Heatmap: Cluster_195 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000057.56 (tig00000057_g78.t2)
1.65 1.17 0.73 1.83 1.9 1.72 2.1 2.14 3.07 2.73 3.8 3.24 1.4 1.22 0.79 1.1 0.79 1.81 1.04 1.07 0.22 2.99 4.8 3.25 5.73 2.91
Cpa|evm.model.tig00000093.94 (tig00000093_g3521.t1)
3.22 2.44 1.13 1.68 1.91 1.78 2.62 3.27 4.07 3.91 4.9 4.41 3.81 1.37 1.02 3.42 1.99 2.3 1.71 1.98 0.71 4.2 5.23 4.8 6.29 4.07
Cpa|evm.model.tig00000114.33 (tig00000114_g6041.t1)
0.02 0.24 0.91 2.2 2.65 1.53 1.99 1.82 2.46 2.11 1.63 0.51 0.11 0.7 0.72 0.96 0.55 0.86 0.66 0.54 0.1 2.14 2.07 0.49 3.22 1.92
Cpa|evm.model.tig00000144.87 (tig00000144_g9084.t1)
2.53 2.62 2.56 2.83 3.39 3.66 4.01 4.01 4.0 3.64 3.23 2.99 2.13 1.36 1.79 1.46 1.87 2.0 2.13 1.99 0.18 1.34 2.59 2.35 2.23 1.82
Cpa|evm.model.tig00000147.51 (tig00000147_g9491.t1)
0.17 0.34 0.41 0.94 1.34 1.47 1.44 1.44 1.62 1.85 1.47 1.52 0.14 0.34 1.01 0.36 0.63 1.38 0.93 0.61 0.0 1.11 3.07 0.88 1.6 1.09
Cpa|evm.model.tig00000157.93 (tig00000157_g9686.t1)
0.47 0.8 1.14 3.03 4.68 6.05 6.3 5.07 5.06 4.91 3.88 3.18 1.01 1.02 0.99 1.94 1.2 2.23 1.87 2.95 0.16 0.7 2.52 5.5 2.41 2.21
Cpa|evm.model.tig00000190.59 (tig00000190_g13876.t1)
15.45 12.54 17.45 24.19 26.85 27.11 27.95 28.57 28.14 30.49 32.26 23.95 17.52 8.36 7.9 8.47 12.52 15.28 13.82 15.94 1.38 9.46 25.16 18.64 29.45 14.34
Cpa|evm.model.tig00000219.74 (tig00000219_g19510.t1)
2.81 7.04 6.07 8.76 12.21 11.83 10.47 8.86 8.47 7.55 7.62 7.1 2.52 4.65 5.0 4.92 4.37 5.68 6.51 5.27 0.73 5.35 6.27 5.8 6.45 5.21
Cpa|evm.model.tig00000219.75 (tig00000219_g19511.t1)
1.62 3.52 3.15 5.37 6.69 5.91 6.1 5.51 4.25 4.48 4.6 3.72 1.11 3.33 3.53 3.77 4.01 4.44 4.47 3.57 0.95 4.67 7.49 6.5 7.17 5.64
Cpa|evm.model.tig00000241.131 (tig00000241_g20998.t1)
0.11 0.28 0.26 1.55 2.27 3.27 2.6 2.44 2.34 1.69 1.56 1.12 0.37 1.57 0.78 1.92 0.93 2.17 1.68 1.04 0.17 1.07 1.61 0.88 1.76 1.23
Cpa|evm.model.tig00000248.38 (tig00000248_g21804.t1)
0.78 0.88 1.03 1.99 2.16 1.27 1.58 1.74 1.43 2.01 1.85 1.56 0.62 0.81 0.1 0.91 0.2 0.33 0.24 0.23 0.04 0.12 2.74 1.19 1.58 1.65
Cpa|evm.model.tig00000254.116 (tig00000254_g22574.t1)
9.83 13.93 20.8 30.41 38.5 38.06 35.52 30.06 29.26 27.51 29.54 26.24 11.6 23.1 14.56 23.93 13.76 6.63 11.22 10.6 7.35 33.81 46.51 29.78 33.43 33.84
