Heatmap: Cluster_67 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000057.91 (tig00000057_g109.t2)	0.3	0.34	0.34	0.38	0.4	0.39	0.53	0.58	0.65	0.78	0.93	0.91	0.45	0.39	0.62	0.35	0.53	0.35	0.33	0.27	0.12	0.42	0.51	0.72	1.0	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000139.1 (tig00000139_g8292.t1)	0.12	0.35	0.34	0.5	0.49	0.42	0.6	0.64	0.68	0.86	0.9	0.8	0.23	0.4	0.84	0.5	0.81	0.25	0.33	0.35	0.11	0.12	0.77	0.79	1.0	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000144.70 (tig00000144_g9061.t1)	0.21	0.2	0.24	0.35	0.4	0.35	0.38	0.35	0.52	0.55	0.74	0.53	0.17	0.12	0.2	0.05	0.27	0.27	0.34	0.3	0.09	0.18	0.19	0.52	1.0	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000145.2 (tig00000145_g8793.t1)	0.73	0.65	0.64	0.64	0.71	0.75	0.86	0.86	0.9	0.99	0.97	0.9	0.78	0.27	0.43	0.21	0.59	0.65	0.56	0.73	0.1	0.69	0.53	0.77	0.83	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000147.56 (tig00000147_g9496.t2)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.08	0.06	0.1	0.09	0.02	0.09	0.01	0.07	0.14	0.01	0.01	0.03	0.01	0.68	0.07	0.11	1.0	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000157.3 (tig00000157_g9592.t1)	0.11	0.11	0.0	0.12	0.09	0.0	0.06	0.14	0.11	0.04	0.19	0.07	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.06	0.08	0.0	0.0	0.42	0.13	0.27	1.0	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000157.43 (tig00000157_g9633.t1)	0.42	0.36	0.37	0.48	0.43	0.3	0.44	0.47	0.56	0.54	0.6	0.57	0.32	0.15	0.22	0.14	0.27	0.36	0.4	0.33	0.03	0.4	0.35	0.42	0.96	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000157.44 (tig00000157_g9633.t1)	0.46	0.59	0.57	0.66	0.59	0.43	0.7	0.7	0.67	0.84	0.83	0.83	0.4	0.29	0.41	0.3	0.55	0.48	0.51	0.69	0.01	0.43	0.27	0.5	0.77	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000157.45 (tig00000157_g9634.t1)	0.51	0.33	0.37	0.38	0.37	0.34	0.43	0.48	0.47	0.63	0.67	0.64	0.51	0.35	0.25	0.1	0.41	0.37	0.49	0.45	0.05	0.42	0.45	0.94	0.76	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000178.18 (tig00000178_g12728.t1)	0.5	0.63	0.61	0.61	0.63	0.61	0.77	0.72	0.78	0.79	0.82	0.75	0.49	0.35	0.38	0.29	0.51	0.63	0.64	0.66	0.02	0.55	0.57	0.69	0.9	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000178.62 (tig00000178_g12774.t1)	0.53	0.3	0.53	0.6	0.3	0.15	0.23	0.44	0.5	0.81	0.94	1.0	0.67	0.32	0.25	0.31	0.54	0.4	0.46	0.42	0.06	0.8	0.48	0.54	0.89	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000254.34 (tig00000254_g22485.t1)	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.05	0.09	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.09	1.0	0.03	0.27	0.76	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000361.20 (tig00000361_g24371.t1)	0.54	0.48	0.49	0.57	0.61	0.45	0.63	0.63	