1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_82 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.45 (tig00001071_g6794.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000053.5 (tig00000053_g23488.t1)
 113.34 133.51 109.34 115.2 77.05 45.34 70.89 73.12 54.87 46.07 53.17 62.33 109.13 313.95 165.27 71.25 97.31 723.52 361.29 969.81 140.88 80.39 17.47 81.1 64.32 15.52
Cpa|evm.model.tig00000056.13 (tig00000056_g24060.t1)
 0.13 0.1 0.09 0.09 0.0 0.1 0.0 0.1 0.04 0.0 0.04 0.14 0.0 0.08 0.07 0.13 0.0 0.33 0.17 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.03 0.12
Cpa|evm.model.tig00000093.171 (tig00000093_g3598.t1)
 0.04 0.05 0.0 0.02 0.15 0.13 0.09 0.02 0.07 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.53 0.51 0.19 0.09 0.29 0.03 0.0 0.71 0.22
Cpa|evm.model.tig00000093.2 (tig00000093_g3439.t1)
 0.18 0.04 0.02 0.07 0.09 0.07 0.0 0.21 0.04 0.04 0.0 0.05 0.08 0.13 0.04 0.07 0.0 1.18 0.37 0.36 0.34 0.02 0.02 0.03 0.04 0.06
Cpa|evm.model.tig00000093.228 (tig00000093_g3654.t1)
 5.42 4.16 4.87 5.48 6.29 7.14 10.36 9.49 10.15 11.3 8.43 6.21 4.04 8.84 8.65 12.4 5.29 28.12 11.92 12.32 3.39 1.95 9.64 7.08 1.96 5.37
Cpa|evm.model.tig00000093.85 (tig00000093_g3512.t1)
 16.52 17.09 19.85 19.32 24.18 32.81 25.5 23.33 42.6 35.07 32.71 32.9 21.05 28.28 38.36 31.77 28.24 65.91 48.82 30.19 29.84 33.35 45.51 51.79 25.71 54.11
0.35 0.38 0.17 0.04 1.07 0.78 1.21 0.46 0.63 0.23 0.08 0.44 0.65 1.39 0.99 0.87 0.21 1.18 1.9 0.6 0.0 2.26 0.03 0.69 0.37 0.03
Cpa|evm.model.tig00000147.71 (tig00000147_g9513.t1)
 0.02 0.04 0.02 0.0 0.09 0.04 0.13 0.07 0.09 0.25 0.28 0.21 0.05 0.52 0.34 0.14 0.7 57.2 1.79 0.34 3.56 0.12 2.03 0.56 0.11 0.19
Cpa|evm.model.tig00000190.27 (tig00000190_g13849.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.23 0.19 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.29 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03
0.06 0.05 0.08 0.04 0.05 0.07 0.02 0.06 0.0 0.04 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.12 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0
Cpa|evm.model.tig00000204.93 (tig00000204_g17759.t1)
 1.11 0.61 0.5 0.72 1.05 1.16 0.98 0.67 1.1 1.45 1.02 0.91 0.67 3.64 2.78 1.93 3.67 19.82 11.88 7.53 1.17 5.43 3.05 4.72 3.72 19.3
Cpa|evm.model.tig00000204.99 (tig00000204_g17763.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000227.37 (tig00000227_g19827.t1)
 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.19 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000241.46 (tig00000241_g20905.t1)
 0.04 0.0 0.0 0.12 0.13 0.05 0.05 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.11 0.07 0.03 0.4 0.17 0.07 0.09 0.09 0.03 0.0 0.07 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.04 0.22 0.05 3.75 0.1 4.24 0.15 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0
