Heatmap: Cluster_181 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000025.59 (tig00000025_g7962.t1)
0.15 0.16 0.09 0.12 0.13 0.09 0.15 0.14 0.19 0.18 0.23 0.22 0.12 0.12 0.07 0.08 0.11 0.26 0.21 0.09 1.0 0.25 0.93 0.79 0.26 0.4
Cpa|evm.model.tig00000131.7 (tig00000131_g7477.t1)
0.09 0.04 0.09 0.18 0.28 0.26 0.25 0.21 0.32 0.32 0.38 0.33 0.09 0.11 0.07 0.08 0.08 0.11 0.12 0.09 0.59 0.14 1.0 0.56 0.27 0.3
Cpa|evm.model.tig00000133.41 (tig00000133_g7703.t1)
0.19 0.14 0.18 0.29 0.35 0.41 0.4 0.38 0.46 0.47 0.59 0.58 0.25 0.14 0.17 0.23 0.22 0.24 0.25 0.28 0.63 0.4 1.0 0.66 0.45 0.36
Cpa|evm.model.tig00000137.12 (tig00021468_g21636.t1)
0.2 0.21 0.16 0.15 0.19 0.2 0.14 0.15 0.18 0.19 0.15 0.18 0.12 0.15 0.14 0.12 0.14 0.23 0.2 0.21 0.86 0.5 1.0 0.32 0.52 0.38
Cpa|evm.model.tig00000144.16 (tig00000144_g9005.t1)
0.28 0.25 0.2 0.26 0.26 0.22 0.29 0.27 0.25 0.26 0.29 0.26 0.28 0.27 0.24 0.24 0.19 0.34 0.21 0.17 0.74 0.53 1.0 0.6 0.41 0.32
Cpa|evm.model.tig00000147.22 (tig00000147_g9459.t1)
0.15 0.13 0.14 0.15 0.17 0.17 0.17 0.19 0.17 0.18 0.18 0.18 0.18 0.48 0.24 0.42 0.23 0.22 0.21 0.19 1.0 0.17 0.96 0.39 0.27 0.39
Cpa|evm.model.tig00000178.95 (tig00000178_g12816.t1)
0.3 0.2 0.17 0.16 0.21 0.3 0.37 0.33 0.35 0.36 0.32 0.33 0.25 0.29 0.39 0.21 0.31 0.4 0.27 0.27 0.63 0.35 1.0 0.6 0.52 0.39
0.12 0.15 0.13 0.18 0.21 0.28 0.28 0.27 0.31 0.43 0.4 0.44 0.11 0.22 0.13 0.2 0.15 0.18 0.18 0.15 0.67 0.3 1.0 0.61 0.27 0.25
Cpa|evm.model.tig00000219.4 (tig00000219_g19439.t1)
0.07 0.17 0.21 0.24 0.15 0.11 0.22 0.29 0.4 0.49 0.48 0.33 0.06 0.14 0.28 0.12 0.21 0.19 0.25 0.17 0.62 0.4 1.0 0.46 0.25 0.26
Cpa|evm.model.tig00000237.16 (tig00000237_g20465.t1)
0.05 0.05 0.07 0.12 0.12 0.1 0.21 0.19 0.19 0.14 0.11 0.08 0.04 0.34 0.31 0.51 0.33 0.36 0.43 0.36 0.7 0.22 1.0 0.66 0.45 0.35
Cpa|evm.model.tig00000241.196 (tig00000241_g21064.t1)
0.01 0.02 0.04 0.06 0.09 0.17 0.13 0.13 0.23 0.17 0.2 0.19 0.02 0.12 0.08 0.09 0.12 0.15 0.1 0.1 0.78 0.21 0.93 1.0 0.21 0.17
Cpa|evm.model.tig00000269.68 (tig00000269_g23729.t1)
0.15 0.28 0.23 0.28 0.28 0.27 0.33 0.29 0.42 0.29 0.37 0.37 0.13 0.45 0.24 0.38 0.29 0.31 0.23 0.25 0.9 0.36 1.0 0.59 0.32 0.29
Cpa|evm.model.tig00000310.81 (tig00000310_g24005.t1)
