Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000073.2 (tig00000073_g1682.t1)	0.87	0.78	0.6	0.7	0.64	0.62	0.7	0.84	0.93	0.86	0.97	1.0	0.64	0.13	0.24	0.17	0.26	0.43	0.43	0.33	0.21	0.52	0.71	0.74	0.58	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000093.131 (tig00000093_g3558.t1)	0.58	0.57	0.72	0.78	0.84	0.78	0.59	0.57	0.68	0.78	0.97	1.0	0.76	0.5	0.58	0.72	0.57	0.54	0.52	0.6	0.37	0.61	0.84	0.57	0.54	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000093.14 (tig00000093_g3452.t1)	0.75	0.62	0.77	0.87	0.94	0.99	0.94	0.93	1.0	0.93	0.85	0.78	0.78	0.26	0.33	0.39	0.41	0.56	0.53	0.55	0.32	0.58	0.75	0.56	0.49	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000144.156 (tig00000144_g9150.t1)	0.68	0.52	0.41	0.36	0.38	0.38	0.48	0.49	0.59	0.69	0.82	1.0	0.7	0.61	0.41	0.9	0.61	0.47	0.5	0.46	0.43	0.31	0.76	0.91	0.33	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000178.34 (tig00000178_g12743.t1)	0.54	0.43	0.47	0.37	0.32	0.19	0.29	0.36	0.34	0.47	0.68	0.9	0.71	0.14	0.22	0.15	0.11	0.23	0.3	0.18	0.07	0.09	1.0	0.82	0.44	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000227.9 (tig00000227_g19801.t1)	0.41	0.34	0.4	0.22	0.15	0.14	0.24	0.37	0.62	0.76	0.97	0.99	0.62	0.3	0.31	0.29	0.09	0.21	0.23	0.22	0.14	0.35	1.0	0.92	0.74	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000388.56 (tig00000388_g24817.t2)	0.59	0.36	0.3	0.34	0.28	0.3	0.3	0.35	0.4	0.52	0.64	0.74	0.65	0.14	0.21	0.13	0.16	0.36	0.35	0.18	0.13	0.22	0.9	1.0	0.49	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000391.15 (tig00000391_g24847.t1)	0.8	0.79	0.58	0.72	0.69	0.62	0.46	0.59	0.66	0.71	0.93	1.0	0.54	0.1	0.13	0.04	0.24	0.43	0.38	0.47	0.01	0.08	0.25	0.47	0.27	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000396.45 (tig00000396_g24917.t1)	0.55	0.45	0.35	0.32	0.35	0.33	0.34	0.46	0.58	0.8	1.0	0.94	0.51	0.08	0.1	0.1	0.18	0.14	0.14	0.26	0.07	0.03	0.51	0.46	0.19	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000430.47 (tig00000430_g636.t1)	0.92	0.67	0.43	0.34	0.28	0.25	0.43	0.52	0.63	0.71	0.85	0.98	0.9	0.35	0.31	0.81	0.59	0.55	0.43	0.46	0.3	0.27	1.0	0.72	0.38	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000448.54 (tig00000448_g887.t1)	0.5	0.32	0.44	0.44	0.43	0.43	0.46	0.47	0.6	0.52	0.94	1.0	0.66	0.26	0.26	0.33	0.24	0.17	0.32	0.35	0.07	0.06	0.46	0.28	0.3	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000473.13 (tig00000473_g1212.t1)	0.71	0.43	0.44	0.45	0.79	0.71	0.56	0.66	0.7	0.68	0.56	1.0	0.86	0.33	0.13	0.09	0.22	0.4	0.3	0.14	0.13	0.48	0.75	0.2	0.25	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000498.8 (tig00000498_g1584.t1)	0.7	0.47	0.35	0.31	0.32	0.37	0.41	0.44	0.54	0.63	0.83	1.0	0.88	0.8	0.37	0.72	0.76	0.3	0.29	0.32	0.19	0.23	0.51	0.65	0.44	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000663.25 (tig00000663_g2957.t1)	0.51	0.53	0.53	0.48	0.72	0.67	0.52	0.43	0.49	0.57	0.74	0.86	0.65	0.52	0.28	0.23	0.25	0.27	0.4	0.29	0.21	0.67	1.0	0.54	0.37	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000692.1	0.28	0.24	0.2	0.21	0.22	0.24	0.28	0.24	0.49	0.44	0.6	0.6	0.28	0.35	0.3	0.21	0.21	0.34	0.36	0.16	0.17	0.1	0.69	1.0	0.45	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000692.35 (tig00000692_g3230.t1)	0.41	0.46	0.36	0.27	0.3	0.24	0.24	0.22	0.35	0.62	0.62	0.95	0.34	0.11	0.13	0.14	0.14	0.31	0.3	0.24	0.09	0.05	1.0	0.64	0.13	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000829.21 (tig00000829_g4663.t1)	0.68	0.57	0.45	0.39	0.44	0.51	0.62	0.62	0.72	0.9	0.92	1.0	0.77	0.68	0.5	0.83	0.9	0.68	0.68	0.73	0.31	0.32	0.87	0.99	0.41	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000870.2 (tig00000870_g5119.t1)	0.71	0.46	0.43	0.38	0.45	0.51	0.44	0.49	0.63	0.68	0.91	1.0	0.84	0.3	0.3	0.46	0.36	0.23	0.29	0.29	0.11	0.25	0.83	0.66	0.22	0.21
Cpa\|evm.model.tig00000989.26 (tig00000989_g6098.t1)	0.49	0.33	0.29	0.28	0.21	0.17	0.22	0.25	0.41	0.6	0.83	1.0	0.58	0.36	0.21	0.64	0.64	0.31	0.34	0.37	0.05	0.33	0.58	0.69	0.3	0.22
Cpa\|evm.model.tig00001030.10 (tig00001030_g6451.t1)	0.74	0.44	0.32	0.34	0.35	0.32	0.46	0.48	0.4	0.44	0.61	0.97	0.82	0.27	0.24	0.6	0.52	0.47	0.28	0.31	0.28	0.29	1.0	0.87	0.89	0.33
Cpa\|evm.model.tig00001030.9 (tig00001030_g6451.t1)	0.91	0.52	0.4	0.38	0.42	0.45	0.51	0.52	0.48	0.46	0.64	1.0	0.94	0.32	0.31	0.65	0.6	0.36	0.37	0.36	0.19	0.23	0.68	0.66	0.56	0.26
Cpa\|evm.model.tig00001033.5 (tig00020516_g9965.t1)	0.63	0.3	0.23	0.49	0.59	0.29	0.27	0.29	0.3	0.64	0.87	0.98	0.56	0.04	0.04	0.03	0.08	0.08	0.07	0.13	0.05	0.48	0.97	1.0	0.29	0.36
Cpa\|evm.model.tig00001094.37 (tig00001094_g7008.t1)	0.4	0.38	0.31	0.33	0.19	0.28	0.25	0.28	0.59	0.54	0.67	0.86	0.3	0.21	0.25	0.23	0.3	0.25	0.3	0.13	0.15	0.05	1.0	0.49	0.47	0.31
Cpa\|evm.model.tig00001126.9 (tig00001126_g7120.t1)	0.72	0.71	0.54	0.4	0.37	0.49	0.57	0.64	0.78	0.82	0.9	1.0	0.76	0.45	0.42	0.82	0.53	0.54	0.54	0.5	0.59	0.37	0.96	0.95	0.41	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001258.8 (tig00001258_g7829.t1)	0.38	0.33	0.35	0.43	0.52	0.58	0.44	0.37	0.5	0.57	0.76	0.89	0.45	0.45	0.4	0.35	0.22	0.15	0.2	0.19	0.31	0.5	1.0	0.92	0.49	0.62
Cpa\|evm.model.tig00001264.12 (tig00001264_g7868.t1)	0.89	0.67	0.49	0.49	0.24	0.31	0.44	0.51	0.68	0.73	0.91	0.92	0.85	0.25	0.24	0.19	0.23	0.19	0.31	0.22	0.12	0.3	0.78	1.0	0.33	0.28
