Heatmap: Cluster_122 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.103 (tig00000042_g15498.t1)	0.4	0.49	0.66	0.78	0.53	0.27	0.31	0.34	0.11	0.2	0.26	0.3	0.71	0.23	0.29	0.19	1.0	0.16	0.11	0.11	0.08	0.46	0.22	0.19	0.56	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000042.104 (tig00000042_g15499.t1)	0.77	0.51	0.45	0.93	0.51	0.22	0.27	0.36	0.12	0.23	0.3	0.31	1.0	0.03	0.04	0.04	0.46	0.07	0.08	0.05	0.01	0.06	0.12	0.07	0.1	0.08
Cpa\|evm.model.tig00000076.154 (tig00000076_g2445.t1)	0.41	0.66	0.76	1.0	0.69	0.43	0.43	0.62	0.47	0.29	0.3	0.28	0.43	0.07	0.11	0.05	0.11	0.14	0.15	0.3	0.0	0.1	0.02	0.02	0.23	0.21
Cpa\|evm.model.tig00000093.153 (tig00000093_g3581.t1)	0.88	0.76	0.97	1.0	0.56	0.17	0.18	0.4	0.1	0.03	0.06	0.1	0.73	0.02	0.04	0.02	0.08	0.05	0.05	0.18	0.01	0.03	0.01	0.03	0.46	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000142.20 (tig00000142_g8655.t1)	0.66	0.38	0.27	0.6	0.46	0.27	0.24	0.34	0.3	0.25	0.51	0.51	1.0	0.09	0.07	0.13	0.25	0.09	0.09	0.08	0.0	0.06	0.26	0.16	0.42	0.16
Cpa\|evm.model.tig00000178.29 (tig00000178_g12738.t1)	0.75	0.43	0.55	0.52	0.16	0.06	0.15	0.29	0.03	0.05	0.07	0.11	1.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.11	0.03	0.0	0.01	0.02	0.26	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000178.44 (tig00000178_g12755.t1)	0.53	0.49	0.61	0.75	0.31	0.44	0.3	0.36	0.39	0.49	0.81	0.82	0.77	0.25	0.25	0.29	1.0	0.27	0.26	0.2	0.22	0.1	0.39	0.36	0.23	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000241.199 (tig00000241_g21067.t1)	0.54	0.44	0.42	0.8	0.59	0.23	0.16	0.17	0.04	0.1	0.11	0.13	1.0	0.02	0.01	0.13	0.58	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02
Cpa\|evm.model.tig00000241.41 (tig00000241_g20899.t1)	0.32	0.34	0.46	0.43	0.32	0.24	0.15	0.15	0.08	0.08	0.11	0.14	0.39	0.09	0.07	0.09	1.0	0.06	0.07	0.06	0.01	0.09	0.02	0.02	0.16	0.1
Cpa\|evm.model.tig00000246.8 (tig00000246_g21499.t1)	0.59	0.42	0.42	0.74	0.42	0.15	0.22	0.25	0.16	0.2	0.27	0.27	1.0	0.05	0.05	0.06	0.33	0.1	0.06	0.04	0.02	0.07	0.08	0.06	0.1	0.09
Cpa\|evm.model.tig00000507.30 (tig00000507_g1784.t1)	0.65	0.77	0.93	1.0	1.0	0.68	0.39	0.36	0.25	0.35	0.52	0.66	0.66	0.14	0.22	0.26	0.44	0.42	0.37	0.66	0.12	0.35	0.12	0.41	0.31	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000545.32 (tig00000545_g2005.t1)	0.55	0.64	0.96	1.0	0.64	0.29	0.25	0.46	0.23	0.06	0.09	0.11	0.45	0.02	0.03	0.02	0.03	0.08	0.07	0.33	0.02	0.21	0.01	0.06	0.53	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000553.4 (tig00000553_g2075.t1)	0.78	0.89	1.0	0.92	0.72	0.51	0.56	0.7	0.67	0.41	0.44	0.48	0.67	0.36	0.38	0.37	0.45	0.42	0.38	0.62	0.2	0.53	0.23	0.29	0.63	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000615.20 (tig00000615_g2549.t1)	0.39	0.41	0.42	0.48	0.31	0.19	0.29	0.27	0.26	0.36	0.4	0.34	0.67	0.27	0.4	0.23	1.0	0.23	0.12	0.14	0.07	0.65	0.12	0.23	0.55	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000663.60 (tig00000663_g2992.t1)	0.66	0.94	0.93	0.86	0.91	0.73	0.44	0.4	0.4	0.45	0.54	0.62	0.76	0.2	0.37	0.25	0.53	0.38	0.44	0.73	0.18	1.0	0.23	0.57	0.49	0.37
