Heatmap: Cluster_187 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000076.131 (tig00000076_g2426.t1)	0.44	0.76	0.78	0.63	0.71	0.63	0.76	0.72	0.8	0.82	0.77	0.81	0.33	0.67	0.48	0.6	0.65	0.87	1.0	0.94	0.01	0.5	0.46	0.38	0.75	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000093.93 (tig00000093_g3520.t1)	0.05	0.27	0.46	0.93	0.82	0.85	1.0	0.75	0.73	0.49	0.43	0.32	0.05	0.4	0.34	0.51	0.42	0.59	0.57	0.46	0.06	0.1	0.2	0.29	0.71	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000144.169 (tig00000144_g9162.t1)	0.31	0.43	0.71	0.7	0.84	1.0	0.86	0.69	0.69	0.62	0.57	0.5	0.29	0.56	0.49	0.48	0.49	0.55	0.82	0.84	0.12	0.6	0.44	0.39	0.85	0.94
Cpa\|evm.model.tig00000144.83 (tig00000144_g9074.t1)	0.2	0.29	0.67	0.88	1.0	0.99	0.97	0.88	0.77	0.67	0.53	0.41	0.23	0.26	0.33	0.25	0.61	0.55	0.5	0.74	0.03	0.37	0.41	0.29	0.81	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000147.50 (tig00000147_g9489.t1)	0.66	0.54	0.76	0.97	0.8	0.69	0.82	1.0	0.82	0.87	0.84	0.75	0.55	0.54	0.41	0.4	0.48	0.54	0.48	0.67	0.06	0.39	0.59	0.48	0.72	0.84
Cpa\|evm.model.tig00000157.73 (tig00000157_g9661.t1)	0.24	0.67	0.91	1.0	0.97	0.67	0.54	0.62	0.67	0.69	0.65	0.54	0.24	0.27	0.5	0.41	0.46	0.75	0.72	0.66	0.04	0.35	1.0	0.69	0.74	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000194.85 (tig00000194_g14817.t1)	0.0	0.17	0.4	0.51	0.67	0.8	0.45	0.32	0.24	0.21	0.14	0.15	0.01	0.34	0.27	0.32	0.27	0.42	0.39	0.26	0.01	0.32	0.06	0.12	1.0	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000203.22 (tig00000203_g17127.t1)	0.45	0.59	0.65	0.67	0.82	0.83	0.89	0.76	0.79	0.83	0.68	0.55	0.45	0.56	0.66	0.54	0.72	1.0	0.76	0.85	0.09	0.45	0.38	0.53	0.91	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000219.15 (tig00000219_g19452.t1)	0.12	0.2	0.43	0.58	0.7	0.87	1.0	0.98	0.71	0.59	0.45	0.37	0.16	0.36	0.46	0.36	0.72	0.66	0.66	0.66	0.01	0.42	0.19	0.31	0.88	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000219.20 (tig00000219_g19459.t1)	0.44	0.61	0.58	0.86	0.91	0.9	1.0	0.98	0.8	0.59	0.56	0.43	0.29	0.32	0.28	0.35	0.35	0.4	0.41	0.38	0.02	0.44	0.26	0.35	0.81	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000317.4 (tig00000317_g24012.t1)	0.44	0.48	0.58	0.76	0.93	0.83	1.0	0.89	0.77	0.84	0.71	0.51	0.37	0.28	0.22	0.09	0.34	0.49	0.36	0.68	0.1	0.61	0.31	0.39	0.9	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000367.20 (tig00000367_g24456.t1)	0.15	0.46	0.71	0.87	1.0	0.79	0.87	0.99	0.84	0.7	0.71	0.66	0.21	0.29	0.34	0.29	0.41	0.38	0.32	0.51	0.15	0.35	0.37	0.22	0.6	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000367.38 (tig00000367_g24474.t1)	0.29	0.46	0.51	0.69	0.88	1.0	0.89	0.69	0.91	0.69	0.72	0.59	0.3	0.51	0.58	0.64	0.42	0.63	0.56	0.4	0.08	0.48	