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Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Glc+ (10 mM),0.5h
Glc+ (10 mM),1h
Glc+ (10 mM),3h
Glc+ (10 mM),6h
Glc+ (10 mM),12h
Glc+ (20 mM),0h
Glc+ (20 mM),0.5h
Glc+ (20 mM),1h
Glc+ (20 mM),3h
Glc+ (20 mM),6h
Glc+ (20 mM),12h
Glc-,0h
Glc-,0.5h
Glc-,1h
Glc-,3h
Glc-,6h
Glc-,12h
Heterotrophy,Mixotrophy
High light,0.5h
High light,1h
High light,3h
High light,6h
High light,12h
High light,Proteose
Low light,Proteose
Med light,0h
Med light,0.5h
Med light,1h
Med light,3h
Med light,6h
Med light,12h
Med light,Proteose
Med light,Proteose,-Fe
Med light,Proteose,-N
Med light,Proteose,-P
Med light,Proteose,-S
Med light,Proteose,Glc+
Med light,Proteose,H2O2
Med light,Proteose,Rose Bengal
Single cell
No light,Proteose
Whole cell,Autotrophy,ND+cerulenin,6h
Whole cell,Autotrophy,ND+cerulenin,12h
Whole cell,Autotrophy,ND,0h
Whole cell,Autotrophy,ND,3h
Whole cell,Autotrophy,ND,6h
Whole cell,Autotrophy,ND,12h
Whole cell,Autotrophy,ND,24h
-0.46 -0.47 -0.34 0.16 -0.21 -0.22 0.09 0.53 0.36 0.07 -0.1 -0.28 -0.09 0.23 0.45 0.54 0.46 -0.13 -0.54 0.01 0.05 0.75 0.44 0.33 -0.46 -0.1 -0.43 0.46 0.35 0.28 0.53 -0.01 -0.52 0.38 -0.45 0.63 -0.33 -0.44 0.12 -0.25 -0.37 -0.76 -0.58 -0.36 -0.26 -0.73 -0.34 -0.72
-0.75 -0.9 -1.0 -0.43 0.01 0.35 0.2 0.43 0.45 0.49 0.34 -0.69 -0.35 0.27 0.58 0.61 0.17 -0.35 -0.96 -1.04 -0.05 0.6 0.85 0.86 -0.15 -0.72 -0.51 0.15 0.25 0.81 0.33 0.43 0.53 -0.36 0.13 1.42 -0.23 0.32 -0.19 -1.19 -1.03 -2.44 -0.28 -0.61 -1.51 -1.4 -1.27 -0.75
-0.51 -0.63 -1.09 -0.99 0.15 1.75 0.6 0.52 0.67 1.5 1.61 -1.44 -0.35 0.19 0.9 1.09 0.47 0.69 -2.05 -1.17 -0.04 0.42 1.29 1.17 0.7 -1.55 -1.81 -0.76 -0.23 0.78 0.45 -0.35 -1.03 -2.37 -1.21 -0.69 -3.07 -1.65 -1.11 - -1.33 -3.1 -0.75 -2.19 -0.73 -1.38 -0.28 -1.12
-0.07 -0.25 -1.68 -1.65 -0.07 1.49 0.45 0.2 0.58 0.37 0.9 -1.01 -0.07 0.17 0.61 0.56 0.08 0.1 -1.28 -0.74 -0.13 0.33 0.94 0.53 0.84 -0.98 -1.03 -0.11 -0.33 0.28 0.3 0.38 0.24 -1.17 -0.47 0.73 -1.46 -0.65 0.21 -1.89 -0.33 -1.98 0.57 -1.79 -0.14 -0.87 -0.18 -0.81
