Heatmap: Cluster_159 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.137 (tig00000042_g15531.t1)	1.0	0.88	0.58	0.56	0.53	0.45	0.44	0.44	0.52	0.56	0.68	0.73	0.67	0.23	0.27	0.17	0.4	0.57	0.48	0.51	0.1	0.73	0.65	0.76	0.61	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000042.16 (tig00000042_g15402.t1)	0.91	0.87	0.89	1.0	0.84	0.64	0.72	0.87	0.63	0.55	0.58	0.65	0.89	0.37	0.38	0.42	0.41	0.62	0.46	0.54	0.46	0.55	0.75	0.58	0.98	0.83
Cpa\|evm.model.tig00000057.81 (tig00000057_g101.t1)	0.7	0.81	0.76	0.71	0.54	0.35	0.25	0.33	0.33	0.41	0.45	0.54	0.54	0.19	0.22	0.15	0.43	0.51	0.48	0.57	0.19	0.97	0.5	0.74	1.0	0.86
Cpa\|evm.model.tig00000073.46 (tig00000073_g1725.t1)	0.84	0.61	0.57	0.49	0.57	0.67	0.73	0.78	0.66	0.64	0.57	0.54	0.72	0.33	0.38	0.34	0.5	0.61	0.67	0.55	0.02	0.59	0.54	0.7	1.0	0.94
Cpa\|evm.model.tig00000076.153 (tig00000076_g2444.t1)	0.55	0.86	0.93	1.0	0.9	0.8	0.59	0.62	0.6	0.39	0.45	0.33	0.39	0.33	0.27	0.22	0.23	0.47	0.6	0.61	0.52	0.22	0.18	0.32	0.57	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000076.70 (tig00000076_g2371.t1)	0.92	0.97	1.0	0.87	0.76	0.69	0.65	0.77	0.73	0.64	0.75	0.73	0.73	0.59	0.57	0.67	0.65	0.72	0.67	0.93	0.49	0.93	0.49	0.78	0.94	0.99
Cpa\|evm.model.tig00000093.223 (tig00000093_g3647.t1)	0.94	0.93	1.0	0.95	0.81	0.78	0.76	0.88	0.9	0.69	0.73	0.77	0.83	0.58	0.54	0.73	0.59	0.72	0.66	0.88	0.28	1.0	0.44	0.68	0.79	0.86
Cpa\|evm.model.tig00000101.5 (tig00000101_g4443.t1)	0.6	0.67	0.62	0.57	0.52	0.47	0.46	0.48	0.51	0.36	0.41	0.45	0.5	0.32	0.38	0.46	0.43	0.47	0.52	0.49	0.18	1.0	0.64	0.84	0.75	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000144.20 (tig00000144_g9009.t1)	0.93	1.0	0.93	0.77	0.57	0.37	0.35	0.4	0.43	0.5	0.63	0.81	0.86	0.33	0.19	0.29	0.37	0.28	0.24	0.41	0.05	0.57	0.22	0.7	0.57	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000194.67 (tig00000194_g14794.t1)	0.76	1.0	0.91	0.64	0.53	0.24	0.29	0.23	0.25	0.24	0.21	0.35	0.39	0.56	0.26	0.21	0.25	0.28	0.38	0.37	0.0	0.08	0.16	0.44	0.44	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000215.116 (tig00000215_g18656.t1)	0.8	1.0	0.82	0.71	0.49	0.37	0.41	0.51	0.59	0.63	0.74	0.81	0.72	0.5	0.44	0.86	0.5	0.56	0.55	0.5	0.18	0.74	0.57	0.66	0.49	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000227.14 (tig00000227_g19808.t1)	0.62	0.89	0.51	0.41	0.37	0.32	0.3	0.29	0.37	0.41	0.4	0.35	0.38	0.22	0.3	0.17	0.38	0.58	0.45	0.42	0.12	1.0	0.76	0.53	0.65	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000237.46 (tig00000237_g20495.t1)	0.79	1.0	0.74	0.55	0.36	0.27	0.32	0.44	0.55	0.63	0.81	0.94	0.52	0.28	0.32	0.26	0.46	0.53	0.42	0.47	0.22	0.77	0.59	0.99	0.53	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000241.105 (tig00000241_g20969.t1)	0.85	0.8	0.74	0.79	0.79	0.69	0.74	0.65	0.6	0.57	0.46	0.61	0.81	0.72	0.49	0.69	0.45	0.78	0.74	0.55	0.15	1.0	0.52	0.93	0.85	0.95