0.48	0.5	0.71	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000391.5 (tig00000391_g24836.t1)	0.39	0.46	0.56	0.66	0.82	1.0	0.73	0.64	0.6	0.47	0.49	0.47	0.45	0.36	0.32	0.28	0.42	0.44	0.47	0.46	0.01	0.42	0.24	0.32	0.55	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000402.47 (tig00000402_g224.t1)	0.36	0.41	0.68	0.84	0.95	1.0	0.96	0.9	0.81	0.71	0.61	0.52	0.4	0.18	0.28	0.2	0.5	0.53	0.48	0.75	0.03	0.26	0.56	0.45	0.85	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000480.75 (tig00000480_g1340.t1)	0.22	0.48	0.55	0.89	0.68	0.52	0.82	1.0	0.55	0.47	0.5	0.38	0.12	0.19	0.13	0.13	0.32	0.43	0.32	0.32	0.01	0.17	0.27	0.17	0.92	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000498.38 (tig00000498_g1614.t1)	0.54	0.59	0.57	0.75	0.85	1.0	0.92	0.95	0.86	0.59	0.53	0.43	0.47	0.24	0.3	0.42	0.54	0.43	0.47	0.51	0.01	0.45	0.45	0.33	0.92	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000498.54 (tig00000498_g1631.t1)	0.54	0.45	0.56	0.89	1.0	0.87	0.96	0.91	0.84	0.65	0.55	0.42	0.41	0.42	0.35	0.44	0.42	0.49	0.45	0.47	0.08	0.5	0.64	0.39	0.74	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000622.18 (tig00000622_g2632.t1)	0.67	0.84	0.65	0.73	0.89	0.98	1.0	0.94	0.85	0.68	0.63	0.61	0.63	0.53	0.47	0.51	0.49	0.55	0.6	0.48	0.0	0.39	0.4	0.44	0.65	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000655.10 (tig00000655_g2837.t1)	0.38	0.37	0.24	0.91	1.0	0.78	0.66	0.66	0.51	0.33	0.34	0.29	0.2	0.2	0.21	0.17	0.28	0.36	0.28	0.37	0.01	0.27	0.35	0.26	0.57	0.37
Cpa\|evm.model.tig00000704.20 (tig00000704_g3310.t1)	0.38	0.42	0.52	0.64	0.66	0.67	0.83	0.91	0.81	0.74	0.55	0.42	0.34	0.42	0.46	0.47	0.44	1.0	1.0	0.95	0.07	0.85	0.21	0.35	0.88	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000741.17 (tig00000741_g3833.t1)	0.11	0.31	0.69	0.74	0.71	0.74	0.63	0.74	0.65	0.62	0.43	0.27	0.07	0.5	0.38	0.61	0.43	1.0	0.73	0.63	0.02	0.08	0.27	0.2	0.78	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000912.39 (tig00000912_g5444.t1)	0.18	0.43	0.47	0.8	0.84	0.78	1.0	1.0	0.8	0.55	0.54	0.38	0.09	0.24	0.34	0.54	0.32	0.46	0.35	0.34	0.11	0.49	0.37	0.22	0.95	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000912.44 (tig00000912_g5449.t1)	0.63	0.63	0.66	0.85	0.8	0.81	0.99	0.82	0.82	0.41	0.63	0.55	0.46	0.48	0.42	0.66	0.35	0.48	0.45	0.4	0.07	0.33	0.63	1.0	0.82	0.94