Cpa|evm.model.tig00000361.66 (tig00000361_g24418.t1)
2.61 2.47 3.49 8.75 9.17 5.72 10.38 10.57 9.8 7.78 7.25 5.23 1.67 4.23 2.71 5.51 3.19 4.17 4.57 2.81 2.24 7.92 5.86 6.24 9.15 6.61
Cpa|evm.model.tig00000369.1 (tig00000369_g24600.t1)
0.33 0.15 0.43 1.41 1.14 1.07 1.41 1.81 1.6 2.09 1.52 0.49 0.17 0.48 0.28 0.67 0.3 0.49 0.12 0.4 0.11 0.42 2.47 0.46 2.69 0.8
Cpa|evm.model.tig00000383.115 (tig00000383_g24725.t1)
13.47 17.32 23.04 30.55 31.74 34.22 42.61 44.65 40.71 35.19 33.72 30.3 17.01 11.12 10.84 14.77 14.33 20.24 13.46 17.78 1.92 9.51 53.45 20.67 41.54 25.5
Cpa|evm.model.tig00000383.116 (tig00000383_g24725.t1)
23.82 24.57 32.6 37.19 47.97 62.6 60.07 60.06 56.58 50.93 50.15 39.09 24.09 18.6 19.02 22.77 22.7 31.96 28.35 28.3 1.19 29.93 44.07 28.4 53.16 32.0
Cpa|evm.model.tig00000403.16 (tig00000403_g273.t1)
0.04 0.3 0.93 4.0 4.74 5.96 7.94 5.82 5.87 5.37 6.39 3.01 0.05 3.18 3.88 2.59 1.95 1.55 0.72 1.49 0.13 6.2 6.78 3.88 5.81 5.97
Cpa|evm.model.tig00000403.92 (tig00000403_g352.t1)
4.13 4.12 3.23 5.43 6.84 4.47 5.29 5.5 5.03 5.49 5.17 5.63 3.39 1.77 2.35 2.06 2.63 4.34 3.41 2.72 0.14 3.64 7.05 4.06 6.24 3.4
Cpa|evm.model.tig00000430.70 (tig00000430_g659.t1)
0.28 0.33 0.82 1.33 1.82 1.94 2.04 1.73 1.87 1.23 1.49 0.86 0.07 0.6 0.71 0.65 0.98 1.14 1.47 1.04 0.31 1.08 2.76 1.68 1.71 2.12
Cpa|evm.model.tig00000441.9 (tig00000441_g703.t1)
0.79 1.85 2.07 5.04 6.13 4.12 4.9 4.34 6.39 4.87 5.21 3.55 0.59 3.49 2.74 2.58 1.76 3.33 3.05 1.65 0.49 5.14 3.9 3.6 5.52 2.92
Cpa|evm.model.tig00000478.26 (tig00000478_g1274.t1)
0.27 0.87 0.56 1.49 1.81 1.19 1.98 1.91 2.3 2.2 2.68 1.96 0.36 0.69 0.6 0.7 1.11 1.21 1.2 1.11 0.59 0.3 2.01 1.77 1.58 1.49
Cpa|evm.model.tig00000658.31 (tig00000658_g2921.t1)
0.09 0.51 1.86 2.94 2.85 2.54 2.69 2.79 2.55 2.34 2.84 2.64 0.25 0.99 1.24 0.85 0.94 2.02 1.7 1.54 0.45 1.6 2.15 1.42 2.75 1.94
Cpa|evm.model.tig00000754.32 (tig00000754_g3916.t1)
2.08 3.57 3.26 5.17 5.57 3.85 4.67 5.76 5.99 6.06 6.69 5.96 1.52 1.9 2.36 2.69 2.62 1.98 2.52 2.06 0.79 2.92 5.3 3.83 6.96 4.23
Cpa|evm.model.tig00000863.40 (tig00000863_g4993.t1)
1.78 5.05 6.2 8.93 10.51 11.51 9.97 10.62 9.01 8.06 6.31 4.83 1.12 4.54 5.97 5.75 5.19 6.44 6.65 4.94 1.65 6.78 9.11 5.08 8.58 5.58
Cpa|evm.model.tig00000880.21 (tig00000880_g5178.t1)
