Heatmap: Cluster_118 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000037.29 (tig00000037_g10098.t1)
0.54 0.4 0.21 0.15 0.16 0.3 0.44 0.46 0.47 0.47 0.52 0.62 0.59 0.44 0.22 0.42 0.35 0.41 0.34 0.31 0.34 0.21 1.0 0.73 0.48 0.25
Cpa|evm.model.tig00000144.104 (tig00000144_g9097.t1)
0.65 0.59 0.51 0.45 0.45 0.52 0.62 0.66 0.72 0.69 0.74 0.81 0.64 0.5 0.34 0.59 0.45 0.47 0.35 0.46 0.32 0.33 1.0 0.67 0.41 0.31
Cpa|evm.model.tig00000157.115 (tig00000157_g9717.t1)
0.23 0.21 0.17 0.13 0.13 0.11 0.14 0.18 0.2 0.18 0.2 0.16 0.22 0.08 0.13 0.11 0.18 0.19 0.19 0.21 0.36 0.13 1.0 0.33 0.2 0.18
Cpa|evm.model.tig00000157.39 (tig00000157_g9629.t1)
0.3 0.12 0.1 0.15 0.14 0.14 0.2 0.22 0.23 0.27 0.34 0.38 0.23 0.12 0.09 0.11 0.06 0.12 0.07 0.06 0.49 0.33 1.0 0.55 0.25 0.19
Cpa|evm.model.tig00000169.27 (tig00000169_g11899.t1)
0.34 0.29 0.19 0.14 0.14 0.19 0.17 0.23 0.22 0.23 0.27 0.3 0.27 0.05 0.08 0.08 0.15 0.17 0.18 0.19 0.55 0.08 1.0 0.51 0.23 0.1
Cpa|evm.model.tig00000178.56 (tig00000178_g12767.t1)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.29 0.19 0.33 0.32 0.29 0.14 0.02 0.08 0.14 0.05 0.52 0.32 0.23 0.15 0.58 0.04 1.0 0.61 0.17 0.2
Cpa|evm.model.tig00000190.53 (tig00000190_g13871.t1)
0.43 0.53 0.4 0.35 0.31 0.27 0.34 0.35 0.39 0.45 0.47 0.57 0.34 0.27 0.29 0.32 0.42 0.3 0.29 0.38 0.59 0.32 1.0 0.97 0.47 0.32
Cpa|evm.model.tig00000194.57 (tig00000194_g14787.t1)
0.35 0.22 0.21 0.27 0.3 0.24 0.23 0.25 0.32 0.36 0.41 0.43 0.42 0.2 0.11 0.15 0.09 0.15 0.11 0.1 0.61 0.46 1.0 0.75 0.32 0.29
Cpa|evm.model.tig00000241.5 (tig00000241_g20864.t1)
0.37 0.09 0.04 0.03 0.03 0.05 0.13 0.3 0.31 0.41 0.39 0.32 0.32 0.03 0.13 0.04 0.1 0.24 0.21 0.16 0.69 0.03 1.0 0.3 0.04 0.04
Cpa|evm.model.tig00000241.6 (tig00000241_g20864.t1)
0.17 0.06 0.02 0.01 0.01 0.03 0.1 0.15 0.16 0.25 0.2 0.19 0.2 0.04 0.11 0.05 0.1 0.31 0.22 0.14 0.69 0.03 1.0 0.35 0.04 0.04
Cpa|evm.model.tig00000367.22 (tig00000367_g24458.t1)
0.23 0.06 0.01 0.02 0.02 0.06 0.15 0.18 0.24 0.27 0.25 0.31 0.26 0.07 0.06 0.06 0.04 0.08 0.08 0.06 0.2 0.02 1.0 0.47 0.1 0.08
Cpa|evm.model.tig00000382.36 (tig00000382_g24569.t1)
0.1 0.08 0.09 0.11 0.11 0.23 0.22 0.14 0.3 0.38 0.46 0.38 0.11 0.21 0.16 0.14 0.23 0.3 0.35 0.35 0.39 0.2 1.0 0.86 0.26 0.38
