Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.247 (tig00000042_g15650.t1)	0.17	0.24	0.33	0.33	0.39	0.4	0.31	0.24	0.22	0.26	0.21	0.18	0.17	1.0	0.54	0.73	0.34	0.44	0.35	0.68	0.01	0.27	0.02	0.11	0.47	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000057.86 (tig00000057_g105.t1)	0.58	0.68	0.66	0.68	0.67	0.69	0.56	0.55	0.54	0.56	0.64	0.7	0.56	0.64	0.44	0.64	0.36	1.0	0.63	0.36	0.19	0.58	0.36	0.32	0.74	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000073.30 (tig00000073_g1712.t1)	0.26	0.24	0.26	0.45	0.44	0.36	0.32	0.32	0.23	0.3	0.35	0.26	0.22	0.43	0.18	0.31	0.17	0.25	0.19	0.31	0.02	0.59	0.15	0.14	1.0	0.84
Cpa\|evm.model.tig00000076.35 (tig00000076_g2335.t1)	0.14	0.22	0.26	0.37	0.45	0.4	0.32	0.25	0.22	0.32	0.31	0.27	0.15	0.65	0.3	0.45	0.17	0.29	0.24	0.62	0.02	0.45	0.02	0.09	0.81	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000093.149 (tig00000093_g3577.t1)	0.48	0.43	0.37	0.64	0.61	0.54	0.46	0.43	0.44	0.46	0.49	0.44	0.48	0.67	0.35	0.47	0.28	0.26	0.3	0.46	0.01	0.35	0.28	0.29	1.0	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000113.128 (tig00000113_g5709.t1)	0.4	0.51	0.61	0.81	0.94	0.93	0.75	0.69	0.67	0.67	0.55	0.51	0.46	0.83	0.56	0.86	0.44	1.0	0.84	0.61	0.16	0.73	0.21	0.3	0.76	0.87
Cpa\|evm.model.tig00000139.10 (tig00000139_g8305.t1)	0.58	0.55	0.57	0.88	0.99	0.73	0.65	0.58	0.51	0.77	0.84	0.8	0.6	0.95	0.5	0.65	0.4	0.39	0.41	0.63	0.01	0.92	0.13	0.37	1.0	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000189.57 (tig00020828_g14366.t1)	0.26	0.48	0.42	0.53	0.66	0.58	0.42	0.33	0.41	0.61	0.58	0.51	0.29	1.0	0.61	0.84	0.39	0.53	0.57	0.5	0.0	0.47	0.13	0.23	0.47	0.77
Cpa\|evm.model.tig00000194.94 (tig00000194_g14826.t1)	0.34	0.59	0.66	0.73	0.79	0.76	0.7	0.62	0.64	0.73	0.61	0.68	0.39	1.0	0.57	0.76	0.37	0.62	0.5	0.71	0.01	0.62	0.15	0.23	0.6	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000197.15 (tig00000197_g15693.t1)	0.11	0.3	0.49	0.52	0.51	0.42	0.42	0.41	0.29	0.32	0.31	0.27	0.15	0.92	0.58	0.63	0.33	0.75	0.66	0.66	0.02	0.44	0.13	0.13	0.8	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000202.8 (tig00000202_g16616.t1)	0.32	0.33	0.36	0.42	0.5	0.54	0.46	0.36	0.44	0.56	0.63	0.69	0.4	0.77	0.53	1.0	0.31	0.52	0.32	0.52	0.01	0.36	0.1	0.22	0.38	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000204.35 (tig00000204_g17704.t1)	0.38	0.37	0.39	0.61	0.56	0.5	0.48	0.39	0.38	0.41	0.46	0.49	0.36	0.66	0.34	0.56	0.34	0.36	0.41	0.6	0.01	0.48	0.28	0.35	0.86	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000204.37 (tig00000204_g17706.t1)	0.34	0.35	0.43	0.52	0.64	0.65	0.53	0.4	0.4	0.45	0.44	0.53	0.37	0.77	0.32	0.63	0.31	0.43	0.41	0.53	0.13	0.39	0.6	0.27	0.8	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000204.38 (tig00000204_g17706.t1)	0.41	0.49	0.64	0.73	0.88	0.81	0.75	0.54	0.5	0.56	0.62	0.69	0.43	1.0	0.47	0.82	0.38	0.42	0.48	0.74	0.11	0.51	0.37	0.48	0.54	0.91
