Heatmap: Cluster_207 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.35 (tig00000042_g15426.t1)	0.26	0.49	0.53	0.68	0.86	0.95	0.9	0.8	1.0	0.94	0.87	0.83	0.33	0.5	0.52	0.49	0.53	0.63	0.64	0.64	0.08	0.42	0.9	0.53	0.68	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000093.152 (tig00000093_g3580.t1)	0.12	0.12	0.22	0.29	0.45	0.67	1.0	0.81	0.82	0.77	0.76	0.65	0.14	0.44	0.32	0.36	0.43	0.49	0.41	0.43	0.03	0.33	0.44	0.35	0.69	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000093.209 (tig00000093_g3635.t1)	0.26	0.35	0.24	0.33	0.45	0.45	0.39	0.44	0.44	0.34	0.34	0.3	0.18	0.16	0.14	0.19	0.14	0.27	0.3	0.17	0.05	1.0	0.58	0.24	0.41	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000241.126 (tig00000241_g20992.t1)	0.01	0.02	0.09	0.24	0.42	0.61	0.69	0.56	0.83	0.94	0.87	0.64	0.03	0.38	0.52	0.38	0.39	0.38	0.28	0.29	0.24	0.68	1.0	0.76	0.81	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000293.13 (tig00000293_g23881.t1)	0.03	0.06	0.21	0.44	0.6	0.47	0.64	0.61	0.94	0.87	0.96	0.78	0.02	0.36	0.38	0.38	0.36	0.41	0.37	0.29	0.23	0.79	1.0	0.97	0.61	0.86
Cpa\|evm.model.tig00000317.25 (tig00000317_g24033.t1)	0.07	0.36	0.54	0.68	1.0	1.0	0.95	0.97	1.0	0.94	0.78	0.8	0.06	0.61	0.5	0.54	0.59	0.74	0.58	0.66	0.24	0.6	0.7	0.84	0.63	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000388.20 (tig00000388_g24781.t1)	0.07	0.32	0.56	0.66	0.83	1.0	0.78	0.68	0.83	0.76	0.79	0.73	0.1	0.57	0.47	0.49	0.35	0.55	0.48	0.32	0.11	0.6	0.64	0.74	0.81	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000403.31 (tig00000403_g287.t1)	0.12	0.34	0.33	0.56	0.71	0.62	0.55	0.51	0.66	0.63	0.56	0.47	0.13	0.35	0.3	0.33	0.37	0.45	0.51	0.43	0.03	1.0	0.55	0.39	0.6	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000459.44 (tig00000459_g1107.t1)	0.02	0.08	0.23	0.33	0.39	0.35	0.53	0.53	0.72	0.82	0.81	0.6	0.01	0.43	0.26	0.31	0.33	0.35	0.21	0.35	0.35	0.71	1.0	0.84	0.81	0.85
Cpa\|evm.model.tig00000480.50 (tig00000480_g1318.t1)	0.16	0.14	0.19	0.37	0.41	0.34	0.49	0.57	0.77	0.76	0.95	0.79	0.13	0.29	0.24	0.37	0.35	0.33	0.25	0.3	0.35	0.63	1.0	0.63	0.68	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000489.10 (tig00000489_g1369.t1)	0.05	0.11	0.06	0.36	0.43	0.52	0.39	0.39	0.22	0.16	0.14	0.14	0.04	0.04	0.06	0.14	0.08	0.36	0.16	0.14	0.08	1.0	0.51	0.06	0.65	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000498.26 (tig00000498_g1603.t1)	0.12	0.37	0.42	0.34	0.49	0.49	0.6	0.62	0.7	0.57	0.65	0.54	0.1	0.36	0.43	0.45	0.41	0.52	0.46	0.39	0.03	0.96	0.46	0.31	1.0	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000655.25 (tig00000655_g2850.t1)	0.07	0.12	0.31	0.88	1.0	0.7	0.73	0.62	0.91	0.86	0.93	0.62	0.13	0.4	0.42	0.34	0.35	0.71	0.69	0.42	0.05	0.77	0.94	0.82	0.9	0.83