Cpa\|evm.model.tig00020510.54 (tig00020510_g9835.t1)	0.56	0.38	0.25	0.18	0.16	0.18	0.3	0.34	0.47	0.68	0.91	1.0	0.65	0.45	0.18	0.56	0.53	0.21	0.23	0.28	0.22	0.25	0.64	0.87	0.23	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020510.55 (tig00020510_g9836.t1)	0.48	0.38	0.25	0.19	0.15	0.15	0.31	0.35	0.45	0.71	0.87	1.0	0.61	0.55	0.2	0.76	0.71	0.32	0.27	0.33	0.28	0.3	0.82	0.98	0.28	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020510.93 (tig00020510_g9875.t1)	0.44	0.39	0.32	0.25	0.29	0.34	0.33	0.45	0.6	0.68	0.61	0.55	0.43	0.31	0.33	0.51	0.32	0.55	0.4	0.35	0.13	0.43	1.0	0.48	0.39	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020537.69 (tig00020537_g10296.t1)	0.64	0.54	0.35	0.24	0.29	0.41	0.63	0.7	0.74	0.89	0.94	1.0	0.75	0.43	0.42	0.76	0.63	0.61	0.45	0.46	0.21	0.16	0.53	0.64	0.48	0.2
Cpa\|evm.model.tig00020542.16 (tig00020542_g10452.t1)	0.61	0.21	0.16	0.35	0.43	0.25	0.34	0.36	0.37	0.59	1.0	0.88	0.87	0.21	0.08	0.12	0.08	0.11	0.01	0.02	0.22	0.13	0.93	0.73	0.6	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020552.11 (tig00020542_g10452.t1)	0.68	0.16	0.21	0.36	0.5	0.18	0.32	0.36	0.4	0.57	0.95	1.0	0.72	0.08	0.07	0.0	0.0	0.12	0.03	0.0	0.09	0.05	0.41	0.82	0.82	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020554.102 (tig00020554_g10879.t1)	0.6	0.43	0.41	0.53	0.46	0.41	0.39	0.43	0.49	0.53	0.72	1.0	0.88	0.09	0.04	0.12	0.06	0.15	0.07	0.11	0.17	0.26	0.53	0.63	0.19	0.19
Cpa\|evm.model.tig00020556.15 (tig00020556_g10986.t1)	0.85	0.76	0.56	0.68	0.86	0.83	0.67	0.79	0.87	0.91	1.0	0.91	0.65	0.32	0.38	0.33	0.39	0.52	0.48	0.46	0.16	0.19	0.59	0.49	0.42	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020704.75 (tig00020704_g13220.t1)	0.59	0.38	0.36	0.36	0.41	0.43	0.41	0.56	0.71	1.0	0.96	0.96	0.59	0.35	0.33	0.45	0.48	0.56	0.51	0.32	0.19	0.08	0.96	0.7	0.65	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020816.114 (tig00020816_g14198.t1)	0.24	0.09	0.07	0.06	0.06	0.11	0.19	0.23	0.32	0.52	0.73	1.0	0.28	0.35	0.11	0.35	0.16	0.16	0.11	0.14	0.12	0.09	0.58	0.67	0.21	0.18
Cpa\|evm.model.tig00020816.115 (tig00020816_g14199.t1)	0.21	0.09	0.04	0.04	0.04	0.06	0.17	0.18	0.27	0.45	0.59	0.85	0.21	0.38	0.08	0.38	0.17	0.2	0.11	0.14	0.14	0.06	0.79	1.0	0.26	0.2
Cpa\|evm.model.tig00020816.61 (tig00020816_g14147.t1)	0.52	0.26	0.21	0.31	0.27	0.28	0.55	0.58	0.56	0.86	1.0	0.87	0.66	0.12	0.05	0.09	0.08	0.11	0.09	0.09	0.26	0.59	0.84	0.62	0.46	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020830.13 (tig00020830_g14394.t1)	0.48	0.27	0.3	0.38	0.44	0.4	0.28	0.29	0.3	0.47	0.73	1.0	0.59	0.18	0.14	0.08	0.05	0.05	0.08	0.05	0.13	0.12	0.91	0.64	0.26	0.29
