Heatmap: Cluster_142 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.166 (tig00000042_g15567.t1)	0.5	0.77	0.77	0.71	0.76	0.89	0.71	0.64	0.68	0.61	0.59	0.57	0.5	0.82	0.84	1.0	0.75	0.73	0.81	0.67	0.22	0.29	0.82	0.44	0.51	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000142.14 (tig00000142_g8649.t1)	0.01	0.14	0.24	0.32	0.48	0.87	0.57	0.37	0.54	0.37	0.25	0.26	0.03	0.94	0.28	1.0	0.28	0.23	0.28	0.23	0.07	0.03	0.12	0.07	0.27	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000241.111 (tig00000241_g20977.t1)	0.68	0.46	0.59	0.6	0.75	1.0	0.8	0.72	0.8	0.61	0.64	0.63	0.69	0.79	0.88	0.88	0.71	0.62	0.6	0.57	0.12	0.33	0.52	0.53	0.62	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000241.17 (tig00000241_g20875.t2)	0.7	0.92	0.93	0.95	1.0	0.97	0.76	0.76	0.86	0.76	0.94	0.77	0.68	0.51	0.55	0.49	0.44	0.61	0.68	0.62	0.01	0.34	0.42	0.57	0.53	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000248.10 (tig00000248_g21778.t1)	0.28	0.39	0.41	0.42	0.45	0.49	0.45	0.45	0.46	0.48	0.5	0.43	0.3	0.13	0.23	0.88	0.28	0.39	0.34	0.33	0.11	0.3	1.0	0.64	0.31	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000317.3 (tig00000317_g24011.t1)	0.45	0.35	0.37	0.41	0.55	0.6	0.37	0.38	0.46	0.55	0.51	0.55	0.47	0.7	0.79	1.0	0.52	0.49	0.85	0.59	0.38	0.68	0.17	0.31	0.28	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000342.35 (tig00000342_g24219.t1)	0.35	0.61	0.67	0.67	0.71	0.86	0.76	0.68	0.78	0.83	0.73	0.74	0.34	0.46	0.67	1.0	0.74	0.79	0.84	0.88	0.12	0.32	0.88	0.63	0.35	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000361.53 (tig00000361_g24401.t1)	0.75	0.71	0.54	0.81	0.75	0.85	0.79	1.0	0.7	0.65	0.69	0.55	0.45	0.61	0.78	0.68	0.54	0.49	0.78	0.67	0.05	0.48	0.63	0.41	0.45	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000403.25 (tig00000403_g282.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	1.0	0.63	0.18	0.11	0.25	0.27	0.24	0.0	0.2	0.15	0.0	0.11
Cpa\|evm.model.tig00000507.22 (tig00000507_g1776.t1)	0.49	0.4	0.5	0.43	0.42	0.49	0.46	0.39	0.38	0.4	0.36	0.37	0.49	0.85	1.0	0.84	0.63	0.5	0.63	0.57	0.23	0.32	0.55	0.3	0.31	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000571.8 (tig00000571_g2159.t1)	0.4	0.39	0.27	0.38	0.69	1.0	0.82	0.42	0.31	0.07	0.04	0.04	0.37	0.8	0.34	0.6	0.3	0.22	0.24	0.2	0.07	0.05	0.09	0.01	0.21	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000600.8 (tig00000600_g2267.t1)	0.62	0.79	0.6	0.45	0.4	0.34	0.4	0.46	0.39	0.4	0.38	0.39	0.6	0.57	1.0	0.71	0.52	0.8	0.79	0.55	0.09	0.49	0.32	0.36	0.31	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000605.32 (tig00000605_g2498.t1)	0.43	0.68	0.74	0.64	0.58	0.44	0.4	0.37	0.51	0.57	0.52	0.54	0.43	0.91	0.93	0.8	0.39	0.55	1.0	0.9	0.33	0.49	0.47	0.31	0.28	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000615.49 (tig00000615_g2578.t1)	0.89	0.92	0.72	0.55	0.51	0.49	0.54	0.55	0.58	0.56	0.51	0.54	0.8	0.64	1.0	0.75	0.67	0.96	0.84	0.62	0.15	0.27	0.52	0.55	0.47	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000624.3 (tig00000624_g2642.t1)	0.61	0.7	0.5	0.46	0.52	0.53	0.55	0.5	0.67	0.61	0.59	0.6	0.49	0.79	1.0	0.82	0.69	0.63	0.96	0.72	0.07	0.31	0.74	0.84	0.56	0.86
