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Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Glc+ (10 mM),0.5h
Glc+ (10 mM),1h
Glc+ (10 mM),3h
Glc+ (10 mM),6h
Glc+ (10 mM),12h
Glc+ (20 mM),0h
Glc+ (20 mM),0.5h
Glc+ (20 mM),1h
Glc+ (20 mM),3h
Glc+ (20 mM),6h
Glc+ (20 mM),12h
Glc-,0h
Glc-,0.5h
Glc-,1h
Glc-,3h
Glc-,6h
Glc-,12h
Heterotrophy,Mixotrophy
High light,0.5h
High light,1h
High light,3h
High light,6h
High light,12h
High light,Proteose
Low light,Proteose
Med light,0h
Med light,0.5h
Med light,1h
Med light,3h
Med light,6h
Med light,12h
Med light,Proteose
Med light,Proteose,-Fe
Med light,Proteose,-N
Med light,Proteose,-P
Med light,Proteose,-S
Med light,Proteose,Glc+
Med light,Proteose,H2O2
Med light,Proteose,Rose Bengal
Single cell
No light,Proteose
Whole cell,Autotrophy,ND+cerulenin,6h
Whole cell,Autotrophy,ND+cerulenin,12h
Whole cell,Autotrophy,ND,0h
Whole cell,Autotrophy,ND,3h
Whole cell,Autotrophy,ND,6h
Whole cell,Autotrophy,ND,12h
Whole cell,Autotrophy,ND,24h
0.74 0.28 -0.49 -0.31 -0.01 -2.41 -1.13 -1.11 -1.36 -1.99 -1.57 0.58 0.04 0.0 -0.14 0.15 0.42 0.4 0.54 0.64 0.81 0.29 0.26 -2.81 -1.01 0.61 0.54 0.65 0.49 0.42 0.62 -0.15 0.81 0.74 0.6 -2.44 -1.28 0.73 -0.69 0.21 -0.47 -0.6 -1.12 0.35 -0.38 -0.48 -0.94 -0.6
-0.29 -0.48 -0.24 -0.31 0.09 -0.56 -0.31 -0.19 -0.26 -0.03 -0.75 -0.07 -0.52 -0.24 -0.34 -0.58 -0.38 0.09 -0.81 -0.41 -0.12 -0.18 -0.66 -0.59 0.75 -0.07 -0.27 -0.05 -0.35 -0.08 -0.76 -0.86 -0.76 0.11 -0.22 -0.48 -0.27 -0.83 -1.68 0.72 -0.06 1.0 1.23 1.09 1.11 0.99 0.81 0.63
0.5 0.38 -0.21 -0.36 -0.1 -1.98 -0.88 -0.59 -0.7 -1.79 -1.76 0.4 0.03 0.1 -0.24 0.08 0.37 0.4 0.68 0.67 0.34 -0.03 0.05 -2.34 -0.03 0.45 0.45 0.54 0.33 0.1 0.56 -0.89 -0.42 0.62 -0.71 -0.66 -0.59 -0.59 -1.1 -0.42 -0.33 0.4 0.18 0.59 0.32 0.52 0.34 0.26
-0.04 -0.91 -1.17 -2.21 -0.86 -2.73 -1.2 -1.8 -1.37 -2.84 -2.53 -0.26 -0.51 -0.53 -1.23 -1.07 -0.43 0.49 -0.05 0.24 0.03 -0.67 -0.61 -2.65 1.55 -0.13 -0.02 -0.06 -0.37 -1.04 -0.22 -1.09 -0.78 0.06 -0.68 0.93 -1.53 0.19 0.06 -0.07 0.46 0.82 1.17 1.43 1.54 1.26 1.23 1.06
