Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000025.56 (tig00020805_g14018.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000057.71 (tig00020878_g14856.t1)
0.09 0.02 0.05 0.04 0.1 0.16 0.09 0.08 0.14 0.17 0.02 0.14 0.0 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.04 0.12 0.06 0.0 0.04
Cpa|evm.model.tig00000079.8 (tig00021434_g21334.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000117.7 (tig00000117_g6350.t1)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Cpa|evm.model.tig00000117.8 (tig00000270_g23913.t1)
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.08 0.06 0.0 0.06 0.13 0.07 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000215.123 (tig00000215_g18665.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000339.20 (tig00000339_g24181.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000339.3 (tig00021137_g19023.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000396.13 (tig00000396_g24896.t1)
0.05 0.0 0.26 0.0 0.08 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.03 0.0
Cpa|evm.model.tig00000396.16 (tig00000630_g2711.t1)
0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Cpa|evm.model.tig00000404.53 (tig00000404_g415.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000443.22 (tig00020918_g15895.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000451.21 (tig00000339_g24175.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000526.15 (tig00000526_g1909.t1)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000743.7 (tig00000743_g3857.t1)
0.09 0.07 0.07 0.04 0.04 0.19 0.08 0.07 0.04 0.04 0.13 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.09 0.03 0.21 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000788.25 (tig00020961_g16736.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000828.10 (tig00000828_g4611.t1)
0.02 0.12 0.0 0.07 0.05 0.5 0.17 0.07 0.09 0.02 0.0 0.05 0.0 0.06 0.04 0.13 0.13 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.05 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000852.13 (tig00000852_g5030.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000912.11 (tig00020921_g15925.t1)
0.05 0.14 0.11 0.05 0.11 0.24 0.06 0.08 0.0 0.08 0.11 0.0 0.03 0.09 0.21 0.22 0.1 0.18 0.12 0.07 0.09 0.07 0.17 0.0 0.04 0.13
Cpa|evm.model.tig00001033.24 (tig00000367_g24441.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00001041.28 (tig00001041_g6569.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00001292.1 (tig00001292_g8036.t1)
0.04 0.1 0.0 0.12 0.09 0.05 0.1 0.11 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020510.114 (tig00020510_g9902.t1)
0.29 0.18 0.09 0.16 0.17 0.25 0.1 0.15 0.11 0.58 0.26 0.23 0.47 0.43 0.09 0.51 0.0 0.28 0.41 0.64 0.06 0.13 0.07 0.0 0.62 0.26
Cpa|evm.model.tig00020531.20 (tig00020531_g10021.t1)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.47 0.11 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
Cpa|evm.model.tig00020553.15 (tig00020553_g10508.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020555.7 (tig00020555_g10969.t1)
0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.29 0.0 0.05 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.07 0.03 0.11
Cpa|evm.model.tig00020629.72 (tig00020629_g12399.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020723.94 (tig00021015_g17152.t1)
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020801.17 (tig00020801_g13902.t1)
0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020801.9 (tig00020904_g15226.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0
Cpa|evm.model.tig00020944.42 (tig00020944_g16391.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020960.11 (tig00020960_g16533.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020960.47 (tig00020960_g16572.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020996.52 (tig00020996_g16959.t2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021038.27 (tig00021038_g17518.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.13 0.09 0.04 0.05 0.05 0.13 0.47 0.15 0.16 0.14 0.2 0.11 0.2
Cpa|evm.model.tig00021098.18 (tig00021098_g18186.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021123.18 (tig00020531_g9998.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.04 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.02 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.03 0.02
Cpa|evm.model.tig00021127.50 (tig00021127_g18727.t1)
0.0 0.13 0.2 0.21 0.23 1.39 0.58 0.97 0.89 0.31 0.45 0.14 0.06 0.28 0.58 0.28 0.53 0.79 0.75 0.37 0.05 0.25 0.09 0.06 0.14 0.14
Cpa|evm.model.tig00021137.56 (tig00000829_g4677.t1)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021137.8 (tig00021137_g18972.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021168.36 (tig00021168_g19112.t1)
0.0 0.13 0.0 0.0 0.14 1.33 0.0 0.07 0.0 0.13 0.07 0.0 0.21 0.1 0.0 0.06 0.3 0.56 0.79 0.0 0.03 0.05 0.14 0.14 0.04 0.84
Cpa|evm.model.tig00021178.8 (tig00021178_g19196.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021254.31 (tig00021254_g19711.t1)
0.02 0.03 0.09 0.02 0.06 0.12 0.05 0.04 0.02 0.04 0.09 0.12 0.1 0.0 0.02 0.02 0.0 0.08 0.15 0.0 0.08 0.0 0.17 0.02 0.0 0.05
Cpa|evm.model.tig00021294.2 (tig00021294_g20027.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021332.26 (tig00021332_g20344.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021339.5 (tig00021339_g20382.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021357.56 (tig00000449_g958.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021762.19 (tig00021762_g23476.t1)
0.11 0.13 0.09 0.07 0.05 0.22 0.05 0.0 0.12 0.1 0.07 0.19 0.21 0.06 0.08 0.02 0.0 0.02 0.05 0.05 0.0 0.02 0.1 0.1 0.0 0.17
Cpa|evm.model.tig00021795.25 (tig00021796_g23554.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)