0.24 0.22 0.26 0.27 0.23 0.28 0.41 0.39 0.38 0.36 0.39 0.46 0.27 0.25 0.24 0.23 0.3 0.28 0.29 0.29 0.46 0.28 1.0 0.79 0.37 0.4
Cpa|evm.model.tig00000382.7 (tig00000382_g24549.t1)
0.19 0.09 0.11 0.2 0.27 0.29 0.22 0.23 0.32 0.35 0.39 0.32 0.21 0.04 0.06 0.11 0.06 0.12 0.11 0.06 0.76 0.48 1.0 0.25 0.25 0.28
Cpa|evm.model.tig00000383.83 (tig00000383_g24694.t1)
0.02 0.04 0.04 0.08 0.1 0.17 0.16 0.16 0.32 0.33 0.36 0.43 0.05 0.13 0.2 0.13 0.12 0.1 0.11 0.11 0.56 0.11 1.0 0.73 0.18 0.18
Cpa|evm.model.tig00000391.17 (tig00000391_g24849.t1)
0.02 0.01 0.02 0.02 0.07 0.14 0.36 0.29 0.58 0.55 0.43 0.3 0.06 0.09 0.02 0.01 0.03 0.06 0.17 0.11 0.67 0.33 1.0 0.45 0.23 0.33
Cpa|evm.model.tig00000444.13 (tig00000444_g804.t1)
0.3 0.24 0.22 0.26 0.28 0.23 0.32 0.31 0.29 0.26 0.27 0.26 0.25 0.22 0.18 0.25 0.23 0.36 0.32 0.29 0.65 0.63 1.0 0.63 0.57 0.41
Cpa|evm.model.tig00000449.33 (tig00000540_g1932.t1)
0.29 0.21 0.25 0.24 0.27 0.26 0.29 0.34 0.35 0.39 0.42 0.51 0.37 0.26 0.28 0.31 0.26 0.44 0.27 0.26 0.84 0.56 1.0 0.91 0.64 0.52
Cpa|evm.model.tig00000455.55 (tig00000455_g1054.t1)
0.12 0.11 0.11 0.2 0.2 0.11 0.17 0.21 0.13 0.16 0.18 0.16 0.14 0.21 0.16 0.21 0.24 0.29 0.18 0.24 1.0 0.59 0.72 0.58 0.45 0.38
Cpa|evm.model.tig00000471.13 (tig00000471_g1188.t1)
0.01 0.03 0.04 0.05 0.08 0.11 0.1 0.08 0.17 0.15 0.24 0.3 0.03 0.13 0.11 0.1 0.07 0.08 0.07 0.04 0.62 0.17 1.0 0.76 0.18 0.2
Cpa|evm.model.tig00000492.80 (tig00000492_g1472.t1)
0.23 0.28 0.28 0.44 0.46 0.33 0.31 0.32 0.36 0.33 0.35 0.32 0.16 0.22 0.17 0.2 0.17 0.21 0.25 0.18 0.73 0.68 0.9 1.0 0.48 0.41
Cpa|evm.model.tig00000600.19 (tig00000600_g2278.t1)
0.27 0.24 0.26 0.29 0.3 0.26 0.4 0.41 0.38 0.38 0.42 0.37 0.29 0.27 0.24 0.34 0.2 0.31 0.23 0.23 0.61 0.68 0.73 1.0 0.44 0.48
Cpa|evm.model.tig00000692.58 (tig00000692_g3255.t1)
0.2 0.17 0.14 0.17 0.16 0.13 0.13 0.13 0.15 0.14 0.17 0.22 0.21 0.11 0.08 0.6 0.08 0.11 0.1 0.08 0.9 0.28 1.0 0.4 0.26 0.21
Cpa|evm.model.tig00000718.54 (tig00000718_g3728.t1)
0.14 0.16 0.13 0.18 0.1 0.06 0.12 0.16 0.32 0.34 0.42 0.44 0.12 0.11 0.09 0.07 0.09 0.19 0.14 0.11 0.82 0.13 0.91 1.0 0.24 0.22
0.17 0.17 0.11 0.15 0.25 0.33 0.29 0.28 0.35 0.29 0.31 0.31 0.16 0.27 0.45 0.27 0.3 0.34 0.23 0.24 0.77 0.29 1.0 0.29 0.47 0.4