Cpa|evm.model.tig00000248.45 (tig00000248_g21809.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.08 0.0 8.47 0.34 27.26 0.0 0.0 0.06 0.07 0.03 0.24
Cpa|evm.model.tig00000269.78 (tig00000269_g23738.t1)
 0.72 0.44 0.22 0.35 0.38 0.56 1.27 0.4 1.63 4.63 3.66 2.52 0.44 34.38 30.71 49.14 13.91 115.6 68.33 194.38 25.86 4.18 18.74 16.01 8.56 9.38
Cpa|evm.model.tig00000269.79 (tig00020563_g11214.t1)
 0.19 0.14 0.02 0.42 0.05 0.02 0.27 0.06 0.52 0.89 0.58 0.37 0.0 8.62 5.4 13.4 3.56 40.37 13.14 43.34 3.07 2.35 0.99 3.11 1.48 2.19
Cpa|evm.model.tig00000269.80 (tig00020563_g11214.t1)
 0.25 0.02 0.14 0.23 0.06 0.03 0.06 0.08 0.24 0.84 0.4 0.0 0.0 9.95 6.83 17.4 4.33 36.71 16.71 53.42 2.75 3.08 0.7 3.2 3.89 2.62
Cpa|evm.model.tig00000269.81 (tig00000254_g22563.t1)
 0.44 0.2 0.44 0.51 0.3 0.25 0.56 0.35 1.0 3.23 1.62 1.0 0.18 27.07 20.25 38.28 10.67 93.96 51.43 153.43 5.84 3.39 3.46 5.82 2.09 5.8
0.62 0.42 0.44 0.35 1.24 1.15 1.22 0.34 1.15 2.81 1.17 0.67 0.11 23.96 20.66 34.24 9.98 82.94 60.7 148.07 7.04 2.93 2.69 6.19 7.98 9.83
Cpa|evm.model.tig00000411.49 (tig00000411_g554.t1)
 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.19 0.16 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000411.50 (tig00000411_g555.t1)
 0.07 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.06 0.03 0.06 0.0 0.02 0.33 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
Cpa|evm.model.tig00000459.72 (tig00000459_g1140.t1)
 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.15 1.06 0.49 0.85 0.18 0.03 0.03 0.15 0.35 0.23
Cpa|evm.model.tig00000475.2 (tig00000475_g1228.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.08 0.3 0.28 0.28 0.07 1.11 0.23 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000523.27 (tig00000053_g23488.t1)
 65.7 44.29 39.78 50.29 33.36 16.98 30.93 33.0 22.71 22.53 34.82 34.82 60.01 67.45 31.42 18.25 17.63 168.61 70.14 186.84 28.26 20.61 11.29 32.45 27.14 10.65
Cpa|evm.model.tig00000555.3 (tig00000555_g2130.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.28 0.0 0.04 5.46 0.14 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
Cpa|evm.model.tig00000555.5 (tig00000555_g2132.t1)
 4.66 4.25 2.74 2.66 2.34 1.45 1.87 1.56 2.9 3.07 3.07 3.62 4.11 2.73 2.71 2.22 2.1 7.62 2.86 2.04 0.17 0.07 2.97 3.13 0.36 1.46
Cpa|evm.model.tig00000615.60 (tig00000615_g2589.t1)
 214.82 276.81 239.83 223.57 194.63 134.45 104.18 102.34 65.57 69.72 79.07 97.25 205.65 303.97 235.97 204.1 175.03 567.73 285.01 752.29 69.14 88.47 34.28 121.44 110.96 82.04
Cpa|evm.model.tig00000718.26 (tig00000718_g3701.t1)
 5.43 5.48 4.15 3.69 2.08 2.12 3.99 5.1 6.24 8.17 8.07 11.22 9.07 4.62 4.31 6.24 3.56 10.85 6.53 5.17 0.42 1.33 4.59 4.37 3.06 4.21
Cpa|evm.model.tig00000870.15 (tig00000870_g5133.t1)
 8.27 7.99 15.23 29.86 45.3 59.14 50.35 44.21 37.86 33.21 29.46 20.83 8.18 12.44 37.54 14.46 12.81 93.25 67.9 40.01 4.3 35.87 25.22 10.17 46.88 28.62
