Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000037.3 (tig00000037_g10070.t1)	0.64	0.64	0.71	0.72	0.55	0.4	0.49	0.56	0.44	0.46	0.45	0.53	0.65	0.63	0.72	0.72	0.56	0.94	0.79	0.71	0.55	0.36	0.48	0.47	0.63	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000076.84 (tig00000076_g2382.t1)	1.0	0.81	0.61	0.41	0.21	0.18	0.25	0.31	0.34	0.37	0.38	0.49	0.91	0.21	0.31	0.22	0.31	0.42	0.53	0.36	0.27	0.29	0.36	0.59	0.45	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000145.17 (tig00000145_g8810.t1)	0.63	0.64	0.65	0.36	0.27	0.35	0.45	0.65	0.6	0.71	0.58	0.54	0.77	1.0	0.91	0.86	0.39	0.55	0.68	0.65	0.29	0.14	0.58	0.96	0.63	0.84
Cpa\|evm.model.tig00000145.18 (tig00000145_g8810.t1)	0.52	0.45	0.79	0.43	0.15	0.07	0.5	0.7	0.47	0.71	0.71	0.43	0.49	1.0	0.74	0.98	0.65	0.74	0.59	0.78	0.6	0.1	0.93	0.56	0.48	0.99
Cpa\|evm.model.tig00000157.19 (tig00000157_g9606.t1)	1.0	0.47	0.24	0.17	0.18	0.3	0.38	0.42	0.28	0.28	0.23	0.24	0.87	0.47	0.61	0.38	0.38	0.49	0.54	0.36	0.32	0.32	0.44	0.25	0.56	0.37
Cpa\|evm.model.tig00000215.124 (tig00000215_g18668.t1)	0.84	0.51	0.42	0.43	0.26	0.17	0.34	0.45	0.43	0.47	0.52	0.52	0.7	0.7	0.67	0.67	0.51	0.9	0.75	0.47	0.66	0.29	1.0	0.46	0.62	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000219.28 (tig00000219_g19468.t1)	0.34	0.08	0.05	0.05	0.14	0.53	0.78	0.78	1.0	0.86	0.69	0.61	0.34	0.1	0.11	0.17	0.14	0.32	0.18	0.09	0.8	0.09	0.91	0.32	0.69	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000241.33 (tig00000241_g20891.t1)	0.5	0.44	0.33	0.25	0.25	0.24	0.34	0.36	0.3	0.26	0.23	0.21	0.43	0.27	0.55	0.25	0.41	0.55	1.0	0.31	0.21	0.12	0.37	0.13	0.12	0.12
Cpa\|evm.model.tig00000254.92 (tig00000254_g22549.t1)	0.76	0.4	0.28	0.3	0.32	0.46	0.48	0.45	0.44	0.5	0.58	0.84	0.92	0.69	0.56	0.74	0.42	0.5	0.6	0.39	0.72	0.71	1.0	0.77	0.58	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000382.40 (tig00000382_g24577.t1)	1.0	0.78	0.59	0.46	0.44	0.45	0.61	0.68	0.47	0.46	0.38	0.33	0.79	0.26	0.57	0.41	0.54	1.0	0.91	0.69	0.18	0.43	0.84	0.28	0.4	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000388.22 (tig00000388_g24783.t1)	0.9	0.61	0.56	0.41	0.3	0.34	0.38	0.48	0.42	0.5	0.64	0.73	1.0	0.51	0.62	0.57	0.35	0.98	0.93	0.51	0.58	0.26	0.85	0.66	0.62	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000441.11 (tig00000441_g705.t1)	0.92	0.24	0.11	0.09	0.16	0.46	0.97	1.0	0.79	0.84	0.77	0.69	0.88	0.4	0.38	0.33	0.55	0.58	0.6	0.56	