0.64 0.19 -0.81 -0.81 -0.02 -1.14 -1.81 -1.4 -1.09 -0.77 -1.19 0.49 -0.14 -0.06 -0.25 -0.43 0.06 1.33 0.44 0.21 0.38 0.3 -0.34 -1.24 -0.28 0.52 0.64 0.47 0.01 -0.31 -0.79 0.52 -0.17 0.52 0.28 -0.36 -0.52 0.36 -0.06 -1.63 -0.23 0.43 -0.3 0.63 0.58 0.1 -0.26 0.37
0.45 -0.05 -2.11 -3.57 -1.18 -4.35 -3.73 -4.22 -3.75 -4.05 -3.68 1.03 0.06 -0.05 -0.5 -0.79 0.29 1.08 1.23 1.36 0.53 -0.49 -0.54 -3.27 -1.24 0.96 1.02 0.73 0.51 -0.39 0.24 0.07 1.11 0.78 0.87 -1.63 -1.14 1.11 -0.31 -1.52 0.32 -0.39 -0.78 0.61 -0.07 0.03 -0.6 -0.06
0.35 -0.03 -0.55 -1.19 -0.02 -0.97 -0.69 -0.55 -0.95 -1.23 -1.25 0.02 -0.28 -0.12 -0.19 -0.53 -0.13 0.54 0.59 0.91 0.21 -0.14 -0.27 -1.57 -0.37 0.11 0.09 0.03 -0.07 -0.51 -0.14 0.09 0.44 0.39 0.08 0.26 0.12 -0.1 0.28 -0.29 0.67 -0.17 0.13 0.83 0.78 0.34 -0.16 0.45
0.61 0.68 0.25 0.03 0.18 -2.28 -1.76 -1.88 -1.52 -1.69 -1.86 0.65 -0.06 0.01 -0.19 -0.1 0.49 0.87 0.45 0.51 0.31 -0.24 -0.19 -2.17 -1.72 0.77 0.61 0.63 0.59 0.1 0.28 -1.02 -0.63 0.88 -0.5 -1.86 0.57 -0.35 -1.74 -0.11 -1.24 0.32 -0.94 1.16 0.43 0.25 -0.76 0.47
-0.15 -0.17 -0.26 0.21 0.76 -0.03 -0.54 0.11 -0.25 0.13 -0.94 -0.5 -0.42 -0.15 -0.05 -0.29 -0.44 0.4 -1.1 -0.42 -0.04 0.0 -0.23 -0.23 0.62 -0.46 -0.4 0.14 0.26 -0.12 -0.37 -1.34 -0.65 -0.5 -1.33 -1.02 -0.5 -0.91 -1.5 -0.14 -1.85 1.08 0.71 1.04 1.38 1.03 0.87 0.62
0.36 -0.17 -0.53 -0.32 0.4 -1.1 0.43 0.04 -0.03 -0.75 -1.01 0.22 0.09 0.04 -0.42 -0.04 0.09 0.64 0.28 0.11 -0.18 -0.15 -0.01 -2.23 0.93 0.2 0.13 0.05 -0.08 -0.27 0.28 -1.56 -2.21 0.28 -2.54 -1.49 -2.19 -2.52 -2.42 0.33 -1.37 1.0 1.0 0.68 0.8 0.93 0.95 0.41
0.44 -0.23 -1.38 -2.37 -1.06 -1.25 -0.86 -1.08 -1.92 -2.33 -2.12 0.72 0.06 -0.13 -0.62 -0.69 0.25 0.84 1.05 1.21 0.43 -0.42 -0.52 -0.85 -0.1 0.78 0.71 0.42 -0.04 -0.64 -0.0 -0.05 0.54 0.76 0.42 -1.35 -0.51 0.53 0.2 -1.07 0.68 -0.01 -0.09 0.66 0.15 0.13 0.04 -0.27
0.15 -0.66 -0.61 -0.99 0.22 -2.65 -0.77 -1.09 -1.11 -2.47 -2.94 -0.14 -0.65 -0.25 -0.57 -0.54 -0.57 0.52 -0.27 0.3 0.17 -0.57 -0.54 -1.79 0.45 -0.1 -0.29 0.06 0.15 -0.14 -0.46 -0.6 0.75 -0.19 0.75 -0.41 0.37 0.45 -0.95 0.38 -0.22 0.51 0.36 1.77 1.24 0.86 0.47 0.74
