Heatmap: Cluster_153 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000025.11 (tig00000025_g7917.t1)
0.74 0.69 0.6 0.73 0.62 0.5 0.57 0.66 0.52 0.4 0.39 0.39 0.59 0.3 0.29 0.28 0.31 0.52 0.42 0.46 0.06 0.68 0.16 0.29 1.0 0.78
Cpa|evm.model.tig00000057.85 (tig00000057_g104.t1)
0.98 0.87 0.87 0.79 0.5 0.32 0.43 0.67 0.45 0.34 0.39 0.43 0.72 0.19 0.22 0.2 0.26 0.4 0.33 0.54 0.04 0.22 0.34 0.31 1.0 0.94
Cpa|evm.model.tig00000076.118 (tig00000076_g2415.t1)
0.59 0.37 0.39 0.71 0.37 0.18 0.2 0.43 0.15 0.17 0.23 0.23 0.43 0.06 0.06 0.06 0.06 0.11 0.1 0.14 0.08 0.26 0.35 0.34 1.0 0.91
Cpa|evm.model.tig00000093.39 (tig00000093_g3475.t2)
0.58 0.8 0.81 1.0 0.77 0.57 0.47 0.66 0.63 0.38 0.37 0.44 0.64 0.13 0.21 0.13 0.19 0.29 0.27 0.4 0.17 0.43 0.23 0.27 0.84 0.77
Cpa|evm.model.tig00000133.53 (tig00000133_g7718.t1)
0.8 0.79 0.92 1.0 0.64 0.46 0.51 0.5 0.41 0.48 0.62 0.61 0.66 0.26 0.33 0.15 0.28 0.31 0.31 0.54 0.02 0.47 0.17 0.21 0.6 0.98
Cpa|evm.model.tig00000157.107 (tig00000157_g9706.t1)
0.62 0.56 0.58 0.68 0.7 0.71 0.7 0.71 0.57 0.52 0.48 0.44 0.55 0.27 0.29 0.31 0.3 0.42 0.39 0.4 0.12 0.53 0.63 0.44 1.0 0.67
Cpa|evm.model.tig00000169.17 (tig00000169_g11886.t1)
0.56 0.67 0.52 0.55 0.49 0.45 0.55 0.61 0.44 0.29 0.26 0.19 0.4 0.22 0.23 0.21 0.33 0.53 0.43 0.45 0.04 0.72 0.27 0.21 1.0 0.59
Cpa|evm.model.tig00000197.12 (tig00000197_g15691.t1)
0.7 0.57 0.72 0.69 0.44 0.39 0.5 0.73 0.38 0.35 0.34 0.36 0.55 0.3 0.31 0.31 0.33 0.38 0.36 0.46 0.04 0.2 0.22 0.28 1.0 0.95
Cpa|evm.model.tig00000215.16 (tig00000215_g18545.t1)
0.61 0.62 0.74 0.88 0.62 0.38 0.49 0.59 0.31 0.29 0.35 0.41 0.41 0.34 0.36 0.31 0.38 0.36 0.32 0.47 0.1 0.08 0.28 0.36 1.0 1.0
Cpa|evm.model.tig00000215.17 (tig00000215_g18546.t1)
0.71 0.55 0.77 0.82 0.61 0.38 0.38 0.55 0.29 0.22 0.36 0.39 0.55 0.2 0.24 0.24 0.25 0.27 0.21 0.31 0.1 0.05 0.25 0.23 0.7 1.0
Cpa|evm.model.tig00000215.47 (tig00000655_g2857.t1)
0.62 0.68 0.71 0.8 0.63 0.51 0.62 0.74 0.47 0.33 0.3 0.29 0.43 0.37 0.37 0.46 0.38 0.54 0.48 0.41 0.04 0.55 0.37 0.21 1.0 0.54
