Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000025.6 (tig00000025_g7913.t1)	0.53	0.29	0.22	0.21	0.15	0.18	0.3	0.37	0.35	0.35	0.41	0.48	0.58	1.0	0.38	0.38	0.33	0.51	0.38	0.29	0.03	0.25	0.15	0.29	0.54	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000073.20 (tig00000073_g1703.t1)	0.79	0.11	0.1	0.18	0.13	0.1	0.31	0.31	0.17	0.27	0.44	0.51	1.0	0.63	0.07	0.57	0.24	0.19	0.11	0.09	0.02	0.01	0.08	0.02	0.79	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000123.15 (tig00000123_g6921.t2)	0.03	0.05	0.03	0.05	0.1	0.09	0.17	0.17	0.25	0.26	0.24	0.15	0.06	1.0	0.13	0.15	0.09	0.26	0.17	0.12	0.03	0.15	0.26	0.17	0.33	0.21
Cpa\|evm.model.tig00000140.15 (tig00000140_g8470.t1)	0.35	0.12	0.13	0.37	0.25	0.24	0.41	0.36	0.26	0.18	0.15	0.13	0.18	1.0	0.13	0.64	0.13	0.23	0.27	0.2	0.13	0.16	0.34	0.36	0.41	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000241.89 (tig00000241_g20952.t1)	0.6	0.4	0.28	0.25	0.12	0.09	0.14	0.24	0.13	0.2	0.25	0.3	0.51	0.94	0.11	0.16	0.13	0.19	0.2	0.15	0.29	0.38	0.17	0.35	1.0	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000361.26 (tig00000361_g24378.t1)	0.64	0.42	0.38	0.42	0.35	0.27	0.43	0.39	0.3	0.31	0.34	0.35	0.69	0.71	0.46	0.62	0.41	0.41	0.34	0.27	0.04	0.26	0.25	0.35	1.0	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000396.19 (tig00000269_g23700.t1)	0.51	0.34	0.5	0.52	0.68	0.51	0.72	0.66	0.69	1.0	0.92	0.75	0.69	0.99	0.27	0.77	0.41	0.73	0.61	0.5	0.15	0.84	0.64	0.84	0.78	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000403.85 (tig00000403_g344.t1)	0.22	0.08	0.06	0.16	0.16	0.15	0.27	0.33	0.38	0.35	0.33	0.25	0.2	1.0	0.26	0.31	0.19	0.26	0.18	0.17	0.03	0.65	0.18	0.13	0.47	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000451.20 (tig00000451_g978.t1)	0.13	0.12	0.13	0.22	0.29	0.22	0.21	0.23	0.18	0.25	0.28	0.24	0.16	1.0	0.08	0.42	0.11	0.35	0.18	0.13	0.13	0.55	0.35	0.26	0.56	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000571.42 (tig00000571_g2195.t1)	0.21	0.12	0.14	0.21	0.15	0.13	0.18	0.19	0.15	0.17	0.23	0.16	0.18	0.59	0.2	0.39	0.11	0.2	0.09	0.1	0.02	0.03	0.21	0.08	1.0	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000658.35 (tig00000658_g2926.t1)	0.61	0.32	0.17	0.17	0.12	0.15	0.3	0.39	0.17	0.22	0.26	0.27	0.61	0.74	0.29	0.56	0.2	0.22	0.12	0.07	0.03	0.22	0.06	0.13	1.0	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000663.64 (tig00000663_g2996.t1)	0.57	0.26	0.26	0.21	0.3	0.34	0.54	0.55	0.39	0.43	0.39	0.39	0.53	1.0	0.56	0.85	0.43	0.39	0.35	0.42	0.01	0.08	0.12	0.1	0.58	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000737.13 (tig00000737_g3793.t1)	0.32	0.22	0.16	0.2	0.13	0.08	0.17	0.22	0.18	0.26	0.32	0.28	0.36	1.0	0.31	0.43	0.3	0.24	0.21	0.19	0.13	0.29	0.46	0.3	