0.69 0.51 -0.66 -1.01 -0.4 -3.58 -3.28 -2.98 -2.63 -2.24 -1.85 0.77 0.03 0.06 -0.08 0.22 0.64 1.15 0.85 0.89 0.45 0.04 -0.07 -1.92 -0.91 0.68 0.92 0.86 0.49 0.49 0.78 -0.09 -0.05 0.62 0.1 -0.93 -0.08 0.26 -0.82 -1.14 -0.77 -0.79 -1.06 0.97 -0.17 -0.45 -0.75 -0.33
-0.23 -0.78 -1.05 -1.5 -0.23 -1.19 -0.74 -0.56 -1.08 -1.4 -1.74 0.27 -0.33 -0.09 -0.11 -0.38 -0.04 0.75 0.16 0.34 0.09 -0.02 -0.01 -1.53 0.03 0.35 0.08 0.25 0.13 -0.17 -0.1 0.08 0.43 0.18 0.34 -0.1 -0.47 0.41 -0.0 -0.19 0.64 0.35 0.37 1.07 0.67 0.56 0.19 0.49
1.03 0.61 0.15 -0.41 0.13 -1.54 -0.28 -0.78 -1.35 -1.42 -1.48 0.69 0.28 0.17 -0.26 -0.27 0.35 1.11 -0.16 0.12 0.26 -0.41 -0.17 -2.47 -1.33 0.61 0.77 0.62 0.51 -0.15 -0.07 -1.59 -0.57 0.95 -0.98 -0.79 -1.79 -0.97 -2.71 -0.21 -0.05 0.88 0.21 0.96 0.18 0.24 -0.26 0.32
0.16 -0.81 -1.64 -2.54 -0.6 -3.77 -3.32 -2.75 -2.7 -3.54 -3.27 -0.41 -1.32 -1.19 -1.06 -1.31 -0.87 0.98 -0.47 -0.2 -0.23 -0.6 -0.84 -6.97 0.48 -0.44 -0.4 -0.59 -0.86 -0.76 -0.69 0.09 0.77 -0.74 0.81 -1.31 0.81 0.89 -0.43 1.56 -0.11 1.45 0.46 1.61 1.51 1.39 0.81 1.26
0.01 -0.88 -1.44 -1.96 -0.56 -0.57 0.27 -0.2 -0.79 -1.63 -1.84 0.12 -0.01 -0.01 -0.56 -0.73 -0.13 0.21 1.23 1.21 0.34 -0.17 0.16 -0.12 0.62 0.28 0.03 0.16 -0.16 -0.7 0.28 -0.06 -0.15 0.57 -0.82 -0.16 -0.79 -0.61 -0.32 -0.4 0.48 -0.27 0.25 0.58 0.88 0.53 0.31 0.37
0.18 -0.07 -0.25 -0.25 -0.09 -1.68 -0.89 -0.72 -0.67 -1.6 -1.24 -0.03 -0.36 -0.09 -0.62 -0.61 -0.27 0.46 0.05 0.04 -0.06 -0.38 -0.2 -1.37 0.47 -0.16 0.06 0.13 0.08 -0.61 -0.09 -0.41 0.48 -0.14 0.27 0.15 -0.18 0.5 -0.72 0.0 -0.81 0.3 0.78 1.16 0.93 1.01 0.56 0.77
0.02 -0.56 0.04 -0.22 0.59 -1.19 -0.41 -0.21 -0.27 -1.13 -1.41 -0.13 -0.47 -0.15 -0.19 -0.36 -0.2 0.97 -0.63 -0.35 0.02 -0.09 -0.21 -0.46 0.94 0.14 -0.41 0.07 0.11 -0.05 -0.47 -1.0 -0.66 0.51 -1.02 -1.26 -0.89 -0.92 -1.18 1.64 -0.02 0.18 0.26 1.06 1.05 0.47 0.64 0.17