Cpa|evm.model.tig00000821.5 (tig00000821_g4464.t1)
0.04 0.03 0.06 0.08 0.16 0.22 0.23 0.23 0.31 0.35 0.42 0.4 0.09 0.11 0.1 0.11 0.13 0.16 0.14 0.13 0.59 0.19 1.0 0.67 0.28 0.16
Cpa|evm.model.tig00000881.2 (tig00000881_g5216.t1)
0.07 0.01 0.01 0.02 0.02 0.06 0.09 0.11 0.24 0.43 0.42 0.36 0.11 0.02 0.03 0.01 0.06 0.09 0.07 0.07 0.41 0.04 1.0 0.86 0.14 0.25
Cpa|evm.model.tig00000889.51 (tig00000889_g5341.t1)
0.14 0.12 0.18 0.18 0.19 0.17 0.17 0.16 0.25 0.32 0.41 0.51 0.2 0.19 0.19 0.17 0.14 0.13 0.13 0.08 0.68 0.25 1.0 0.58 0.17 0.24
Cpa|evm.model.tig00000989.13 (tig00000989_g6086.t1)
0.24 0.17 0.14 0.19 0.2 0.2 0.21 0.23 0.29 0.2 0.29 0.26 0.2 0.14 0.1 0.09 0.11 0.16 0.14 0.11 0.78 0.46 1.0 0.63 0.4 0.28
Cpa|evm.model.tig00001030.36 (tig00001030_g6475.t1)
0.16 0.11 0.12 0.19 0.24 0.21 0.2 0.22 0.27 0.37 0.43 0.48 0.18 0.14 0.12 0.16 0.18 0.28 0.26 0.2 0.41 0.46 1.0 0.54 0.35 0.26
Cpa|evm.model.tig00001130.3 (tig00001130_g7232.t1)
0.11 0.12 0.11 0.14 0.18 0.16 0.18 0.15 0.18 0.16 0.15 0.17 0.08 0.23 0.15 0.23 0.13 0.25 0.2 0.12 0.46 0.47 1.0 0.41 0.33 0.22
Cpa|evm.model.tig00001224.14 (tig00001224_g7636.t1)
0.3 0.29 0.33 0.33 0.33 0.36 0.33 0.32 0.37 0.37 0.38 0.47 0.27 0.21 0.27 0.28 0.25 0.35 0.34 0.28 0.64 0.4 1.0 0.95 0.34 0.37
Cpa|evm.model.tig00001376.7 (tig00001376_g8528.t1)
0.11 0.07 0.06 0.06 0.05 0.06 0.06 0.07 0.1 0.14 0.21 0.28 0.11 0.36 0.1 0.53 0.16 0.09 0.09 0.08 0.84 0.17 1.0 0.6 0.16 0.2
Cpa|evm.model.tig00001600.5 (tig00001600_g9389.t1)
0.15 0.12 0.11 0.1 0.07 0.06 0.11 0.12 0.1 0.11 0.13 0.13 0.19 0.76 0.16 0.25 0.16 0.17 0.16 0.09 1.0 0.2 0.67 0.48 0.28 0.23
Cpa|evm.model.tig00020553.113 (tig00020553_g10600.t1)
0.04 0.05 0.06 0.05 0.12 0.1 0.12 0.1 0.12 0.11 0.16 0.13 0.03 0.23 0.27 0.25 0.27 0.35 0.31 0.27 0.89 0.34 1.0 0.94 0.4 0.28
Cpa|evm.model.tig00020554.123 (tig00020554_g10899.t1)
0.12 0.1 0.08 0.11 0.13 0.1 0.1 0.15 0.2 0.18 0.29 0.25 0.11 0.05 0.05 0.06 0.03 0.06 0.03 0.03 0.72 0.15 1.0 0.52 0.22 0.18
Cpa|evm.model.tig00020556.94 (tig00020556_g11061.t1)
0.17 0.26 0.31 0.35 0.43 0.46 0.4 0.36 0.38 0.36 0.37 0.37 0.2 0.37 0.29 0.44 0.37 0.4 0.36 0.37 0.82 0.31 1.0 0.88 0.45 0.42
Cpa|evm.model.tig00020684.64 (tig00020684_g12915.t1)