Cpa|evm.model.tig00000219.5 (tig00000219_g19441.t1)
0.67 0.43 0.41 0.85 0.49 0.31 0.34 0.44 0.22 0.17 0.2 0.16 0.48 0.07 0.08 0.06 0.03 0.13 0.09 0.12 0.08 0.57 0.17 0.31 0.86 1.0
Cpa|evm.model.tig00000241.156 (tig00000241_g21021.t1)
0.55 0.51 0.49 0.77 0.58 0.42 0.54 0.8 0.56 0.47 0.48 0.36 0.25 0.21 0.29 0.24 0.22 0.36 0.31 0.34 0.03 0.46 0.49 0.25 1.0 0.63
Cpa|evm.model.tig00000241.22 (tig00000241_g20880.t1)
0.86 0.51 0.57 1.0 0.61 0.34 0.46 0.68 0.33 0.29 0.38 0.36 0.72 0.36 0.27 0.32 0.3 0.26 0.26 0.27 0.04 0.8 0.17 0.37 0.92 1.0
Cpa|evm.model.tig00000344.13 (tig00000344_g24294.t1)
0.77 0.52 0.61 0.82 0.58 0.36 0.39 0.61 0.21 0.22 0.25 0.25 0.78 0.16 0.11 0.12 0.11 0.13 0.11 0.19 0.05 0.52 0.14 0.23 1.0 0.72
Cpa|evm.model.tig00000350.16 (tig00000350_g24316.t1)
0.51 0.6 0.65 1.0 0.65 0.42 0.55 0.69 0.45 0.39 0.39 0.31 0.43 0.12 0.09 0.14 0.17 0.23 0.19 0.32 0.06 0.25 0.25 0.36 0.52 0.92
Cpa|evm.model.tig00000361.40 (tig00000361_g24388.t1)
0.3 0.3 0.32 0.38 0.38 0.45 0.51 0.53 0.29 0.19 0.16 0.11 0.35 0.28 0.18 0.22 0.23 0.32 0.31 0.28 0.0 0.15 0.05 0.08 1.0 0.79
Cpa|evm.model.tig00000383.108 (tig00000383_g24717.t1)
0.79 0.71 0.78 0.84 0.52 0.27 0.38 0.61 0.39 0.43 0.51 0.55 0.75 0.22 0.19 0.13 0.2 0.25 0.25 0.32 0.0 0.51 0.07 0.15 0.86 1.0
Cpa|evm.model.tig00000383.117 (tig00000383_g24726.t1)
0.43 0.68 0.68 0.63 0.36 0.28 0.39 0.47 0.2 0.26 0.29 0.36 0.54 0.13 0.19 0.15 0.19 0.39 0.35 0.35 0.03 0.18 0.21 0.4 1.0 0.92
Cpa|evm.model.tig00000403.77 (tig00000403_g337.t1)
0.82 0.84 1.0 0.88 0.54 0.33 0.39 0.59 0.43 0.38 0.39 0.44 0.7 0.21 0.24 0.19 0.26 0.46 0.39 0.46 0.04 0.36 0.31 0.36 0.84 0.95
Cpa|evm.model.tig00000455.8 (tig00000455_g995.t1)
1.0 0.74 0.76 0.82 0.54 0.36 0.53 0.68 0.27 0.25 0.27 0.28 0.9 0.3 0.36 0.23 0.34 0.52 0.35 0.45 0.04 0.38 0.11 0.21 0.81 0.91
Cpa|evm.model.tig00000455.9 (tig00000455_g996.t1)
0.83 1.0 0.88 0.76 0.57 0.51 0.47 0.5 0.47 0.47 0.49 0.6 0.73 0.17 0.2 0.19 0.37 0.58 0.42 0.57 0.04 0.51 0.43 0.4 0.81 0.77
Cpa|evm.model.tig00000615.34 (tig00000615_g2562.t1)
