Heatmap: Cluster_206 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000093.220 (tig00000093_g3642.t1)	0.18	0.1	0.13	0.11	0.19	0.15	0.3	0.25	0.25	0.32	0.34	0.34	0.16	0.63	0.2	0.56	0.43	0.48	0.43	0.32	0.36	1.0	0.59	0.86	0.78	0.85
Cpa\|evm.model.tig00000113.16 (tig00000113_g5583.t1)	0.02	0.05	0.08	0.16	0.23	0.2	0.3	0.23	0.27	0.2	0.2	0.19	0.04	0.08	0.05	0.12	0.18	0.37	0.41	0.22	0.06	1.0	0.7	0.12	0.37	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000123.16 (tig00000123_g6922.t1)	0.18	0.26	0.25	0.3	0.35	0.27	0.31	0.28	0.32	0.33	0.35	0.35	0.18	0.34	0.36	0.33	0.26	0.48	0.48	0.22	0.23	1.0	0.6	0.39	0.37	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000123.22 (tig00000123_g6929.t1)	0.3	0.33	0.35	0.34	0.33	0.3	0.31	0.31	0.25	0.27	0.25	0.3	0.27	0.3	0.21	0.32	0.21	0.46	0.37	0.22	0.2	1.0	0.33	0.48	0.36	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000190.57 (tig00000190_g13875.t1)	0.23	0.38	0.26	0.37	0.44	0.44	0.52	0.42	0.4	0.45	0.42	0.38	0.27	0.46	0.21	0.45	0.25	0.51	0.38	0.21	0.12	1.0	0.59	0.45	0.68	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000217.20 (tig00000217_g19153.t1)	0.14	0.28	0.35	0.49	0.39	0.28	0.45	0.35	0.35	0.36	0.37	0.36	0.16	0.48	0.39	0.54	0.37	1.0	0.44	0.34	0.45	0.54	0.69	0.52	0.91	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000241.137 (tig00000241_g21002.t1)	0.01	0.0	0.04	0.04	0.13	0.07	0.16	0.09	0.2	0.15	0.21	0.09	0.02	0.28	0.23	0.14	0.26	0.28	0.16	0.17	0.17	1.0	0.6	0.7	0.39	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000241.51 (tig00000241_g20914.t1)	0.31	0.28	0.2	0.26	0.24	0.18	0.28	0.26	0.34	0.34	0.3	0.28	0.31	0.63	0.45	0.52	0.43	0.53	0.33	0.34	0.19	1.0	0.47	0.53	0.71	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000241.55 (tig00000241_g20909.t1)	0.28	0.22	0.24	0.28	0.2	0.18	0.22	0.22	0.35	0.31	0.28	0.23	0.24	0.57	0.3	0.49	0.35	0.66	0.31	0.32	0.29	1.0	0.6	0.43	0.74	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000361.33 (tig00000361_g24383.t1)	0.36	0.3	0.33	0.37	0.34	0.25	0.36	0.39	0.28	0.37	0.38	0.46	0.52	0.36	0.26	0.38	0.63	0.34	0.27	0.31	0.33	1.0	0.49	0.42	0.55	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000361.51 (tig00000361_g24399.t1)	0.06	0.04	0.05	0.08	0.08	0.06	0.06	0.04	0.12	0.09	0.08	0.11	0.08	0.99	0.7	1.0	0.66	0.73	0.55	0.8	0.06	0.14	0.33	0.78	0.89	0.99