Cpa\|evm.model.tig00000640.2 (tig00000640_g2756.t1)	0.22	0.53	0.46	0.62	0.68	0.52	0.6	0.45	0.21	0.11	0.09	0.08	0.18	0.91	0.65	1.0	0.48	0.34	0.36	0.12	0.0	0.22	0.07	0.03	0.37	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000718.45 (tig00000718_g3720.t1)	0.77	0.65	0.7	0.79	0.99	1.0	0.99	0.93	0.87	0.74	0.7	0.59	0.79	0.91	0.91	0.93	0.86	0.8	0.82	0.89	0.15	0.56	0.8	0.52	0.76	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000734.5 (tig00000734_g3759.t1)	0.32	0.44	0.58	0.49	0.54	0.45	0.67	0.46	0.43	0.44	0.44	0.25	0.29	0.87	0.99	0.98	1.0	0.38	0.73	1.0	0.15	0.2	0.11	0.28	0.15	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000734.6 (tig00000734_g3760.t1)	0.61	0.8	1.0	0.67	0.31	0.21	0.38	0.38	0.53	0.59	0.6	0.46	0.48	0.98	0.96	0.97	0.67	0.59	0.77	0.96	0.03	0.01	0.0	0.13	0.01	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000737.8 (tig00000737_g3784.t1)	0.13	0.21	0.33	0.35	0.43	0.4	0.45	0.38	0.49	0.68	0.62	0.5	0.11	0.95	1.0	0.92	0.84	0.41	0.56	0.57	0.01	0.02	0.15	0.19	0.06	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000802.37 (tig00000802_g4286.t1)	0.2	0.19	0.21	0.32	0.69	0.83	0.64	0.53	0.33	0.3	0.22	0.14	0.25	1.0	0.36	0.8	0.44	0.48	0.39	0.31	0.08	0.16	0.4	0.21	0.4	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000829.7 (tig00000829_g4649.t1)	0.52	0.66	0.77	0.83	0.95	1.0	0.9	0.84	0.82	0.69	0.67	0.6	0.58	0.73	0.73	0.7	0.57	0.52	0.54	0.65	0.17	0.16	0.32	0.27	0.36	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000865.26 (tig00000865_g5078.t1)	0.32	0.36	0.38	0.39	0.6	0.73	0.56	0.47	0.38	0.32	0.28	0.2	0.19	0.26	0.39	1.0	0.45	0.45	0.44	0.59	0.0	0.03	0.1	0.11	0.16	0.16
Cpa\|evm.model.tig00001003.16 (tig00001003_g6273.t1)	0.33	0.32	0.51	0.43	0.55	0.49	0.84	0.64	0.56	0.53	0.32	0.29	0.25	0.65	0.69	0.87	1.0	0.57	0.75	0.99	0.04	0.13	0.16	0.2	0.16	0.23
Cpa\|evm.model.tig00001024.11 (tig00001024_g6320.t1)	0.45	0.41	0.34	0.46	0.56	0.85	0.81	0.67	0.71	0.43	0.4	0.38	0.35	1.0	0.53	0.89	0.35	0.35	0.25	0.27	0.04	0.3	0.2	0.19	0.32	0.25
Cpa\|evm.model.tig00001095.25 (tig00001095_g7042.t1)	0.89	0.72	0.71	0.8	0.76	0.79	0.87	0.81	0.87	0.67	0.62	0.54	0.73	0.78	1.0	0.84	0.87	0.98	0.99	0.72	0.12	0.38	0.71	0.47	0.56	0.59
Cpa\|evm.model.tig00001178.4 (tig00001178_g7385.t1)	0.59	0.62	0.67	0.84	0.98	1.0	0.89	0.66	0.84	0.79	0.65	0.47	0.37	0.28	0.56	0.23	0.54	0.47	0.69	0.63	0.01	0.29	0.34	0.37	0.33	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001331.7 (tig00001331_g8170.t1)	0.51	0.55	0.56	0.57	0.75	0.98	0.79	0.68	0.7	0.54	0.44	0.37	0.46	0.68	0.72	1.0	0.65	0.5	0.65	0.71	0.09	0.42	0.28	0.34	0.46	0.38
Cpa\|evm.model.tig00001374.11 (tig00001374_g8503.t1)	0.55	0.62	0.83	0.94	0.82	0.96	1.0	0.97	0.88	0.68	0.64	0.62	0.56	0.73	0.78	0.89	0.71	0.68	0.53	0.55	0.01	0.11	0.22	0.27	0.44	0.44
Cpa\|evm.model.tig00001408.2 (tig00001408_g8598.t1)	0.71	0.48	0.54	0.52	0.55	0.53	0.45	0.45	0.56	0.67	0.77	0.85	0.69	0.67	0.68	1.0	0.73	0.7	0.98	0.83	0.31	0.55	0.9	0.88	0.64	0.67
