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Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Glc+ (10 mM),0.5h
Glc+ (10 mM),1h
Glc+ (10 mM),3h
Glc+ (10 mM),6h
Glc+ (10 mM),12h
Glc+ (20 mM),0h
Glc+ (20 mM),0.5h
Glc+ (20 mM),1h
Glc+ (20 mM),3h
Glc+ (20 mM),6h
Glc+ (20 mM),12h
Glc-,0h
Glc-,0.5h
Glc-,1h
Glc-,3h
Glc-,6h
Glc-,12h
Heterotrophy,Mixotrophy
High light,0.5h
High light,1h
High light,3h
High light,6h
High light,12h
High light,Proteose
Low light,Proteose
Med light,0h
Med light,0.5h
Med light,1h
Med light,3h
Med light,6h
Med light,12h
Med light,Proteose
Med light,Proteose,-Fe
Med light,Proteose,-N
Med light,Proteose,-P
Med light,Proteose,-S
Med light,Proteose,Glc+
Med light,Proteose,H2O2
Med light,Proteose,Rose Bengal
Single cell
No light,Proteose
Whole cell,Autotrophy,ND+cerulenin,6h
Whole cell,Autotrophy,ND+cerulenin,12h
Whole cell,Autotrophy,ND,0h
Whole cell,Autotrophy,ND,3h
Whole cell,Autotrophy,ND,6h
Whole cell,Autotrophy,ND,12h
Whole cell,Autotrophy,ND,24h
0.48 -0.31 -0.57 -0.46 -0.02 -1.07 -1.65 -1.15 -1.27 -0.83 -1.89 0.36 -0.6 -0.28 -0.1 -0.28 0.17 0.49 -0.12 0.04 -0.01 0.07 -0.13 -1.42 0.78 0.53 -0.12 0.4 0.37 0.28 -0.22 -0.43 -0.52 0.7 -0.4 -0.56 -1.51 -0.49 0.02 -0.39 -0.27 0.31 0.71 0.47 1.26 0.91 0.68 0.58
0.3 -0.44 -0.35 -0.3 0.29 -1.15 -1.15 -0.5 -0.03 -0.2 -0.78 0.8 0.03 0.41 0.44 -0.11 0.34 0.34 0.34 0.43 0.34 -0.25 -0.39 -0.89 0.19 0.94 0.61 0.83 0.77 -0.12 -0.04 -0.52 -0.8 1.08 -0.84 -1.8 -0.99 -0.54 -0.67 -0.15 -0.74 -0.48 -0.02 -0.14 -0.1 0.16 0.41 -0.45
0.83 -0.43 -0.85 0.02 0.66 -1.76 -2.08 -1.57 -0.77 -0.47 -0.81 0.31 -0.42 0.14 0.26 -0.11 0.18 0.28 0.14 0.07 0.68 -0.07 0.05 -1.16 0.39 0.33 0.35 0.79 0.86 0.23 -0.03 0.31 0.01 0.75 -0.39 0.63 -0.9 0.14 0.06 -2.15 -0.1 -1.2 -0.19 -0.64 0.02 0.16 0.22 -0.02
1.45 -0.06 -1.94 -2.28 1.29 -1.06 0.06 0.08 -0.4 -1.43 -1.51 0.06 -0.27 -0.02 0.21 0.26 0.08 1.39 -0.27 0.3 0.17 0.58 0.48 -0.66 0.41 0.15 -0.07 0.56 0.42 0.6 0.41 -0.92 -0.63 0.1 -1.68 -3.84 -1.0 -1.18 -1.33 1.39 0.58 -1.63 -0.16 -1.55 -0.4 -0.42 0.2 -1.37
-1.04 -0.8 -1.07 -0.65 -0.13 -0.35 0.58 0.45 0.64 0.3 0.63 -0.55 0.29 0.22 0.5 0.8 0.24 0.09 -0.46 -0.19 0.02 -0.33 -0.4 0.01 0.32 -0.87 -0.21 0.26 -0.11 0.2 0.47 -1.0 -0.41 -1.25 -0.31 -0.56 -0.49 -0.27 -0.02 -1.72 1.36 -0.04 -0.32 -0.16 0.26 0.29 0.62 -0.35