Cpa\|evm.model.tig00000241.149 (tig00000241_g21014.t1)	0.74	0.6	0.65	0.77	0.67	0.53	0.45	0.44	0.34	0.33	0.35	0.44	0.86	0.38	0.34	0.37	0.36	0.34	0.29	0.37	0.36	0.43	0.49	0.28	1.0	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000269.18 (tig00000269_g23679.t1)	0.81	0.69	0.74	0.74	0.68	0.48	0.61	0.68	0.5	0.68	0.64	0.66	0.78	0.45	0.37	0.46	0.58	0.77	0.82	0.69	0.07	1.0	0.34	0.72	0.67	0.89
Cpa\|evm.model.tig00000342.8 (tig00000342_g24196.t1)	0.86	0.77	0.82	0.76	0.65	0.56	0.45	0.45	0.31	0.38	0.45	0.61	0.87	0.54	0.56	0.58	0.67	0.76	0.75	0.54	0.18	0.72	0.33	0.55	1.0	0.89
Cpa\|evm.model.tig00000383.56 (tig00000383_g24670.t1)	1.0	0.67	0.8	0.76	0.39	0.26	0.4	0.63	0.31	0.3	0.34	0.39	0.96	0.22	0.21	0.2	0.2	0.21	0.21	0.32	0.55	0.21	0.35	0.34	0.67	0.84
Cpa\|evm.model.tig00000411.13 (tig00000411_g517.t1)	0.8	0.72	0.64	0.68	0.65	0.53	0.61	0.73	0.49	0.64	0.69	0.7	0.64	0.65	0.53	0.29	0.54	0.68	1.0	0.59	0.07	0.67	0.31	0.47	0.5	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000411.3 (tig00000411_g517.t1)	0.82	0.63	0.6	0.69	0.8	0.52	0.69	0.64	0.49	0.66	0.55	0.63	0.73	0.85	0.46	0.49	0.57	0.95	1.0	0.74	0.13	0.59	0.34	0.92	0.74	0.95
Cpa\|evm.model.tig00000459.28 (tig00000459_g1094.t1)	1.0	0.76	0.71	0.68	0.48	0.59	0.61	0.66	0.56	0.44	0.46	0.5	0.67	0.42	0.41	0.4	0.5	0.73	0.69	0.52	0.07	0.76	0.58	0.7	0.83	0.89
Cpa\|evm.model.tig00000478.17 (tig00000478_g1266.t1)	0.88	0.63	0.41	0.36	0.29	0.3	0.4	0.57	0.57	0.61	0.66	0.65	0.68	0.13	0.39	0.15	0.43	0.5	0.54	0.47	0.03	1.0	0.36	0.58	0.82	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000498.43 (tig00000498_g1618.t1)	0.64	0.57	0.64	0.7	0.55	0.4	0.28	0.35	0.28	0.24	0.25	0.37	0.58	0.37	0.75	0.37	0.31	0.39	0.33	0.31	0.22	0.87	0.57	0.5	0.79	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000655.64 (tig00000655_g2894.t1)	0.99	1.0	0.97	0.86	0.77	0.57	0.37	0.36	0.42	0.52	0.72	0.97	0.96	0.35	0.37	0.25	0.59	0.45	0.46	0.6	0.11	0.98	0.38	0.89	0.48	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000737.37 (tig00000737_g3815.t1)	0.64	1.0	1.0	0.9	0.84	0.73	0.58	0.61	0.7	0.64	0.53	0.53	0.59	0.54	0.58	0.63	0.67	0.72	0.76	0.89	0.6	0.93	0.47	0.36	0.81	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000806.50 (tig00000806_g4380.t1)	0.48	0.36	0.35	0.3	0.34	0.32	0.21	0.24	0.15	0.24	0.2	0.24	0.32	0.42	0.18	0.1	0.25	0.59	0.51	0.26	0.1	0.78	0.39	0.75	0.72	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000842.33 (tig00000842_g4853.t1)	0.83	0.98	0.71	0.6	0.41	0.25	0.36	0.48	0.49	0.59	0.64	0.71	0.56	0.43	0.31	0.33	0.52	0.7	0.61	0.58	0.04	1.0	0.3	0.7	0.7	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000912.23 (tig00000912_g5428.t1)	0.93	0.67	0.78	0.88	0.65	0.42	0.53	0.64	0.14	0.18	0.21	0.27	1.0	0.47	0.29	0.47	0.25	0.33	0.24	0.35	0.41	0.2	0.27	0.18	0.84	0.77