0.73	0.27	0.92	0.6	0.52	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000498.78 (tig00000498_g1657.t1)	0.57	0.58	0.63	0.78	0.5	0.32	0.36	0.59	0.42	0.35	0.46	0.35	0.46	0.16	0.25	0.19	0.6	0.46	0.55	0.55	0.53	0.86	0.35	0.29	1.0	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000692.34 (tig00000692_g3229.t1)	0.71	1.0	0.75	0.55	0.34	0.32	0.41	0.58	0.46	0.28	0.31	0.33	0.72	0.19	0.42	0.32	0.42	0.76	0.49	0.45	0.79	0.62	0.56	0.3	0.94	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000692.51 (tig00000692_g3247.t1)	0.76	0.5	0.57	0.68	0.56	0.54	0.58	0.52	0.73	0.89	0.88	0.86	0.61	0.75	0.47	0.68	0.52	0.91	0.84	0.42	0.56	0.52	1.0	1.0	0.64	0.74
Cpa\|evm.model.tig00000704.41 (tig00000704_g3328.t1)	0.75	0.7	0.58	0.57	0.49	0.62	0.56	0.59	0.49	0.4	0.43	0.42	0.61	0.42	0.54	0.45	0.44	0.72	0.6	0.48	0.51	0.11	1.0	0.59	0.52	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000754.15 (tig00000754_g3898.t1)	0.72	0.33	0.26	0.3	0.27	0.31	0.27	0.35	0.24	0.52	0.42	0.47	0.58	0.67	0.6	0.46	0.33	0.59	0.62	0.54	0.52	0.18	1.0	0.72	0.8	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000789.52 (tig00000789_g4144.t1)	0.1	0.21	0.27	0.24	0.16	0.18	0.13	0.17	0.18	0.21	0.2	0.17	0.07	0.31	0.3	0.16	0.13	0.67	0.49	0.13	0.77	0.08	0.67	0.19	1.0	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000789.8 (tig00000178_g12753.t1)	0.58	0.45	0.49	0.77	0.69	0.58	0.62	0.72	0.76	0.79	1.0	0.98	0.64	0.75	0.58	0.73	0.63	0.84	0.77	0.48	0.28	0.25	0.74	0.66	0.48	0.91
Cpa\|evm.model.tig00000802.54 (tig00000802_g4303.t1)	0.43	0.53	0.46	0.34	0.16	0.1	0.23	0.49	0.67	0.76	0.73	0.74	0.53	0.45	0.73	0.52	0.61	1.0	0.61	0.5	0.55	0.56	0.4	0.64	0.64	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000842.1 (tig00000842_g4820.t2)	1.0	0.72	0.43	0.26	0.24	0.37	0.6	0.61	0.67	0.65	0.6	0.58	0.81	0.68	0.39	0.54	0.55	0.61	0.49	0.57	0.51	0.35	0.87	0.66	0.94	0.87
Cpa\|evm.model.tig00000842.18 (tig00000842_g4838.t1)	0.3	0.37	0.34	0.5	0.51	0.55	0.55	0.51	0.56	0.57	0.5	0.58	0.27	0.63	1.0	0.81	0.69	0.85	1.0	0.75	0.48	0.12	0.7	0.83	0.4	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000852.26 (tig00000852_g5039.t1)	0.56	0.61	0.54	0.52	0.52	0.4	0.62	0.56	0.54	0.65	0.7	0.73	0.76	0.77	0.73	0.7	0.63	1.0	0.7	0.66	0.62	0.33	0.57	0.65	0.79	0.83