Cpa\|evm.model.tig00000383.69 (tig00000383_g24680.t1)	0.39	0.55	0.39	0.32	0.19	0.21	0.23	0.4	0.4	0.46	0.45	0.46	0.39	0.48	0.51	0.42	0.25	0.55	0.67	0.27	0.42	0.72	0.92	0.94	1.0	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000383.70 (tig00000383_g24680.t1)	0.31	0.48	0.35	0.32	0.16	0.1	0.19	0.37	0.33	0.39	0.5	0.33	0.32	0.53	0.57	0.57	0.27	0.7	0.64	0.28	0.54	0.95	0.89	0.55	1.0	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000430.66 (tig00000430_g656.t1)	0.3	0.28	0.26	0.28	0.31	0.24	0.34	0.35	0.34	0.49	0.45	0.48	0.19	0.59	0.78	0.84	1.0	0.93	0.67	0.53	0.31	0.95	0.87	0.83	0.84	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000451.5 (tig00000451_g964.t1)	0.06	0.07	0.07	0.1	0.07	0.05	0.04	0.03	0.03	0.05	0.06	0.06	0.05	0.66	0.66	0.52	0.45	1.0	0.87	0.79	0.23	0.46	0.37	0.77	0.93	0.92
Cpa\|evm.model.tig00000480.59 (tig00000480_g1326.t1)	0.3	0.47	0.49	0.58	0.57	0.5	0.46	0.39	0.62	0.54	0.6	0.6	0.31	0.7	0.64	0.72	0.51	0.88	0.62	0.35	0.26	1.0	0.81	0.85	0.84	0.88
Cpa\|evm.model.tig00000489.9 (tig00000489_g1368.t1)	0.18	0.37	0.43	0.57	0.53	0.41	0.46	0.47	0.4	0.33	0.31	0.26	0.15	0.41	0.58	0.53	0.4	0.64	0.55	0.26	0.43	1.0	0.69	0.41	0.78	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000551.20 (tig00000551_g2041.t1)	0.51	0.5	0.4	0.46	0.35	0.35	0.34	0.45	0.4	0.5	0.51	0.6	0.53	0.72	0.71	0.65	0.56	0.66	0.61	0.43	0.63	0.54	0.94	0.85	1.0	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000655.39 (tig00000655_g2864.t1)	0.25	0.28	0.36	0.5	0.32	0.26	0.57	0.44	0.39	0.44	0.4	0.36	0.27	0.85	0.83	1.0	0.69	0.96	0.62	0.62	0.32	0.71	0.62	0.55	0.65	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000692.30 (tig00000692_g3225.t1)	0.2	0.17	0.13	0.22	0.23	0.23	0.32	0.24	0.25	0.24	0.34	0.16	0.26	0.38	0.32	0.44	0.2	0.28	0.22	0.25	0.06	1.0	0.21	0.31	0.39	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000802.6 (tig00000802_g4257.t1)	0.11	0.22	0.3	0.4	0.31	0.22	0.34	0.38	0.44	0.53	0.56	0.44	0.11	0.62	0.71	0.6	0.48	0.86	0.77	0.46	0.28	0.68	0.73	0.73	1.0	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000842.5 (tig00000842_g4824.t1)	0.41	0.42	0.38	0.42	0.43	0.4	0.42	0.41	0.38	0.39	0.4	0.43	0.42	0.47	0.53	0.39	0.37	0.71	0.51	0.34	0.22	1.0	0.45	0.58	0.67	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000880.47 (tig00000880_g5205.t1)	0.09	0.06	0.05	0.13	0.13	0.17	0.19	0.13	0.26	0.15	0.17	0.19	0.04	0.23	0.32	0.19	0.12	0.21	0.11	0.09	0.13	1.0	0.29	0.56	0.39	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000880.5 (tig00000880_g5164.t1)	0.67	0.35	0.4	0.41	0.67	0.45	0.44	0.58	0.56	0.43	0.52	0.58	0.7	0.57	0.56	0.66	0.43	0.92	0.75	0.45	0.24	0.98	1.0	0.62	0.84	0.79