-0.16 -0.43 -0.44 0.11 0.25 -1.42 -0.01 -0.9 -0.65 -0.97 -1.9 -0.08 -0.66 -0.48 -0.41 -0.51 -0.4 0.29 -0.45 -0.25 -0.24 -0.13 -0.47 0.36 0.7 0.03 -0.64 0.23 -0.07 -0.2 -0.51 -0.23 -0.37 0.1 -0.6 0.53 -0.15 -1.14 -1.18 0.45 -1.03 0.85 1.11 1.06 1.14 1.04 0.95 0.36
0.51 -0.09 -0.9 -1.15 -0.05 -2.42 -1.16 -1.11 -1.17 -2.27 -1.81 0.35 -0.31 -0.16 -0.23 -0.02 0.21 0.89 0.63 0.79 0.47 -0.02 0.1 -1.66 -0.4 0.37 0.28 0.32 0.24 -0.08 0.31 -0.3 0.18 0.68 -0.25 -1.02 -0.5 0.15 0.74 1.06 0.29 -0.27 -0.39 0.68 0.19 0.03 -0.26 0.05
0.79 -0.03 -1.74 -2.22 -0.64 -2.09 -1.28 -0.93 -1.54 -2.57 -2.22 0.6 -0.13 -0.08 -0.74 -0.95 -0.01 0.68 0.58 0.6 0.52 -0.24 -0.16 -2.55 -0.28 0.56 0.6 0.35 0.12 -0.61 0.08 0.44 1.44 0.66 1.09 -2.32 -2.06 1.34 0.03 -0.25 0.45 0.03 -0.04 0.19 -0.07 0.07 -0.09 -0.22
0.25 -7.53 -7.43 -6.45 -0.57 -3.42 -0.93 -3.35 -4.44 -4.56 -4.69 -7.95 -4.91 -5.3 -4.62 -6.16 -6.81 2.64 -6.58 -5.08 -5.97 -3.64 -5.9 -5.04 2.7 - -5.95 -5.59 -5.68 -4.68 -6.45 -6.06 - -5.77 -6.07 - - -6.06 -6.98 -2.53 -3.28 1.83 1.68 2.12 2.61 2.39 2.5 1.88
-1.21 -3.52 - -3.65 -1.12 - -2.24 - -2.43 - - -3.71 -3.19 -5.01 -3.0 -5.06 -4.85 1.98 -4.05 - -3.6 -4.34 -1.68 -1.03 2.15 -3.71 -2.19 -4.01 -2.71 - - -1.48 0.31 - 0.26 -0.89 -2.05 -2.05 -0.85 0.78 -0.73 2.14 2.67 1.8 2.15 1.85 2.19 1.42
-0.03 -0.61 -1.12 -1.84 0.15 -4.22 -1.92 -1.83 -2.2 -2.36 -3.91 0.07 -0.64 -0.68 -1.08 -0.72 -0.41 1.58 0.06 0.21 -0.31 -0.79 -0.44 -2.22 0.98 -0.19 0.21 -0.12 -0.16 -0.87 -0.15 -1.25 -0.94 0.37 -0.25 -2.4 -2.98 -0.03 -1.06 0.7 -2.07 1.23 1.04 1.57 1.55 1.58 1.36 0.95
-0.05 -0.52 -1.63 -1.88 -0.24 -0.6 -1.44 -1.2 -1.97 -1.65 -1.15 0.6 -0.06 -0.05 -0.48 -1.46 -0.32 1.36 0.63 0.73 0.09 -1.2 -0.54 -0.57 0.85 0.46 0.56 0.53 0.35 -1.33 -0.22 -1.37 -0.81 0.44 0.27 -0.43 - 0.29 -1.65 0.36 -0.54 0.51 1.39 0.62 0.57 1.02 0.55 0.57
0.29 0.19 -0.46 -0.08 0.23 -2.47 -1.56 -1.67 -1.82 -1.44 -1.95 -0.66 -0.72 -0.54 -0.64 -0.25 0.04 1.39 -0.52 -0.2 -0.13 -0.39 -0.18 -1.06 0.96 -0.64 -0.39 0.1 -0.03 -0.07 0.27 -0.6 -0.47 0.03 -0.2 -0.17 -0.43 -0.47 -0.71 -0.84 -2.01 1.04 0.73 1.55 1.23 1.12 0.75 0.94