Cpa\|evm.model.tig00000692.46 (tig00000692_g3242.t1)	0.01	0.02	0.06	0.11	0.15	0.18	0.38	0.4	0.57	0.67	0.72	0.56	0.02	0.29	0.18	0.35	0.25	0.26	0.2	0.18	0.34	0.72	1.0	0.85	0.64	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000769.11 (tig00000769_g4006.t1)	0.12	0.05	0.16	0.36	0.65	0.7	0.76	0.66	1.0	0.71	0.82	0.65	0.08	0.25	0.28	0.21	0.33	0.38	0.37	0.25	0.1	0.41	0.76	0.63	0.48	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000786.11 (tig00000786_g4059.t1)	0.04	0.14	0.14	0.21	0.31	0.36	0.35	0.36	0.7	0.8	1.0	0.98	0.04	0.13	0.11	0.15	0.15	0.19	0.24	0.21	0.04	0.43	0.6	0.8	0.31	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000792.31 (tig00000792_g4182.t1)	0.14	0.3	0.46	0.62	0.87	1.0	1.0	0.87	0.96	0.83	0.78	0.68	0.11	0.53	0.58	0.46	0.57	0.56	0.62	0.57	0.45	0.83	0.93	0.71	0.69	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000802.57 (tig00000802_g4306.t1)	0.01	0.05	0.3	0.5	0.72	0.76	0.91	0.77	1.0	0.96	0.76	0.65	0.05	0.4	0.4	0.39	0.48	0.49	0.54	0.66	0.01	0.07	0.48	0.49	0.78	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000808.47 (tig00000808_g4434.t1)	0.36	0.43	0.41	0.46	0.69	0.85	0.8	0.67	0.72	0.83	0.76	0.75	0.41	0.22	0.16	0.22	0.32	0.49	0.42	0.58	0.15	1.0	0.64	0.77	0.58	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000828.23 (tig00000828_g4626.t1)	0.21	0.13	0.42	0.78	0.99	0.87	0.62	0.47	0.54	0.79	0.83	0.8	0.25	0.02	0.1	0.03	0.22	0.67	0.4	0.77	0.16	0.81	0.96	1.0	0.44	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000851.37 (tig00000851_g4921.t1)	0.12	0.13	0.35	0.51	0.74	0.8	0.96	0.82	0.84	1.0	0.75	0.47	0.12	0.23	0.12	0.35	0.45	0.42	0.47	0.66	0.09	0.9	0.73	0.44	0.82	0.88
Cpa\|evm.model.tig00000863.45 (tig00000863_g4998.t1)	0.77	0.62	0.68	0.72	0.8	0.89	0.78	0.78	0.79	0.75	0.78	0.85	0.85	0.43	0.42	0.5	0.48	0.55	0.5	0.54	0.19	0.94	0.73	1.0	0.81	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000880.15 (tig00000880_g5172.t1)	0.01	0.04	0.22	0.34	0.49	0.45	0.67	0.55	1.0	0.82	0.72	0.47	0.02	0.33	0.64	0.43	0.62	0.47	0.51	0.54	0.04	0.41	0.72	0.39	0.46	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001003.8 (tig00001003_g6266.t1)	0.12	0.4	0.33	0.71	1.0	0.67	0.81	0.76	0.76	0.75	0.93	0.71	0.16	0.33	0.33	0.36	0.38	0.57	0.4	0.35	0.07	0.67	0.81	0.86	0.78	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001065.24 (tig00001065_g6725.t1)	0.35	0.42	0.38	0.43	0.46	0.53	0.89	1.0	0.93	0.82	0.87	0.61	0.41	0.44	0.34	0.5	0.31	0.47	0.39	0.41	0.08	0.27	0.63	0.5	0.94	0.71
Cpa\|evm.model.tig00001095.12 (tig00001095_g7028.t1)	0.03	0.33	0.48	0.68	0.86	1.0	0.81	0.67	0.78	0.71	0.7	0.59	0.06	0.41	0.29	0.41	0.4	0.68	0.55	0.48	0.05	0.96	0.47	0.61	0.83	0.66