Cpa|evm.model.tig00000411.63 (tig00000411_g577.t1)
0.17 0.16 0.16 0.17 0.18 0.18 0.19 0.19 0.28 0.34 0.38 0.46 0.26 0.2 0.26 0.16 0.21 0.26 0.3 0.25 0.27 0.18 1.0 0.6 0.2 0.37
Cpa|evm.model.tig00000471.14 (tig00000471_g1189.t1)
0.23 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.06 0.07 0.1 0.09 0.13 0.02 0.08 0.05 0.02 0.02 0.02 0.06 0.0 0.0 0.22 0.19 1.0 0.13 0.04 0.17
Cpa|evm.model.tig00000478.2 (tig00000478_g1255.t1)
0.48 0.24 0.2 0.24 0.31 0.29 0.32 0.28 0.32 0.27 0.29 0.25 0.43 0.24 0.26 0.2 0.2 0.17 0.2 0.16 0.07 0.12 1.0 0.21 0.26 0.2
Cpa|evm.model.tig00000478.25 (tig00000478_g1273.t1)
0.34 0.45 0.47 0.44 0.31 0.31 0.32 0.37 0.45 0.5 0.57 0.6 0.38 0.21 0.31 0.32 0.31 0.39 0.4 0.4 0.34 0.15 1.0 0.53 0.23 0.26
Cpa|evm.model.tig00000498.59 (tig00000498_g1636.t1)
0.18 0.14 0.13 0.13 0.16 0.23 0.26 0.24 0.31 0.32 0.39 0.4 0.2 0.2 0.16 0.18 0.17 0.29 0.26 0.21 0.4 0.16 1.0 0.59 0.25 0.33
Cpa|evm.model.tig00000507.21 (tig00000507_g1775.t1)
0.07 0.11 0.1 0.1 0.18 0.26 0.26 0.25 0.39 0.44 0.37 0.29 0.07 0.2 0.29 0.26 0.24 0.42 0.49 0.34 0.5 0.12 1.0 0.62 0.36 0.32
Cpa|evm.model.tig00000711.19 (tig00000711_g3379.t1)
0.64 0.35 0.23 0.18 0.14 0.1 0.26 0.38 0.4 0.41 0.46 0.5 0.6 0.24 0.22 0.25 0.24 0.26 0.28 0.22 0.26 0.23 1.0 0.42 0.37 0.32
Cpa|evm.model.tig00000737.16 (tig00000737_g3795.t1)
0.37 0.27 0.22 0.22 0.17 0.14 0.17 0.21 0.25 0.25 0.32 0.37 0.32 0.13 0.06 0.19 0.11 0.17 0.13 0.16 0.88 0.41 1.0 0.6 0.51 0.27
Cpa|evm.model.tig00000737.18 (tig00000737_g3797.t1)
0.47 0.36 0.22 0.14 0.17 0.31 0.38 0.38 0.41 0.46 0.42 0.37 0.46 0.12 0.11 0.15 0.19 0.27 0.18 0.23 0.12 0.04 1.0 0.29 0.3 0.18
Cpa|evm.model.tig00000743.14 (tig00000743_g3866.t1)
0.42 0.12 0.03 0.04 0.08 0.18 0.26 0.27 0.2 0.17 0.15 0.2 0.39 0.12 0.08 0.14 0.1 0.14 0.11 0.11 0.59 0.08 1.0 0.32 0.2 0.11
Cpa|evm.model.tig00000769.22 (tig00000769_g4017.t1)
0.51 0.32 0.19 0.18 0.17 0.18 0.31 0.41 0.22 0.32 0.31 0.21 0.34 0.1 0.06 0.3 0.14 0.21 0.18 0.16 0.01 0.06 1.0 0.16 0.35 0.16
Cpa|evm.model.tig00000849.18 (tig00000849_g4759.t1)
0.35 0.22 0.2 0.23 0.27 0.22 0.33 0.25 0.25 0.29 0.33 0.43 0.42 0.12 0.17 0.15 0.1 0.17 0.22 0.13 0.05 0.1 1.0 0.19 0.38 0.28