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0.55 0.09 -0.77 -0.87 0.73 -1.89 -1.73 -0.95 -1.2 -1.7 -1.75 0.01 -0.6 -0.33 -0.47 -0.55 -0.14 1.03 -0.27 0.05 -0.23 -0.89 -0.74 -1.2 0.85 0.04 -0.03 -0.05 -0.2 -0.61 -0.32 -0.53 -0.35 0.51 -0.25 -0.59 -0.18 -0.06 -1.73 1.19 -0.35 0.36 0.64 1.37 1.23 0.7 0.74 0.73
-0.12 -0.49 -0.55 -0.42 0.46 -2.07 -0.69 -0.55 -0.27 -1.43 -1.08 -0.13 -0.53 -0.44 -0.53 0.06 0.0 1.01 -0.28 -0.2 -0.06 -0.28 -0.05 -1.23 0.99 -0.32 0.04 -0.12 -0.33 0.01 0.16 -1.36 -0.02 -0.28 -0.41 -2.67 -1.98 0.17 -2.24 0.63 -1.38 1.31 0.81 0.91 1.22 0.86 1.13 0.72
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0.31 0.38 0.32 0.22 -0.08 -1.3 0.03 -0.37 -0.14 -1.13 -1.17 0.17 -0.05 -0.04 -0.41 -0.55 -0.17 0.73 0.12 -0.08 0.18 -0.55 -0.49 -2.13 0.55 0.27 0.2 0.12 0.27 -0.69 -0.12 -2.52 -2.76 0.22 -3.25 -2.28 -1.48 -2.67 -3.01 0.52 -1.79 1.31 1.01 1.27 0.83 1.16 0.94 0.66
0.79 0.68 0.17 -0.98 -0.46 -0.72 -0.72 -0.66 -0.98 -1.58 -1.52 0.37 -0.0 -0.09 -0.43 -0.9 0.15 1.24 0.59 0.68 0.68 -0.43 -0.16 0.25 -0.53 0.5 0.43 0.33 0.43 -0.67 -0.35 -0.26 -0.28 0.79 -0.31 -1.03 -1.22 -0.08 -0.75 -0.66 -0.17 0.27 -0.27 0.4 0.57 0.16 -0.38 0.47
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0.26 -0.02 0.06 -0.02 0.4 -0.24 -0.51 -0.22 -0.31 -0.28 -0.42 -0.13 -0.41 -0.04 -0.04 -0.36 -0.39 0.16 -0.97 -0.29 -0.13 -0.03 -0.31 -0.24 0.87 0.06 -0.61 0.06 0.06 0.03 -0.59 -1.67 -1.94 -0.21 -1.62 -0.63 -1.33 -1.26 -1.32 0.76 -1.88 1.11 1.03 0.92 1.18 0.83 0.89 0.73
0.34 0.19 -0.19 -0.02 0.51 -1.26 -0.48 -0.37 -0.83 -1.13 -1.4 0.26 -0.14 -0.01 -0.3 -0.32 0.05 0.87 0.09 0.22 0.2 -0.24 -0.03 -1.69 0.28 0.37 0.23 0.39 0.2 -0.48 0.15 -1.28 -0.8 0.4 -0.95 -0.44 -1.01 -0.65 -2.42 0.08 -1.55 0.85 0.67 0.87 0.74 0.87 0.73 0.35
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0.18 -0.3 -0.65 -0.24 0.14 -2.71 -1.41 -1.58 -1.71 -1.53 -2.49 -0.13 -0.83 -0.61 -0.77 -0.38 -0.24 1.14 -1.08 -0.32 -0.2 -0.26 -0.43 -0.63 0.27 -0.15 -0.23 0.13 -0.28 -0.11 -0.31 0.17 0.7 0.12 0.58 0.05 -0.91 0.71 -0.84 0.07 0.1 1.14 0.74 1.08 0.79 1.03 0.71 0.74

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.