Cpa\|evm.model.tig00001424.10 (tig00001424_g8709.t1)	0.46	0.46	0.47	0.52	0.63	0.75	0.59	0.56	0.56	0.6	0.6	0.57	0.45	0.27	0.33	0.69	0.37	0.48	0.44	0.41	0.07	0.15	1.0	0.64	0.46	0.33
Cpa\|evm.model.tig00001479.1 (tig00001479_g8902.t1)	0.2	0.1	0.03	0.14	0.11	0.1	0.21	0.22	0.27	0.23	0.29	0.11	0.2	0.93	0.75	1.0	0.22	0.66	0.51	0.06	0.09	0.12	0.28	0.5	0.6	0.37
Cpa\|evm.model.tig00001542.9 (tig00001542_g9318.t1)	0.68	0.66	0.67	0.71	0.85	1.0	0.63	0.72	0.72	0.57	0.55	0.59	0.52	0.86	0.92	0.81	0.55	0.47	0.68	0.67	0.14	0.14	0.5	0.38	0.38	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020539.43 (tig00020539_g10434.t1)	0.1	0.1	0.2	0.26	0.22	0.28	0.47	0.4	0.41	0.21	0.11	0.09	0.07	0.36	0.43	1.0	0.34	0.51	0.63	0.35	0.26	0.07	0.16	0.22	0.07	0.15
Cpa\|evm.model.tig00020563.190 (tig00020563_g11392.t1)	0.33	0.42	0.48	0.45	0.48	0.44	0.47	0.47	0.44	0.44	0.37	0.32	0.32	0.71	1.0	0.79	0.64	0.69	0.86	0.59	0.17	0.38	0.21	0.33	0.22	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020564.27 (tig00020564_g11428.t1)	0.64	0.85	0.82	0.79	0.82	0.8	0.82	0.67	0.71	0.83	0.77	0.74	0.62	0.85	0.97	0.78	0.84	0.9	1.0	0.74	0.33	0.29	0.75	0.85	0.65	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020589.3 (tig00020589_g11617.t1)	0.47	0.39	0.44	0.52	0.52	0.73	1.0	0.96	0.72	0.57	0.39	0.33	0.45	0.83	0.85	0.85	0.43	0.43	0.38	0.42	0.04	0.09	0.39	0.23	0.41	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020592.39 (tig00020592_g11672.t1)	0.7	0.81	0.79	1.0	0.98	0.87	0.81	0.9	0.83	0.73	0.78	0.67	0.68	0.49	0.86	0.73	0.56	0.8	0.87	0.59	0.08	0.49	0.57	0.49	0.55	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020610.41 (tig00020610_g11981.t1)	0.42	0.5	0.57	0.49	0.56	0.65	0.56	0.51	0.53	0.56	0.52	0.53	0.42	0.52	1.0	0.87	0.69	0.67	0.8	0.68	0.42	0.29	0.39	0.46	0.23	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020629.23 (tig00020629_g12342.t2)	0.25	0.52	0.61	0.6	0.85	0.93	0.82	0.7	0.79	0.53	0.53	0.39	0.29	0.84	0.77	1.0	0.7	0.63	0.8	0.73	0.1	0.27	0.56	0.39	0.43	0.76
Cpa\|evm.model.tig00020629.31 (tig00020629_g12354.t1)	0.3	0.31	0.33	0.38	0.39	0.48	0.69	0.63	0.53	0.31	0.3	0.23	0.24	0.7	0.66	1.0	0.29	0.59	0.69	0.31	0.29	0.24	0.29	0.23	0.38	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020629.32 (tig00020629_g12354.t1)	0.23	0.17	0.27	0.26	0.28	0.21	0.52	0.44	0.31	0.22	0.15	0.15	0.13	0.71	0.5	1.0	0.34	0.65	0.61	0.31	0.3	0.24	0.2	0.38	0.47	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020703.3 (tig00020703_g13107.t1)	0.32	0.4	0.47	0.41	0.47	0.54	0.52	0.47	0.62	0.57	0.53	0.46	0.3	0.71	0.47	1.0	0.45	0.48	0.58	0.48	0.09	0.55	0.44	0.36	0.47	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020703.36 (tig00020703_g13138.t1)	0.33	0.32	0.43	0.55	0.69	0.74	1.0	0.83	0.71	0.47	0.38	0.33	0.25	0.65	0.66	0.84	0.53	0.44	0.58	0.51	0.03	0.27	0.65	0.22	0.43	0.28