Cpa\|evm.model.tig00000955.13 (tig00000955_g5788.t1)	0.2	0.49	0.83	0.96	0.99	1.0	0.73	0.85	0.71	0.62	0.7	0.66	0.38	0.18	0.29	0.21	0.48	0.5	0.57	0.58	0.0	0.55	0.2	0.29	0.85	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000970.32 (tig00000970_g5850.t1)	0.13	0.46	0.93	1.0	0.96	0.96	0.77	0.68	0.51	0.34	0.23	0.2	0.16	0.5	0.51	0.53	0.64	0.59	0.62	0.79	0.03	0.88	0.15	0.18	0.7	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000970.33 (tig00000970_g5851.t1)	0.08	0.31	0.68	0.72	0.65	1.0	0.73	0.61	0.61	0.38	0.29	0.26	0.1	0.52	0.56	0.48	0.6	0.4	0.6	0.7	0.11	0.39	0.3	0.35	0.28	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000981.32 (tig00000981_g5887.t1)	0.26	0.35	0.48	1.0	0.99	0.92	0.87	0.97	0.89	0.69	0.67	0.5	0.28	0.26	0.26	0.38	0.32	0.53	0.58	0.66	0.16	0.46	0.4	0.24	0.83	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000989.35 (tig00000989_g6108.t1)	0.06	0.61	0.9	0.97	1.0	0.92	0.76	0.71	0.62	0.61	0.52	0.5	0.13	0.54	0.53	0.62	0.48	0.8	0.59	0.7	0.03	0.1	0.36	0.18	0.82	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000989.37 (tig00000989_g6110.t1)	0.54	0.61	0.89	1.0	0.97	0.96	0.89	0.92	0.73	0.61	0.56	0.48	0.46	0.71	0.68	0.74	0.59	0.79	0.69	0.56	0.25	0.51	0.65	0.29	0.94	0.93
Cpa\|evm.model.tig00001029.10 (tig00001029_g6409.t1)	0.55	0.6	0.6	0.55	0.59	0.77	0.98	0.94	0.72	0.67	0.56	0.44	0.38	0.42	0.62	0.38	0.66	1.0	0.82	0.9	0.01	0.51	0.27	0.38	0.68	0.71
Cpa\|evm.model.tig00001049.7 (tig00001049_g6658.t1)	0.57	0.6	0.54	0.54	0.66	0.64	0.79	0.76	0.62	0.7	0.51	0.41	0.46	0.34	0.36	0.32	0.6	1.0	0.78	0.89	0.02	0.26	0.27	0.26	0.72	0.58
Cpa\|evm.model.tig00001098.16 (tig00001098_g7067.t1)	0.02	0.27	0.48	0.61	0.87	1.0	0.76	0.53	0.6	0.36	0.28	0.28	0.01	0.19	0.16	0.15	0.17	0.25	0.22	0.34	0.16	0.05	0.19	0.08	0.58	0.66
Cpa\|evm.model.tig00001130.26 (tig00001130_g7256.t1)	0.49	0.56	0.72	0.87	0.77	0.79	1.0	0.94	0.84	0.59	0.57	0.6	0.43	0.51	0.51	0.59	0.42	0.45	0.51	0.45	0.02	0.55	0.4	0.42	0.59	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001302.7 (tig00001302_g8091.t1)	0.25	0.77	0.97	0.95	1.0	0.98	0.75	0.62	0.67	0.59	0.59	0.64	0.21	0.54	0.23	0.4	0.35	0.46	0.53	0.57	0.04	0.38	0.13	0.3	0.61	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001333.27 (tig00001333_g8197.t1)	0.44	0.56	0.54	0.6	0.75	0.75	0.79	0.69	0.66	0.66	0.5	0.46	0.42	0.41	0.59	0.47	0.6	1.0	0.79	0.79	0.02	0.44	0.42	0.49	0.61	0.63
Cpa\|evm.model.tig00001333.33 (tig00001333_g8204.t1)	0.36	0.48	0.59	0.76	0.75	0.61	0.87	0.83	0.72	0.71	0.54	0.45	0.28	0.51	0.48	0.49	0.55	1.0	0.77	0.74	0.06	0.4	0.34	0.35	0.64	0.67
Cpa\|evm.model.tig00001466.3 (tig00001466_g8781.t1)	0.36	0.69	0.63	0.9	1.0	0.71	0.73	0.69	0.61	0.48	0.41	0.3	0.22	0.21	0.41	0.25	0.28	0.51	0.44	0.44	0.06	0.5	0.39	0.28	0.49	0.37
Cpa\|evm.model.tig00001490.10 (tig00001490_g8975.t1)	0.16	0.27	0.67	1.0	0.96	0.96	0.79	0.92	0.86	0.63	0.62	0.44	0.19	0.66	0.61	0.82	0.53	0.56	0.6	0.63	0.07	0.36	0.2	0.3	0.55	0.64
Cpa\|evm.model.tig00001545.13 (tig00001545_g9343.t1)	0.55	0.46	0.56	0.74	0.82	0.84	0.96	1.0	0.82	0.57	0.51	0.47	0.46	0.47	0.42	0.56	0.38	0.49	0.53	0.39	0.03	0.41	0.39	0.45	0.78	0.51