0.64 0.69 0.62 0.85 0.65 0.45 0.49 0.64 0.47 0.44 0.42 0.4 0.48 0.27 0.18 0.26 0.21 0.28 0.21 0.29 0.01 0.18 0.27 0.22 1.0 0.72
Cpa|evm.model.tig00000692.71 (tig00000692_g3270.t1)
0.68 0.72 0.7 0.86 0.71 0.67 0.73 0.76 0.47 0.38 0.35 0.31 0.54 0.39 0.48 0.36 0.35 0.57 0.39 0.45 0.01 0.22 0.27 0.12 1.0 0.96
Cpa|evm.model.tig00000786.6 (tig00000786_g4054.t1)
0.88 0.62 0.79 1.0 0.59 0.48 0.6 0.79 0.3 0.28 0.3 0.35 0.65 0.2 0.2 0.18 0.16 0.26 0.22 0.27 0.04 0.43 0.19 0.17 0.89 0.97
Cpa|evm.model.tig00000792.15 (tig00000792_g4164.t1)
0.4 0.68 0.85 0.8 0.48 0.34 0.29 0.35 0.21 0.18 0.21 0.18 0.31 0.28 0.1 0.34 0.05 0.29 0.16 0.27 0.03 0.33 0.1 0.19 0.84 1.0
Cpa|evm.model.tig00000842.58 (tig00000842_g4879.t1)
1.0 0.84 0.73 0.83 0.46 0.22 0.32 0.62 0.44 0.32 0.43 0.43 0.77 0.17 0.12 0.27 0.15 0.29 0.25 0.35 0.05 0.44 0.33 0.24 0.94 0.9
Cpa|evm.model.tig00000849.26 (tig00000849_g4766.t1)
0.63 1.0 0.73 0.6 0.34 0.26 0.33 0.49 0.49 0.47 0.47 0.49 0.5 0.12 0.21 0.16 0.38 0.4 0.36 0.42 0.05 0.46 0.23 0.35 0.63 0.4
Cpa|evm.model.tig00000889.23 (tig00000889_g5312.t1)
0.68 1.0 1.0 0.94 0.67 0.59 0.59 0.75 0.59 0.38 0.42 0.4 0.51 0.42 0.4 0.41 0.45 0.59 0.58 0.56 0.04 0.61 0.23 0.3 0.8 0.84
Cpa|evm.model.tig00000912.1 (tig00000912_g5408.t2)
0.56 0.81 0.84 0.83 0.46 0.27 0.46 0.58 0.2 0.27 0.32 0.42 0.83 0.24 0.23 0.23 0.21 0.4 0.29 0.44 0.21 0.3 0.13 0.26 0.7 1.0
Cpa|evm.model.tig00001003.13 (tig00001003_g6270.t1)
0.82 0.81 0.88 1.0 0.72 0.52 0.41 0.64 0.41 0.35 0.44 0.49 0.7 0.17 0.24 0.23 0.23 0.3 0.25 0.41 0.33 0.36 0.29 0.42 0.78 0.81
Cpa|evm.model.tig00001094.6 (tig00001094_g6977.t1)
0.65 1.0 0.84 0.68 0.47 0.28 0.32 0.44 0.42 0.44 0.48 0.56 0.57 0.17 0.22 0.16 0.37 0.46 0.38 0.52 0.02 0.2 0.15 0.29 0.68 0.51
Cpa|evm.model.tig00001127.17 (tig00001127_g7147.t1)
1.0 0.65 0.81 0.93 0.56 0.39 0.34 0.65 0.32 0.24 0.33 0.37 0.87 0.14 0.21 0.17 0.15 0.21 0.17 0.24 0.12 0.27 0.36 0.25 0.78 0.76
Cpa|evm.model.tig00001249.4 (tig00001249_g7774.t1)
1.0 0.75 0.75 0.88 0.66 0.42 0.58 0.78 0.64 0.47 0.56 0.54 0.79 0.27 0.24 0.33 0.3 0.43 0.35 0.47 0.25 0.48 0.35 0.55 0.8 0.81