Cpa\|evm.model.tig00000980.27 (tig00000980_g6154.t1)	0.99	0.57	0.7	0.74	0.62	0.49	0.63	0.68	0.59	0.63	0.63	0.74	0.93	0.56	0.5	0.51	0.57	0.7	0.42	0.63	0.57	0.47	0.49	0.54	0.95	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001042.12 (tig00001042_g6589.t1)	0.76	0.95	0.96	0.83	0.71	0.64	0.69	0.74	0.73	0.56	0.49	0.47	0.64	0.57	0.63	0.63	0.69	0.66	0.65	0.95	0.5	1.0	0.34	0.48	0.85	0.82
Cpa\|evm.model.tig00001085.5 (tig00001085_g6946.t1)	1.0	0.8	0.82	0.72	0.36	0.23	0.53	0.72	0.32	0.35	0.38	0.4	0.91	0.56	0.17	0.45	0.34	0.49	0.26	0.4	0.57	0.33	0.36	0.38	0.97	0.96
Cpa\|evm.model.tig00001085.6 (tig00001085_g6946.t1)	0.95	0.79	0.81	0.66	0.34	0.24	0.49	0.63	0.32	0.31	0.33	0.37	0.83	0.49	0.17	0.39	0.29	0.39	0.27	0.37	0.49	0.25	0.3	0.34	0.88	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001085.7 (tig00001085_g6946.t1)	1.0	0.87	0.82	0.7	0.37	0.33	0.51	0.65	0.34	0.32	0.33	0.36	0.84	0.47	0.17	0.35	0.27	0.39	0.31	0.39	0.47	0.28	0.32	0.31	0.89	0.97
Cpa\|evm.model.tig00001107.23 (tig00001107_g7106.t1)	0.95	0.98	1.0	0.97	0.85	0.69	0.61	0.76	0.78	0.49	0.56	0.61	0.82	0.51	0.54	0.62	0.59	0.7	0.62	0.82	0.41	0.99	0.32	0.51	0.9	0.92
Cpa\|evm.model.tig00001249.9 (tig00001249_g7779.t1)	0.77	0.91	0.9	0.81	0.73	0.66	0.5	0.54	0.56	0.45	0.49	0.59	0.78	0.66	0.36	0.93	0.66	0.37	0.39	0.61	0.47	0.63	0.4	0.52	1.0	0.62
Cpa\|evm.model.tig00001472.7 (tig00001472_g8886.t1)	0.75	1.0	0.91	0.84	0.73	0.64	0.61	0.67	0.71	0.56	0.51	0.57	0.69	0.48	0.55	0.62	0.58	0.84	0.69	0.79	0.15	0.82	0.33	0.5	0.89	0.95
Cpa\|evm.model.tig00001535.5 (tig00001535_g9287.t1)	0.86	0.75	0.78	1.0	0.68	0.39	0.53	0.65	0.39	0.46	0.5	0.5	0.68	0.4	0.25	0.36	0.41	0.63	0.6	0.81	0.15	0.83	0.63	0.48	0.84	0.81
Cpa\|evm.model.tig00001542.10 (tig00001542_g9319.t1)	1.0	0.87	0.69	0.46	0.5	0.43	0.41	0.52	0.46	0.49	0.67	0.62	0.67	0.26	0.23	0.17	0.46	0.35	0.36	0.62	0.44	0.54	0.43	0.76	0.35	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001542.13 (tig00001542_g9322.t1)	0.72	0.59	0.62	0.56	0.51	0.55	0.56	0.55	0.45	0.47	0.49	0.52	0.69	0.49	0.51	0.41	0.39	0.43	0.53	0.44	0.12	0.86	0.66	0.71	1.0	0.84
Cpa\|evm.model.tig00001590.9 (tig00001590_g9381.t1)	1.0	0.58	0.63	0.65	0.43	0.24	0.3	0.52	0.27	0.2	0.27	0.29	0.79	0.23	0.29	0.26	0.18	0.3	0.23	0.29	0.42	0.33	0.78	0.28	0.99	0.84
Cpa\|evm.model.tig00001694.7 (tig00001694_g9572.t1)	0.44	0.4	0.33	0.3	0.23	0.34	0.26	0.26	0.26	0.21	0.17	0.18	0.49	0.42	0.28	0.37	0.17	0.33	0.36	0.18	0.08	0.42	0.54	0.3	1.0	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020510.129 (tig00020510_g9917.t1)	1.0	0.79	0.77	0.29	0.05	0.01	0.02	0.08	0.06	0.05	0.15	0.16	0.59	0.56	0.15	0.43	0.25	0.15	0.17	0.09	0.27	0.12	0.05	0.06	0.81	0.92