-0.14 -0.52 -0.79 -0.0 0.17 -0.38 -0.26 -0.31 0.07 0.71 0.93 -0.63 -0.38 0.06 0.92 1.25 0.51 0.23 -0.83 -0.36 0.41 0.33 0.13 0.75 0.63 -0.66 -0.38 0.34 0.52 0.72 0.19 -0.38 -1.07 -0.36 -1.03 -1.49 -0.74 -0.67 -1.02 -1.48 -2.28 -0.37 -0.04 -0.12 -0.03 0.33 0.65 -0.73
0.01 -0.46 -1.15 -0.76 -0.2 -1.11 -1.13 -1.03 -0.39 -0.27 -0.13 -0.15 -0.43 0.21 0.68 0.72 0.41 0.27 -0.26 0.13 0.48 0.22 0.44 0.16 0.68 -0.22 -0.03 0.71 0.71 0.75 0.66 0.22 0.02 -0.09 -0.07 -0.42 -0.99 -0.09 -0.24 -1.37 -0.57 -0.5 -0.45 -0.58 0.26 0.34 0.49 -0.39
-0.96 -0.1 -0.13 0.77 0.11 0.55 0.2 0.35 0.66 1.19 1.64 -0.99 -0.31 0.59 1.55 1.57 0.62 -2.94 -0.96 -0.57 0.7 1.61 0.9 -2.52 - -1.11 -1.2 1.1 1.54 2.01 0.71 -3.07 -2.75 -0.66 -2.34 -2.94 -3.55 -3.13 -3.33 -3.72 -2.29 - -3.1 -5.9 -5.54 -5.52 -4.87 -3.97
-0.21 -0.39 -1.21 -0.59 -0.55 1.02 1.0 0.22 0.92 1.35 1.36 -0.35 0.13 0.65 0.99 0.73 0.27 -0.02 -0.26 -0.02 0.32 0.42 0.49 0.04 -0.11 -0.25 -0.02 0.52 0.36 0.58 -0.02 -1.32 -1.33 0.08 -1.49 -2.59 -2.49 -0.67 -2.17 -2.92 0.68 -1.89 -1.65 -1.75 -0.79 -0.69 -0.29 -1.82
-0.5 -1.1 -1.18 -1.34 0.33 1.7 0.89 -0.05 0.65 1.08 1.09 -1.14 -0.63 -0.24 0.3 -0.23 -0.49 0.37 -1.78 -1.38 -0.89 -0.14 0.65 1.59 0.45 -1.49 -1.15 -1.1 -0.83 -1.22 -0.49 0.03 -0.0 -0.58 -0.15 2.2 -2.46 -0.58 -0.01 -2.63 -0.63 -2.9 1.23 -2.4 -0.34 -1.29 -0.57 -1.31
-0.02 -0.03 0.11 0.4 0.43 -0.72 -0.34 -0.58 -0.4 0.6 -0.16 -0.27 -0.33 -0.09 0.51 0.4 0.11 0.33 -0.67 -0.36 -0.07 0.0 -0.23 1.03 0.8 -0.24 -0.34 0.39 0.48 0.37 0.06 -0.58 -0.79 -0.11 -0.99 -1.79 -0.89 -0.63 -0.67 -0.72 -0.97 -0.09 -0.23 0.45 0.52 0.69 0.89 -0.35
-0.0 -0.04 -0.02 0.32 0.22 -0.55 -0.08 -0.51 -0.15 0.54 0.19 -0.36 -0.07 -0.09 0.42 0.66 0.31 0.56 -0.45 -0.32 -0.03 -0.09 -0.34 1.0 0.81 -0.36 -0.17 0.35 0.29 0.36 0.17 -0.62 -0.63 -0.57 -0.76 -1.38 -1.06 -0.82 -0.68 -0.38 -1.24 -0.09 -0.36 0.29 0.24 0.57 0.73 -0.24