0.65	0.85	0.88	0.81	0.56	0.31	0.37	0.2	0.52	0.53	0.49	0.5	0.03	0.91	0.52	0.94	1.0	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000378.8 (tig00000378_g24499.t1)	0.78	0.65	0.63	0.62	0.61	0.52	0.68	0.67	0.72	0.96	0.91	0.87	0.7	0.37	0.39	0.21	0.47	0.62	0.52	0.6	0.21	0.99	0.6	0.79	0.9	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000391.21 (tig00000391_g24854.t1)	0.53	0.54	0.59	0.65	0.66	0.61	0.76	0.78	0.73	0.94	0.92	0.82	0.46	0.14	0.21	0.08	0.35	0.43	0.47	0.45	0.02	0.53	0.48	0.69	1.0	0.98
Cpa\|evm.model.tig00000404.10 (tig00000404_g374.t1)	0.54	0.46	0.39	0.59	0.57	0.53	0.56	0.65	0.8	0.84	0.88	1.0	0.69	0.22	0.2	0.18	0.34	0.47	0.42	0.39	0.02	0.41	0.24	0.59	0.8	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000455.44 (tig00000455_g1038.t1)	0.87	0.85	0.83	0.84	0.87	0.85	0.87	0.89	0.91	0.96	0.98	0.93	0.85	0.31	0.48	0.3	0.67	0.85	0.7	0.64	0.04	0.94	0.41	0.86	0.97	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000553.18 (tig00000553_g2089.t1)	0.03	0.05	0.06	0.15	0.23	0.38	0.48	0.39	0.17	0.16	0.12	0.06	0.03	0.08	0.44	0.95	0.19	0.07	0.13	0.1	0.05	0.92	0.36	0.07	1.0	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000553.25 (tig00000553_g2096.t1)	0.27	0.66	1.0	0.83	0.35	0.2	0.23	0.33	0.31	0.46	0.58	0.9	0.38	0.82	0.49	0.8	0.46	0.54	0.29	0.45	0.16	0.34	0.42	0.55	0.75	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000663.36 (tig00000663_g2967.t1)	0.24	0.89	0.82	0.59	0.46	0.33	0.23	0.18	0.16	0.25	0.36	0.39	0.2	0.93	0.36	0.71	0.48	0.52	0.41	0.35	0.16	0.89	0.52	0.8	0.93	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000737.20 (tig00000737_g3799.t1)	0.33	0.28	0.33	0.47	0.39	0.34	0.42	0.5	0.68	0.62	0.82	0.79	0.42	0.32	0.71	0.28	0.47	0.44	0.27	0.3	0.35	0.25	0.49	0.65	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000741.7 (tig00000741_g3827.t1)	0.24	0.1	0.07	0.06	0.04	0.03	0.05	0.09	0.22	0.3	0.39	0.46	0.39	0.0	0.0	0.0	0.22	0.01	0.02	0.2	0.01	0.42	0.09	0.43	1.0	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000870.37 (tig00000870_g5154.t1)	0.64	0.57	0.66	0.68	0.85	0.82	1.0	0.94	0.9	1.0	0.97	0.92	0.69	0.55	0.48	0.52	0.66	0.68	0.63	0.67	0.17	0.56	0.61	0.61	0.76	0.83
Cpa\|evm.model.tig00000912.9 (tig00000912_g5415.t1)	0.25	0.21	0.22	0.25	0.27	0.2	0.19	0.19	0.3	0.52	0.73	1.0	0.28	0.26	0.16	0.4	0.47	0.31	0.23	0.3	0.09	0.56	0.17	0.52	0.76	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000984.8 (tig00000984_g5983.t1)	0.66	0.49	0.54	0.79	0.76	0.6	0.76	0.74	0.73	0.83	0.87	0.68	0.59	0.23	0.29	0.25	0.56	0.68	0.63	0.61	0.18	0.8	0.32	0.75	1.0	0.98
Cpa\|evm.model.tig00001182.1	0.09	0.12	0.08	0.07	0.14	0.17	0.14	0.15	0.07	0.22	0.16	0.17	0.09	0.1	0.09	0.06	0.14	0.43	0.31	0.1	0.01	0.65	0.19	0.39	1.0	0.5