3.51 6.61 8.68 14.34 15.9 12.62 13.99 15.12 13.94 14.73 15.17 11.96 4.87 5.26 6.04 6.68 6.94 9.95 8.3 9.07 5.01 6.42 17.53 10.9 17.98 12.07
Cpa|evm.model.tig00001038.17 (tig00001038_g6526.t1)
0.1 0.65 0.65 1.85 1.6 0.75 1.23 1.15 1.61 1.78 2.36 2.41 0.03 0.15 0.29 0.25 0.02 0.53 0.28 0.28 0.1 1.0 1.03 0.68 2.75 1.51
Cpa|evm.model.tig00001085.34 (tig00001085_g6971.t1)
1.27 0.31 1.91 3.55 5.0 5.44 7.0 8.27 9.26 8.25 6.69 5.72 1.73 3.14 1.95 4.44 3.03 4.4 4.14 3.88 0.11 2.28 13.12 3.67 7.02 4.84
Cpa|evm.model.tig00001094.20 (tig00001094_g6991.t1)
4.66 2.53 11.71 19.76 20.29 20.0 22.74 24.97 23.39 23.37 22.07 18.01 4.94 11.74 11.56 10.33 9.97 17.25 13.81 15.71 3.66 13.82 26.19 15.73 22.1 17.65
Cpa|evm.model.tig00001154.29 (tig00001154_g7293.t1)
0.64 2.88 5.09 8.23 12.3 11.32 10.32 8.12 12.77 8.78 9.71 6.98 1.16 4.68 3.57 5.17 3.67 6.19 3.3 3.49 0.28 2.39 9.15 6.32 12.11 10.5
Cpa|evm.model.tig00001222.17 (tig00001222_g7613.t1)
1.38 0.53 0.49 2.1 2.17 2.21 2.68 3.86 3.24 2.82 2.4 1.43 0.94 0.2 0.38 0.53 0.49 1.07 0.46 0.7 0.07 2.58 3.48 2.42 4.86 2.22
Cpa|evm.model.tig00001254.10 (tig00001254_g7815.t1)
0.2 0.43 0.78 2.09 2.13 2.26 2.93 2.68 3.12 2.32 2.14 1.43 0.25 0.72 0.35 0.57 0.75 1.45 0.98 0.57 0.33 1.1 2.0 1.25 2.15 1.71
Cpa|evm.model.tig00001264.20 (tig00001264_g7876.t1)
4.01 7.79 10.24 15.94 15.36 12.36 13.55 14.97 13.2 14.78 16.35 16.12 5.76 6.64 4.81 6.35 4.4 6.58 5.52 5.4 4.38 13.1 20.98 10.66 14.63 16.75
Cpa|evm.model.tig00001292.9 (tig00001292_g8043.t1)
0.89 2.03 4.36 7.83 6.35 5.49 5.97 6.5 6.31 6.21 6.67 7.77 1.37 3.25 3.45 3.08 3.9 4.61 4.87 4.7 1.81 2.66 13.39 6.25 12.14 9.18
Cpa|evm.model.tig00001374.15 (tig00001374_g8506.t1)
0.36 1.06 1.73 4.61 4.66 3.86 5.9 5.06 5.23 3.82 2.99 1.44 0.29 0.62 0.38 1.37 1.06 2.91 1.4 1.6 1.12 4.27 6.68 1.54 4.26 3.9
Cpa|evm.model.tig00001384.14 (tig00001384_g8561.t1)
7.92 5.99 5.79 8.94 7.22 5.73 9.51 11.73 8.73 7.56 6.57 5.35 5.48 3.16 3.99 3.62 4.06 6.05 6.25 5.88 0.72 0.67 15.8 5.43 8.59 7.84
Cpa|evm.model.tig00001388.16 (tig00001388_g8586.t1)
16.9 15.85 14.81 28.97 30.54 26.91 38.52 36.09 34.92 29.84 24.79 19.35 23.29 16.3 14.95 19.88 15.0 21.51 17.91 14.31 3.88 18.82 32.03 15.29 29.57 21.82
Cpa|evm.model.tig00020556.40 (tig00020556_g11009.t1)