Cpa\|evm.model.tig00000984.3 (tig00000984_g5978.t1)	1.0	0.58	0.34	0.3	0.42	0.54	0.67	0.57	0.49	0.52	0.45	0.47	0.85	0.5	0.67	0.49	0.67	0.75	0.87	0.68	0.75	0.6	0.62	0.47	0.42	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000984.4 (tig00000984_g5978.t1)	1.0	0.64	0.39	0.31	0.48	0.72	0.75	0.57	0.51	0.55	0.4	0.43	0.83	0.69	0.91	0.62	0.85	0.81	0.96	0.87	0.69	0.51	0.58	0.47	0.42	0.52
Cpa\|evm.model.tig00001003.7 (tig00001003_g6265.t1)	0.51	0.3	0.1	0.09	0.22	0.43	0.56	0.44	0.33	0.22	0.23	0.19	0.43	0.35	0.28	0.15	0.46	0.29	0.36	0.25	0.41	0.08	1.0	0.38	0.29	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001030.18 (tig00001030_g6457.t1)	0.77	0.94	0.76	0.66	0.73	0.76	0.67	0.62	0.65	0.58	0.61	0.59	0.57	0.52	0.55	0.59	0.6	0.74	0.72	0.67	0.68	0.41	0.88	1.0	0.69	0.68
Cpa\|evm.model.tig00001130.5 (tig00001130_g7234.t1)	1.0	0.79	0.47	0.38	0.39	0.46	0.77	0.85	0.66	0.68	0.58	0.49	0.74	0.45	0.44	0.37	0.57	0.78	0.68	0.54	0.6	0.95	0.6	0.47	0.73	0.58
Cpa\|evm.model.tig00001264.3 (tig00001264_g7860.t1)	0.74	0.82	0.65	0.53	0.38	0.25	0.36	0.47	0.49	0.62	0.56	0.6	0.63	0.47	0.34	0.75	0.56	0.91	0.8	0.69	0.51	0.7	1.0	0.9	0.62	0.62
Cpa\|evm.model.tig00001284.15 (tig00001284_g8013.t1)	0.57	0.42	0.49	0.42	0.47	0.51	0.5	0.5	0.55	0.7	0.68	0.68	0.62	0.72	0.64	0.75	0.58	0.76	0.71	0.69	0.46	0.29	1.0	0.72	0.48	0.64
Cpa\|evm.model.tig00001371.16 (tig00001371_g8433.t1)	1.0	0.73	0.41	0.29	0.29	0.39	0.59	0.57	0.48	0.5	0.41	0.38	0.77	0.33	0.39	0.25	0.55	0.8	0.71	0.6	0.88	0.4	0.64	0.49	0.37	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001371.20 (tig00001371_g8437.t1)	0.44	0.91	0.92	0.92	0.85	0.68	0.63	0.66	0.59	0.54	0.5	0.46	0.42	0.17	0.4	0.23	0.53	0.84	0.53	0.62	0.86	0.99	0.45	0.5	1.0	0.5
Cpa\|evm.model.tig00001537.3 (tig00001537_g9297.t1)	0.64	0.65	0.69	0.68	0.7	0.74	0.62	0.57	0.64	0.64	0.59	0.59	0.68	0.59	0.72	0.71	0.67	0.87	0.68	0.6	0.51	0.51	1.0	0.79	0.66	0.81
Cpa\|evm.model.tig00020537.62 (tig00020537_g10287.t1)	1.0	0.52	0.33	0.22	0.23	0.18	0.37	0.49	0.24	0.2	0.31	0.4	0.98	0.42	0.36	0.23	0.34	0.66	0.62	0.21	0.41	0.2	0.72	0.42	0.57	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020554.106 (tig00020554_g10883.t2)	0.72	0.32	0.33	0.5	0.45	0.27	0.38	0.51	0.49	0.49	0.61	0.66	0.76	0.73	0.31	0.26	0.2	0.34	0.47	0.25	0.58	0.31	1.0	0.28	0.65	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020554.93 (tig00020554_g10871.t1)	0.41	0.45	0.47	0.55	0.66	0.7	0.76	0.7	0.7	0.63	0.69	0.72	0.54	0.87	0.65	0.71	0.46	0.84	0.64	0.51	0.68	0.35	1.0	0.55	0.71	0.74