Cpa\|evm.model.tig00001229.21 (tig00001229_g7855.t1)	0.57	0.59	0.68	0.74	0.71	0.51	0.53	0.52	0.52	0.59	0.62	0.67	0.55	1.0	0.54	0.96	0.6	0.57	0.4	0.54	0.39	0.4	0.59	0.63	0.63	0.77
Cpa\|evm.model.tig00001336.16 (tig00001336_g8233.t1)	0.36	0.19	0.38	0.77	0.35	0.54	0.7	0.6	0.46	0.74	0.55	0.73	0.16	0.47	0.52	0.28	0.22	0.57	0.44	0.24	0.13	0.44	0.33	0.32	1.0	0.75
Cpa\|evm.model.tig00001629.2 (tig00001629_g9518.t2)	0.51	0.43	0.5	0.5	0.48	0.41	0.56	0.64	0.68	0.93	1.0	0.95	0.55	0.12	0.16	0.05	0.39	0.35	0.37	0.47	0.02	0.46	0.36	0.74	0.81	0.86
Cpa\|evm.model.tig00020538.46 (tig00020538_g10353.t1)	0.23	0.4	0.67	0.61	0.33	0.26	0.5	0.59	0.53	0.62	0.91	0.98	0.32	0.75	0.47	0.51	0.46	0.36	0.42	0.34	0.24	0.56	0.49	0.66	1.0	0.92
Cpa\|evm.model.tig00020563.38 (tig00020563_g11221.t1)	0.68	0.65	0.64	0.64	0.83	0.88	0.56	0.6	0.84	0.79	1.0	0.93	0.55	0.36	0.33	0.27	0.38	0.64	0.59	0.37	0.01	0.78	0.39	0.47	0.64	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020592.51 (tig00020592_g11682.t1)	0.52	0.26	0.2	0.48	0.57	0.35	0.44	0.45	0.72	0.91	0.98	1.0	0.46	0.6	0.23	0.6	0.29	0.18	0.24	0.25	0.04	0.77	0.38	0.72	0.88	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020629.141 (tig00020629_g12469.t1)	0.73	0.72	0.73	0.85	0.83	0.77	0.84	0.76	0.84	0.99	0.99	0.9	0.73	0.18	0.27	0.16	0.47	0.67	0.48	0.62	0.01	0.87	0.32	0.68	1.0	0.79
Cpa\|evm.model.tig00020660.57 (tig00020660_g12567.t1)	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.07	0.08	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.05	0.0	0.98	0.01	0.09	1.0	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020746.3 (tig00020746_g13650.t1)	0.07	0.26	0.28	0.44	0.49	0.44	0.52	0.54	0.77	0.84	0.96	0.74	0.21	0.2	0.78	0.64	0.93	0.33	0.34	0.36	0.12	0.19	0.44	0.86	1.0	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020904.116 (tig00020904_g15245.t1)	0.35	0.3	0.33	0.45	0.35	0.37	0.52	0.64	0.71	0.92	1.0	0.89	0.58	0.29	0.27	0.19	0.29	0.43	0.42	0.38	0.06	0.14	0.43	0.62	0.74	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020904.117 (tig00020904_g15245.t1)	0.32	0.32	0.27	0.25	0.27	0.27	0.42	0.49	0.48	0.57	0.63	0.79	0.33	0.26	0.21	0.31	0.4	0.4	0.49	0.39	0.03	0.47	0.4	0.61	1.0	0.87
Cpa\|evm.model.tig00020904.53 (tig00020904_g15185.t1)	0.7	0.76	0.6	0.92	0.92	1.0	0.77	0.68	0.92	0.86	0.79	0.94	0.86	0.32	0.29	0.3	0.45	0.67	0.6	0.61	0.07	0.68	0.24	0.52	0.81	0.84
Cpa\|evm.model.tig00021013.26 (tig00021013_g17054.t1)	0.09	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.08	0.44	0.51	0.66	0.7	0.29	0.0	0.0	0.01	0.46	0.02	0.02	0.16	0.0	0.6	0.06	0.39	1.0	0.78
Cpa\|evm.model.tig00021013.34 (tig00021013_g17066.t1)	0.22	0.08	0.06	0.06	0.06	0.1	0.19	0.22	0.73	0.88	0.98	1.0	0.33	0.02	0.01	0.07	0.43	0.07	0.07	0.26	0.04	0.98	0.16	0.83	0.95	0.83