Cpa\|evm.model.tig00000204.39 (tig00000204_g17707.t1)	0.3	0.4	0.42	0.58	0.69	0.51	0.48	0.43	0.39	0.5	0.51	0.51	0.36	0.82	0.31	0.71	0.29	0.49	0.36	0.56	0.03	0.85	0.12	0.2	0.88	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000204.40 (tig00000204_g17708.t1)	0.51	0.44	0.46	0.48	0.46	0.41	0.43	0.38	0.35	0.42	0.45	0.46	0.46	0.75	0.58	0.69	0.5	0.49	0.53	0.8	0.01	0.61	0.17	0.3	0.83	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000204.41 (tig00000204_g17709.t1)	0.33	0.35	0.46	0.65	0.69	0.66	0.53	0.4	0.41	0.47	0.47	0.44	0.28	0.88	0.48	0.69	0.35	0.48	0.42	0.8	0.04	0.51	0.07	0.24	0.83	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000215.117 (tig00000215_g18658.t1)	0.03	0.01	0.12	0.55	0.32	0.16	0.14	0.13	0.07	0.1	0.05	0.08	0.02	0.26	0.0	0.16	0.0	0.05	0.1	0.07	0.0	0.82	0.03	0.06	0.9	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000248.2 (tig00000248_g21771.t1)	0.3	0.53	0.65	0.8	0.85	0.69	0.66	0.55	0.46	0.62	0.66	0.54	0.34	1.0	0.47	0.87	0.61	0.56	0.49	0.72	0.01	0.62	0.29	0.28	0.79	0.85
Cpa\|evm.model.tig00000248.23 (tig00000248_g21789.t1)	0.45	0.62	0.61	0.85	0.96	0.57	0.77	0.63	0.41	0.69	0.88	0.79	0.49	1.0	0.38	0.71	0.38	0.34	0.31	0.65	0.01	0.57	0.1	0.26	0.93	0.9
Cpa\|evm.model.tig00000248.24 (tig00000248_g21789.t1)	0.33	0.42	0.49	0.55	0.67	0.66	0.49	0.37	0.31	0.49	0.47	0.45	0.32	1.0	0.47	0.65	0.4	0.24	0.38	0.81	0.0	0.29	0.03	0.09	0.35	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000403.71 (tig00000403_g330.t1)	0.42	0.33	0.33	0.58	0.54	0.32	0.35	0.35	0.25	0.36	0.41	0.38	0.36	0.42	0.2	0.29	0.2	0.2	0.22	0.27	0.01	0.74	0.1	0.14	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000441.13 (tig00000441_g706.t1)	0.34	0.44	0.56	0.68	0.77	0.69	0.58	0.47	0.45	0.48	0.49	0.44	0.38	1.0	0.61	0.86	0.43	0.5	0.41	0.78	0.01	0.5	0.05	0.14	0.62	0.9
Cpa\|evm.model.tig00000498.36 (tig00000498_g1612.t1)	0.07	0.17	0.33	0.4	0.37	0.28	0.24	0.23	0.27	0.33	0.35	0.31	0.09	0.59	0.28	0.35	0.15	0.18	0.29	0.37	0.05	0.37	0.01	0.18	0.7	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000523.44 (tig00000523_g1866.t1)	0.28	0.29	0.31	0.38	0.47	0.4	0.39	0.28	0.25	0.33	0.3	0.32	0.28	1.0	0.46	0.71	0.37	0.36	0.35	0.69	0.0	0.85	0.05	0.12	0.6	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000553.2 (tig00000553_g2074.t1)	0.19	0.34	0.46	0.5	0.56	0.62	0.42	0.27	0.47	0.62	0.56	0.48	0.15	1.0	0.61	0.9	0.44	0.36	0.35	0.65	0.01	0.35	0.07	0.23	0.76	0.9