Cpa\|evm.model.tig00020927.59 (tig00020927_g15990.t1)	0.79	0.66	0.7	0.75	0.79	0.68	0.67	0.7	0.66	0.81	0.85	0.97	0.92	0.51	0.5	0.56	0.56	0.51	0.53	0.55	0.41	0.62	1.0	0.93	0.62	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020934.21 (tig00020934_g16088.t1)	0.25	0.26	0.16	0.27	0.28	0.14	0.16	0.18	0.51	0.63	0.75	0.73	0.17	0.1	0.09	0.05	0.16	0.42	0.2	0.15	0.06	0.37	1.0	0.39	0.22	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020943.32 (tig00020943_g16274.t1)	0.36	0.45	0.27	0.15	0.04	0.02	0.06	0.16	0.17	0.34	0.62	0.84	0.68	0.08	0.04	0.01	0.03	0.08	0.07	0.07	0.06	0.12	1.0	0.66	0.3	0.32
Cpa\|evm.model.tig00020961.88 (tig00020961_g16706.t1)	0.5	0.43	0.43	0.47	0.38	0.38	0.42	0.53	0.7	0.7	0.89	1.0	0.5	0.31	0.44	0.39	0.31	0.38	0.39	0.26	0.04	0.14	0.57	0.35	0.18	0.21
Cpa\|evm.model.tig00021038.80 (tig00021038_g17569.t1)	0.68	0.53	0.56	0.63	0.73	0.78	0.58	0.55	0.65	0.72	0.92	1.0	0.75	0.48	0.41	0.5	0.44	0.32	0.52	0.48	0.27	0.54	0.87	0.65	0.52	0.47
Cpa\|evm.model.tig00021046.8 (tig00021046_g17789.t1)	0.5	0.54	0.42	0.24	0.27	0.24	0.44	0.51	0.63	0.7	0.78	1.0	0.58	0.25	0.16	0.17	0.15	0.53	0.28	0.31	0.04	0.11	0.92	0.36	0.3	0.49
Cpa\|evm.model.tig00021070.4 (tig00021070_g17808.t1)	0.2	0.14	0.23	0.36	0.36	0.17	0.35	0.26	0.27	0.53	0.66	1.0	0.25	0.12	0.07	0.21	0.08	0.08	0.07	0.05	0.14	0.01	0.52	0.38	0.32	0.19
Cpa\|evm.model.tig00021070.45 (tig00021070_g17850.t1)	0.57	0.3	0.2	0.41	0.4	0.28	0.27	0.32	0.42	0.51	0.89	1.0	0.78	0.24	0.05	0.11	0.1	0.08	0.04	0.07	0.1	0.11	0.31	0.63	0.26	0.18
Cpa\|evm.model.tig00021357.49 (tig00021357_g20774.t1)	0.74	0.56	0.66	0.6	0.54	0.72	0.66	0.79	0.92	0.94	1.0	0.89	0.81	0.18	0.27	0.1	0.3	0.33	0.35	0.52	0.12	0.38	0.7	0.41	0.44	0.49
Cpa\|evm.model.tig00021432.3 (tig00021432_g21193.t1)	0.66	0.71	0.57	0.59	0.5	0.41	0.51	0.6	0.91	0.78	1.0	0.95	0.63	0.11	0.2	0.13	0.17	0.29	0.22	0.17	0.04	0.12	0.73	0.46	0.26	0.19
Cpa\|evm.model.tig00021463.3 (tig00021463_g21612.t1)	0.62	0.49	0.43	0.38	0.39	0.39	0.47	0.47	0.6	0.81	0.9	0.98	0.66	0.55	0.32	0.9	0.75	0.44	0.45	0.57	0.16	0.46	0.46	1.0	0.37	0.41
Cpa\|evm.model.tig00021617.16 (tig00021617_g22943.t1)	0.81	0.77	0.63	0.7	0.56	0.41	0.51	0.59	0.81	0.75	1.0	0.91	0.65	0.08	0.16	0.07	0.22	0.39	0.33	0.37	0.05	0.13	0.6	0.48	0.34	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021719.4 (tig00021719_g23149.t1)	0.65	0.38	0.4	0.57	0.73	0.84	0.78	0.7	0.9	0.89	0.96	1.0	0.79	0.17	0.16	0.38	0.2	0.28	0.14	0.16	0.51	0.45	0.96	0.97	0.7	0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)