1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000076.147 (tig00000076_g2439.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.61 - 3.17 - 1.61 2.97
Cpa|evm.model.tig00000093.176 (tig00000093_g3611.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 3.3 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000093.28 (tig00000093_g3463.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.25 - - 4.04 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000123.34 (tig00000123_g6940.t1)
 - - - - - - - - - - 2.75 - - - - - - - - - 4.27 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000144.198 (tig00000144_g9192.t1)
 -0.15 - 1.16 0.11 - - - - 0.14 - - 1.25 - - - 1.18 0.39 1.68 1.39 -0.22 0.97 - 1.27 - 0.54 1.16
Cpa|evm.model.tig00000157.23 (tig00000157_g9617.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - 3.95 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000194.90 (tig00000520_g1810.t2)
 - - - 1.98 - - - - - - - - - 1.32 - - - - 1.83 - 3.77 - 1.24 - - -
Cpa|evm.model.tig00000248.59 (tig00001250_g7795.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000249.9 (tig00000073_g1744.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000269.101 (tig00000269_g23762.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - 3.95 - - -
Cpa|evm.model.tig00000269.16 (tig00000269_g23678.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000269.4 (tig00000269_g23678.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000269.47 (tig00000269_g23709.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000269.99 (tig00000269_g23761.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000343.3 (tig00000640_g2787.t1)
 - - - - 2.1 - - - - 2.82 - - - - - - - - - 1.83 3.47 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000382.55 (tig00020564_g11458.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000404.63 (tig00000202_g16612.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000404.65 (tig00000202_g16612.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000411.54 (tig00000411_g559.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000459.46 (tig00000459_g1108.t1)
 -1.27 0.06 -0.31 - 0.49 - - 0.74 0.38 -0.47 1.06 -0.28 -1.72 - -0.52 -2.13 - -0.44 -2.47 -0.62 3.05 -0.64 1.07 -0.82 - 0.4
Cpa|evm.model.tig00000488.20 (tig00020629_g12492.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000492.163 (tig00000492_g1564.t1)
 1.58 - - - - - - - - - - - - 1.3 - - - - - 1.51 0.9 1.49 2.51 - 1.27 2.31
Cpa|evm.model.tig00000545.22 (tig00000076_g2447.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 2.7 2.26 - - - - - 3.88 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000572.1 (tig00000572_g2205.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000572.6 (tig00000572_g2209.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000595.4 (tig00020564_g11415.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000629.9 (tig00000629_g2676.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000630.20 (tig00000630_g2709.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000654.26 (tig00000022_g4806.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.73 3.75 - - 2.55
Cpa|evm.model.tig00000658.23 (tig00000658_g2912.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - 3.46 - - -
Cpa|evm.model.tig00000767.11 (tig00000767_g3957.t1)
 - - - - - - - - - - 1.34 - - - - - - - - - 2.9 - 4.0 - - -
Cpa|evm.model.tig00000796.4 (tig00020952_g16470.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000821.66 (tig00000821_g4526.t1)
 - -1.51 0.1 -0.08 0.04 0.12 -2.1 1.19 0.57 -0.13 -0.33 0.76 - -3.7 -0.67 -0.8 0.04 0.52 1.25 0.21 0.14 -1.92 0.74 0.12 0.44 0.45
Cpa|evm.model.tig00000829.42 (tig00000829_g4683.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000889.31 (tig00020816_g14217.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000889.44 (tig00000889_g5337.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000939.20 (tig00021720_g23193.t1)
 -1.18 0.34 -1.87 -2.05 -1.7 -0.53 -0.49 0.72 -0.85 -0.96 -0.69 -1.88 0.37 0.15 -1.03 0.83 -0.11 0.17 -0.67 1.68 0.47 0.28 1.46 -0.65 -0.04 -0.13
Cpa|evm.model.tig00000983.11 (tig00000262_g23083.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
0.39 - - - - 0.71 - - - 0.61 - - - - - - - -0.05 0.34 - 4.27 - - - - -
-0.63 -0.49 -0.9 0.03 0.89 1.25 1.12 0.17 0.96 0.55 0.37 -0.09 -0.85 -0.81 -1.64 -1.62 -1.26 -1.38 -0.88 -0.44 1.9 -1.84 -0.45 -2.92 -0.79 -0.72
Cpa|evm.model.tig00001292.20 (tig00001292_g8053.t1)
 -0.8 -0.67 -1.31 -0.82 -0.68 -1.38 -1.17 -0.22 -0.24 0.45 0.27 -0.86 -0.84 -1.65 -0.7 -2.24 -1.02 -1.41 0.09 -2.13 3.57 -1.72 -2.49 -2.3 -1.47 -0.39
Cpa|evm.model.tig00001374.1 (tig00000737_g3819.t1)
 - - - - - - - - - - - - 3.03 - - - - - - - 4.16 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001409.2 (tig00001409_g8622.t1)
 - - - - - - - - - 3.06 - - - - - - - - - - 4.14 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001542.4 (tig00001542_g9311.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020509.24 (tig00020509_g9743.t2)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.83 - - 3.56 - -