Cpa\|evm.model.tig00000711.61 (tig00000711_g3427.t1)	0.19	0.26	0.38	0.6	0.45	0.62	0.38	0.25	0.44	0.32	0.5	0.54	0.26	0.58	0.19	0.31	0.05	0.18	0.23	0.26	0.04	0.6	0.19	0.56	0.69	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000741.20 (tig00000741_g3836.t1)	0.6	0.53	0.62	0.74	0.78	0.68	0.56	0.57	0.51	0.61	0.6	0.63	0.53	0.83	0.54	0.67	0.43	0.51	0.37	0.55	0.02	0.54	0.22	0.45	0.88	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000802.32 (tig00000802_g4281.t1)	0.48	0.54	0.65	0.77	0.92	0.72	0.7	0.55	0.56	0.67	0.81	0.75	0.49	0.92	0.37	0.57	0.34	0.4	0.35	0.71	0.12	0.77	0.01	0.18	0.74	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000823.26 (tig00000823_g4552.t1)	0.39	0.5	0.47	0.65	0.78	0.63	0.5	0.38	0.32	0.42	0.48	0.46	0.34	0.52	0.21	0.39	0.21	0.43	0.37	0.47	0.01	0.44	0.0	0.11	0.77	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000842.62 (tig00000842_g4883.t1)	0.72	0.62	0.81	0.97	0.98	0.77	0.63	0.65	0.53	0.63	0.76	0.83	0.77	0.67	0.27	0.48	0.27	0.3	0.21	0.54	0.06	0.41	0.42	0.34	0.92	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000857.4	0.32	0.43	0.63	0.68	0.65	0.66	0.68	0.61	0.65	0.57	0.49	0.53	0.38	0.87	0.71	0.75	0.56	0.95	1.0	0.78	0.04	0.35	0.18	0.28	0.4	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000865.67 (tig00000865_g5116.t1)	0.92	0.72	0.53	0.57	0.56	0.52	0.55	0.64	0.51	0.58	0.61	0.62	1.0	0.72	0.53	0.66	0.47	0.47	0.47	0.63	0.2	0.5	0.49	0.41	0.75	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000989.17 (tig00000989_g6089.t1)	0.32	0.33	0.33	0.59	0.62	0.56	0.42	0.39	0.45	0.51	0.55	0.47	0.3	0.45	0.31	0.41	0.25	0.3	0.32	0.42	0.0	0.83	0.13	0.2	1.0	0.77
Cpa\|evm.model.tig00001265.6 (tig00001265_g7892.t1)	0.47	0.45	0.55	0.85	0.95	0.73	0.66	0.59	0.57	0.73	0.81	0.74	0.57	0.92	0.33	0.7	0.29	0.35	0.26	0.5	0.02	0.71	0.06	0.19	1.0	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020537.58 (tig00020537_g10283.t1)	0.29	0.29	0.39	0.5	0.62	0.56	0.38	0.29	0.26	0.36	0.39	0.4	0.29	1.0	0.35	0.68	0.27	0.28	0.31	0.51	0.0	0.68	0.04	0.08	0.65	0.79