Cpa\|evm.model.tig00020703.8 (tig00020703_g13110.t1)	0.3	0.37	0.42	0.36	0.43	0.44	0.42	0.43	0.44	0.45	0.43	0.38	0.29	0.56	0.78	1.0	0.51	0.51	0.62	0.51	0.26	0.21	0.35	0.38	0.21	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020780.15 (tig00020780_g13768.t1)	0.2	0.34	0.4	0.43	0.53	0.75	0.74	0.71	0.68	0.63	0.53	0.42	0.19	0.67	0.56	1.0	0.46	0.57	0.63	0.53	0.09	0.49	0.46	0.45	0.55	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020830.52 (tig00020830_g14435.t1)	0.35	0.29	0.38	0.44	0.51	0.49	0.47	0.52	0.48	0.44	0.29	0.34	0.26	0.28	0.4	0.97	0.31	0.42	0.4	0.49	0.03	0.01	1.0	0.2	0.17	0.26
Cpa\|evm.model.tig00020912.79 (tig00020912_g15849.t1)	0.44	0.62	0.75	0.83	0.93	1.0	0.88	0.76	0.65	0.49	0.41	0.38	0.47	0.6	0.51	0.62	0.65	0.47	0.45	0.53	0.11	0.29	0.24	0.19	0.36	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020960.65 (tig00020960_g16591.t1)	0.64	0.57	0.65	0.57	0.58	0.56	0.57	0.55	0.68	0.85	0.84	0.83	0.46	0.87	0.88	0.77	0.84	0.78	1.0	0.87	0.16	0.48	0.9	0.98	0.52	0.69
Cpa\|evm.model.tig00020961.47 (tig00020961_g16669.t1)	0.67	0.72	0.78	0.79	0.89	1.0	0.89	0.71	0.74	0.54	0.5	0.52	0.59	0.62	0.65	0.77	0.58	0.59	0.58	0.55	0.18	0.64	0.57	0.38	0.49	0.43
Cpa\|evm.model.tig00021098.7 (tig00021098_g18173.t1)	0.44	0.68	0.71	0.71	0.7	0.61	0.8	0.77	0.64	0.53	0.42	0.35	0.44	1.0	0.62	0.91	0.47	0.45	0.38	0.44	0.19	0.3	0.45	0.27	0.53	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021098.8 (tig00021098_g18174.t1)	0.52	0.77	0.86	0.79	0.86	0.98	0.91	0.85	0.78	0.61	0.53	0.47	0.54	1.0	0.69	0.87	0.49	0.42	0.5	0.47	0.15	0.32	0.4	0.28	0.52	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021312.32 (tig00021312_g20066.t1)	0.07	0.05	0.08	0.24	0.22	0.29	0.4	0.18	0.83	0.19	0.13	0.13	0.05	1.0	0.21	0.59	0.06	0.2	0.08	0.08	0.3	0.11	0.09	0.02	0.13	0.2
Cpa\|evm.model.tig00021319.5 (tig00021319_g20200.t1)	0.56	0.7	0.76	0.79	0.77	1.0	0.91	0.78	0.8	0.59	0.67	0.65	0.51	0.57	0.73	0.87	0.49	0.55	0.54	0.49	0.12	0.28	0.56	0.42	0.51	0.53
Cpa\|evm.model.tig00021374.13 (tig00021374_g21096.t1)	0.34	0.37	0.44	0.44	0.4	0.38	0.36	0.33	0.4	0.35	0.35	0.34	0.38	0.72	1.0	0.8	0.38	0.79	0.76	0.36	0.13	0.16	0.26	0.27	0.21	0.32
Cpa\|evm.model.tig00021428.28 (tig00021428_g21170.t1)	0.04	0.04	0.06	0.13	0.34	0.76	0.59	0.28	0.48	0.19	0.15	0.06	0.07	1.0	0.41	0.67	0.19	0.27	0.27	0.16	0.0	0.01	0.07	0.04	0.04	0.08
Cpa\|evm.model.tig00021493.35 (tig00021493_g21880.t1)	0.67	0.92	0.69	0.48	0.44	0.57	0.85	1.0	0.81	0.53	0.35	0.27	0.53	0.93	0.28	0.44	0.39	0.45	0.39	0.48	0.01	0.08	0.2	0.12	0.68	0.47
Cpa\|evm.model.tig00021501.11 (tig00021501_g21951.t1)	0.47	0.48	0.63	0.66	0.77	0.97	1.0	0.87	0.71	0.52	0.34	0.27	0.42	0.51	0.41	0.63	0.5	0.51	0.55	0.67	0.01	0.17	0.06	0.09	0.3	0.23
Cpa\|evm.model.tig00021582.32 (tig00021582_g22630.t1)	0.5	0.48	0.59	0.65	0.87	1.0	0.98	0.86	0.72	0.52	0.38	0.31	0.41	0.62	0.45	0.79	0.58	0.47	0.57	0.58	0.02	0.24	0.11	0.16	0.33	0.26
Cpa\|evm.model.tig00021742.28 (tig00021742_g23339.t1)	0.03	0.21	0.38	0.26	0.25	0.03	0.13	0.03	0.03	0.29	0.17	0.0	0.0	0.81	0.89	0.75	1.0	0.21	0.43	0.68	0.02	0.05	0.0	0.12	0.0	0.08

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)