Cpa\|evm.model.tig00001127.29 (tig00001127_g7162.t1)	0.1	0.24	0.17	0.2	0.27	0.4	0.46	0.33	0.25	0.2	0.14	0.11	0.09	0.16	0.22	0.41	0.25	0.45	0.42	0.29	0.1	1.0	0.62	0.31	0.37	0.32
Cpa\|evm.model.tig00001187.18 (tig00001187_g7467.t1)	0.05	0.02	0.21	0.45	0.79	1.0	0.82	0.68	0.84	0.96	0.79	0.66	0.12	0.36	0.34	0.31	0.37	0.53	0.47	0.56	0.13	0.69	0.79	0.86	0.75	0.64
Cpa\|evm.model.tig00001253.6 (tig00001253_g7804.t1)	0.02	0.03	0.24	0.43	0.63	0.76	0.72	0.65	0.73	0.8	0.8	0.72	0.07	0.59	0.38	0.39	0.35	0.55	0.44	0.37	0.13	0.85	0.86	1.0	0.94	0.81
Cpa\|evm.model.tig00001366.5 (tig00001366_g8380.t1)	0.02	0.15	0.28	0.43	0.61	0.85	0.69	0.63	1.0	0.9	0.77	0.53	0.02	0.45	0.32	0.47	0.48	0.55	0.48	0.57	0.04	0.68	0.77	0.59	0.45	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020553.208 (tig00020553_g10698.t1)	0.28	0.16	0.27	0.53	0.72	0.84	1.0	0.88	0.88	0.95	0.92	0.86	0.35	0.37	0.21	0.29	0.24	0.65	0.39	0.47	0.03	0.49	0.47	0.52	0.94	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020564.49 (tig00020564_g11451.t1)	0.1	0.32	0.45	0.58	0.78	0.73	0.88	0.75	1.0	0.76	0.79	0.65	0.08	0.44	0.76	0.58	0.69	0.72	0.6	0.64	0.18	0.21	0.66	0.61	0.77	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020572.8 (tig00020572_g11528.t1)	0.16	0.31	0.38	0.77	0.81	0.72	0.81	0.75	0.73	0.73	0.77	0.79	0.2	0.11	0.11	0.13	0.2	0.44	0.38	0.42	0.16	0.82	0.51	0.5	1.0	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020603.53 (tig00020603_g11784.t1)	0.02	0.25	0.29	0.44	0.41	0.39	0.84	0.58	1.0	0.83	0.82	0.69	0.05	0.36	0.5	0.55	0.56	0.64	0.56	0.58	0.0	0.24	0.49	0.67	0.73	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020610.122 (tig00020610_g12067.t1)	0.33	0.39	0.43	0.49	0.65	0.8	0.66	0.61	0.78	0.76	0.72	0.78	0.48	0.48	0.47	0.51	0.49	0.63	0.47	0.42	0.29	1.0	0.83	0.85	0.94	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020693.44 (tig00021017_g17221.t2)	0.3	0.32	0.34	0.49	0.57	0.79	0.77	0.78	1.0	0.99	0.9	0.78	0.4	0.42	0.25	0.35	0.4	0.42	0.39	0.51	0.12	0.57	0.41	0.34	0.72	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020710.71 (tig00020710_g13323.t1)	0.05	0.27	0.33	0.47	0.61	0.5	0.53	0.68	0.85	0.77	0.75	0.5	0.1	0.55	0.4	0.59	0.45	0.55	0.45	0.4	0.07	0.78	0.77	0.77	1.0	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020723.82 (tig00020723_g13493.t1)	0.02	0.03	0.1	0.19	0.32	0.33	0.42	0.34	0.51	0.68	0.57	0.41	0.02	0.32	0.17	0.2	0.18	0.23	0.13	0.12	0.04	0.84	1.0	0.64	0.54	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020806.7 (tig00020806_g14031.t1)	0.07	0.21	0.4	0.69	1.0	0.9	0.81	0.77	0.8	0.76	0.81	0.63	0.07	0.29	0.27	0.29	0.34	0.53	0.44	0.36	0.1	0.61	0.54	0.81	0.66	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020830.85 (tig00020830_g14468.t1)	0.14	0.18	0.31	0.39	0.28	0.17	0.17	0.3	0.5	0.67	0.87	1.0	0.29	0.14	0.13	0.19	0.2	0.2	0.22	0.23	0.01	0.46	0.68	0.39	0.4	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020904.78 (tig00020904_g15211.t1)	0.0	0.05	0.19	0.49	0.4	0.42	0.67	0.68	0.78	0.69	0.73	0.46	0.02	0.52	0.14	0.33	0.16	0.28	0.19	0.15	0.05	0.07	0.24	0.18	1.0	0.35