Cpa\|evm.model.tig00020544.8 (tig00020544_g10488.t1)	0.66	0.91	0.94	1.0	0.89	0.64	0.55	0.54	0.51	0.53	0.53	0.58	0.57	0.18	0.26	0.25	0.46	0.89	0.51	0.73	0.16	0.83	0.67	0.66	0.63	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020554.100 (tig00020554_g10878.t1)	0.89	1.0	0.68	0.6	0.49	0.38	0.42	0.44	0.46	0.49	0.62	0.66	0.65	0.26	0.33	0.2	0.39	0.4	0.37	0.47	0.05	0.84	0.33	0.62	0.64	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020557.26 (tig00020557_g11126.t1)	0.73	0.69	0.86	0.67	0.54	0.33	0.31	0.41	0.27	0.25	0.32	0.41	0.51	0.3	0.26	0.33	0.37	0.49	0.44	0.63	0.09	0.82	0.25	0.46	1.0	0.9
Cpa\|evm.model.tig00020603.7 (tig00020603_g11740.t1)	1.0	0.73	0.64	0.5	0.29	0.24	0.37	0.51	0.24	0.26	0.32	0.37	0.83	0.22	0.17	0.2	0.24	0.22	0.24	0.28	0.52	0.23	0.45	0.43	0.96	0.73
Cpa\|evm.model.tig00020629.38 (tig00020629_g12360.t1)	0.57	0.61	0.69	0.71	0.8	0.48	0.32	0.29	0.18	0.3	0.35	0.48	0.51	0.37	0.25	0.38	0.53	0.51	0.38	0.52	0.44	0.83	0.39	0.7	0.91	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020629.85 (tig00020629_g12406.t1)	0.66	0.73	0.7	0.63	0.57	0.63	0.59	0.56	0.65	0.43	0.51	0.52	0.47	0.5	0.57	0.48	0.56	0.69	0.65	0.59	0.25	0.66	0.46	0.7	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00020710.25 (tig00020710_g13257.t1)	0.76	1.0	0.67	0.65	0.6	0.66	0.55	0.72	0.61	0.25	0.25	0.24	0.53	0.38	0.4	0.32	0.39	0.61	0.8	0.77	0.11	0.79	0.13	0.16	0.92	0.83
Cpa\|evm.model.tig00020801.10 (tig00020801_g13891.t1)	0.52	0.47	0.59	0.71	0.66	0.46	0.55	0.57	0.53	0.53	0.52	0.5	0.51	0.79	0.36	0.58	0.45	0.74	0.58	0.59	0.19	0.52	0.24	0.35	0.72	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020902.11 (tig00020902_g14953.t1)	0.7	0.83	0.9	0.97	0.76	0.61	0.65	0.71	0.71	0.62	0.6	0.61	0.56	0.42	0.37	0.42	0.48	0.71	0.67	0.84	0.1	0.92	0.73	0.77	1.0	0.77
Cpa\|evm.model.tig00020904.113 (tig00020904_g15242.t1)	0.82	1.0	0.86	0.74	0.65	0.41	0.36	0.3	0.22	0.36	0.43	0.47	0.55	0.41	0.31	0.25	0.51	0.45	0.44	0.89	0.28	0.42	0.39	0.69	0.7	0.99
Cpa\|evm.model.tig00020911.58 (tig00020911_g15760.t1)	0.69	0.94	0.91	0.83	0.56	0.39	0.52	0.52	0.56	0.67	0.65	0.72	0.65	0.54	0.56	0.54	0.56	0.61	0.61	0.66	0.5	0.98	0.71	0.77	0.89	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020938.19 (tig00020938_g16143.t1)	0.48	0.39	0.57	0.76	0.38	0.14	0.34	0.6	0.09	0.07	0.12	0.17	0.44	0.31	0.15	0.19	0.13	0.15	0.08	0.2	0.28	0.12	0.13	0.09	0.94	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020999.9 (tig00020999_g16974.t2)	0.9	0.71	0.76	0.71	0.41	0.23	0.38	0.55	0.33	0.39	0.45	0.51	0.7	0.24	0.18	0.16	0.29	0.51	0.48	