Cpa|evm.model.tig00001527.9 (tig00001527_g9259.t1)
0.52 0.46 0.54 0.59 0.24 0.15 0.13 0.21 0.1 0.11 0.11 0.15 0.39 0.1 0.39 0.12 0.08 0.21 0.06 0.13 0.09 0.15 0.22 0.17 1.0 0.82
Cpa|evm.model.tig00020537.10 (tig00020537_g10232.t1)
0.77 0.7 0.75 0.85 0.69 0.59 0.54 0.65 0.51 0.44 0.46 0.5 0.81 0.15 0.18 0.28 0.33 0.43 0.35 0.47 0.05 0.5 0.51 0.58 1.0 0.85
Cpa|evm.model.tig00020553.281 (tig00020553_g10766.t1)
0.45 1.0 0.85 0.44 0.19 0.12 0.18 0.26 0.16 0.32 0.28 0.35 0.5 0.14 0.09 0.12 0.21 0.19 0.17 0.26 0.02 0.04 0.13 0.05 0.61 0.57
Cpa|evm.model.tig00020629.100 (tig00020629_g12421.t1)
0.97 0.57 0.61 0.87 0.53 0.33 0.42 0.68 0.2 0.17 0.23 0.3 0.9 0.13 0.11 0.11 0.11 0.12 0.1 0.21 0.02 0.04 0.06 0.15 1.0 0.84
Cpa|evm.model.tig00020684.15 (tig00020684_g12865.t1)
1.0 0.93 0.97 0.94 0.66 0.52 0.52 0.62 0.59 0.56 0.65 0.72 0.86 0.2 0.22 0.23 0.3 0.5 0.44 0.62 0.1 0.46 0.43 0.43 0.97 0.93
Cpa|evm.model.tig00020693.22 (tig00020693_g13029.t1)
1.0 0.44 0.54 0.73 0.25 0.06 0.11 0.32 0.04 0.05 0.1 0.16 0.76 0.06 0.05 0.03 0.04 0.06 0.05 0.09 0.04 0.21 0.05 0.11 0.68 0.86
Cpa|evm.model.tig00020704.57 (tig00020704_g13201.t1)
0.74 0.64 0.75 0.85 0.89 0.73 0.69 0.64 0.52 0.49 0.54 0.61 0.99 0.3 0.24 0.34 0.35 0.4 0.34 0.37 0.15 0.73 0.49 0.49 1.0 0.8
Cpa|evm.model.tig00020816.56 (tig00020816_g14141.t1)
0.72 0.93 0.92 0.91 0.5 0.36 0.41 0.58 0.19 0.31 0.28 0.33 0.97 0.19 0.19 0.22 0.21 0.45 0.33 0.39 0.03 0.25 0.12 0.17 0.95 1.0
Cpa|evm.model.tig00020830.15 (tig00020830_g14396.t1)
0.67 0.83 0.97 1.0 0.47 0.17 0.29 0.5 0.16 0.21 0.28 0.29 0.39 0.02 0.03 0.01 0.11 0.14 0.11 0.29 0.07 0.21 0.28 0.18 0.89 0.8
Cpa|evm.model.tig00020911.37 (tig00020911_g15741.t1)
0.31 0.4 0.42 0.43 0.37 0.33 0.26 0.29 0.22 0.1 0.08 0.09 0.27 0.17 0.17 0.22 0.18 0.39 0.33 0.29 0.01 0.29 0.03 0.06 1.0 0.53
Cpa|evm.model.tig00020927.16 (tig00020927_g15945.t1)
0.41 0.61 0.73 0.75 0.66 0.44 0.42 0.57 0.41 0.39 0.31 0.3 0.29 0.11 0.22 0.16 0.22 0.31 0.28 0.33 0.0 0.09 0.19 0.27 1.0 0.53
Cpa|evm.model.tig00020934.55 (tig00020934_g16123.t1)