0.12 0.04 0.03 0.04 0.05 0.08 0.09 0.09 0.15 0.24 0.34 0.45 0.16 0.93 0.14 0.38 0.35 0.07 0.07 0.1 1.0 0.23 0.71 0.87 0.42 0.57
Cpa|evm.model.tig00020725.8 (tig00020725_g13534.t1)
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.07 0.27 0.36 0.51 0.15 0.16 0.24 0.91 0.03 1.0 0.52 0.15 0.25
0.24 0.12 0.1 0.15 0.15 0.17 0.15 0.14 0.13 0.18 0.18 0.27 0.26 0.09 0.16 0.16 0.07 0.14 0.14 0.06 0.56 0.35 1.0 0.26 0.4 0.33
Cpa|evm.model.tig00020801.74 (tig00020801_g13955.t1)
0.38 0.35 0.34 0.31 0.19 0.18 0.2 0.23 0.13 0.08 0.12 0.14 0.29 0.19 0.22 0.21 0.25 0.28 0.23 0.18 0.59 0.17 1.0 0.35 0.45 0.33
Cpa|evm.model.tig00020902.4 (tig00020902_g14947.t1)
0.03 0.01 0.02 0.04 0.1 0.1 0.06 0.05 0.19 0.38 0.52 0.68 0.07 0.04 0.01 0.03 0.03 0.03 0.03 0.1 0.61 0.37 1.0 0.92 0.16 0.25
Cpa|evm.model.tig00020902.98 (tig00020902_g15045.t1)
0.34 0.12 0.13 0.22 0.23 0.36 0.31 0.31 0.41 0.37 0.43 0.46 0.25 0.11 0.11 0.11 0.09 0.17 0.17 0.12 0.64 0.32 1.0 0.39 0.38 0.31
Cpa|evm.model.tig00020904.45 (tig00020904_g15178.t1)
0.12 0.09 0.1 0.1 0.1 0.11 0.13 0.16 0.24 0.34 0.41 0.45 0.11 0.17 0.07 0.08 0.09 0.13 0.06 0.12 0.69 0.19 1.0 0.73 0.27 0.36
Cpa|evm.model.tig00020904.75 (tig00020904_g15208.t1)
0.1 0.1 0.14 0.17 0.29 0.35 0.32 0.21 0.21 0.23 0.18 0.17 0.08 0.29 0.28 0.3 0.29 0.32 0.33 0.25 1.0 0.1 0.91 0.85 0.46 0.37
Cpa|evm.model.tig00020996.29 (tig00020996_g16941.t1)
0.16 0.06 0.02 0.02 0.02 0.04 0.05 0.05 0.07 0.11 0.16 0.23 0.17 0.57 0.08 0.33 0.18 0.07 0.08 0.07 1.0 0.13 0.29 0.33 0.14 0.16
Cpa|evm.model.tig00021127.99 (tig00021127_g18779.t1)
0.0 0.0 0.01 0.03 0.07 0.09 0.13 0.09 0.15 0.12 0.1 0.05 0.0 0.45 0.36 0.25 0.19 0.17 0.14 0.11 1.0 0.34 0.9 0.86 0.34 0.32
Cpa|evm.model.tig00021135.1 (tig00021135_g18924.t1)
0.06 0.06 0.1 0.17 0.22 0.2 0.2 0.26 0.21 0.15 0.27 0.22 0.08 0.16 0.18 0.13 0.12 0.21 0.17 0.08 0.93 0.56 1.0 0.35 0.59 0.35
Cpa|evm.model.tig00021290.7 (tig00021290_g19967.t1)
0.08 0.03 0.06 0.09 0.1 0.08 0.14 0.17 0.26 0.36 0.47 0.45 0.13 0.19 0.11 0.14 0.12 0.2 0.13 0.13 0.41 0.17 1.0 0.73 0.31 0.37
Cpa|evm.model.tig00021314.6 (tig00021314_g20116.t1)
0.27 0.19 0.21 0.23 0.14 0.07 0.11 0.18 0.13 0.17 0.21 0.22 0.2 0.17 0.18 0.17 0.11 0.16 0.13 0.12 0.64 0.17 1.0 0.57 0.57 0.44