Cpa\|evm.model.tig00000912.5 (tig00000912_g5411.t1)	0.44	0.45	0.48	0.41	0.31	0.25	0.39	0.44	0.34	0.44	0.34	0.34	0.35	0.45	0.58	0.43	0.44	1.0	0.67	0.46	0.09	0.49	0.74	0.54	0.51	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000984.28 (tig00000984_g6005.t1)	0.13	0.11	0.16	0.18	0.23	0.22	0.26	0.3	0.24	0.22	0.23	0.19	0.14	0.45	0.33	0.39	0.17	0.32	0.16	0.15	0.09	1.0	0.46	0.35	0.65	0.31
Cpa\|evm.model.tig00001215.11 (tig00001215_g7576.t1)	0.38	0.38	0.43	0.4	0.34	0.31	0.33	0.37	0.33	0.35	0.3	0.3	0.27	0.9	0.89	0.82	0.73	0.9	0.77	0.87	0.13	0.61	0.67	0.52	0.94	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001254.15 (tig00001254_g7820.t1)	0.21	0.27	0.26	0.38	0.36	0.33	0.41	0.39	0.42	0.37	0.51	0.42	0.21	0.73	0.47	0.65	0.41	0.61	0.44	0.31	0.49	1.0	0.53	0.66	0.6	0.66
Cpa\|evm.model.tig00001525.8 (tig00001525_g9238.t1)	0.14	0.2	0.25	0.27	0.34	0.3	0.26	0.28	0.66	0.59	0.54	0.48	0.2	0.53	0.71	0.68	0.47	0.87	0.56	0.45	0.64	0.86	1.0	0.65	0.65	0.75
Cpa\|evm.model.tig00020531.11 (tig00020531_g10007.t1)	0.18	0.22	0.24	0.3	0.3	0.27	0.34	0.32	0.33	0.33	0.32	0.32	0.21	0.48	0.33	0.47	0.38	0.53	0.43	0.33	0.54	1.0	0.59	0.69	0.53	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020537.65 (tig00020537_g10291.t1)	0.3	0.33	0.4	0.47	0.51	0.35	0.51	0.5	0.38	0.45	0.47	0.42	0.29	0.48	0.34	0.4	0.43	0.5	0.42	0.32	0.69	1.0	0.69	0.41	0.84	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020539.40 (tig00020539_g10431.t1)	0.28	0.38	0.35	0.37	0.45	0.32	0.53	0.56	0.37	0.47	0.37	0.32	0.25	0.25	0.4	0.24	0.33	1.0	0.59	0.36	0.03	0.37	0.65	0.47	0.28	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020560.23	0.08	0.17	0.09	0.05	0.05	0.06	0.08	0.04	0.09	0.06	0.06	0.06	0.11	0.39	0.44	0.47	0.44	1.0	0.71	0.52	0.17	0.97	0.56	0.48	0.59	0.89
Cpa\|evm.model.tig00020563.25 (tig00020563_g11208.t1)	0.25	0.34	0.47	0.5	0.35	0.29	0.31	0.41	0.26	0.26	0.29	0.3	0.29	0.38	0.43	0.47	0.27	1.0	0.44	0.27	0.43	0.8	0.66	0.32	0.64	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020603.33 (tig00020603_g11764.t1)	0.37	0.3	0.3	0.24	0.26	0.21	0.24	0.25	0.14	0.32	0.22	0.19	0.29	0.38	0.46	0.49	0.31	0.49	0.44	0.27	0.22	1.0	0.59	0.5	0.83	0.69
Cpa\|evm.model.tig00020610.55 (tig00020610_g11998.t1)	0.19	0.22	0.2	0.22	0.28	0.34	0.35	0.26	0.37	0.31	0.3	0.27	0.17	0.26	0.37	0.29	0.29	0.46	0.24	0.29	0.26	1.0	0.6	0.31	0.39	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020614.61 (tig00020614_g12173.t1)	0.35	0.24	0.31	0.32	0.29	0.19	0.26	0.32	0.21	0.3	0.31	0.32	0.35	0.44	0.38	0.46	0.3	0.45	0.31	0.28	0.41	1.0	0.54	0.37	0.52	0.52