0.42	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000743.33 (tig00000743_g3881.t1)	0.61	0.36	0.29	0.37	0.41	0.41	0.67	0.68	0.53	0.53	0.58	0.49	0.72	0.67	0.45	0.46	0.25	0.32	0.23	0.28	0.03	0.29	0.36	0.2	1.0	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000792.10 (tig00000792_g4159.t1)	0.64	0.48	0.42	0.46	0.53	0.55	0.69	0.71	0.57	0.6	0.62	0.55	0.63	1.0	0.54	0.88	0.64	0.54	0.43	0.44	0.1	0.56	0.54	0.6	0.9	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000821.42 (tig00000821_g4500.t1)	0.71	0.43	0.39	0.42	0.39	0.31	0.47	0.55	0.51	0.62	0.63	0.64	0.78	1.0	0.49	0.64	0.43	0.5	0.36	0.4	0.15	0.37	0.66	0.37	0.7	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000821.53 (tig00000821_g4513.t1)	0.55	0.45	0.45	0.62	0.58	0.51	0.54	0.57	0.51	0.46	0.48	0.49	0.6	0.61	0.5	0.61	0.43	0.54	0.44	0.26	0.05	0.42	0.39	0.38	1.0	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000980.26 (tig00000980_g6153.t1)	0.58	0.43	0.54	0.67	0.61	0.69	0.79	0.67	0.81	0.58	0.65	0.68	0.67	1.0	0.54	0.88	0.52	0.63	0.57	0.45	0.18	0.83	0.4	0.64	0.75	0.64
Cpa\|evm.model.tig00001024.14 (tig00001024_g6323.t1)	0.25	0.12	0.08	0.16	0.12	0.1	0.37	0.32	0.27	0.37	0.41	0.31	0.26	0.86	0.12	0.22	0.19	0.17	0.06	0.09	0.09	0.17	0.49	0.53	1.0	0.44
Cpa\|evm.model.tig00001056.8 (tig00001056_g6628.t1)	0.15	0.12	0.1	0.05	0.01	0.02	0.06	0.09	0.08	0.1	0.08	0.06	0.18	1.0	0.05	0.06	0.06	0.06	0.04	0.04	0.0	0.02	0.0	0.0	0.05	0.02
Cpa\|evm.model.tig00001057.22 (tig00001057_g6696.t1)	0.72	0.33	0.2	0.33	0.27	0.15	0.31	0.36	0.2	0.28	0.38	0.4	0.79	0.52	0.28	0.71	0.26	0.19	0.14	0.11	0.06	0.61	0.24	0.19	1.0	0.54
Cpa\|evm.model.tig00001065.12 (tig00001065_g6714.t1)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.01	0.03	0.0	1.0	0.01	0.0	0.07	0.04	0.04	0.02	0.03	0.03	0.16	0.11	0.05	0.09
Cpa\|evm.model.tig00001181.5 (tig00001181_g7422.t1)	0.58	0.27	0.23	0.22	0.22	0.27	0.42	0.47	0.42	0.42	0.38	0.35	0.54	1.0	0.4	0.62	0.34	0.48	0.41	0.34	0.04	0.17	0.28	0.28	0.42	0.38
Cpa\|evm.model.tig00001292.2 (tig00001292_g8038.t1)	0.29	0.27	0.28	0.35	0.31	0.31	0.4	0.44	0.3	0.33	0.34	0.29	0.39	0.86	0.34	0.82	0.35	0.34	0.27	0.21	0.05	0.18	0.22	0.18	1.0	0.39
Cpa\|evm.model.tig00001496.4 (tig00001496_g9204.t1)	0.31	0.13	0.15	0.18	0.11	0.11	0.38	0.71	0.3	0.31	0.26	0.19	0.39	1.0	0.04	0.21	0.23	0.15	0.16	0.17	0.0	0.01	0.01	0.01	0.31	0.18
Cpa\|evm.model.tig00020516.14 (tig00020516_g9962.t1)	0.43	0.31	0.36	0.39	0.31	0.26	0.35	0.36	0.4	0.25	0.25	0.25	0.45	0.69	0.52	0.57	0.41	0.37	0.31	0.26	0.02	0.27	0.21	0.18	1.0	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020554.105 (tig00020554_g10882.t1)	0.28	0.04	0.04	0.05	0.04	0.08	0.25	0.31	0.21	0.24	0.19	0.15	0.44	1.0	0.01	0.08	0.04	0.08	0.09	0.09	0.0	0.01	0.0	0.0	0.1	0.07