Cpa\|evm.model.tig00000718.34 (tig00000718_g3709.t1)	0.88	0.87	0.83	0.83	0.37	0.11	0.19	0.37	0.07	0.15	0.19	0.26	1.0	0.02	0.03	0.02	0.05	0.12	0.09	0.28	0.02	0.09	0.02	0.05	0.32	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000806.40 (tig00000806_g4370.t1)	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.23	0.43	0.03	0.01	0.01	0.0	0.72	0.78	0.23	0.24	0.82	0.32	0.27	0.26	0.0	0.01	0.31	0.0	1.0	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000826.20 (tig00000826_g4588.t1)	0.56	0.77	0.95	1.0	0.86	0.69	0.64	0.58	0.3	0.42	0.44	0.53	0.81	0.16	0.14	0.15	0.96	0.3	0.21	0.18	0.03	0.2	0.21	0.14	0.43	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000828.19 (tig00000828_g4620.t1)	0.64	0.69	0.82	1.0	0.41	0.1	0.2	0.49	0.04	0.02	0.03	0.05	0.63	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.08	0.04	0.0	0.03	0.51	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000829.10 (tig00000829_g4653.t1)	0.61	0.86	0.99	1.0	0.78	0.57	0.66	0.82	0.86	0.56	0.48	0.44	0.48	0.23	0.41	0.24	0.44	0.63	0.52	0.92	0.13	0.61	0.26	0.34	0.77	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000836.13 (tig00000836_g4696.t1)	0.44	0.18	0.19	0.17	0.13	0.12	0.31	0.36	0.16	0.23	0.19	0.2	0.65	0.43	0.28	0.39	1.0	0.26	0.25	0.24	0.03	0.16	0.07	0.09	0.66	0.24
Cpa\|evm.model.tig00000849.36 (tig00000849_g4777.t1)	0.68	0.77	0.9	1.0	0.69	0.44	0.51	0.6	0.15	0.18	0.17	0.17	0.76	0.13	0.17	0.13	0.18	0.3	0.25	0.39	0.06	0.7	0.09	0.15	0.8	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000851.18 (tig00000851_g4905.t1)	0.56	0.91	1.0	0.92	0.61	0.37	0.31	0.45	0.43	0.28	0.29	0.3	0.43	0.21	0.19	0.19	0.22	0.25	0.28	0.49	0.13	0.58	0.22	0.26	0.55	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000851.2 (tig00000851_g4886.t1)	0.89	0.71	0.61	0.7	0.37	0.14	0.21	0.34	0.08	0.15	0.21	0.24	1.0	0.05	0.04	0.04	0.07	0.13	0.09	0.25	0.08	0.17	0.04	0.1	0.33	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000881.22 (tig00000881_g5235.t1)	0.85	0.92	1.0	0.91	0.64	0.36	0.32	0.56	0.53	0.38	0.51	0.65	0.83	0.08	0.32	0.13	0.23	0.29	0.23	0.57	0.09	0.44	0.18	0.3	0.49	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000889.37 (tig00000889_g5328.t1)	0.74	0.74	1.0	0.88	0.5	0.25	0.26	0.53	0.35	0.17	0.19	0.19	0.7	0.17	0.3	0.18	0.19	0.33	0.3	0.48	0.06	0.28	0.08	0.15	0.74	0.81
Cpa\|evm.model.tig00001029.7 (tig00001029_g6408.t1)	0.54	0.9	1.0	0.99	0.61	0.38	0.41	0.59	0.28	0.17	0.17	0.17	0.5	0.06	0.14	0.06	0.13	0.35	0.27	0.5	0.08	0.17	0.04	0.11	0.6	0.7