Cpa|evm.model.tig00001001.20 (tig00000157_g9677.t1)
 0.07 0.13 0.13 0.13 0.27 0.16 0.07 0.04 0.18 0.17 0.3 0.16 0.07 0.03 0.02 0.91 0.08 1.4 0.52 1.39 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03
Cpa|evm.model.tig00001220.7 (tig00001220_g7623.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.13 0.14 0.18 0.03 0.23 0.08 0.18 0.0 0.0 0.13 0.13
Cpa|evm.model.tig00020510.99 (tig00020510_g9888.t1)
 0.98 0.36 0.04 0.28 0.8 0.36 0.45 0.79 1.15 1.26 2.21 2.07 1.91 3.3 2.5 1.95 0.73 4.17 7.33 7.19 3.92 3.4 1.68 6.78 1.69 1.23
Cpa|evm.model.tig00020542.14 (tig00021591_g22790.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020616.36 (tig00020616_g12272.t1)
 7.96 4.6 5.56 7.46 12.86 16.53 17.48 14.19 11.75 21.34 20.92 17.25 9.68 78.91 20.57 31.27 77.45 45.39 47.01 126.85 11.13 6.61 20.24 32.0 21.29 18.5
Cpa|evm.model.tig00020629.3 (tig00000498_g1650.t1)
 0.19 0.08 0.25 0.05 0.17 0.14 0.34 0.09 0.18 0.13 0.19 0.12 0.18 0.54 0.34 0.23 0.15 5.02 0.5 0.14 0.01 0.05 0.31 0.25 0.04 0.07
Cpa|evm.model.tig00020675.105 (tig00020675_g12688.t1)
 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 1.21 2.25 0.13 0.05 3.38 3.45 3.65 0.18 0.0 0.15 0.73 0.07 0.33
Cpa|evm.model.tig00020688.7 (tig00020921_g15923.t1)
 0.04 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.04 0.11 0.03 0.06 0.08 0.23 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0
Cpa|evm.model.tig00020734.39 (tig00020734_g13591.t1)
 0.14 0.29 0.31 0.07 0.59 0.31 0.44 0.08 0.04 0.18 0.49 0.19 0.15 27.24 7.36 11.4 24.81 23.24 15.37 101.47 5.26 4.24 0.97 18.21 4.63 5.03
Cpa|evm.model.tig00020734.40 (tig00020734_g13592.t1)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.89 0.0 0.41 0.3 0.49 0.2 1.32 0.17 0.0 0.0 0.3 0.0 0.07
Cpa|evm.model.tig00020849.14 (tig00020849_g14644.t1)
 0.23 0.0 0.17 0.43 0.32 0.39 0.27 0.67 0.64 1.0 1.42 0.88 0.19 1.64 0.67 0.02 0.94 0.62 0.76 2.45 0.02 0.24 0.62 0.57 0.58 1.31
Cpa|evm.model.tig00020849.15 (tig00020849_g14645.t1)
 0.04 0.0 0.0 0.04 0.17 0.09 0.02 0.08 0.02 0.21 0.15 0.16 0.03 0.37 0.09 0.05 0.09 0.22 0.23 0.5 0.0 0.09 0.02 0.11 0.1 0.35
Cpa|evm.model.tig00020902.16 (tig00020902_g14960.t1)
 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.38 0.92 0.36 0.3 3.27 1.65 0.73 0.68 0.46 1.04 1.04 0.21 1.17
Cpa|evm.model.tig00020902.79 (tig00020902_g15034.t1)
 6.96 8.96 13.52 15.76 9.0 5.38 3.27 6.78 4.15 7.45 8.07 8.63 5.89 0.27 1.6 9.54 1.03 57.91 6.8 13.81 1.12 0.73 5.96 8.43 25.49 16.83
Cpa|evm.model.tig00020904.62 (tig00020904_g15192.t1)
 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.23 0.0 0.89 0.0 0.93 0.8 1.58 0.54 1.27 0.14 0.37 0.22 0.73 0.15 0.73
Cpa|evm.model.tig00020943.17 (tig00020943_g16259.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.06 0.0 0.78 0.17 0.0 0.1 0.05 0.03 0.0 0.08 0.1
Cpa|evm.model.tig00020960.12 (tig00020960_g16534.t1)