0.44 0.05 0.38 0.75 0.91 -2.48 -3.07 -1.89 -1.13 -0.72 -0.63 0.56 0.07 0.25 0.06 0.2 0.55 -0.17 0.1 0.2 0.51 0.07 0.13 -1.57 0.05 0.51 0.8 1.0 0.8 0.59 0.8 -2.41 -2.69 0.53 -2.38 -5.57 0.05 -1.7 -2.32 0.05 -3.26 0.7 0.39 0.15 -0.17 0.38 0.32 -0.44
0.03 -0.25 -0.49 -0.27 0.14 -0.1 0.14 0.64 0.59 -0.05 -0.08 -0.19 0.3 0.11 0.1 0.28 0.38 -0.09 -0.07 -0.22 -0.25 0.04 0.56 -0.33 0.67 -0.15 -0.17 0.2 -0.25 -0.13 0.42 -0.22 -0.38 0.17 -0.99 -0.32 -0.48 -0.94 -0.51 -0.76 -1.27 0.12 0.42 0.26 0.23 0.25 0.35 -0.11
-0.18 -1.08 -1.03 -0.55 0.49 -0.7 -1.05 -0.86 0.11 -0.03 -0.46 0.09 -0.49 -0.16 0.08 -0.2 -0.21 0.28 -0.58 -0.11 -0.33 -0.43 -0.57 0.92 1.03 0.0 -0.17 0.21 -0.16 -0.24 -0.32 -0.25 -0.53 -0.34 -1.66 -0.49 -1.24 -0.57 -0.88 -0.13 -0.45 0.75 0.92 0.4 0.69 1.29 1.41 0.45
1.86 -0.7 0.27 -0.63 2.36 0.4 1.36 -0.57 -0.45 -0.62 -3.33 -0.66 -0.44 -1.32 -0.86 -0.59 -0.25 1.64 -1.11 -0.78 -0.49 -1.07 0.22 1.32 1.31 -0.74 -1.07 -0.12 -1.18 0.48 -1.49 -1.53 -1.47 -1.22 - 0.65 - - -0.42 -0.67 -0.6 -0.22 0.78 -0.61 -0.15 -0.26 0.13 -1.3
0.12 -0.23 -0.18 0.11 0.58 -0.1 -0.18 0.47 0.24 0.17 0.25 0.22 0.22 0.3 0.24 0.43 0.38 0.02 0.08 0.06 0.12 0.28 0.4 -0.64 0.62 0.19 0.23 0.4 0.22 0.26 0.48 -0.92 -1.41 0.1 -1.39 -1.95 -0.72 -1.2 -0.71 -1.35 -1.52 -0.02 0.03 -0.82 0.17 0.29 0.43 -0.08
0.76 -0.23 -1.61 -1.4 0.54 -0.55 -0.56 -0.44 -0.29 0.47 0.28 0.31 -0.08 0.16 0.43 0.24 0.22 1.25 0.25 0.19 0.1 -0.48 -0.53 0.19 0.61 0.34 0.22 0.39 0.29 -0.6 -0.29 -0.01 -0.48 0.56 -0.67 0.07 -2.14 -0.38 0.11 -1.39 -1.61 -1.03 0.44 -0.82 0.03 0.22 0.55 -0.39
1.33 -0.18 -1.08 -3.04 1.45 -0.76 -2.03 -1.66 -0.43 -0.0 -2.28 0.58 -0.27 -0.17 0.1 -1.5 -0.52 1.93 0.9 0.52 -0.05 -1.96 -2.39 -0.23 0.45 0.42 0.62 -0.01 0.42 -2.41 -0.85 1.02 -0.2 0.36 0.03 -2.49 -5.45 -0.02 1.04 -4.04 -2.22 -1.76 -0.0 -0.31 0.36 0.52 0.16 0.57
-0.03 -0.69 0.72 1.31 1.35 -4.57 -3.11 -2.61 -1.61 -1.65 -0.84 0.57 -0.13 -0.05 -0.28 0.15 0.46 -0.19 -0.38 -0.35 0.31 -0.32 -0.05 -4.01 0.87 0.54 0.79 0.74 0.58 0.78 0.99 -4.58 -6.79 0.62 - - -0.3 -8.41 -8.33 -1.71 -3.92 1.03 0.76 0.93 0.09 0.84 1.13 -0.55
