0.13 0.16 0.43 0.24 0.11 0.16 0.27 0.17 0.13 0.33 0.23 0.29 0.12 0.04 0.05 0.05 0.08 0.07 0.05 0.8 1.0 0.94 0.98 0.78 0.51
Cpa|evm.model.tig00000981.18 (tig00000981_g5872.t1)
0.82 0.39 0.28 0.25 0.18 0.12 0.24 0.34 0.12 0.27 0.31 0.41 1.0 0.29 0.21 0.26 0.19 0.48 0.25 0.19 0.28 0.3 0.24 0.15 0.71 0.45
Cpa|evm.model.tig00001024.16 (tig00001024_g6325.t1)
0.15 0.09 0.08 0.13 0.08 0.06 0.07 0.09 0.04 0.05 0.05 0.06 0.15 0.15 0.06 0.09 0.05 0.1 0.06 0.06 0.35 0.05 0.21 0.11 1.0 0.34
Cpa|evm.model.tig00001065.40 (tig00001065_g6740.t1)
0.54 0.78 0.23 0.26 0.19 0.26 0.51 0.32 0.3 0.32 0.39 0.35 0.6 0.31 0.4 0.38 0.2 0.31 0.39 0.25 0.93 0.15 0.62 0.46 1.0 0.94
Cpa|evm.model.tig00001095.26 (tig00001095_g7043.t1)
0.59 0.3 0.34 0.22 0.06 0.04 0.11 0.23 0.08 0.16 0.25 0.3 0.64 0.21 0.21 0.35 0.24 0.25 0.25 0.22 0.34 0.22 0.1 0.23 1.0 0.47
Cpa|evm.model.tig00001127.21 (tig00001127_g7152.t1)
0.17 0.15 0.11 0.21 0.25 0.31 0.37 0.31 0.37 0.4 0.39 0.27 0.06 0.16 0.16 0.09 0.15 0.39 0.21 0.12 0.59 0.39 0.51 0.28 1.0 0.46
Cpa|evm.model.tig00001668.3 (tig00001668_g9549.t1)
0.51 0.29 0.24 0.42 0.35 0.36 0.29 0.33 0.38 0.28 0.43 0.29 0.34 0.2 0.22 0.17 0.13 0.16 0.18 0.12 0.8 0.97 0.77 0.55 1.0 0.5
Cpa|evm.model.tig00001694.5 (tig00001694_g9570.t1)
0.14 0.26 0.16 0.17 0.18 0.15 0.25 0.3 0.26 0.44 0.34 0.46 0.05 0.28 0.31 0.31 0.13 0.38 0.32 0.18 0.32 0.23 0.59 0.5 1.0 0.54
Cpa|evm.model.tig00020531.52 (tig00020531_g10058.t1)
0.42 0.37 0.35 0.32 0.3 0.33 0.33 0.38 0.42 0.39 0.39 0.36 0.4 0.18 0.2 0.17 0.22 0.39 0.26 0.34 0.39 0.9 0.59 0.58 1.0 0.73
Cpa|evm.model.tig00020610.30 (tig00020610_g11968.t1)
0.2 0.07 0.04 0.29 0.1 0.18 0.23 0.23 0.12 0.06 0.13 0.17 0.1 0.08 0.2 0.09 0.02 0.15 0.1 0.13 0.51 0.17 0.28 0.54 1.0 0.5
Cpa|evm.model.tig00020616.52 (tig00020616_g12285.t1)
0.21 0.14 0.07 0.17 0.15 0.13 0.15 0.12 0.03 0.03 0.05 0.02 0.17 0.07 0.03 0.05 0.04 0.13 0.09 0.05 0.5 0.19 0.16 0.04 1.0 0.24
Cpa|evm.model.tig00020661.2 (tig00020661_g12574.t1)
0.37 0.4 0.29 0.31 0.23 0.23 0.22 0.32 0.26 0.35 0.29 0.21 0.33 0.19 0.25 0.16 0.32 0.36 0.41 0.24 0.53 1.0 0.91 0.37 0.78 0.68
Cpa|evm.model.tig00020723.96 (tig00020723_g13506.t1)
0.38 0.23 0.21 0.33 0.23 0.13 0.24 0.33 0.29 0.39 0.56 0.46 0.44 0.23 0.16 0.26 0.17 0.34 0.26 0.13 0.59 0.97 0.65 0.58 1.0 0.48