-0.49 -1.21 0.19 0.54 -0.16 -0.25 -2.15 0.03 0.47 0.66 1.2 -0.74 -0.75 0.06 0.9 1.22 0.75 -0.69 -1.76 -0.73 0.41 0.47 0.58 0.29 -0.03 -0.48 -1.17 0.45 0.78 1.26 -0.08 -0.28 -0.27 0.82 -0.96 -0.8 -0.35 -0.38 -1.26 -2.75 -0.51 -0.91 -0.52 -0.16 -1.14 -0.22 0.0 -0.76
-0.26 -0.25 -1.04 -0.72 -0.06 0.94 0.38 0.29 0.64 0.67 1.0 -1.17 -0.32 0.04 0.26 0.23 -0.16 0.82 -0.81 -1.34 -0.35 -0.39 0.29 1.48 0.85 -1.0 -1.09 -0.42 -0.33 -0.33 0.25 0.14 -0.66 -2.52 -0.6 -0.07 -0.23 0.36 0.03 -1.76 -1.0 -0.43 -0.29 -0.32 0.26 0.28 0.45 -0.12
-0.11 -0.59 -0.89 0.08 0.42 -0.07 -0.28 -0.08 0.34 0.65 0.32 -0.63 -0.47 -0.1 0.65 0.65 0.24 0.23 -1.03 -0.3 0.09 0.51 0.43 0.58 0.55 -0.52 -0.54 0.36 0.28 0.62 0.36 -0.5 -0.09 0.1 -0.62 -0.53 -0.84 -0.36 -1.1 -0.48 -1.77 -0.49 0.13 -0.1 0.26 0.27 0.49 -0.62
0.48 -0.26 -0.52 -0.28 0.19 0.82 -0.37 -0.41 0.56 1.32 0.79 -0.29 -0.77 0.04 1.03 0.29 -0.36 0.85 -0.57 -0.81 0.43 -0.0 0.56 0.24 -0.07 -0.41 -0.69 0.13 0.92 -0.09 -0.78 -0.34 -1.33 0.32 -1.31 -1.34 - -1.96 -1.45 0.31 -1.86 -0.21 0.29 -0.32 -0.1 0.53 0.41 -0.35
-0.15 -0.43 -0.2 0.25 -0.08 0.3 0.41 0.62 0.1 0.42 0.23 -0.1 0.02 0.1 0.38 0.06 0.0 -0.51 -0.46 -0.11 -0.06 0.45 -0.01 0.15 -0.07 0.09 -0.82 0.11 0.16 0.2 -0.16 -0.1 -0.09 0.4 -0.62 0.19 -0.02 -0.28 -1.14 -0.49 -0.82 -0.13 0.41 0.26 0.01 -0.06 -0.03 -0.31
-0.32 -0.95 -1.05 -0.31 0.35 0.89 0.59 0.34 0.44 0.78 1.04 -2.39 -0.54 -0.21 0.27 0.17 -0.1 0.25 -2.09 -2.0 -0.45 0.52 1.07 1.01 0.54 -2.01 -2.22 -0.18 -0.69 0.15 0.4 0.21 0.32 -2.6 -0.65 -0.09 -0.72 -0.18 -0.67 -0.05 -0.92 -0.33 0.5 -0.53 0.54 0.22 0.48 -0.24
0.02 -0.8 -1.58 -1.35 -0.06 0.73 -0.36 -0.59 0.36 0.94 0.92 -0.55 -0.71 -0.44 0.32 0.45 0.04 1.2 -0.89 -0.62 -0.46 0.53 0.33 1.03 0.73 -0.85 -0.8 -0.66 -0.92 0.43 0.44 0.61 -0.64 -1.48 -1.08 -1.02 -1.96 -1.06 1.04 -1.47 1.54 -0.48 -0.17 -1.32 -0.12 -0.11 -0.0 -0.29