4.83 5.25 7.05 8.26 10.43 11.89 12.05 11.24 11.45 8.44 8.91 7.76 5.31 5.61 5.16 6.54 6.17 6.37 6.93 6.25 1.76 5.0 8.01 8.82 8.12 5.54
Cpa|evm.model.tig00020562.33 (tig00020562_g11158.t1)
0.59 1.0 0.91 2.19 1.94 1.43 2.22 2.03 2.43 1.95 2.28 1.96 0.71 1.67 0.99 1.37 0.96 1.38 1.13 0.78 0.66 2.59 1.87 1.73 2.38 1.57
Cpa|evm.model.tig00020616.21 (tig00020616_g12257.t1)
2.99 4.75 5.62 8.61 8.02 7.19 9.51 9.43 6.56 8.35 8.12 6.34 4.34 4.15 4.77 4.52 6.73 8.36 6.65 6.36 0.73 5.68 14.03 5.96 10.32 7.39
Cpa|evm.model.tig00020616.22 (tig00020616_g12258.t1)
4.89 5.47 7.23 10.21 9.45 9.07 11.19 10.2 8.07 9.16 8.76 7.27 4.72 5.22 5.0 4.99 7.42 9.47 9.13 7.42 0.71 5.92 12.14 6.79 12.2 8.51
Cpa|evm.model.tig00020629.84 (tig00020629_g12405.t1)
2.22 4.66 6.27 10.88 12.78 10.32 9.94 9.91 8.28 8.43 9.22 6.42 1.8 3.53 3.86 4.44 4.77 7.26 5.97 5.68 0.7 8.04 13.53 6.83 10.86 6.13
Cpa|evm.model.tig00020723.19 (tig00020723_g13438.t1)
2.06 3.09 3.91 5.49 5.88 5.02 5.11 5.08 6.43 6.14 7.12 6.68 1.63 2.38 2.54 2.19 2.11 3.27 2.58 2.24 0.53 4.28 7.7 5.67 8.77 4.87
Cpa|evm.model.tig00020816.37 (tig00020816_g14126.t1)
1.4 2.42 3.05 3.11 3.61 3.65 4.06 3.91 4.52 4.87 4.84 3.39 1.46 1.67 1.55 2.14 1.36 2.44 3.19 2.15 0.11 2.19 3.79 2.07 4.41 2.51
Cpa|evm.model.tig00020816.39 (tig00020816_g14128.t1)
0.91 1.32 1.4 2.94 2.37 2.44 3.29 3.58 3.57 3.31 4.1 3.36 0.62 1.44 0.75 1.44 0.57 1.2 1.4 0.93 0.07 1.24 2.18 2.55 3.66 2.63
Cpa|evm.model.tig00020830.128 (tig00020830_g14515.t1)
1.47 2.16 2.9 4.99 5.68 5.65 6.26 5.92 6.24 7.04 6.34 5.0 2.04 1.59 1.74 2.04 2.46 3.5 2.43 3.41 0.64 2.07 6.36 4.57 5.96 4.56
Cpa|evm.model.tig00020878.22 (tig00020878_g14869.t2)
0.44 0.93 2.86 6.74 9.04 7.1 5.73 5.05 5.7 5.69 4.32 3.76 0.66 3.98 3.33 4.21 3.48 6.57 4.35 3.87 0.67 5.41 6.62 3.65 7.59 6.0
Cpa|evm.model.tig00020903.55 (tig00020903_g15124.t1)
1.52 1.85 2.28 3.84 4.09 3.16 3.42 4.55 3.71 3.94 4.62 3.74 1.93 1.45 2.1 1.78 1.21 2.55 2.02 1.71 0.19 2.12 4.87 2.78 4.17 2.1
Cpa|evm.model.tig00020909.59 (tig00020909_g15376.t1)
0.02 0.11 1.83 4.1 5.05 3.97 4.91 4.72 6.3 4.97 6.78 4.0 0.06 1.62 2.17 1.42 1.58 2.93 2.65 2.24 0.26 0.47 4.92 2.6 4.74 3.66
Cpa|evm.model.tig00020941.32 (tig00020941_g16226.t1)
2.42 2.96 4.12 4.0 5.69 5.47 6.72 7.01 6.25 5.77 5.1 4.42 2.23 1.78 1.86 1.58 2.21 3.92 4.4 3.56 1.04 2.57 11.15 3.19 7.35 3.79