Cpa\|evm.model.tig00020554.97 (tig00020554_g10875.t1)	0.93	0.69	0.65	0.52	0.38	0.29	0.36	0.5	0.58	0.69	0.68	0.87	1.0	0.4	0.45	0.49	0.65	0.65	0.52	0.67	0.4	0.46	0.65	0.65	0.66	0.79
Cpa\|evm.model.tig00020563.127 (tig00020563_g11329.t1)	0.57	0.17	0.55	0.51	0.58	0.49	0.38	0.2	0.13	0.14	0.23	0.13	0.21	0.29	0.13	0.38	0.19	0.48	0.52	0.11	0.82	0.04	1.0	0.02	0.16	0.51
Cpa\|evm.model.tig00020601.6 (tig00020601_g11713.t1)	0.3	0.2	0.28	0.48	0.48	0.62	0.66	0.54	0.46	0.48	0.55	0.41	0.22	0.91	1.0	0.89	0.36	0.87	0.72	0.32	0.66	0.2	0.62	0.56	0.45	0.74
Cpa\|evm.model.tig00020610.132 (tig00020610_g12077.t1)	1.0	0.94	0.53	0.38	0.16	0.18	0.27	0.43	0.38	0.4	0.44	0.54	0.88	0.43	0.47	0.36	0.42	0.5	0.55	0.35	0.42	0.2	0.69	0.48	0.59	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020629.148 (tig00020629_g12477.t1)	0.3	0.18	0.2	0.21	0.34	0.52	0.51	0.51	0.73	0.85	0.72	0.64	0.4	0.57	0.37	0.52	0.37	0.69	0.53	0.58	0.37	0.08	1.0	0.58	0.36	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020704.40 (tig00020704_g13183.t1)	1.0	0.0	0.23	0.23	0.0	0.0	0.16	0.11	0.0	0.11	0.0	0.12	0.78	0.0	0.11	0.0	0.0	0.39	0.09	0.0	0.24	0.0	0.29	0.0	0.22	0.16
Cpa\|evm.model.tig00020710.43 (tig00020911_g15757.t1)	0.67	0.53	0.47	0.44	0.51	0.47	0.62	0.6	0.5	0.5	0.63	0.59	0.57	0.9	0.65	0.55	0.47	0.73	0.71	0.6	0.64	0.22	0.95	0.52	0.78	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020848.44 (tig00020848_g14573.t1)	0.11	0.13	0.21	0.18	0.14	0.13	0.17	0.2	0.19	0.18	0.17	0.13	0.13	0.22	0.36	0.35	0.28	0.79	0.56	0.43	0.73	0.11	0.3	0.16	1.0	0.3
Cpa\|evm.model.tig00021017.10 (tig00021017_g17185.t1)	1.0	0.37	0.22	0.23	0.39	0.41	0.73	0.73	0.56	0.65	0.52	0.46	0.93	0.51	0.34	0.31	0.5	0.75	0.7	0.54	0.54	0.17	0.99	0.84	0.51	0.67
Cpa\|evm.model.tig00021123.36 (tig00021123_g18519.t1)	0.72	0.57	0.38	0.37	0.23	0.46	0.29	0.21	0.3	0.39	0.49	0.49	1.0	0.46	0.34	0.28	0.32	0.56	0.78	0.42	0.39	0.15	0.28	0.4	0.49	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021127.133 (tig00021127_g18813.t1)	0.89	0.31	0.12	0.08	0.17	0.43	0.63	0.54	0.52	0.5	0.47	0.52	0.85	0.5	0.47	0.38	0.5	0.48	0.51	0.33	0.67	0.28	1.0	0.74	0.38	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021127.67 (tig00021127_g18744.t1)	0.98	0.92	0.82	0.74	0.82	0.95	0.77	0.76	0.64	0.65	0.7	0.75	0.72	0.64	0.7	0.65	0.73	0.54	0.62	0.68	0.79	0.57	1.0	0.97	0.54	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021137.21 (tig00021137_g18986.t1)	0.63	0.57	0.48	0.42	0.29	0.25	0.31	0.46	0.54	0.56	0.54	0.52	0.66	0.3	0.49	0.45	0.58	1.0	0.65	0.5	0.79	0.34	0.51	0.35	0.77	0.43