0.06 -0.52 -0.8 -0.57 -0.38 0.84 -0.66 -0.3 0.23 1.58 1.67 -0.94 -0.76 0.08 0.66 0.65 0.02 0.66 -1.25 -0.58 -0.25 -0.04 0.41 0.78 0.63 -0.83 -1.09 -0.37 -0.18 -0.23 -0.29 -0.59 0.41 -0.72 -0.34 -0.17 -1.33 -0.87 -1.15 0.31 -0.62 -0.76 -0.01 -0.44 0.12 0.11 0.3 -0.71
0.36 0.03 -1.18 -1.06 0.0 1.28 0.05 -0.03 0.25 0.48 0.71 -0.55 -0.22 -0.06 0.35 0.44 0.29 0.35 -0.43 -0.3 -0.25 0.25 0.88 0.14 0.66 -0.59 -0.41 -0.16 -0.13 0.3 0.45 -0.34 -0.59 -0.75 -0.74 -1.44 -0.8 -0.95 -1.04 -0.74 -1.02 0.08 0.41 -0.94 0.35 0.33 0.52 0.0
0.32 0.19 -0.9 -1.11 -0.15 0.7 -0.31 -0.23 0.33 0.79 0.49 -0.04 -0.12 0.45 0.49 0.05 0.0 0.22 -0.1 0.27 0.05 -0.02 0.24 0.91 -0.0 -0.1 0.25 0.35 0.12 -0.15 -0.06 0.15 -0.02 0.16 -0.04 -0.29 -1.62 -0.11 -0.89 -1.07 -0.98 -0.49 0.34 -0.31 -0.19 -0.37 -0.15 -1.0
0.06 0.17 -0.82 0.12 0.51 0.21 0.31 0.29 0.15 -0.21 0.1 -0.27 0.07 0.03 0.37 0.57 0.18 0.17 -0.66 -0.34 0.01 0.26 0.63 0.88 -0.11 -0.37 -0.27 0.42 0.41 0.45 0.3 -0.07 -0.03 -0.0 -0.3 0.31 -0.71 -0.17 -0.48 -0.46 -0.47 -0.93 -0.25 -0.8 -0.41 -0.82 -0.29 -0.66
-0.61 -1.42 -2.49 -1.25 0.2 0.8 0.12 -0.51 0.08 1.23 1.38 -2.4 -0.86 -0.71 0.37 0.28 0.24 1.19 -1.93 -1.42 -0.73 -0.3 0.19 2.33 0.42 -2.47 -1.73 -0.47 -1.53 -0.31 0.82 1.22 -0.89 -3.64 -0.24 0.39 -3.93 -0.61 1.04 -0.78 -0.03 -2.74 0.46 -2.74 -0.02 -0.59 0.3 -0.55
0.17 -0.17 -1.03 -0.9 -0.12 0.12 -0.74 -0.13 0.41 0.82 -0.02 0.22 -0.51 0.03 0.31 -0.06 -0.03 0.08 -0.6 0.07 -0.33 -0.65 -0.47 1.08 0.01 0.18 -0.26 0.08 -0.28 -0.35 -0.26 0.38 -0.03 -0.17 -0.23 -0.3 -1.4 -0.07 -0.5 0.34 -0.41 0.21 0.62 0.29 0.36 0.54 0.38 -0.09
-0.05 -0.33 -0.8 -1.12 -0.03 0.35 0.81 0.49 0.68 0.17 0.24 -0.38 0.17 0.35 0.66 0.51 0.23 0.36 -0.09 0.45 0.24 0.5 0.99 1.76 -0.09 -0.44 -0.09 0.68 0.23 -0.04 0.26 -0.17 -2.55 -0.36 -2.01 1.09 -1.71 -2.36 -0.8 -0.88 -0.36 -2.04 -0.24 -1.74 -1.33 -2.33 -0.94 -1.75
-0.4 -0.27 -0.55 -0.6 -0.19 0.28 -0.05 0.47 0.29 0.74 0.46 -0.19 -0.17 0.07 0.14 -0.02 -0.05 -0.5 -0.38 -0.17 -0.3 0.05 0.03 0.03 -0.2 -0.28 -0.22 -0.06 -0.23 -0.18 0.25 0.33 0.59 -0.38 0.46 -0.97 0.92 0.58 0.11 -0.02 -0.55 -0.28 -0.19 0.13 -0.23 -0.1 -0.23 -0.3