Cpa\|evm.model.tig00020554.167 (tig00020554_g10946.t1)	0.41	0.34	0.36	0.38	0.29	0.31	0.53	0.64	0.62	0.72	0.71	0.67	0.5	1.0	0.36	0.68	0.48	0.5	0.4	0.43	0.14	0.35	0.61	0.45	0.74	0.59
Cpa\|evm.model.tig00020554.8 (tig00020554_g10792.t1)	0.4	0.17	0.13	0.08	0.18	0.3	0.14	0.17	0.27	0.25	0.25	0.21	0.33	1.0	0.25	0.44	0.19	0.31	0.42	0.38	0.03	0.1	0.17	0.06	0.54	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020563.91 (tig00020563_g11276.t1)	0.34	0.23	0.18	0.42	0.48	0.22	0.46	0.64	0.55	0.48	0.62	0.45	0.38	0.54	0.2	0.46	0.21	0.21	0.23	0.23	0.02	0.12	0.55	0.41	1.0	0.4
Cpa\|evm.model.tig00020610.59 (tig00020610_g12002.t1)	0.35	0.16	0.18	0.21	0.28	0.44	0.61	0.51	0.36	0.33	0.25	0.16	0.31	1.0	0.54	0.76	0.28	0.24	0.2	0.22	0.01	0.22	0.27	0.16	0.69	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020614.122 (tig00020614_g12238.t1)	0.51	0.21	0.19	0.17	0.14	0.15	0.28	0.3	0.3	0.38	0.31	0.37	0.48	1.0	0.25	0.53	0.27	0.38	0.28	0.33	0.05	0.07	0.17	0.16	0.48	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020614.20	0.41	0.59	0.68	0.7	0.69	0.47	0.77	0.85	0.86	0.8	0.77	0.78	0.42	1.0	0.4	0.71	0.57	0.66	0.61	0.5	0.12	0.45	0.73	0.47	0.87	0.88
Cpa\|evm.model.tig00020660.47 (tig00020660_g12551.t1)	0.56	0.36	0.35	0.49	0.46	0.37	0.54	0.6	0.47	0.51	0.57	0.48	0.55	0.73	0.33	0.7	0.36	0.31	0.33	0.28	0.03	0.39	0.26	0.23	1.0	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020703.25 (tig00020703_g13127.t1)	0.42	0.14	0.1	0.13	0.09	0.09	0.17	0.25	0.26	0.3	0.4	0.28	0.4	1.0	0.44	0.19	0.14	0.2	0.21	0.11	0.16	0.47	0.63	0.53	0.54	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020704.16 (tig00020704_g13158.t1)	0.33	0.2	0.22	0.24	0.3	0.34	0.48	0.54	0.44	0.38	0.43	0.25	0.3	1.0	0.46	0.64	0.22	0.29	0.24	0.29	0.03	0.34	0.46	0.37	0.62	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020734.33 (tig00000850_g4797.t2)	0.3	0.25	0.35	0.41	0.45	0.49	0.69	0.61	0.67	0.97	0.88	0.71	0.37	1.0	0.35	0.55	0.46	0.59	0.46	0.34	0.17	0.75	0.91	0.74	0.84	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020806.31 (tig00020806_g14050.t1)	0.03	0.0	0.04	0.12	0.08	0.15	0.33	0.46	0.44	0.35	0.39	0.31	0.12	1.0	0.34	0.74	0.16	0.19	0.24	0.09	0.11	0.76	0.2	0.18	0.52	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020902.48 (tig00020902_g15000.t1)	0.46	0.24	0.26	0.17	0.26	0.33	0.41	0.48	0.45	0.33	0.51	0.45	0.46	1.0	0.34	0.44	0.26	0.3	0.25	0.1	0.06	0.13	0.43	0.2	0.65	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020909.6 (tig00020909_g15325.t1)	0.61	0.38	0.43	0.54	0.56	0.67	0.97	0.86	0.93	0.73	0.62	0.57	0.53	0.99	0.75	1.0	0.71	0.71	0.6	0.54	0.22	0.54	0.76	0.54	0.8	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021073.19 (tig00021073_g18022.t1)	0.66	0.48	0.44	0.69	0.47	0.34	0.46	0.57	0.31	0.37	0.47	0.51	0.97	0.8	0.38	0.68	0.28	0.38	0.33	0.25	0.09	0.42	0.23	0.52	1.0	0.58