Cpa|evm.model.tig00000882.35 (tig00000882_g5278.t1)
0.25 0.07 0.06 0.06 0.04 0.02 0.07 0.09 0.14 0.4 0.43 0.4 0.21 0.13 0.09 0.13 0.07 0.05 0.07 0.08 0.12 0.09 1.0 0.27 0.32 0.22
Cpa|evm.model.tig00001067.19 (tig00001067_g6777.t1)
0.39 0.37 0.29 0.28 0.22 0.2 0.21 0.3 0.32 0.37 0.44 0.51 0.3 0.26 0.15 0.33 0.19 0.29 0.25 0.25 0.59 0.26 1.0 0.56 0.3 0.18
Cpa|evm.model.tig00001130.13 (tig00001130_g7243.t1)
0.26 0.09 0.08 0.14 0.19 0.2 0.22 0.25 0.29 0.34 0.42 0.45 0.29 0.21 0.21 0.27 0.16 0.18 0.16 0.14 0.38 0.14 1.0 0.57 0.24 0.2
Cpa|evm.model.tig00001181.12 (tig00001181_g7428.t1)
0.14 0.09 0.12 0.2 0.23 0.52 0.41 0.32 0.44 0.52 0.49 0.52 0.17 0.25 0.24 0.33 0.28 0.33 0.5 0.43 0.47 0.38 1.0 0.77 0.27 0.46
Cpa|evm.model.tig00001187.6 (tig00001187_g7455.t1)
0.53 0.43 0.33 0.34 0.31 0.28 0.39 0.42 0.4 0.44 0.49 0.58 0.56 0.15 0.17 0.19 0.19 0.26 0.18 0.22 0.53 0.58 1.0 0.56 0.49 0.39
Cpa|evm.model.tig00001408.25 (tig00001408_g8618.t1)
0.6 0.49 0.43 0.35 0.3 0.38 0.45 0.47 0.61 0.58 0.65 0.73 0.7 0.23 0.24 0.24 0.47 0.35 0.33 0.39 0.52 0.19 1.0 0.6 0.39 0.31
Cpa|evm.model.tig00001493.8 (tig00001493_g8983.t1)
0.56 0.21 0.08 0.07 0.12 0.15 0.19 0.2 0.26 0.24 0.32 0.28 0.36 0.18 0.16 0.13 0.15 0.16 0.07 0.09 0.03 0.13 1.0 0.25 0.38 0.21
Cpa|evm.model.tig00001590.4 (tig00001590_g9376.t1)
0.2 0.15 0.12 0.11 0.07 0.06 0.12 0.16 0.16 0.15 0.12 0.14 0.19 0.1 0.15 0.1 0.11 0.23 0.17 0.13 0.48 0.19 1.0 0.24 0.24 0.2
Cpa|evm.model.tig00020537.5 (tig00020537_g10228.t1)
0.41 0.26 0.21 0.23 0.22 0.16 0.23 0.28 0.3 0.32 0.44 0.52 0.4 0.22 0.15 0.2 0.14 0.23 0.23 0.16 0.69 0.26 1.0 0.84 0.41 0.36
Cpa|evm.model.tig00020553.275 (tig00020553_g10759.t1)
0.28 0.17 0.1 0.07 0.05 0.08 0.14 0.18 0.21 0.23 0.3 0.36 0.27 0.08 0.1 0.12 0.11 0.15 0.14 0.11 0.64 0.06 1.0 0.52 0.1 0.07
Cpa|evm.model.tig00020554.165 (tig00020554_g10944.t1)
0.61 0.74 0.57 0.52 0.46 0.51 0.54 0.58 0.64 0.61 0.58 0.54 0.54 0.16 0.2 0.15 0.28 0.41 0.39 0.43 0.77 0.52 1.0 0.71 0.75 0.58
Cpa|evm.model.tig00020554.166 (tig00020554_g10944.t1)
0.38 0.5 0.4 0.36 0.31 0.25 0.37 0.44 0.43 0.44 0.41 0.39 0.35 0.13 0.14 0.12 0.22 0.38 0.24 0.31 0.67 0.49 1.0 0.61 0.62 0.42