 0.06 0.0 0.05 0.02 0.07 0.04 0.07 0.09 0.11 0.04 0.06 0.09 0.0 0.06 0.2 0.09 0.12 0.64 0.54 0.39 0.02 0.03 0.36 0.16 0.03 0.18
Cpa|evm.model.tig00020996.42 (tig00020996_g16954.t1)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.04 0.11 0.11 0.0 0.16 0.08 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0
Cpa|evm.model.tig00021036.44 (tig00021036_g17314.t1)
 0.21 0.25 0.38 0.24 0.16 0.14 0.21 0.35 0.25 0.65 0.43 0.4 0.26 0.82 0.65 0.28 0.34 2.4 0.4 1.36 0.05 0.28 0.69 0.47 1.5 0.72
Cpa|evm.model.tig00021036.45 (tig00021036_g17318.t1)
 0.23 0.14 0.16 0.16 0.26 0.14 0.23 0.18 0.23 0.33 0.39 0.33 0.22 0.39 0.45 0.05 0.24 2.04 0.37 1.83 0.09 0.17 0.89 1.37 1.68 0.96
Cpa|evm.model.tig00021036.57 (tig00021036_g17333.t1)
 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.08 0.0 0.02 0.36 0.02 0.12 0.01 0.0 0.11 0.0 0.03 0.01
Cpa|evm.model.tig00021073.54 (tig00021073_g18060.t1)
 0.02 0.0 0.07 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.11 0.1 0.02 0.06 0.19 0.0 0.0 0.01 0.02
Cpa|evm.model.tig00021105.21 (tig00021105_g18232.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021105.57 (tig00021105_g18269.t1)
 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.06 0.01 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0
Cpa|evm.model.tig00021127.141 (tig00021127_g18822.t2)
 0.52 0.17 0.37 0.57 0.2 0.11 0.18 0.14 0.2 0.1 0.36 0.12 0.26 0.14 0.16 0.13 0.05 0.42 0.36 0.05 0.06 0.54 0.02 0.02 0.4 0.33
Cpa|evm.model.tig00021128.16 (tig00020904_g15225.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.03 0.07 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021254.7 (tig00021254_g19683.t1)
 0.16 0.6 0.65 0.73 0.84 0.83 0.76 0.3 0.34 0.7 0.72 0.54 0.17 0.0 0.66 0.0 1.07 5.98 4.29 1.15 0.75 2.85 0.06 0.22 2.13 0.46
Cpa|evm.model.tig00021314.15 (tig00021314_g20125.t1)
 4.35 3.51 11.02 11.62 4.89 2.26 3.47 6.57 2.14 2.22 1.8 1.65 2.45 4.17 5.46 4.03 3.19 19.03 6.51 34.04 1.58 6.11 0.46 8.28 10.04 13.84
Cpa|evm.model.tig00021348.99 (tig00021348_g20607.t1)
 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.08 0.02 0.0 0.35 0.06 0.09 0.14 0.78 0.09 0.12 0.49 0.0 0.62 0.14 0.03 0.26
Cpa|evm.model.tig00021374.43 (tig00021374_g21126.t1)
 0.02 0.15 0.16 0.5 0.6 0.95 0.67 0.44 0.33 0.91 0.6 0.7 0.11 0.71 0.16 0.23 0.24 2.32 0.34 10.1 0.77 0.27 5.11 2.61 1.78 3.12
Cpa|evm.model.tig00021433.28 (tig00021433_g21280.t1)
 5.28 3.72 4.36 5.17 5.09 5.58 4.66 3.97 7.67 5.97 5.12 5.21 3.5 5.81 5.45 6.89 4.72 15.24 8.14 4.3 7.01 9.68 4.8 5.44 7.89 4.25
Cpa|evm.model.tig00021440.3 (tig00021440_g21532.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.08 0.02 0.0 0.09 0.02 0.01 0.2 0.01 0.03
Cpa|evm.model.tig00021612.4 (tig00021612_g22852.t1)
 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.05 0.04 0.06 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.07

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)