Cpa\|evm.model.tig00021168.56 (tig00021168_g19123.t1)	0.48	0.42	0.42	0.52	0.49	0.34	0.54	0.71	0.67	0.73	0.78	0.67	0.56	0.75	0.98	0.67	0.46	1.0	0.88	0.67	0.54	0.3	0.62	0.5	0.57	0.86
Cpa\|evm.model.tig00021168.57 (tig00021168_g19123.t1)	0.44	0.31	0.39	0.43	0.34	0.26	0.43	0.6	0.49	0.59	0.57	0.5	0.41	0.65	1.0	0.69	0.46	0.81	0.75	0.59	0.34	0.15	0.4	0.39	0.38	0.63
Cpa\|evm.model.tig00021179.84 (tig00021179_g19301.t1)	0.28	0.5	0.69	0.67	0.52	0.39	0.67	0.8	0.66	0.82	0.91	0.97	0.3	0.42	0.49	0.57	0.61	1.0	0.8	0.63	0.57	0.49	0.55	0.39	0.93	0.46
Cpa\|evm.model.tig00021293.26 (tig00021293_g20018.t1)	0.72	0.09	0.05	0.07	0.07	0.11	0.21	0.15	0.1	0.08	0.16	0.14	0.83	0.29	0.29	0.22	0.2	0.45	0.22	0.16	0.32	0.05	1.0	0.21	0.66	0.21
Cpa\|evm.model.tig00021350.39 (tig00021350_g20656.t1)	0.45	0.47	0.42	0.45	0.56	0.57	0.65	0.56	0.7	0.68	0.7	0.66	0.46	0.75	0.69	0.64	0.56	1.0	0.76	0.59	0.7	0.45	0.79	0.66	0.72	0.88
Cpa\|evm.model.tig00021428.2 (tig00021428_g21143.t1)	0.73	0.65	0.57	0.31	0.3	0.37	0.53	0.54	0.4	0.42	0.38	0.34	0.77	0.33	0.49	0.38	0.37	1.0	0.89	0.54	0.64	0.2	0.67	0.53	0.98	0.68
Cpa\|evm.model.tig00021434.53 (tig00021434_g21356.t1)	0.5	0.32	0.3	0.35	0.46	0.25	0.63	0.64	0.64	0.55	0.83	0.98	0.6	0.97	0.5	0.71	0.46	0.73	0.54	0.34	0.23	0.27	0.83	0.54	0.43	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021532.12 (tig00021532_g22192.t1)	0.68	0.31	0.2	0.18	0.22	0.32	0.8	0.8	1.0	0.93	0.86	0.57	0.67	0.47	0.31	0.4	0.43	0.49	0.45	0.44	0.74	0.26	0.97	0.49	0.57	0.46
Cpa\|evm.model.tig00021532.14 (tig00021532_g22194.t1)	0.3	0.39	0.48	0.52	0.41	0.38	0.54	0.66	0.8	0.8	1.0	0.95	0.43	0.34	0.37	0.26	0.65	0.74	0.41	0.32	0.72	0.41	0.99	0.5	0.59	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021537.23 (tig00021537_g22279.t1)	1.0	0.83	0.46	0.31	0.3	0.37	0.67	0.73	0.58	0.57	0.45	0.38	0.79	0.41	0.67	0.43	0.54	0.88	0.73	0.54	0.39	0.51	0.71	0.44	0.45	0.37
Cpa\|evm.model.tig00021616.19 (tig00021616_g22924.t1)	0.84	0.31	0.22	0.44	0.68	0.53	0.4	0.3	0.42	0.31	0.5	0.34	0.56	0.86	0.33	0.6	0.16	0.5	0.44	0.14	0.73	0.39	1.0	0.23	0.91	0.49
Cpa\|evm.model.tig00021720.24 (tig00022080_g23797.t1)	0.49	0.45	0.49	0.41	0.37	0.27	0.3	0.38	0.14	0.32	0.32	0.32	0.57	0.67	0.44	0.57	0.48	0.5	0.42	0.53	0.55	0.24	0.83	0.38	0.6	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)