Cpa|evm.model.tig00020554.20 (tig00020554_g10806.t1)
0.33 0.13 0.03 0.03 0.12 0.44 0.61 0.54 0.6 0.48 0.35 0.25 0.27 0.08 0.16 0.05 0.25 0.34 0.48 0.29 0.51 0.11 1.0 0.37 0.16 0.11
Cpa|evm.model.tig00020554.21 (tig00020554_g10806.t1)
0.21 0.12 0.03 0.04 0.11 0.23 0.51 0.43 0.41 0.4 0.29 0.2 0.19 0.1 0.13 0.07 0.29 0.54 0.52 0.32 0.61 0.2 1.0 0.74 0.21 0.15
Cpa|evm.model.tig00020610.108 (tig00020610_g12054.t1)
0.41 0.43 0.28 0.17 0.14 0.24 0.31 0.32 0.36 0.43 0.46 0.53 0.38 0.14 0.1 0.08 0.2 0.23 0.2 0.21 0.57 0.28 1.0 0.65 0.44 0.23
Cpa|evm.model.tig00020614.6 (tig00020614_g12119.t1)
0.31 0.23 0.14 0.1 0.08 0.11 0.19 0.24 0.27 0.31 0.38 0.44 0.3 0.1 0.19 0.28 0.18 0.24 0.23 0.18 0.81 0.18 1.0 0.6 0.13 0.09
Cpa|evm.model.tig00020629.60 (tig00020629_g12385.t1)
0.11 0.02 0.02 0.04 0.04 0.05 0.14 0.2 0.23 0.35 0.39 0.34 0.07 0.02 0.03 0.03 0.04 0.13 0.09 0.11 0.05 0.05 1.0 0.26 0.12 0.18
Cpa|evm.model.tig00020704.12 (tig00020704_g13154.t1)
0.19 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.11
Cpa|evm.model.tig00020816.109 (tig00020816_g14195.t1)
0.54 0.28 0.14 0.06 0.02 0.03 0.13 0.24 0.3 0.4 0.51 0.58 0.55 0.12 0.17 0.11 0.2 0.19 0.15 0.16 0.38 0.1 1.0 0.87 0.32 0.28
Cpa|evm.model.tig00020903.13 (tig00020903_g15080.t1)
0.46 0.28 0.22 0.2 0.16 0.18 0.27 0.33 0.32 0.3 0.35 0.42 0.4 0.19 0.12 0.23 0.16 0.18 0.15 0.17 0.68 0.19 1.0 0.48 0.36 0.31
Cpa|evm.model.tig00020943.86 (tig00020943_g16325.t1)
0.24 0.14 0.08 0.07 0.08 0.11 0.15 0.16 0.2 0.27 0.37 0.47 0.29 0.06 0.06 0.1 0.11 0.09 0.07 0.08 0.57 0.11 1.0 0.59 0.14 0.1
Cpa|evm.model.tig00020964.31 (tig00020964_g16806.t1)
0.06 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.02 0.11 0.02 0.27 0.17 0.19 0.11 0.09 0.24 0.02 0.06 0.03 0.0 0.02 0.12 0.03 1.0 0.1 0.45 0.24
Cpa|evm.model.tig00021015.10 (tig00021015_g17150.t1)
0.33 0.24 0.16 0.15 0.11 0.11 0.13 0.18 0.14 0.15 0.16 0.21 0.28 0.08 0.08 0.08 0.1 0.18 0.15 0.14 0.56 0.16 1.0 0.36 0.29 0.27
Cpa|evm.model.tig00021127.145 (tig00021127_g18826.t1)
0.45 0.43 0.26 0.13 0.11 0.13 0.26 0.31 0.39 0.42 0.43 0.45 0.35 0.12 0.16 0.11 0.24 0.26 0.24 0.28 0.35 0.09 1.0 0.48 0.26 0.2
Cpa|evm.model.tig00021127.43 (tig00021127_g18720.t1)