Cpa\|evm.model.tig00021038.18 (tig00021038_g17505.t1)	0.45	0.32	0.32	0.23	0.21	0.13	0.19	0.26	0.35	0.66	0.86	0.86	0.55	0.14	0.2	0.18	0.26	0.23	0.22	0.19	0.02	0.19	0.2	1.0	0.48	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021070.106 (tig00021070_g17922.t1)	0.21	0.1	0.25	0.25	0.22	0.25	0.5	0.66	0.7	0.75	0.89	1.0	0.39	0.49	0.45	0.36	0.42	0.52	0.42	0.31	0.01	0.27	0.36	0.46	0.93	0.67
Cpa\|evm.model.tig00021073.38 (tig00021073_g18047.t1)	0.63	0.61	0.6	0.6	0.64	0.66	0.73	0.77	0.81	0.99	1.0	0.91	0.67	0.27	0.38	0.22	0.46	0.67	0.47	0.63	0.03	0.43	0.28	0.54	0.64	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021096.10 (tig00021098_g18171.t1)	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.03	0.09	0.09	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.01	0.03	1.0	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021098.5 (tig00021098_g18171.t1)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.09	0.1	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.91	0.01	0.07	1.0	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021127.38 (tig00021127_g18715.t1)	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.1	0.12	0.07	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.01	0.07	0.02	0.65	0.03	0.26	1.0	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021127.59 (tig00021127_g18737.t1)	0.45	0.37	0.41	0.6	0.59	0.53	0.65	0.7	0.75	0.86	1.0	0.83	0.75	0.41	0.53	0.51	0.9	0.37	0.28	0.32	0.05	0.21	0.42	0.43	0.77	0.56
Cpa\|evm.model.tig00021428.7 (tig00021428_g21148.t1)	0.74	0.7	0.7	0.81	0.81	0.68	0.84	0.84	0.85	0.92	0.85	0.73	0.7	0.2	0.34	0.19	0.58	0.73	0.67	0.69	0.03	0.66	0.32	0.56	0.9	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021435.21 (tig00021435_g21398.t1)	0.5	0.51	0.48	0.53	0.58	0.55	0.56	0.57	0.62	0.7	0.65	0.6	0.5	0.28	0.35	0.18	0.58	0.63	0.52	0.61	0.02	0.71	0.33	0.56	0.82	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021493.43 (tig00021493_g21888.t1)	0.42	0.35	0.42	0.56	0.38	0.42	0.6	0.62	0.53	0.8	0.61	0.67	0.43	0.46	0.39	0.39	0.66	0.62	0.5	0.68	0.12	0.43	0.43	0.48	0.99	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021493.44 (tig00021493_g21888.t1)	0.64	0.48	0.54	0.62	0.56	0.45	0.79	0.85	0.71	0.87	1.0	0.91	0.74	0.41	0.42	0.37	0.51	0.63	0.56	0.64	0.07	0.58	0.33	0.66	0.83	0.75
Cpa\|evm.model.tig00021537.32 (tig00021537_g22285.t1)	0.16	0.32	0.36	0.43	0.3	0.23	0.48	0.45	0.65	0.8	0.97	1.0	0.28	0.16	0.09	0.06	0.22	0.23	0.25	0.24	0.08	0.37	0.26	0.33	0.78	0.7
Cpa\|evm.model.tig00021795.20 (tig00021795_g23538.t1)	0.66	0.63	0.75	0.73	0.8	0.8	0.83	0.87	0.89	1.0	0.92	0.84	0.78	0.46	0.59	0.35	0.62	0.6	0.62	0.7	0.1	0.56	0.53	0.56	0.65	0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)