0.46	0.38	0.55	0.65	0.46	0.97	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021123.13 (tig00021123_g18495.t1)	0.67	0.63	0.71	0.63	0.61	0.54	0.57	0.57	0.47	0.49	0.43	0.51	0.69	0.47	0.36	0.37	0.42	0.58	0.68	0.61	0.03	0.82	0.46	0.45	0.76	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021128.8 (tig00021128_g18890.t1)	0.85	1.0	0.63	0.49	0.37	0.43	0.33	0.33	0.26	0.27	0.27	0.32	0.72	0.34	0.26	0.39	0.31	0.5	0.47	0.35	0.47	0.66	0.59	0.56	0.86	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021312.63 (tig00021312_g20096.t1)	0.75	1.0	0.68	0.62	0.37	0.12	0.09	0.21	0.14	0.28	0.66	0.96	0.64	0.07	0.03	0.03	0.13	0.32	0.25	0.43	0.02	0.26	0.15	0.56	0.37	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021314.19 (tig00021314_g20129.t1)	1.0	0.94	0.8	0.53	0.24	0.12	0.18	0.31	0.21	0.17	0.2	0.26	0.8	0.26	0.39	0.28	0.34	0.35	0.35	0.36	0.46	0.31	0.42	0.24	0.99	0.62
Cpa\|evm.model.tig00021319.65 (tig00021319_g20257.t1)	0.57	0.47	0.57	0.65	0.6	0.58	0.58	0.55	0.41	0.44	0.42	0.34	0.52	0.61	0.5	0.49	0.42	0.65	0.58	0.54	0.04	0.43	0.11	0.43	0.71	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021326.42 (tig00021326_g20307.t1)	0.47	0.41	0.41	0.4	0.39	0.46	0.52	0.44	0.47	0.45	0.38	0.41	0.45	0.35	0.41	0.45	0.45	0.64	0.57	0.49	0.17	0.88	0.64	1.0	0.69	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021352.34 (tig00021352_g20703.t1)	0.54	0.4	0.53	0.53	0.16	0.12	0.19	0.42	0.1	0.09	0.12	0.17	0.37	0.13	0.09	0.12	0.1	0.27	0.15	0.25	0.41	0.51	0.1	0.18	1.0	0.8
Cpa\|evm.model.tig00021357.5 (tig00021357_g20738.t1)	0.89	0.94	1.0	0.98	0.95	0.95	0.69	0.73	0.76	0.67	0.66	0.78	0.8	0.56	0.71	0.65	0.72	0.61	0.75	0.96	0.4	0.9	0.74	0.75	0.86	0.99
Cpa\|evm.model.tig00021435.34 (tig00021435_g21413.t2)	0.83	0.7	0.68	0.63	0.55	0.56	0.51	0.55	0.5	0.52	0.51	0.55	0.81	0.64	0.41	0.52	0.47	0.82	0.65	0.64	0.07	0.53	0.3	0.43	0.86	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021494.8 (tig00021494_g21919.t1)	0.82	0.81	0.81	0.64	0.41	0.27	0.28	0.51	0.37	0.21	0.27	0.3	0.61	0.13	0.23	0.17	0.27	0.31	0.29	0.39	0.36	0.17	0.31	0.21	1.0	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021682.5 (tig00021682_g23094.t1)	0.39	0.46	0.48	0.66	0.49	0.31	0.29	0.34	0.43	0.36	0.49	0.48	0.4	0.43	0.31	0.2	0.24	0.56	0.39	0.35	0.1	1.0	0.24	0.46	0.68	0.58
Cpa\|evm.model.tig00021759.11 (tig00021759_g23425.t1)	0.63	0.81	0.79	0.59	0.4	0.32	0.18	0.27	0.35	0.38	0.49	0.59	0.46	0.35	0.44	0.44	0.45	0.25	0.43	0.57	0.34	1.0	0.49	0.73	0.52	0.58
Cpa\|evm.model.tig00022075.26 (tig00022075_g23590.t1)	0.88	0.72	0.73	0.85	0.74	0.67	0.64	0.66	0.52	0.45	0.49	0.45	0.76	0.44	0.43	0.51	0.44	0.78	0.82	0.45	0.05	1.0	0.43	0.41	0.73	0.81

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)