Cpa\|evm.model.tig00001130.31 (tig00001130_g7262.t1)	0.59	0.71	1.0	0.96	0.53	0.22	0.31	0.57	0.25	0.11	0.17	0.18	0.55	0.03	0.1	0.04	0.14	0.22	0.16	0.46	0.01	0.06	0.01	0.06	0.42	0.53
Cpa\|evm.model.tig00001154.27 (tig00001154_g7291.t1)	0.9	1.0	1.0	0.81	0.36	0.13	0.18	0.42	0.23	0.17	0.24	0.33	0.9	0.12	0.18	0.12	0.21	0.26	0.22	0.41	0.06	0.11	0.07	0.15	0.42	0.53
Cpa\|evm.model.tig00001373.2 (tig00001373_g8441.t1)	0.26	0.42	0.56	1.0	0.31	0.21	0.24	0.09	0.2	0.1	0.3	0.36	0.66	0.03	0.01	0.04	0.17	0.0	0.02	0.0	0.13	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03
Cpa\|evm.model.tig00001424.9 (tig00001424_g8708.t1)	0.95	0.68	0.78	0.64	0.2	0.06	0.14	0.31	0.02	0.02	0.03	0.06	1.0	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04	0.17	0.02	0.01	0.0	0.02	0.33	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001532.2 (tig00001532_g9268.t1)	0.64	0.72	0.93	1.0	1.0	0.72	0.48	0.42	0.4	0.48	0.68	0.8	0.73	0.07	0.2	0.09	0.54	0.4	0.31	0.59	0.04	0.52	0.21	0.44	0.19	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001628.3 (tig00001628_g9428.t1)	0.52	0.44	0.47	0.57	0.37	0.13	0.17	0.2	0.13	0.27	0.4	0.47	1.0	0.04	0.03	0.04	0.67	0.05	0.04	0.03	0.04	0.17	0.11	0.09	0.16	0.12
Cpa\|evm.model.tig00020538.36 (tig00020538_g10342.t1)	0.44	0.29	0.35	0.37	0.34	0.28	0.28	0.29	0.08	0.15	0.17	0.19	1.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Cpa\|evm.model.tig00020538.37 (tig00020538_g10343.t1)	0.74	0.6	0.61	0.83	0.65	0.38	0.35	0.32	0.15	0.22	0.36	0.5	1.0	0.04	0.08	0.07	0.96	0.12	0.07	0.06	0.09	0.09	0.31	0.28	0.15	0.14
Cpa\|evm.model.tig00020538.38 (tig00020538_g10345.t1)	0.67	0.5	0.56	0.65	0.46	0.27	0.22	0.22	0.06	0.13	0.16	0.19	1.0	0.01	0.0	0.01	0.4	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01
Cpa\|evm.model.tig00020538.47 (tig00020538_g10355.t1)	0.57	0.4	0.5	0.58	0.33	0.18	0.16	0.17	0.05	0.09	0.13	0.15	1.0	0.01	0.01	0.03	0.48	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03
Cpa\|evm.model.tig00020539.38 (tig00020539_g10429.t1)	0.76	0.7	0.74	1.0	0.48	0.15	0.21	0.41	0.02	0.04	0.06	0.11	0.78	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.15	0.15	0.19	0.04	0.13	0.6	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020553.69 (tig00020553_g10559.t1)	0.29	0.69	0.94	1.0	0.8	0.54	0.52	0.58	0.45	0.4	0.42	0.38	0.21	0.33	0.22	0.27	0.18	0.19	0.22	0.35	0.01	0.2	0.13	0.2	0.45	0.75
Cpa\|evm.model.tig00020554.133 (tig00020554_g10909.t1)	0.57	0.55	0.85	1.0	0.57	0.27	0.34	0.45	0.04	0.07	0.09	0.13	0.65	0.09	0.05	0.07	0.06	0.07	0.09	0.24	0.16	0.42	0.05	0.1	0.63	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020563.189 (tig00020563_g11391.t1)	0.43	0.68	0.92	1.0	0.98	0.82	0.53	0.49	0.33	0.37	0.42	0.46	0.45	0.11	0.19	0.14	0.51	0.39	0.32	0.44	0.05	0.35	0.07	0.31	0.23	0.35