Cpa|evm.model.tig00020892.5 (tig00020892_g14907.t1)
0.27 0.16 0.15 0.12 0.15 0.08 0.15 0.11 0.16 0.23 0.35 0.37 0.22 0.14 0.07 0.14 0.15 0.06 0.09 0.04 0.52 0.19 0.27 1.0 0.28 0.43
Cpa|evm.model.tig00020904.74 (tig00020904_g15207.t1)
0.48 0.25 0.17 0.33 0.21 0.13 0.31 0.4 0.39 0.37 0.35 0.27 0.42 0.18 0.13 0.21 0.24 0.35 0.22 0.16 0.42 0.76 0.56 0.56 1.0 0.39
Cpa|evm.model.tig00020908.10 (tig00020908_g15305.t1)
0.14 0.18 0.17 0.22 0.26 0.17 0.13 0.2 0.09 0.12 0.2 0.1 0.19 0.11 0.1 0.06 0.07 0.12 0.11 0.07 0.72 1.0 0.63 0.42 0.9 0.49
Cpa|evm.model.tig00020908.9 (tig00020908_g15305.t1)
0.1 0.13 0.05 0.35 0.09 0.11 0.07 0.15 0.06 0.1 0.11 0.09 0.07 0.08 0.06 0.02 0.01 0.06 0.06 0.03 0.99 1.0 0.91 0.84 0.92 0.65
Cpa|evm.model.tig00020911.40 (tig00020911_g15744.t1)
0.16 0.08 0.06 0.15 0.11 0.06 0.1 0.11 0.11 0.09 0.14 0.08 0.09 0.07 0.05 0.06 0.05 0.12 0.1 0.05 0.73 1.0 0.36 0.49 0.97 0.37
Cpa|evm.model.tig00020912.98 (tig00020912_g15865.t1)
0.46 0.37 0.33 0.42 0.44 0.32 0.36 0.4 0.47 0.56 0.6 0.63 0.55 0.59 0.61 0.63 0.42 0.64 0.45 0.32 0.23 1.0 0.71 0.82 0.87 0.59
Cpa|evm.model.tig00020927.48 (tig00020927_g15978.t1)
1.0 0.76 0.56 0.61 0.49 0.28 0.27 0.31 0.22 0.28 0.32 0.41 0.93 0.68 0.41 0.42 0.48 0.39 0.33 0.32 0.2 0.8 0.26 0.65 0.95 0.7
Cpa|evm.model.tig00020934.23 (tig00020934_g16090.t1)
0.34 0.29 0.32 0.39 0.49 0.37 0.46 0.48 0.47 0.4 0.5 0.39 0.41 0.32 0.22 0.3 0.24 0.47 0.36 0.37 0.47 0.48 0.81 0.56 1.0 0.57
Cpa|evm.model.tig00020961.136 (tig00020961_g16757.t1)
0.58 0.47 0.46 0.43 0.33 0.22 0.2 0.28 0.16 0.15 0.14 0.19 0.48 0.21 0.23 0.28 0.21 0.29 0.25 0.21 0.4 0.4 0.33 0.19 1.0 0.49
Cpa|evm.model.tig00021038.88 (tig00021038_g17577.t1)
0.04 0.02 0.13 0.3 0.48 0.58 0.61 0.36 0.45 0.56 0.53 0.46 0.08 0.48 0.13 0.33 0.21 0.38 0.32 0.41 0.43 0.54 0.74 0.93 1.0 0.72
Cpa|evm.model.tig00021070.10 (tig00021070_g17819.t1)
0.77 0.63 0.54 0.66 0.44 0.19 0.22 0.31 0.21 0.32 0.46 0.6 1.0 0.63 0.38 0.53 0.34 0.43 0.23 0.29 0.41 0.7 0.44 0.44 0.85 0.77
Cpa|evm.model.tig00021126.2 (tig00021126_g18455.t1)
0.64 0.57 0.33 0.29 0.37 0.54 0.72 0.69 0.73 0.64 0.6 0.51 0.52 0.22 0.21 0.18 0.43 0.69 0.55 0.51 0.35 1.0 0.81 0.75 1.0 0.62
Cpa|evm.model.tig00021126.20 (tig00021126_g18469.t1)