0.31 0.17 0.11 0.08 0.05 0.05 0.1 0.16 0.16 0.16 0.21 0.24 0.28 0.08 0.08 0.08 0.11 0.17 0.16 0.16 0.34 0.12 1.0 0.36 0.22 0.18
Cpa|evm.model.tig00021181.15 (tig00021181_g19318.t1)
0.22 0.25 0.21 0.14 0.06 0.06 0.05 0.05 0.03 0.08 0.07 0.09 0.19 0.16 0.12 0.15 0.08 0.15 0.11 0.07 0.57 0.05 1.0 0.11 0.13 0.12
Cpa|evm.model.tig00021244.17 (tig00021244_g19574.t1)
0.48 0.34 0.22 0.23 0.19 0.16 0.27 0.41 0.43 0.42 0.55 0.65 0.56 0.12 0.13 0.12 0.19 0.25 0.25 0.2 0.5 0.2 1.0 0.62 0.59 0.3
Cpa|evm.model.tig00021257.14 (tig00021257_g19752.t1)
0.32 0.12 0.03 0.03 0.04 0.09 0.2 0.24 0.26 0.26 0.22 0.21 0.22 0.07 0.1 0.06 0.11 0.17 0.17 0.13 0.28 0.01 1.0 0.43 0.24 0.17
Cpa|evm.model.tig00021319.18 (tig00021319_g20212.t1)
0.35 0.11 0.02 0.04 0.01 0.09 0.16 0.22 0.25 0.29 0.38 0.35 0.24 0.02 0.03 0.02 0.1 0.18 0.17 0.1 0.51 0.02 1.0 0.69 0.14 0.07
Cpa|evm.model.tig00021348.4 (tig00021348_g20508.t1)
0.34 0.16 0.09 0.09 0.11 0.12 0.17 0.19 0.27 0.26 0.37 0.38 0.41 0.1 0.13 0.15 0.13 0.11 0.09 0.08 0.38 0.2 1.0 0.61 0.38 0.1
Cpa|evm.model.tig00021433.35 (tig00021433_g21287.t2)
0.26 0.17 0.12 0.11 0.12 0.13 0.14 0.13 0.16 0.21 0.24 0.29 0.22 0.1 0.17 0.15 0.12 0.19 0.21 0.16 0.46 0.15 1.0 0.39 0.13 0.1
Cpa|evm.model.tig00021537.59 (tig00021537_g22310.t1)
0.45 0.35 0.32 0.27 0.2 0.14 0.16 0.2 0.21 0.25 0.35 0.42 0.39 0.12 0.12 0.17 0.18 0.2 0.15 0.14 0.72 0.3 1.0 0.54 0.25 0.21
Cpa|evm.model.tig00021721.4 (tig00021721_g23203.t1)
0.59 0.7 0.54 0.4 0.33 0.33 0.33 0.4 0.41 0.41 0.45 0.58 0.54 0.23 0.27 0.24 0.26 0.34 0.34 0.32 0.74 0.47 1.0 0.73 0.75 0.55
Cpa|evm.model.tig00021745.24 (tig00021745_g23370.t1)
0.23 0.17 0.17 0.27 0.39 0.31 0.2 0.16 0.19 0.23 0.34 0.3 0.27 0.11 0.06 0.15 0.06 0.08 0.09 0.07 0.5 0.45 1.0 0.41 0.37 0.33
Cpa|evm.model.tig00022075.100 (tig00022075_g23662.t1)
0.28 0.5 0.25 0.34 0.17 0.15 0.17 0.25 0.25 0.14 0.45 0.2 0.34 0.28 0.16 0.31 0.23 0.17 0.3 0.29 0.63 0.65 1.0 0.39 0.78 0.55
Cpa|evm.model.tig00022075.90 (tig00000070_g24430.t1)
0.3 0.29 0.25 0.19 0.14 0.15 0.19 0.19 0.19 0.25 0.29 0.31 0.29 0.09 0.17 0.12 0.15 0.17 0.13 0.12 0.86 0.11 1.0 0.31 0.2 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)