Cpa\|evm.model.tig00020629.140 (tig00020629_g12468.t1)	0.55	0.55	0.74	0.77	0.77	0.68	0.5	0.47	0.51	0.6	0.67	0.75	0.57	0.26	0.42	0.45	1.0	0.78	0.73	0.64	0.36	0.5	0.7	0.82	0.33	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020675.95 (tig00020675_g12678.t1)	0.75	0.94	1.0	0.89	0.51	0.24	0.21	0.45	0.29	0.13	0.18	0.22	0.61	0.06	0.13	0.06	0.17	0.29	0.28	0.61	0.05	0.22	0.02	0.08	0.46	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020675.96 (tig00020675_g12678.t1)	0.7	0.88	1.0	0.87	0.49	0.16	0.21	0.45	0.28	0.13	0.19	0.22	0.6	0.06	0.13	0.06	0.18	0.3	0.18	0.6	0.05	0.21	0.02	0.07	0.4	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020685.26 (tig00020685_g12942.t1)	0.62	0.83	1.0	0.92	0.45	0.32	0.59	0.65	0.1	0.07	0.05	0.03	0.93	0.18	0.24	0.2	0.32	0.32	0.31	0.3	0.11	0.19	0.06	0.03	0.6	0.51
Cpa\|evm.model.tig00020703.34 (tig00020703_g13136.t1)	0.67	0.61	0.71	0.73	0.76	0.5	0.67	0.72	0.56	0.56	0.55	0.56	0.9	0.36	0.32	0.41	0.87	0.58	0.35	0.42	0.11	0.49	0.35	0.56	1.0	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020704.21 (tig00020704_g13163.t1)	0.38	0.55	0.64	0.97	1.0	0.54	0.17	0.12	0.13	0.24	0.39	0.55	0.39	0.05	0.05	0.05	0.11	0.18	0.1	0.28	0.04	0.22	0.21	0.31	0.22	0.32
Cpa\|evm.model.tig00020780.3 (tig00020780_g13754.t1)	0.37	0.48	0.55	0.64	0.52	0.45	0.42	0.46	0.41	0.34	0.35	0.38	0.46	0.34	0.4	0.36	1.0	0.51	0.53	0.45	0.11	0.41	0.51	0.29	0.38	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020830.48 (tig00020830_g14432.t1)	0.95	0.64	0.59	0.63	0.17	0.06	0.12	0.33	0.08	0.04	0.08	0.14	1.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.12	0.03	0.06	0.01	0.04	0.31	0.4
Cpa\|evm.model.tig00020848.34 (tig00020848_g14561.t1)	0.63	1.0	0.99	0.83	0.5	0.23	0.28	0.47	0.42	0.26	0.28	0.33	0.64	0.1	0.22	0.1	0.21	0.32	0.3	0.66	0.08	0.34	0.04	0.16	0.7	0.83
Cpa\|evm.model.tig00020903.21 (tig00020903_g15089.t1)	0.64	0.88	1.0	0.92	0.69	0.37	0.36	0.51	0.58	0.44	0.47	0.51	0.6	0.08	0.23	0.13	0.28	0.4	0.3	0.65	0.14	0.79	0.11	0.29	0.51	0.64
Cpa\|evm.model.tig00020909.11 (tig00020909_g15331.t1)	0.29	0.75	1.0	1.0	0.65	0.38	0.43	0.44	0.39	0.35	0.37	0.54	0.31	0.33	0.29	0.39	0.25	0.32	0.32	0.33	0.01	0.23	0.14	0.16	0.55	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020912.35 (tig00020912_g15807.t1)	0.08	0.57	0.81	1.0	0.8	0.53	0.27	0.2	0.16	0.1	0.1	0.12	0.05	0.04	0.12	0.08	0.2	0.28	0.25	0.28	0.0	0.21	0.0	0.02	0.05	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020934.47 (tig00020934_g16114.t1)	0.51	0.76	0.8	1.0	0.76	0.36	0.23	0.36	0.32	0.3	0.42	0.48	0.48	0.05	0.16	0.06	0.36	0.28	0.27	0.42	0.01	0.43	0.07	0.21	0.29	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020943.45 (tig00020943_g16289.t1)	0.33	0.23	0.29	0.23	0.16	0.17	0.2	0.21	0.16	0.19	0.23	0.24	0.72	0.04	1.0	0.04	0.65	0.07	0.07	0.06	0.07	0.52	0.21	0.11	0.48	0.28