0.81 0.26 0.28 0.3 0.19 0.11 0.17 0.25 0.09 0.17 0.23 0.34 1.0 0.25 0.16 0.17 0.24 0.24 0.15 0.12 0.29 0.21 0.18 0.2 0.65 0.48
Cpa|evm.model.tig00021127.153 (tig00021127_g18834.t1)
0.17 0.22 0.18 0.15 0.13 0.13 0.19 0.28 0.07 0.12 0.17 0.23 0.35 0.13 0.08 0.14 0.15 0.19 0.13 0.16 0.49 0.08 0.33 0.13 1.0 0.39
Cpa|evm.model.tig00021135.6 (tig00021135_g18928.t1)
0.26 0.2 0.12 0.12 0.15 0.16 0.13 0.2 0.08 0.11 0.11 0.17 0.26 0.19 0.14 0.4 0.22 0.05 0.1 0.26 0.88 0.37 0.66 0.07 0.95 1.0
Cpa|evm.model.tig00021244.41 (tig00021244_g19599.t1)
0.58 0.48 0.45 0.35 0.44 0.19 0.17 0.28 0.25 0.27 0.32 0.55 0.54 0.25 0.24 0.24 0.21 0.25 0.32 0.19 0.73 0.49 0.68 0.39 1.0 0.54
Cpa|evm.model.tig00021434.5 (tig00021434_g21301.t1)
0.16 0.14 0.14 0.26 0.18 0.11 0.18 0.23 0.25 0.25 0.36 0.31 0.15 0.19 0.08 0.18 0.23 0.17 0.15 0.13 0.36 0.55 0.69 0.6 1.0 0.31
Cpa|evm.model.tig00021463.8 (tig00021463_g21617.t1)
0.1 0.29 0.23 0.23 0.25 0.31 0.32 0.39 0.43 0.46 0.48 0.51 0.23 0.32 0.3 0.36 0.34 0.36 0.37 0.23 0.33 0.52 0.67 0.59 1.0 0.35
Cpa|evm.model.tig00021501.5 (tig00021501_g21945.t1)
0.27 0.11 0.1 0.15 0.14 0.06 0.12 0.13 0.15 0.19 0.21 0.18 0.27 0.21 0.1 0.13 0.12 0.16 0.13 0.08 0.51 0.55 0.29 0.62 1.0 0.55
Cpa|evm.model.tig00021582.39 (tig00021582_g22636.t1)
0.69 0.36 0.24 0.2 0.14 0.11 0.23 0.26 0.08 0.12 0.16 0.19 0.84 0.29 0.25 0.31 0.22 0.27 0.21 0.16 0.36 0.26 0.29 0.16 1.0 0.47
Cpa|evm.model.tig00021717.8 (tig00021719_g23147.t1)
0.17 0.03 0.03 0.3 0.17 0.06 0.04 0.11 0.12 0.14 0.26 0.12 0.09 0.01 0.01 0.01 0.04 0.05 0.02 0.02 0.58 1.0 0.81 0.98 0.67 0.22
Cpa|evm.model.tig00021720.12 (tig00021720_g23182.t1)
0.07 0.09 0.11 0.07 0.09 0.11 0.13 0.13 0.09 0.11 0.12 0.14 0.12 0.16 0.12 0.2 0.18 0.2 0.16 0.11 0.28 0.15 0.37 0.29 1.0 0.3
Cpa|evm.model.tig00021795.10 (tig00021795_g23527.t1)
0.1 0.16 0.16 0.2 0.07 0.13 0.2 0.27 0.37 0.32 0.35 0.24 0.09 0.16 0.2 0.16 0.14 0.35 0.12 0.11 0.34 0.26 0.36 0.3 1.0 0.3
Cpa|evm.model.tig00021795.21 (tig00021795_g23541.t1)
0.53 0.4 0.35 0.35 0.25 0.22 0.27 0.26 0.22 0.15 0.25 0.31 0.53 0.12 0.16 0.18 0.13 0.18 0.17 0.14 0.51 0.27 0.49 0.72 1.0 0.53
Cpa|evm.model.tig00021796.1 (tig00021796_g23547.t2)
0.79 0.8 0.47 0.47 0.37 0.31 0.36 0.42 0.24 0.29 0.37 0.46 0.78 0.26 0.3 0.31 0.37 0.3 0.46 0.26 0.66 0.38 0.5 0.53 1.0 0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)