Cpa\|evm.model.tig00021168.5 (tig00021168_g19071.t1)	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.07	0.05	0.05	0.04	0.03	0.03	0.03	1.0	0.05	0.15	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.02	0.05	0.03	0.18	0.16
Cpa\|evm.model.tig00021168.6 (tig00021168_g19071.t1)	0.03	0.01	0.02	0.04	0.06	0.08	0.1	0.08	0.05	0.07	0.05	0.04	0.04	1.0	0.05	0.19	0.04	0.04	0.04	0.08	0.03	0.01	0.06	0.03	0.34	0.2
Cpa\|evm.model.tig00021179.15 (tig00021179_g19230.t1)	0.15	0.04	0.07	0.11	0.08	0.06	0.1	0.15	0.12	0.18	0.22	0.17	0.14	1.0	0.03	0.14	0.03	0.09	0.11	0.04	0.02	0.12	0.06	0.11	0.14	0.09
Cpa\|evm.model.tig00021276.10 (tig00021276_g19895.t1)	0.14	0.06	0.04	0.03	0.04	0.05	0.13	0.15	0.2	0.28	0.23	0.16	0.17	1.0	0.02	0.09	0.06	0.1	0.12	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.07
Cpa\|evm.model.tig00021348.23 (tig00021348_g20526.t1)	0.1	0.12	0.17	0.2	0.19	0.16	0.27	0.32	0.33	0.33	0.38	0.39	0.14	1.0	0.23	0.51	0.18	0.2	0.22	0.14	0.21	0.19	0.34	0.2	0.47	0.41
Cpa\|evm.model.tig00021348.48 (tig00021348_g20550.t1)	0.3	0.11	0.14	0.17	0.07	0.05	0.13	0.23	0.2	0.27	0.35	0.33	0.26	1.0	0.17	0.25	0.09	0.28	0.19	0.14	0.05	0.43	0.03	0.08	0.32	0.25
Cpa\|evm.model.tig00021428.27 (tig00021428_g21170.t1)	0.96	0.4	0.19	0.19	0.24	0.46	0.61	0.56	0.49	0.43	0.47	0.35	0.93	1.0	0.49	0.62	0.23	0.48	0.44	0.35	0.18	0.18	0.44	0.23	0.55	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021462.2 (tig00021462_g21568.t1)	0.68	0.32	0.28	0.19	0.11	0.1	0.25	0.35	0.23	0.37	0.34	0.35	0.75	1.0	0.09	0.18	0.31	0.32	0.22	0.29	0.0	0.05	0.01	0.03	0.57	0.31
Cpa\|evm.model.tig00021501.7 (tig00021501_g21947.t1)	0.74	0.49	0.63	0.67	0.54	0.41	0.6	0.72	0.66	0.7	0.69	0.66	0.84	0.78	0.65	0.72	0.61	0.56	0.59	0.46	0.25	0.5	0.54	0.52	1.0	0.67
Cpa\|evm.model.tig00021517.5 (tig00021517_g21986.t1)	0.61	0.22	0.22	0.3	0.23	0.15	0.28	0.36	0.34	0.38	0.42	0.44	0.59	1.0	0.14	0.36	0.19	0.29	0.29	0.22	0.17	0.16	0.2	0.24	0.49	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021517.6 (tig00021517_g21988.t1)	0.47	0.21	0.22	0.22	0.16	0.11	0.24	0.31	0.21	0.31	0.31	0.34	0.43	1.0	0.12	0.31	0.19	0.3	0.24	0.23	0.14	0.15	0.17	0.18	0.36	0.33
Cpa\|evm.model.tig00021589.20 (tig00021589_g22726.t1)	0.67	0.39	0.39	0.36	0.26	0.23	0.37	0.45	0.39	0.42	0.42	0.43	0.61	1.0	0.21	0.5	0.3	0.39	0.35	0.33	0.06	0.28	0.24	0.29	0.7	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021616.17 (tig00021616_g22922.t1)	0.64	0.26	0.17	0.15	0.07	0.04	0.2	0.28	0.24	0.24	0.34	0.26	0.55	1.0	0.13	0.56	0.15	0.17	0.14	0.11	0.03	0.14	0.11	0.07	0.7	0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)