Cpa\|evm.model.tig00020941.41 (tig00020941_g16233.t1)	0.12	0.19	0.24	0.25	0.61	0.57	0.6	0.53	0.75	0.73	0.75	0.8	0.06	0.29	0.13	0.25	0.17	0.28	0.23	0.34	0.16	1.0	0.54	0.68	0.42	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020961.122 (tig00020961_g16742.t1)	0.05	0.04	0.14	0.48	0.86	1.0	0.96	0.79	0.91	0.94	0.87	0.67	0.12	0.4	0.38	0.39	0.43	0.56	0.53	0.47	0.11	0.46	0.78	0.94	0.62	0.51
Cpa\|evm.model.tig00020961.16 (tig00020961_g16638.t1)	0.18	0.29	0.26	0.38	0.37	0.33	0.48	0.54	0.82	0.78	0.88	0.7	0.22	0.52	0.61	0.36	0.43	0.45	0.38	0.34	0.15	0.81	1.0	0.81	0.85	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020964.9 (tig00020964_g16780.t1)	0.23	0.46	0.4	0.55	0.75	0.7	0.77	0.73	1.0	0.6	0.82	0.76	0.16	0.36	0.46	0.36	0.32	0.55	0.47	0.38	0.04	0.13	0.76	0.51	0.53	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021035.18 (tig00021035_g17252.t1)	0.33	0.41	0.38	0.47	0.46	0.51	0.45	0.5	0.72	0.75	0.89	1.0	0.4	0.25	0.33	0.32	0.36	0.33	0.46	0.43	0.08	0.5	0.76	0.71	0.41	0.31
Cpa\|evm.model.tig00021094.27 (tig00021094_g18112.t1)	0.0	0.17	0.29	0.57	0.77	0.68	0.79	0.69	1.0	0.89	0.79	0.54	0.01	0.29	0.27	0.26	0.37	0.71	0.65	0.57	0.03	0.22	0.48	0.53	0.64	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021105.34 (tig00021105_g18243.t1)	0.02	0.23	0.36	0.84	0.85	0.81	0.71	0.62	0.98	0.88	0.86	0.86	0.04	0.58	0.51	0.45	0.39	0.54	0.54	0.27	0.2	0.76	1.0	0.98	0.86	0.99
Cpa\|evm.model.tig00021244.34 (tig00021244_g19589.t1)	0.02	0.2	0.39	0.42	0.58	0.75	0.64	0.58	0.82	0.85	0.94	0.96	0.05	0.29	0.24	0.48	0.41	0.37	0.38	0.4	0.22	0.74	1.0	0.83	0.73	0.41
Cpa\|evm.model.tig00021374.38 (tig00021374_g21119.t1)	0.19	0.38	0.43	0.81	0.95	0.94	1.0	0.71	0.8	0.82	0.94	0.93	0.11	0.29	0.23	0.26	0.26	0.44	0.41	0.24	0.23	0.53	0.31	0.52	0.8	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021521.22 (tig00021521_g22085.t1)	0.09	0.07	0.24	0.4	0.51	0.46	0.7	0.79	0.95	0.96	1.0	0.73	0.1	0.43	0.4	0.45	0.51	0.68	0.68	0.64	0.11	0.74	0.9	0.59	0.71	0.54
Cpa\|evm.model.tig00021537.74 (tig00021537_g22325.t1)	0.05	0.09	0.22	0.43	0.29	0.16	0.16	0.21	0.48	0.5	0.64	0.48	0.1	0.28	0.2	0.16	0.15	0.15	0.16	0.12	0.39	0.61	1.0	0.59	0.57	0.35
Cpa\|evm.model.tig00021721.20 (tig00021721_g23220.t1)	0.15	0.21	0.19	0.27	0.49	0.6	0.71	0.81	1.0	0.71	0.82	0.45	0.12	0.18	0.14	0.18	0.3	0.57	0.39	0.42	0.0	0.18	0.4	0.29	0.68	0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)