0.79 0.53 0.49 0.6 0.48 0.28 0.22 0.21 0.17 0.2 0.33 0.45 0.84 0.21 0.13 0.17 0.19 0.23 0.2 0.16 0.02 0.47 0.27 0.3 1.0 0.7
Cpa|evm.model.tig00020941.36 (tig00020941_g16229.t1)
0.86 0.47 0.47 0.69 0.46 0.17 0.21 0.44 0.13 0.18 0.27 0.31 0.78 0.3 0.13 0.17 0.11 0.24 0.12 0.2 0.11 0.36 0.29 0.38 1.0 0.94
Cpa|evm.model.tig00020941.49 (tig00020941_g16241.t1)
0.52 0.64 0.7 0.83 0.68 0.59 0.51 0.55 0.5 0.44 0.46 0.4 0.41 0.25 0.35 0.2 0.27 0.33 0.27 0.36 0.05 0.46 0.37 0.28 1.0 0.73
0.74 0.38 0.39 0.5 0.33 0.17 0.21 0.25 0.16 0.13 0.2 0.19 0.56 0.17 0.14 0.17 0.11 0.19 0.18 0.15 0.03 0.21 0.27 0.26 1.0 0.84
Cpa|evm.model.tig00020961.58 (tig00020961_g16680.t1)
0.88 0.55 0.55 0.66 0.4 0.23 0.31 0.44 0.21 0.29 0.33 0.39 0.8 0.19 0.13 0.16 0.17 0.23 0.18 0.28 0.09 0.37 0.27 0.34 1.0 0.71
Cpa|evm.model.tig00021012.31 (tig00021012_g17011.t1)
0.59 0.32 0.37 0.46 0.19 0.08 0.16 0.35 0.13 0.1 0.16 0.15 0.33 0.11 0.09 0.08 0.07 0.18 0.17 0.15 0.02 0.08 0.16 0.17 0.94 1.0
Cpa|evm.model.tig00021094.10 (tig00021094_g18099.t1)
0.88 0.62 0.71 0.91 0.52 0.2 0.25 0.42 0.11 0.13 0.17 0.19 0.76 0.09 0.08 0.07 0.1 0.13 0.08 0.17 0.05 0.19 0.09 0.1 1.0 0.76
Cpa|evm.model.tig00021123.12 (tig00021123_g18494.t1)
0.87 1.0 0.84 0.8 0.45 0.25 0.32 0.49 0.39 0.41 0.48 0.45 0.61 0.2 0.3 0.19 0.28 0.52 0.47 0.54 0.06 0.26 0.36 0.38 0.68 0.68
Cpa|evm.model.tig00021127.155 (tig00021127_g18837.t1)
0.97 0.67 0.63 0.89 0.46 0.25 0.43 0.66 0.25 0.23 0.3 0.28 0.79 0.11 0.17 0.1 0.18 0.29 0.25 0.29 0.03 0.09 0.18 0.11 1.0 0.74
Cpa|evm.model.tig00021128.12 (tig00021128_g18893.t1)
1.0 0.7 0.91 0.89 0.67 0.45 0.44 0.63 0.33 0.4 0.45 0.32 0.7 0.39 0.29 0.3 0.29 0.48 0.33 0.39 0.01 0.08 0.18 0.19 0.57 0.94
Cpa|evm.model.tig00021135.37 (tig00021135_g18956.t1)
0.64 0.6 0.61 1.0 0.64 0.46 0.47 0.72 0.51 0.39 0.51 0.49 0.61 0.29 0.23 0.35 0.2 0.32 0.29 0.35 0.26 0.77 0.38 0.38 0.76 0.86
Cpa|evm.model.tig00021179.43 (tig00021179_g19257.t1)
0.32 0.42 0.6 0.69 0.64 0.58 0.46 0.51 0.29 0.3 0.3 0.31 0.35 0.22 0.13 0.18 0.21 0.26 0.2 0.29 0.04 0.26 0.2 0.27 1.0 0.61