Cpa\|evm.model.tig00020614.88 (tig00020614_g12203.t1)	0.73	0.72	0.61	0.51	0.36	0.28	0.54	0.67	0.58	0.71	0.72	0.71	0.58	0.8	0.76	0.71	0.61	1.0	0.81	0.45	0.55	0.97	0.66	0.43	0.84	0.91
Cpa\|evm.model.tig00020723.70 (tig00020723_g13482.t1)	0.17	0.38	0.56	0.58	0.51	0.5	0.51	0.57	0.44	0.35	0.42	0.36	0.16	0.46	0.48	0.45	0.32	0.54	0.52	0.31	0.45	1.0	0.46	0.33	0.68	0.64
Cpa\|evm.model.tig00020848.31 (tig00020848_g14558.t1)	0.35	0.3	0.27	0.31	0.29	0.31	0.34	0.31	0.29	0.3	0.31	0.26	0.32	0.61	0.46	0.62	0.35	0.76	0.54	0.33	0.32	1.0	0.59	0.55	0.74	0.57
Cpa\|evm.model.tig00020930.23 (tig00020930_g16032.t1)	0.1	0.09	0.05	0.11	0.19	0.18	0.26	0.18	0.23	0.14	0.2	0.17	0.04	0.18	0.13	0.14	0.15	0.46	0.24	0.1	0.11	1.0	0.49	0.23	0.57	0.25
Cpa\|evm.model.tig00021127.157 (tig00021127_g18841.t1)	0.19	0.17	0.15	0.17	0.18	0.11	0.14	0.14	0.13	0.15	0.19	0.21	0.12	0.33	0.29	0.45	0.29	0.35	0.36	0.31	0.21	1.0	0.68	0.72	0.61	0.55
Cpa\|evm.model.tig00021357.8 (tig00021357_g20741.t1)	0.38	0.3	0.31	0.37	0.35	0.19	0.43	0.45	0.34	0.46	0.4	0.32	0.34	0.45	0.4	0.46	0.46	0.9	0.5	0.42	0.14	0.44	0.87	0.45	1.0	0.79
Cpa\|evm.model.tig00021434.58 (tig00021434_g21361.t1)	0.18	0.12	0.12	0.14	0.16	0.13	0.17	0.16	0.18	0.15	0.14	0.15	0.17	0.33	0.27	0.25	0.16	0.35	0.28	0.13	0.25	1.0	0.5	0.46	0.46	0.41
Cpa\|evm.model.tig00021518.24 (tig00021518_g22041.t1)	0.33	0.23	0.29	0.31	0.34	0.27	0.4	0.36	0.43	0.58	0.61	0.57	0.35	0.82	0.4	0.52	0.48	0.63	0.54	0.53	0.32	0.82	0.6	1.0	0.76	0.84
Cpa\|evm.model.tig00021521.2 (tig00021521_g22059.t1)	0.4	0.36	0.32	0.45	0.37	0.23	0.35	0.33	0.32	0.39	0.43	0.44	0.33	0.69	0.81	0.6	0.62	1.0	0.73	0.61	0.08	0.33	0.83	0.74	0.72	0.88
Cpa\|evm.model.tig00021531.11 (tig00021531_g22174.t1)	0.32	0.38	0.34	0.41	0.42	0.33	0.39	0.4	0.5	0.62	0.55	0.53	0.33	0.64	0.57	0.63	0.45	0.85	0.61	0.44	0.62	1.0	0.81	0.87	0.71	0.9
Cpa\|evm.model.tig00021719.17 (tig00021719_g23162.t1)	0.38	0.34	0.32	0.37	0.32	0.2	0.43	0.39	0.25	0.49	0.44	0.41	0.26	0.6	0.49	0.55	0.55	0.61	0.51	0.42	0.18	1.0	0.94	0.61	0.96	0.59
Cpa\|evm.model.tig00021760.5 (tig00021760_g23434.t1)	0.12	0.1	0.12	0.17	0.18	0.13	0.14	0.15	0.18	0.2	0.21	0.18	0.1	0.45	0.76	0.49	0.35	1.0	0.59	0.4	0.24	1.0	0.61	0.59	0.66	0.69
Cpa\|evm.model.tig00022075.34	0.27	0.36	0.37	0.39	0.4	0.26	0.37	0.34	0.34	0.37	0.32	0.28	0.25	0.59	0.65	0.55	0.46	1.0	0.67	0.49	0.28	0.57	0.78	0.53	0.86	0.56

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)