-0.07 -0.22 -0.25 0.09 0.22 -2.59 -2.05 -0.93 -0.2 -0.86 -1.33 0.66 0.04 0.27 0.32 0.04 0.28 -0.71 0.49 0.53 0.71 0.08 -0.15 -3.43 -0.39 0.68 0.71 0.88 0.85 0.39 0.44 0.05 -0.15 0.8 0.13 0.6 0.02 0.18 -0.66 -0.13 0.18 -1.79 -0.39 -0.45 -0.73 -0.62 -0.5 -0.41
1.52 0.23 -0.04 -2.09 0.14 -0.01 -1.34 -0.13 0.61 0.42 -2.11 1.2 0.49 0.67 0.47 -1.02 0.37 1.32 1.1 0.71 -0.06 -1.77 -0.9 -2.49 -0.11 1.24 1.12 0.49 0.73 -2.31 -0.48 -0.25 -2.02 1.49 -1.77 -5.64 -4.63 -1.84 0.22 -5.03 -2.74 -1.35 -1.16 -0.93 -0.59 -0.56 -0.61 -0.21
0.81 -0.58 -0.72 -0.68 0.93 0.49 -0.53 0.06 0.9 0.76 -0.56 0.47 -0.05 0.49 0.64 -0.58 -0.16 0.98 0.39 0.44 0.22 -0.67 -0.56 -0.97 0.78 0.5 0.23 0.29 0.58 -1.27 -0.9 -0.07 -1.12 0.97 -0.75 -2.41 -2.16 -0.31 -0.3 -1.66 -1.83 -1.37 -0.47 -0.51 0.2 -0.12 0.54 -0.62
0.77 -0.45 -0.76 -0.73 0.19 0.42 -0.47 0.23 0.87 0.78 -0.6 0.64 -0.07 0.51 0.65 -0.41 0.14 0.44 0.3 0.28 0.44 -0.54 -0.61 -0.74 0.59 0.82 0.39 0.48 0.56 -0.78 -0.66 -0.13 -1.32 1.29 -0.79 -2.38 -1.78 -0.48 -0.44 -1.45 -1.86 -1.36 -0.13 -0.59 -0.19 -0.06 0.33 -0.54
1.54 -0.51 -0.46 -0.7 0.77 0.29 -0.54 0.4 0.49 0.46 -0.37 0.57 0.1 0.37 0.8 -0.65 -0.01 1.27 0.12 0.0 0.55 -1.47 -0.76 -1.72 0.73 0.81 0.32 0.07 0.93 -1.34 -0.64 -0.21 -2.43 0.76 -1.07 -2.31 -3.06 -0.88 -0.27 -2.22 -2.15 -1.62 -0.09 -0.2 -0.09 0.31 0.47 -1.23
0.07 -0.33 -0.64 -0.64 -0.57 -1.13 -0.34 0.25 0.41 -0.29 -0.74 0.67 0.37 0.65 0.58 0.52 0.46 0.24 0.58 0.32 0.48 0.35 -0.01 -0.39 0.57 0.7 0.73 1.07 1.02 0.51 0.08 -0.43 -1.13 0.76 -1.17 -1.82 -2.57 -1.21 -0.46 -2.55 -1.87 -1.02 -0.83 -1.75 -0.08 0.07 0.23 -0.65
0.74 0.49 0.19 0.35 0.71 -0.75 -0.4 -0.12 -0.45 -0.43 -0.62 0.18 -0.09 0.08 -0.04 0.11 0.32 0.12 -0.05 0.12 0.32 0.25 0.39 -0.82 0.47 0.32 0.03 0.37 0.42 0.29 0.32 -0.59 -0.49 0.48 -0.69 -0.55 -0.78 -0.54 -0.63 -1.71 -1.21 -0.15 0.02 -0.18 0.17 0.07 0.16 0.0
1.44 0.49 -0.24 -2.49 0.03 0.54 -0.52 0.01 0.27 -0.47 -2.1 1.04 0.49 0.6 0.02 -1.47 0.27 1.27 0.87 0.36 -0.87 -1.33 -0.02 -4.05 0.76 1.06 1.04 0.48 0.27 -2.62 -0.57 0.87 -2.47 1.29 -2.4 -3.7 -3.83 -2.3 1.2 -4.21 -2.66 -1.5 -1.41 -1.18 -0.47 -1.01 -0.21 0.48
0.18 -0.16 -0.8 -1.38 -0.12 -1.44 -0.73 -0.59 -1.31 -1.14 -1.72 0.61 -0.1 -0.04 -0.78 -0.42 0.22 0.32 0.6 0.71 -0.21 -0.06 -0.3 -1.36 0.74 0.79 0.05 0.6 -0.18 -0.16 0.08 -0.49 -1.8 0.84 -2.27 0.45 -1.52 -2.84 -0.4 -1.2 0.55 0.35 0.47 1.01 1.34 0.65 0.73 0.27