-0.76 -0.42 -0.1 0.18 0.16 0.38 0.11 0.54 0.53 0.85 0.37 -0.06 -0.14 0.22 0.16 0.06 -0.05 -1.22 -0.64 -0.06 0.2 0.28 0.11 -0.39 0.46 0.07 -0.29 0.11 0.11 0.21 -0.24 -0.03 -0.11 0.26 -0.1 -0.55 -0.35 0.05 -1.1 -1.37 -0.17 -0.25 -0.09 0.03 0.32 0.19 0.12 -0.38
-0.25 0.17 0.33 0.86 0.34 -0.06 -0.57 -0.04 0.33 0.68 0.72 -0.68 -0.46 0.18 0.77 0.69 0.18 -0.98 -0.7 -0.32 0.23 0.26 0.01 -0.82 0.18 -0.6 -0.59 0.45 0.55 1.03 0.4 -1.65 -1.32 -0.85 -1.7 -3.8 0.18 -1.32 -0.19 -1.79 0.35 0.16 -0.15 -0.54 0.19 0.55 0.64 -0.58
-0.33 -0.45 -0.89 -0.6 -0.21 0.56 0.1 0.57 0.93 1.06 0.89 -0.54 -0.33 0.26 0.56 0.47 0.24 -0.16 -0.91 -0.39 -0.33 0.28 0.43 0.52 -0.04 -0.72 -0.51 -0.07 -0.1 0.45 0.77 0.38 0.43 -0.93 0.07 -1.18 0.86 0.23 0.01 -1.61 -0.74 -1.51 -0.49 -0.72 -0.92 -0.88 -0.52 -0.85
-0.18 -0.06 -0.24 0.28 0.36 -0.23 -0.22 0.06 -0.04 0.35 -0.28 -0.02 -0.3 0.05 0.28 0.35 0.23 -0.71 -0.26 0.06 0.24 0.31 0.32 -0.26 -0.05 0.01 -0.15 0.39 0.29 0.67 0.42 0.11 0.05 0.02 0.04 -0.95 0.29 0.13 -0.73 -1.06 0.14 -0.39 -0.24 -0.33 -0.04 -0.08 0.06 -0.67
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- -2.72 -1.51 -0.38 -0.26 1.87 0.29 1.01 1.52 2.19 2.06 -1.2 -0.02 1.22 1.89 0.55 -0.37 -2.62 -0.5 -0.41 -0.59 0.67 -0.48 2.66 - -0.84 -1.14 -0.25 -0.05 -0.12 -0.33 -2.84 - -1.53 -1.83 - -1.82 - - -1.99 -0.18 - - - - - - -3.39
- -2.72 -1.51 -0.38 -0.26 1.87 0.29 1.01 1.52 2.19 2.06 -1.2 -0.02 1.22 1.89 0.55 -0.37 -2.62 -0.5 -0.41 -0.59 0.67 -0.48 2.66 - -0.84 -1.14 -0.25 -0.05 -0.12 -0.33 -2.84 - -1.53 -1.83 - -1.82 - - -1.99 -0.18 - - - - - - -3.39
-0.95 -0.98 -0.9 0.67 -0.74 0.44 0.04 -0.06 0.28 0.86 1.05 -0.23 -0.76 -0.05 1.23 1.66 0.85 0.02 -0.86 -0.29 0.65 0.33 0.3 -1.63 -0.22 -0.23 -0.89 0.63 1.14 2.02 0.09 -1.56 -2.75 0.49 - -1.25 - -2.72 -1.43 -0.65 -1.04 -1.97 0.91 -2.47 -1.11 -0.89 -0.66 -1.78

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.