Cpa\|evm.model.tig00020553.89 (tig00020553_g10576.t1)	0.4	0.43	0.47	0.68	0.72	0.61	0.51	0.44	0.42	0.48	0.51	0.45	0.42	0.62	0.38	0.47	0.36	0.21	0.3	0.57	0.01	0.57	0.07	0.16	0.81	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020629.146 (tig00020629_g12475.t1)	0.35	0.47	0.52	0.66	0.86	0.82	0.83	0.67	0.36	0.42	0.38	0.25	0.28	0.66	0.33	0.73	0.55	0.64	0.52	0.94	0.01	0.37	0.11	0.11	0.8	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020710.112 (tig00020710_g13375.t1)	0.31	0.32	0.29	0.54	0.57	0.44	0.51	0.41	0.48	0.49	0.63	0.59	0.27	0.51	0.33	0.72	0.32	0.27	0.24	0.41	0.0	0.67	0.12	0.13	1.0	0.81
Cpa\|evm.model.tig00020723.1 (tig00020723_g13420.t1)	0.33	0.34	0.39	0.4	0.42	0.28	0.37	0.31	0.25	0.39	0.37	0.38	0.33	1.0	0.6	0.79	0.45	0.47	0.38	0.89	0.02	0.37	0.1	0.11	0.4	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020723.2 (tig00020723_g13421.t1)	0.23	0.28	0.31	0.36	0.4	0.35	0.31	0.21	0.24	0.28	0.29	0.29	0.22	1.0	0.61	0.85	0.49	0.47	0.43	0.67	0.03	0.5	0.14	0.2	0.68	0.69
Cpa\|evm.model.tig00020892.8 (tig00020892_g14909.t1)	0.88	0.83	0.83	0.99	0.91	0.58	0.56	0.6	0.49	0.7	0.76	0.74	0.83	0.81	0.42	0.6	0.39	0.43	0.34	0.64	0.18	0.77	0.3	0.4	0.9	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020961.42 (tig00020961_g16664.t1)	0.17	0.09	0.12	0.26	0.34	0.33	0.26	0.16	0.18	0.28	0.29	0.24	0.14	0.87	0.09	0.9	0.04	0.05	0.05	0.31	0.0	0.23	0.01	0.11	0.66	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021035.1 (tig00021035_g17231.t1)	0.08	0.12	0.14	0.36	0.34	0.33	0.31	0.2	0.26	0.24	0.24	0.2	0.12	0.37	0.17	0.33	0.08	0.18	0.12	0.27	0.0	0.34	0.02	0.16	1.0	0.75
Cpa\|evm.model.tig00021036.5 (tig00021036_g17273.t1)	0.2	0.3	0.36	0.51	0.47	0.49	0.47	0.4	0.37	0.34	0.3	0.25	0.21	0.42	0.2	0.38	0.19	0.4	0.21	0.27	0.01	0.8	0.26	0.17	1.0	0.7
Cpa\|evm.model.tig00021038.33 (tig00021038_g17525.t1)	0.17	0.31	0.44	0.54	0.6	0.47	0.47	0.37	0.38	0.55	0.57	0.55	0.23	1.0	0.53	0.81	0.36	0.55	0.48	0.75	0.01	0.32	0.04	0.16	0.33	0.73
Cpa\|evm.model.tig00021038.34 (tig00021038_g17526.t1)	0.36	0.42	0.52	0.61	0.72	0.61	0.53	0.42	0.3	0.57	0.61	0.66	0.36	0.77	0.29	0.48	0.42	0.4	0.48	0.9	0.0	0.29	0.11	0.14	0.69	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021038.35 (tig00021038_g17527.t2)	0.41	0.58	0.73	0.73	0.99	0.78	0.62	0.61	0.62	0.96	0.87	0.98	0.44	0.81	0.4	0.58	0.52	0.67	0.78	1.0	0.02	0.61	0.51	0.34	0.69	0.95
Cpa\|evm.model.tig00021179.79 (tig00021179_g19295.t1)	0.55	0.52	0.67	0.76	0.59	0.52	0.54	0.56	0.54	0.62	0.73	0.69	0.54	0.33	0.17	0.11	0.24	0.2	0.14	0.2	0.09	0.23	0.25	0.56	0.59	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021181.8 (tig00021181_g19312.t1)	0.43	0.35	0.52	0.55	0.53	0.47	0.38	0.36	0.29	0.3	0.31	0.33	0.34	0.68	0.35	0.51	0.25	0.34	0.27	0.43	0.03	0.66	0.12	0.22	0.77	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021234.16 (tig00021234_g19390.t1)	0.23	0.26	0.35	0.44	0.47	0.44	0.44	0.38	0.3	0.42	0.4	0.37	0.23	0.82	0.36	0.7	0.32	0.31	0.25	0.46	0.01	0.48	0.01	0.12	0.67	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021257.12 (tig00021257_g19750.t1)	0.27	0.21	0.25	0.22	0.17	0.14	0.15	0.17	0.19	0.28	0.34	0.37	0.31	0.61	0.2	0.33	0.06	0.06	0.08	0.32	0.0	0.23	0.0	0.05	0.52	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021319.39 (tig00021319_g20233.t1)	0.39	0.46	0.58	0.63	0.77	0.68	0.66	0.49	0.53	0.62	0.58	0.57	0.43	0.99	0.65	1.0	0.52	0.89	0.82	0.74	0.16	0.54	0.23	0.32	0.48	0.87
Cpa\|evm.model.tig00021319.40 (tig00021319_g20234.t1)	0.32	0.44	0.54	0.64	0.7	0.62	0.52	0.43	0.4	0.56	0.61	0.55	0.38	1.0	0.36	0.55	0.29	0.4	0.37	0.55	0.04	0.41	0.06	0.11	0.55	0.81
Cpa\|evm.model.tig00021319.43 (tig00021319_g20237.t1)	0.17	0.33	0.38	0.5	0.56	0.49	0.39	0.35	0.35	0.44	0.43	0.44	0.16	0.67	0.34	0.82	0.32	0.56	0.48	0.56	0.06	1.0	0.22	0.24	0.61	0.92
Cpa\|evm.model.tig00021374.47 (tig00021374_g21130.t1)	0.61	0.6	0.65	0.84	0.99	0.81	0.63	0.58	0.46	0.65	0.71	0.62	0.67	0.95	0.61	0.96	0.48	0.38	0.38	0.76	0.15	1.0	0.08	0.25	0.98	0.87
Cpa\|evm.model.tig00021537.11 (tig00021537_g22267.t1)	0.35	0.43	0.49	0.57	0.61	0.5	0.52	0.4	0.36	0.45	0.38	0.39	0.34	1.0	0.61	0.84	0.53	0.62	0.53	0.91	0.01	0.33	0.1	0.24	0.61	0.98
Cpa\|evm.model.tig00021537.51 (tig00021537_g22302.t1)	0.43	0.37	0.37	0.51	0.54	0.67	0.54	0.43	0.48	0.5	0.49	0.54	0.49	0.71	0.41	0.47	0.43	0.33	0.42	0.51	0.01	0.68	0.16	0.29	0.88	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021537.52 (tig00021537_g22303.t1)	0.28	0.27	0.29	0.28	0.36	0.35	0.45	0.3	0.29	0.34	0.28	0.28	0.24	1.0	0.6	0.68	0.61	0.37	0.51	0.77	0.01	0.26	0.1	0.21	0.39	0.77
Cpa\|evm.model.tig00021537.57 (tig00021537_g22308.t1)	0.29	0.34	0.43	0.38	0.33	0.2	0.26	0.25	0.21	0.34	0.28	0.27	0.26	0.82	0.52	0.55	0.33	0.43	0.35	0.77	0.01	0.3	0.04	0.1	0.54	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021590.5 (tig00021590_g22762.t1)	0.09	0.38	0.57	0.57	0.76	0.84	0.59	0.47	0.49	0.53	0.43	0.39	0.1	0.84	0.63	0.92	0.49	1.0	0.95	0.85	0.01	0.1	0.09	0.17	0.35	0.92
Cpa\|evm.model.tig00021742.11 (tig00021742_g23325.t1)	0.26	0.09	0.11	0.12	0.1	0.06	0.11	0.09	0.08	0.14	0.2	0.21	0.23	0.58	0.13	0.18	0.07	0.08	0.14	0.85	0.01	0.19	0.0	0.12	0.47	1.0
Cpa\|evm.model.tig00022080.8 (tig00022080_g23792.t1)	0.33	0.29	0.49	0.74	0.83	0.73	0.7	0.57	0.77	0.77	0.75	0.72	0.38	0.97	0.2	0.68	0.21	0.08	0.12	0.47	0.02	0.38	0.12	0.08	0.79	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)