Cpa|evm.model.tig00021432.32 (tig00021432_g21223.t1)
0.09 0.15 0.24 0.31 0.33 0.21 0.15 0.14 0.14 0.23 0.3 0.38 0.14 0.37 0.31 0.3 0.22 0.21 0.16 0.14 0.95 0.48 1.0 0.84 0.48 0.49
Cpa|evm.model.tig00021433.10 (tig00021433_g21263.t1)
0.34 0.29 0.29 0.36 0.35 0.28 0.28 0.32 0.31 0.25 0.29 0.32 0.36 0.33 0.31 0.26 0.2 0.34 0.27 0.17 0.85 0.42 1.0 0.64 0.49 0.56
Cpa|evm.model.tig00021434.36 (tig00021434_g21342.t3)
0.08 0.01 0.03 0.12 0.16 0.14 0.2 0.2 0.25 0.31 0.39 0.33 0.1 0.18 0.1 0.1 0.09 0.12 0.13 0.11 0.72 0.24 1.0 0.8 0.34 0.48
Cpa|evm.model.tig00021438.8 (tig00021438_g21444.t1)
0.16 0.09 0.05 0.18 0.19 0.13 0.24 0.25 0.52 0.41 0.45 0.39 0.16 0.22 0.22 0.18 0.18 0.26 0.2 0.2 0.63 0.37 1.0 0.69 0.36 0.32
Cpa|evm.model.tig00021525.3 (tig00021525_g22118.t1)
0.19 0.18 0.21 0.31 0.35 0.3 0.3 0.3 0.31 0.32 0.35 0.37 0.23 0.39 0.4 0.4 0.21 0.36 0.35 0.17 1.0 0.59 0.97 0.66 0.61 0.48
Cpa|evm.model.tig00021525.30 (tig00021525_g22147.t1)
0.06 0.05 0.05 0.13 0.22 0.22 0.2 0.18 0.23 0.23 0.3 0.23 0.07 0.1 0.04 0.08 0.07 0.08 0.06 0.07 0.51 0.12 1.0 0.47 0.19 0.19
Cpa|evm.model.tig00021537.40 (tig00021537_g22290.t1)
0.19 0.13 0.15 0.09 0.06 0.07 0.05 0.06 0.06 0.08 0.09 0.12 0.12 0.03 0.05 0.05 0.02 0.03 0.03 0.03 0.89 0.13 0.75 1.0 0.13 0.15
Cpa|evm.model.tig00021590.8 (tig00021590_g22765.t1)
0.23 0.29 0.28 0.22 0.23 0.25 0.36 0.41 0.37 0.36 0.33 0.3 0.26 0.25 0.31 0.28 0.26 0.54 0.4 0.3 0.77 0.35 1.0 0.62 0.71 0.48
Cpa|evm.model.tig00021591.4 (tig00021591_g22791.t1)
0.33 0.21 0.2 0.25 0.33 0.22 0.39 0.4 0.51 0.5 0.51 0.4 0.3 0.22 0.19 0.19 0.2 0.26 0.3 0.19 0.86 0.44 1.0 0.46 0.51 0.32
Cpa|evm.model.tig00021617.9 (tig00021617_g22937.t1)
0.16 0.1 0.09 0.23 0.17 0.14 0.16 0.16 0.25 0.22 0.29 0.31 0.11 0.13 0.12 0.15 0.1 0.28 0.16 0.08 0.7 0.28 1.0 0.68 0.27 0.29
Cpa|evm.model.tig00021720.23 (tig00021720_g23194.t1)
0.09 0.1 0.04 0.17 0.12 0.05 0.09 0.14 0.15 0.09 0.15 0.17 0.08 0.11 0.13 0.13 0.08 0.26 0.08 0.05 1.0 0.74 0.83 0.31 0.62 0.37
Cpa|evm.model.tig00021746.9 (tig00021746_g23391.t1)
0.23 0.16 0.1 0.23 0.22 0.14 0.17 0.17 0.2 0.23 0.29 0.27 0.24 0.24 0.15 0.15 0.1 0.13 0.13 0.08 0.86 0.58 1.0 0.9 0.52 0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)