Cpa\|evm.model.tig00020510.72 (tig00020510_g9854.t1)	0.08	0.41	0.68	0.82	1.0	0.93	0.86	0.72	0.87	0.63	0.53	0.48	0.15	0.52	0.51	0.47	0.55	0.36	0.33	0.5	0.02	0.39	0.36	0.2	0.63	0.52
Cpa\|evm.model.tig00020537.16 (tig00020537_g10238.t1)	0.48	0.75	0.85	0.91	0.67	0.85	0.78	0.98	0.71	0.83	0.61	0.57	0.28	0.13	0.29	0.13	0.38	0.87	0.82	0.94	0.04	0.34	0.45	0.49	0.8	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020554.3 (tig00020554_g10787.t1)	0.35	0.56	0.91	1.0	0.93	0.84	0.55	0.5	0.46	0.51	0.45	0.51	0.38	0.52	0.55	0.63	0.4	0.63	0.57	0.49	0.15	0.25	0.56	0.53	0.98	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020556.39 (tig00020556_g11007.t1)	0.19	0.3	0.69	1.0	0.97	0.88	0.87	0.97	0.93	0.81	0.68	0.53	0.21	0.28	0.4	0.31	0.48	0.64	0.49	0.77	0.09	0.77	0.36	0.49	0.72	0.73
Cpa\|evm.model.tig00020560.26 (tig00020560_g11091.t1)	0.47	0.67	0.72	0.78	0.64	0.8	0.92	1.0	0.96	0.84	0.8	0.6	0.47	0.3	0.31	0.36	0.36	0.49	0.4	0.5	0.02	0.59	0.25	0.44	0.9	0.92
Cpa\|evm.model.tig00020563.123 (tig00020563_g11318.t1)	0.16	0.14	0.52	0.79	1.0	0.96	0.78	0.68	0.67	0.82	0.71	0.54	0.24	0.15	0.25	0.16	0.32	0.48	0.68	0.79	0.11	0.28	0.38	0.28	0.4	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020610.136 (tig00020610_g12081.t1)	0.43	0.69	0.91	0.96	0.99	0.97	0.59	0.61	0.22	0.15	0.15	0.19	0.46	0.39	0.38	0.4	0.36	0.27	0.3	0.42	0.07	0.36	0.04	0.17	1.0	0.98
Cpa\|evm.model.tig00020629.129 (tig00020629_g12458.t1)	0.38	0.74	0.95	0.91	0.82	0.72	0.55	0.51	0.48	0.43	0.38	0.39	0.38	0.11	0.19	0.17	0.26	0.35	0.36	0.53	0.06	1.0	0.26	0.37	0.49	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020703.40 (tig00020703_g13141.t1)	0.23	0.52	0.82	0.9	0.99	1.0	0.86	0.86	0.64	0.6	0.52	0.51	0.27	0.6	0.62	0.68	0.56	0.71	0.75	0.76	0.09	0.35	0.61	0.58	0.86	0.88
Cpa\|evm.model.tig00020780.12 (tig00020780_g13764.t1)	0.66	0.8	0.94	0.96	0.99	1.0	0.85	0.9	0.82	0.79	0.69	0.68	0.62	0.31	0.33	0.31	0.58	0.75	0.71	0.88	0.04	0.18	0.45	0.44	0.53	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020830.74 (tig00020830_g14457.t1)	0.02	0.35	0.44	0.82	0.64	0.9	0.74	0.88	1.0	0.58	0.49	0.24	0.0	0.05	0.11	0.09	0.2	0.49	0.33	0.42	0.08	0.15	0.17	0.02	0.6	0.33
Cpa\|evm.model.tig00020902.59 (tig00020902_g15014.t1)	0.16	0.52	0.78	0.66	0.65	0.64	0.63	0.63	0.56	0.71	0.6	0.51	0.12	0.41	0.53	0.32	0.54	0.81	1.0	0.86	0.01	0.44	0.22	0.29	0.64	0.75
Cpa\|evm.model.tig00020944.39 (tig00020944_g16387.t1)	0.64	0.73	0.9	0.97	1.0	0.89	0.68	0.75	0.75	0.74	0.63	0.65	0.41	0.31	0.23	0.23	0.45	0.8	0.8	0.65	0.03	0.56	0.35	0.42	0.64	0.98
Cpa\|evm.model.tig00021037.75 (tig00021037_g17485.t1)	0.39	0.23	0.33	0.73	0.76	0.75	0.95	1.0	0.88	0.61	0.54	0.34	0.32	0.19	0.2	0.27	0.28	0.3	0.32	0.23	0.07	0.52	0.44	0.26	0.78	0.47