Cpa\|evm.model.tig00021015.9 (tig00021015_g17149.t1)	0.58	0.99	1.0	0.99	0.79	0.39	0.22	0.32	0.19	0.1	0.16	0.22	0.55	0.05	0.16	0.06	0.22	0.33	0.22	0.54	0.0	0.07	0.04	0.04	0.21	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021127.120 (tig00021127_g18800.t1)	0.65	0.77	0.82	1.0	0.83	0.42	0.16	0.21	0.15	0.17	0.3	0.45	0.57	0.03	0.05	0.02	0.1	0.17	0.11	0.28	0.12	0.87	0.18	0.59	0.48	0.42
Cpa\|evm.model.tig00021127.26 (tig00021127_g18704.t1)	0.47	0.51	0.77	1.0	0.67	0.39	0.3	0.41	0.12	0.13	0.14	0.19	0.51	0.04	0.04	0.05	0.06	0.07	0.05	0.18	0.09	0.25	0.06	0.13	0.55	0.74
Cpa\|evm.model.tig00021127.84 (tig00021127_g18761.t1)	0.27	0.54	0.65	0.85	0.48	0.19	0.37	0.42	0.4	0.59	0.61	0.52	0.82	0.5	0.33	0.41	1.0	0.47	0.33	0.3	0.15	0.15	0.07	0.08	0.29	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021181.14 (tig00021181_g19317.t1)	0.78	1.0	1.0	0.92	0.5	0.28	0.37	0.6	0.37	0.35	0.38	0.43	0.79	0.11	0.14	0.09	0.21	0.45	0.3	0.58	0.01	0.14	0.03	0.15	0.57	0.83
Cpa\|evm.model.tig00021350.38 (tig00021350_g20656.t1)	0.58	0.92	1.0	0.86	0.54	0.3	0.29	0.42	0.34	0.18	0.19	0.23	0.53	0.08	0.13	0.26	0.19	0.23	0.23	0.53	0.04	0.16	0.07	0.09	0.26	0.32
Cpa\|evm.model.tig00021435.31 (tig00021435_g21408.t1)	0.92	0.6	0.67	0.86	0.36	0.13	0.25	0.54	0.04	0.03	0.04	0.07	1.0	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.17	0.02	0.03	0.0	0.02	0.31	0.33
Cpa\|evm.model.tig00021435.37 (tig00021435_g21416.t1)	0.8	0.68	0.8	1.0	0.41	0.14	0.25	0.56	0.08	0.02	0.04	0.06	0.74	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.04	0.22	0.04	0.04	0.01	0.04	0.56	0.62
Cpa\|evm.model.tig00021531.10 (tig00021531_g22173.t1)	0.42	0.63	0.89	1.0	0.89	0.5	0.23	0.26	0.2	0.19	0.28	0.39	0.39	0.12	0.25	0.1	0.27	0.2	0.21	0.46	0.04	0.84	0.11	0.31	0.35	0.43
Cpa\|evm.model.tig00021612.57 (tig00021612_g22898.t1)	0.23	0.52	0.6	0.65	0.45	0.23	0.23	0.28	0.16	0.19	0.21	0.26	0.28	0.12	0.16	0.19	1.0	0.3	0.3	0.21	0.01	0.1	0.09	0.09	0.64	0.18
Cpa\|evm.model.tig00021612.59 (tig00021612_g22900.t1)	0.83	0.64	0.79	0.67	0.22	0.08	0.14	0.25	0.04	0.06	0.1	0.19	1.0	0.03	0.03	0.03	0.04	0.07	0.06	0.2	0.09	0.09	0.04	0.08	0.32	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021720.14 (tig00021720_g23184.t1)	0.82	0.99	1.0	0.84	0.45	0.25	0.31	0.5	0.24	0.25	0.35	0.48	0.87	0.04	0.06	0.05	0.11	0.23	0.16	0.44	0.08	0.28	0.08	0.25	0.5	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021795.13 (tig00021795_g23530.t1)	0.36	0.77	0.83	1.0	0.88	0.71	0.6	0.6	0.39	0.65	0.69	0.75	0.47	0.11	0.15	0.13	0.43	0.55	0.36	0.68	0.03	0.46	0.1	0.36	0.37	0.38
Cpa\|evm.model.tig00021795.19 (tig00021795_g23537.t1)	0.3	0.39	0.72	1.0	0.6	0.19	0.18	0.38	0.11	0.01	0.02	0.02	0.23	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.29	0.03	0.06	0.01	0.03	0.32	0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)