Cpa|evm.model.tig00020951.34 (tig00020951_g16434.t1)
1.73 2.68 2.71 4.14 4.45 3.67 4.14 3.85 3.76 3.64 3.28 3.18 0.99 2.41 1.96 2.01 1.8 2.49 2.51 1.8 0.02 3.07 3.56 2.9 3.68 2.71
Cpa|evm.model.tig00020960.63 (tig00020960_g16589.t1)
0.2 0.59 2.23 6.09 7.24 6.3 6.13 5.73 6.83 5.27 5.52 4.11 0.2 1.97 2.57 2.57 2.74 3.43 2.56 2.24 0.42 3.45 4.46 3.98 7.92 3.75
Cpa|evm.model.tig00020960.68 (tig00020960_g16596.t1)
4.01 3.36 3.66 5.4 7.54 8.95 7.98 7.76 7.08 7.95 7.56 6.17 3.74 2.12 2.47 2.92 3.0 3.27 4.0 3.4 2.44 3.06 5.58 5.74 5.45 5.11
Cpa|evm.model.tig00020996.15 (tig00020996_g16932.t1)
0.72 1.87 2.45 3.98 4.57 4.62 3.68 4.25 2.03 3.11 2.92 2.78 0.77 1.43 1.9 5.29 2.15 2.77 2.2 2.65 0.57 2.37 3.33 4.97 3.67 3.8
Cpa|evm.model.tig00021094.28 (tig00021094_g18113.t1)
4.95 5.07 5.64 9.27 12.82 12.51 17.82 16.68 14.43 13.4 11.42 8.13 5.34 7.53 5.53 7.25 6.23 8.37 7.66 6.9 3.29 13.19 16.5 8.59 13.18 9.62
Cpa|evm.model.tig00021123.4 (tig00021123_g18486.t1)
0.11 0.46 2.1 3.93 3.55 3.41 3.61 3.82 3.08 2.55 3.53 1.59 0.11 0.85 0.89 1.18 1.01 2.91 1.92 1.75 0.9 2.6 2.14 1.78 4.78 2.86
Cpa|evm.model.tig00021135.10 (tig00021135_g18931.t1)
1.39 3.74 3.59 7.29 8.88 8.79 11.27 8.22 7.13 6.1 6.22 4.69 0.94 4.53 4.54 5.32 5.25 7.81 6.71 5.85 0.77 5.59 9.65 7.14 9.65 8.77
Cpa|evm.model.tig00021135.34 (tig00021135_g18953.t2)
2.2 3.73 3.26 6.34 6.44 4.5 7.3 5.92 6.07 4.27 5.08 4.74 2.19 2.69 1.39 2.13 2.34 3.62 2.33 1.52 1.08 6.3 8.85 4.31 6.15 4.82
Cpa|evm.model.tig00021178.13 (tig00021178_g19202.t2)
1.34 0.94 1.46 3.17 3.15 2.2 4.28 4.95 4.97 5.79 4.85 3.32 2.08 2.47 1.47 5.17 1.87 4.21 2.45 1.93 0.49 1.73 4.44 2.24 6.05 2.8
Cpa|evm.model.tig00021238.16 (tig00021238_g19553.t1)
1.42 2.45 2.1 3.85 4.79 4.83 4.63 3.73 3.17 2.68 2.73 2.5 1.29 2.49 2.27 3.17 2.36 3.55 3.37 2.71 0.35 2.65 3.71 1.97 3.19 2.43
Cpa|evm.model.tig00021275.8 (tig00021275_g19871.t1)
1.36 4.27 6.15 8.18 10.87 10.27 13.76 11.28 10.55 10.24 9.14 5.26 1.47 8.0 6.52 6.21 4.4 5.65 5.25 4.35 3.47 8.13 9.37 4.77 10.61 7.95
Cpa|evm.model.tig00021489.13 (tig00021489_g21660.t1)
0.4 1.04 1.07 1.34 2.64 2.81 3.13 2.34 1.79 1.97 1.52 1.14 0.22 1.16 1.06 1.34 0.87 1.17 1.23 1.02 0.45 0.63 1.67 2.61 1.35 1.38

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)