Cpa|evm.model.tig00020510.140 (tig00020510_g9927.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020510.34 (tig00020510_g9817.t1)
 - - - - - - - - - - - 1.37 - - - - - - - 1.19 4.4 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020510.84 (tig00000381_g24532.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020531.10 (tig00020531_g10039.t1)
 - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - 4.26 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020539.11 (tig00020539_g10402.t1)
 - - - - - - - - - 3.29 - - - - - 1.78 - - - - 3.67 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020539.14 (tig00020539_g10404.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.33 - - - - - - 2.78 - 3.34 - - 1.99
Cpa|evm.model.tig00020553.117 (tig00020553_g10604.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - 2.69 - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.216 (tig00000903_g5529.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.35 (tig00020553_g10524.t1)
 - - 0.16 - -0.65 - - - - - -0.83 - - - - - 1.25 -0.58 -1.19 - 4.08 - -1.21 - -1.45 1.33
Cpa|evm.model.tig00020553.36 (tig00020553_g10525.t1)
 - - - - 1.56 0.52 1.84 - - - - - - - - - - -0.08 - - 3.9 - 1.13 - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.37 (tig00020553_g10525.t1)
 - - - - 0.1 - 0.21 - - - - - - - - - - - - - 3.81 - 1.69 1.81 0.56 0.63
Cpa|evm.model.tig00020553.38 (tig00020553_g10526.t1)
 - - - - 2.41 - - -0.4 - - - -0.52 - - - -0.47 - -1.15 - - 3.8 -1.0 1.84 - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.39 (tig00020553_g10527.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.43 0.22 - 1.22 -0.06 -
- - - - - - - - - - 2.27 - - - - - - - - - 4.4 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - - 2.34 -
Cpa|evm.model.tig00020675.64 (tig00020675_g12641.t1)
 -0.26 -1.35 -1.09 -0.95 -0.27 -1.75 -0.1 0.26 0.76 -0.33 0.35 -0.68 -0.76 -0.43 -0.42 -1.49 -1.13 -2.26 0.25 -1.46 3.18 -2.83 -0.28 -1.33 -1.12 -0.72
Cpa|evm.model.tig00020685.46 (tig00020685_g12963.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020693.19 (tig00020693_g13025.t1)
 0.82 -1.18 -1.86 0.22 0.39 -1.38 0.69 0.38 -1.92 1.05 0.56 0.29 0.14 -0.46 -2.06 - - -3.52 -0.79 -1.71 1.4 -0.91 1.0 1.2 -0.92 0.73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - - 2.32 - 0.52
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020801.63 (tig00020801_g13948.t1)
 - - - - - - - 1.61 - - - - - - 1.5 - - - - - 4.33 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.29 - - - - - 1.79 3.62 - - - 1.2 2.46
Cpa|evm.model.tig00020902.96 (tig00020902_g15044.t1)
 - - - -2.88 - - - - -2.71 -1.63 - - - - 0.44 0.95 - -1.66 - - 3.44 -1.38 1.3 2.34 -0.8 1.27
Cpa|evm.model.tig00020944.14 (tig00020944_g16357.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020951.22 (tig00021589_g22749.t1)
 - - - -0.69 -0.75 - -0.44 - 1.06 0.82 - - - 0.77 0.69 -0.67 - -1.24 -1.0 -0.97 3.49 - 0.91 - -1.32 0.36
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - - 1.61 -
Cpa|evm.model.tig00021012.2 (tig00021012_g16980.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.22 - 3.54 - - 2.34
Cpa|evm.model.tig00021037.22 (tig00021037_g17428.t1)
 - - - - - - 2.68 2.36 - - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.71 (tig00021038_g17559.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021070.125 (tig00000900_g5351.t1)
 - - - - - - - - - - 2.44 - - - - - 2.71 2.36 - - 3.15 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021072.2 (tig00021072_g17961.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021096.6 (tig00020849_g14661.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021116.12 (tig00021116_g18414.t1)
 - 0.67 - - - - 1.3 0.98 - - - 2.18 - - - - - - 1.74 0.77 0.15 - 1.71 1.69 1.48 -
-0.49 -1.67 -0.68 -0.02 -0.17 -0.8 -0.19 -1.31 -1.05 -0.83 0.07 -0.15 -0.19 0.72 0.79 -1.54 -0.76 0.27 -0.17 0.21 2.48 -1.81 -0.73 0.34 -1.36 0.09
Cpa|evm.model.tig00021318.49 (tig00021318_g20169.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021357.61 (tig00000449_g958.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021374.30 (tig00021374_g21108.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021462.14 (tig00021462_g21579.t1)
 -0.51 - - - - - - - - - - - - - 1.29 - - 1.25 -0.21 - 4.24 -0.46 - - - -
Cpa|evm.model.tig00021535.5 (tig00021535_g22212.t1)
 -0.29 - - 1.38 -0.52 -0.52 -0.22 -0.21 1.03 - - -0.33 - - - - - - - - 3.58 - 1.55 - -1.1 0.4
Cpa|evm.model.tig00021571.2 (tig00021571_g22354.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 3.77 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021608.9 (tig00000788_g4080.t2)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.33 - - - - - - - - -0.37 1.27 - - 1.1 - 1.16 - - - - 4.14 - - - - -
- - - - - - - - - - 2.42 - - - - - - - 2.45 - 3.92 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021742.15 (tig00021742_g23327.t1)
 - - - - - - 0.54 - - - 0.46 - 2.01 2.06 - - - - - - 1.73 - 2.69 0.43 1.5 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.