Cpa\|evm.model.tig00021038.98 (tig00021038_g17587.t1)	0.33	0.48	0.66	0.83	0.87	0.92	0.97	0.84	0.89	0.8	0.7	0.59	0.4	0.38	0.45	0.48	0.52	0.81	0.9	0.91	0.05	0.51	0.39	0.39	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00021042.10 (tig00021042_g17601.t1)	0.74	0.42	0.52	0.89	0.73	0.61	0.9	1.0	0.77	0.62	0.63	0.54	0.5	0.31	0.26	0.29	0.24	0.27	0.29	0.34	0.0	0.38	0.31	0.41	0.84	0.75
Cpa\|evm.model.tig00021098.12 (tig00021098_g18180.t1)	0.36	0.15	0.38	0.43	0.5	0.79	1.0	0.89	0.68	0.35	0.24	0.2	0.26	0.07	0.18	0.12	0.3	0.32	0.27	0.42	0.06	0.06	0.42	0.26	0.47	0.3
Cpa\|evm.model.tig00021123.10 (tig00021123_g18492.t1)	0.11	0.53	0.89	0.96	1.0	0.9	0.8	0.75	0.55	0.54	0.36	0.25	0.1	0.27	0.41	0.3	0.44	0.9	0.93	0.92	0.01	0.37	0.19	0.14	0.75	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021179.36 (tig00021179_g19250.t1)	0.15	0.2	0.63	1.0	0.93	0.73	0.94	0.88	0.73	0.7	0.55	0.44	0.21	0.41	0.34	0.56	0.52	0.69	0.57	0.83	0.01	0.35	0.05	0.14	0.58	0.53
Cpa\|evm.model.tig00021179.37 (tig00021179_g19250.t1)	0.14	0.19	0.56	0.82	1.0	0.86	0.91	0.87	0.72	0.59	0.48	0.41	0.15	0.26	0.23	0.48	0.33	0.45	0.45	0.56	0.01	0.21	0.03	0.12	0.38	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021293.14 (tig00021293_g20007.t1)	0.54	0.66	0.62	0.79	1.0	0.73	0.64	0.59	0.58	0.46	0.5	0.39	0.27	0.38	0.33	0.37	0.33	0.37	0.38	0.35	0.04	0.28	0.37	0.65	0.48	0.52
Cpa\|evm.model.tig00021332.8	0.35	0.23	0.5	0.75	0.82	1.0	0.79	0.75	0.7	0.62	0.63	0.64	0.49	0.22	0.39	0.23	0.19	0.35	0.38	0.35	0.06	0.17	0.18	0.31	0.31	0.38
Cpa\|evm.model.tig00021432.5 (tig00021432_g21196.t1)	0.31	0.56	0.96	1.0	0.87	0.8	0.71	0.82	0.6	0.47	0.42	0.43	0.21	0.45	0.66	0.48	0.59	0.5	0.62	0.69	0.06	0.31	0.66	0.33	0.7	0.71
Cpa\|evm.model.tig00021463.2 (tig00021463_g21610.t1)	0.47	0.76	1.0	0.85	0.73	0.63	0.67	0.76	0.71	0.52	0.44	0.39	0.42	0.28	0.64	0.39	0.55	0.72	0.77	0.82	0.14	0.41	0.7	0.45	0.55	0.4
Cpa\|evm.model.tig00021493.60 (tig00021493_g21897.t1)	0.26	0.47	0.61	0.71	0.87	1.0	0.81	0.7	0.65	0.47	0.51	0.41	0.28	0.51	0.37	0.55	0.4	0.52	0.54	0.44	0.05	0.53	0.41	0.32	0.64	0.63
Cpa\|evm.model.tig00021721.12 (tig00021721_g23211.t1)	0.57	0.75	0.74	0.85	0.88	0.9	1.0	0.98	0.82	0.61	0.67	0.55	0.48	0.35	0.46	0.49	0.52	0.68	0.57	0.52	0.06	0.58	0.4	0.47	0.8	0.66
Cpa\|evm.model.tig00021795.6 (tig00021795_g23524.t1)	0.15	0.25	0.28	0.66	1.0	0.89	0.74	0.71	0.49	0.47	0.42	0.25	0.06	0.07	0.09	0.1	0.16	0.35	0.24	0.3	0.05	0.19	0.37	0.19	0.55	0.4
Cpa\|evm.model.tig00022075.21 (tig00022075_g23585.t1)	0.12	0.7	0.95	0.97	1.0	0.89	0.54	0.54	0.45	0.42	0.43	0.38	0.1	0.24	0.34	0.28	0.35	0.37	0.45	0.64	0.07	0.57	0.19	0.29	0.5	0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)