Cpa|evm.model.tig00021318.55 (tig00000361_g24381.t1)
0.23 0.13 0.19 0.59 0.43 0.21 0.22 0.4 0.11 0.11 0.18 0.09 0.12 0.03 0.02 0.06 0.02 0.07 0.04 0.12 0.09 0.11 0.08 0.15 0.81 1.0
Cpa|evm.model.tig00021374.32 (tig00021374_g21110.t1)
0.47 0.51 0.69 0.79 0.8 0.65 0.48 0.46 0.28 0.26 0.26 0.25 0.44 0.11 0.12 0.1 0.17 0.35 0.26 0.47 0.02 0.27 0.24 0.12 1.0 0.74
Cpa|evm.model.tig00021435.45 (tig00021435_g21425.t1)
0.71 0.72 0.81 0.79 0.55 0.37 0.49 0.57 0.32 0.43 0.45 0.51 0.65 0.25 0.38 0.28 0.37 0.47 0.38 0.49 0.2 0.26 0.42 0.54 1.0 1.0
Cpa|evm.model.tig00021438.11 (tig00021438_g21453.t1)
1.0 0.88 0.96 0.96 0.83 0.72 0.79 0.89 0.61 0.58 0.57 0.57 0.88 0.46 0.57 0.54 0.51 0.68 0.61 0.69 0.45 0.63 0.5 0.59 0.92 1.0
Cpa|evm.model.tig00021489.1 (tig00021489_g21650.t1)
0.48 0.52 0.55 0.77 0.63 0.34 0.33 0.44 0.26 0.14 0.14 0.18 0.49 0.15 0.13 0.13 0.18 0.19 0.14 0.21 0.15 0.28 0.17 0.08 1.0 0.69
Cpa|evm.model.tig00021493.51 (tig00021493_g21890.t1)
0.71 0.74 0.69 0.77 0.59 0.32 0.28 0.42 0.38 0.28 0.36 0.39 0.75 0.13 0.22 0.19 0.23 0.38 0.25 0.31 0.09 0.37 0.38 0.25 1.0 0.55
Cpa|evm.model.tig00021525.21 (tig00021525_g22137.t1)
0.53 1.0 0.77 0.64 0.53 0.48 0.44 0.38 0.5 0.47 0.51 0.49 0.33 0.24 0.24 0.12 0.37 0.38 0.38 0.52 0.08 0.47 0.32 0.44 0.7 0.61
Cpa|evm.model.tig00021569.17 (tig00021569_g22348.t1)
0.57 0.5 0.41 0.63 0.44 0.35 0.41 0.47 0.39 0.32 0.36 0.25 0.33 0.27 0.23 0.25 0.24 0.39 0.3 0.28 0.22 0.43 0.18 0.29 1.0 0.56
Cpa|evm.model.tig00021590.12 (tig00021590_g22769.t1)
0.75 0.57 0.61 0.78 0.39 0.16 0.17 0.37 0.1 0.13 0.22 0.31 0.66 0.12 0.08 0.08 0.1 0.14 0.12 0.22 0.07 0.19 0.19 0.26 0.84 1.0
Cpa|evm.model.tig00021612.37 (tig00021612_g22880.t1)
0.79 0.89 1.0 0.93 0.73 0.56 0.61 0.73 0.52 0.37 0.34 0.34 0.65 0.33 0.51 0.39 0.47 0.79 0.56 0.76 0.14 0.55 0.36 0.29 0.96 0.81
Cpa|evm.model.tig00021682.6 (tig00021682_g23095.t1)
0.45 0.5 0.73 0.95 0.72 0.5 0.43 0.5 0.29 0.15 0.14 0.19 0.44 0.13 0.15 0.14 0.26 0.21 0.17 0.32 0.11 0.62 0.19 0.14 1.0 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)