0.72 0.4 -0.21 -0.18 0.44 -0.9 -0.64 -0.58 -0.7 -0.47 -1.03 0.2 -0.22 -0.1 -0.16 -0.24 0.23 0.33 -0.12 0.1 0.01 -0.01 -0.26 -0.46 0.23 0.19 0.06 0.38 0.14 0.13 -0.14 0.11 -0.61 0.5 -0.47 0.06 -0.54 -0.4 -0.31 -0.36 0.01 0.46 0.19 0.47 0.51 0.26 0.27 0.18
0.18 0.45 -0.25 0.37 0.73 -0.02 0.46 0.41 0.43 0.68 0.64 -0.57 0.16 0.15 0.19 0.52 0.29 -0.64 -0.38 -0.23 -0.36 0.2 -0.08 0.56 -0.34 -0.63 -0.42 0.07 -0.05 0.34 0.36 -0.46 -0.83 -1.22 -0.78 -0.03 0.52 -0.84 -0.57 -2.26 0.04 -0.33 0.3 -0.5 0.07 -0.4 -0.22 -0.22
-0.06 0.39 0.42 0.59 0.32 -0.66 -0.63 0.06 0.23 0.04 -0.34 0.29 0.01 0.46 0.52 0.66 0.55 -0.71 0.04 0.23 0.61 0.62 0.46 -2.42 -1.01 0.37 0.41 0.77 0.64 0.92 0.75 -0.83 -0.61 0.47 -0.58 -2.86 1.13 -0.23 -1.65 -0.88 -2.18 -1.59 -1.91 -0.29 -0.85 -1.08 -1.23 -1.23
0.59 0.08 -0.17 -0.03 0.86 -0.85 -1.01 -0.64 -0.0 0.68 -0.13 0.5 -0.06 0.39 0.61 0.64 0.6 0.37 0.13 0.2 0.4 0.24 0.11 -1.29 -0.88 0.67 0.5 0.76 0.53 0.39 0.25 -0.57 -1.59 0.89 -0.91 -0.36 0.71 -0.61 -0.36 -2.7 -1.97 -1.56 -0.86 0.38 -1.12 -1.64 -1.09 -1.18
-0.82 -0.38 -0.85 -0.34 0.57 -0.2 0.84 0.48 0.5 0.09 0.32 -0.72 0.32 0.31 0.27 0.75 0.24 0.16 -0.02 -0.43 0.18 -0.07 -0.17 -1.24 0.06 -0.86 -0.03 0.3 0.3 0.34 0.61 -0.49 -1.64 -0.43 -0.12 -0.67 -0.54 -0.85 0.28 -0.46 0.65 -0.12 0.29 -1.85 -0.22 0.13 0.49 -0.03
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2.86 -1.83 -2.15 -2.42 3.15 -0.52 1.08 -0.09 -0.35 -1.63 -1.78 -1.91 -1.09 -1.09 -1.84 -2.17 -1.94 2.82 -2.05 -1.95 -2.16 -0.82 -1.58 -0.94 -1.24 -1.9 -2.25 -1.89 -2.87 -2.02 -2.07 -2.56 -1.34 -1.67 -0.75 -1.8 -1.96 -0.96 -1.84 -0.55 2.33 -0.89 -0.23 -0.37 -0.55 -0.92 -0.94 -0.82
0.26 0.13 0.06 -0.05 0.52 -1.04 -1.2 -0.31 0.15 0.68 0.22 0.6 0.22 0.44 0.38 0.36 0.29 -0.93 0.65 0.77 0.65 -0.08 -0.65 -0.67 -1.86 0.57 0.76 0.61 0.6 0.3 0.26 -1.18 -1.57 0.39 -1.32 -1.77 0.56 -1.28 1.14 -2.35 -1.57 -0.43 -0.59 -0.22 -0.7 -1.16 -1.61 0.33
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1.57 -0.07 -0.64 -0.81 1.61 0.38 0.19 1.04 0.15 -0.51 -1.37 -0.18 0.56 -0.13 -1.3 -1.4 -0.96 0.79 0.14 -0.26 -0.58 -0.37 -1.28 -2.58 1.25 -0.33 -0.35 -0.84 -0.98 -2.09 -1.0 -2.61 -2.55 -0.26 -2.6 -1.44 -2.6 - 0.24 -2.39 -0.19 1.27 1.02 0.68 0.89 0.65 0.69 0.91

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.