Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Glc+ (10 mM),0.5h
Glc+ (10 mM),1h
Glc+ (10 mM),3h
Glc+ (10 mM),6h
Glc+ (10 mM),12h
Glc+ (20 mM),0h
Glc+ (20 mM),0.5h
Glc+ (20 mM),1h
Glc+ (20 mM),3h
Glc+ (20 mM),6h
Glc+ (20 mM),12h
Glc-,0h
Glc-,0.5h
Glc-,1h
Glc-,3h
Glc-,6h
Glc-,12h
Heterotrophy,Mixotrophy
High light,0.5h
High light,1h
High light,3h
High light,6h
High light,12h
High light,Proteose
Low light,Proteose
Med light,0h
Med light,0.5h
Med light,1h
Med light,3h
Med light,6h
Med light,12h
Med light,Proteose
Med light,Proteose,-Fe
Med light,Proteose,-N
Med light,Proteose,-P
Med light,Proteose,-S
Med light,Proteose,Glc+
Med light,Proteose,H2O2
Med light,Proteose,Rose Bengal
Single cell
No light,Proteose
Whole cell,Autotrophy,ND+cerulenin,6h
Whole cell,Autotrophy,ND+cerulenin,12h
Whole cell,Autotrophy,ND,0h
Whole cell,Autotrophy,ND,3h
Whole cell,Autotrophy,ND,6h
Whole cell,Autotrophy,ND,12h
Whole cell,Autotrophy,ND,24h
0.15 0.21 0.29 0.36 0.29 0.14 0.3 0.25 0.28 0.16 0.12 0.11 0.22 0.19 0.1 0.11 0.1 0.14 0.12 0.11 0.13 0.16 0.13 0.05 0.4 0.12 0.11 0.13 0.12 0.09 0.12 0.04 0.05 0.12 0.04 0.09 0.09 0.04 0.04 0.39 0.15 1.0 0.73 0.33 0.55 0.79 0.63 0.55
0.15 0.23 0.32 0.46 0.39 0.19 0.34 0.23 0.17 0.14 0.09 0.12 0.2 0.12 0.13 0.12 0.14 0.09 0.08 0.12 0.16 0.25 0.17 0.11 0.54 0.14 0.09 0.17 0.15 0.16 0.13 0.06 0.06 0.17 0.04 0.09 0.13 0.07 0.04 0.09 0.09 1.0 0.79 0.42 0.81 0.96 0.82 0.66
0.06 0.11 0.23 0.28 0.21 0.08 0.11 0.09 0.06 0.07 0.05 0.04 0.07 0.05 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.06 0.06 0.06 0.25 0.04 0.04 0.05 0.04 0.04 0.04 0.04 0.03 0.05 0.02 0.06 0.07 0.03 0.23 0.37 0.13 1.0 0.69 0.19 0.42 0.57 0.44 0.47
0.29 0.38 0.43 0.5 0.46 0.27 0.28 0.34 0.26 0.33 0.26 0.15 0.23 0.22 0.21 0.21 0.23 0.21 0.12 0.13 0.18 0.24 0.27 0.17 0.56 0.16 0.14 0.23 0.25 0.23 0.21 0.06 0.05 0.2 0.04 0.04 0.09 0.05 0.07 0.33 0.12 1.0 0.73 0.36 0.7 0.84 0.75 0.52
0.05 0.13 0.24 0.21 0.18 0.12 0.08 0.12 0.07 0.11 0.06 0.02 0.05 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01 0.05 0.04 0.04 0.33 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.0 0.15 0.27 0.06 1.0 0.69 0.12 0.45 0.72 0.65 0.45
0.12 0.2 0.26 0.26 0.24 0.07 0.14 0.15 0.12 0.11 0.05 0.12 0.12 0.14 0.1 0.1 0.12 0.11 0.1 0.12 0.12 0.12 0.09 0.09 0.48 0.12 0.12 0.17 0.13 0.11 0.1 0.07 0.08 0.09 0.05 0.04 0.11 0.11 0.06 0.3 0.13 1.0 0.73 0.47 0.75 0.91 0.64 0.59
0.06 0.24 0.31 0.17 0.17 0.17 0.2 0.13 0.11 0.14 0.04 0.03 0.07 0.06 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.06 0.09 0.11 0.19 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.05 0.05 0.01 0.02 0.03 0.12 0.04 0.03 0.25 0.03 1.0 0.61 0.42 0.73 0.79 0.48 0.71
0.06 0.1 0.11 0.13 0.09 0.04 0.03 0.04 0.04 0.08 0.05 0.04 0.04 0.03 0.02 0.02 0.04 0.07 0.05 0.04 0.03 0.02 0.03 0.04 0.22 0.04 0.05 0.04 0.02 0.02 0.04 0.04 0.02 0.03 0.01 0.03 0.11 0.03 0.03 0.08 0.04 1.0 0.58 0.31 0.59 0.84 0.5 0.65
0.13 0.2 0.27 0.24 0.23 0.09 0.06 0.06 0.08 0.14 0.07 0.09 0.08 0.06 0.04 0.04 0.08 0.1 0.09 0.09 0.06 0.07 0.07 0.04 0.24 0.1 0.1 0.09 0.06 0.05 0.08 0.04 0.02 0.07 0.02 0.02 0.12 0.03 0.04 0.22 0.03 1.0 0.61 0.36 0.75 0.87 0.53 0.68
0.19 0.27 0.38 0.5 0.44 0.27 0.31 0.34 0.26 0.31 0.2 0.18 0.26 0.22 0.2 0.24 0.23 0.21 0.15 0.19 0.19 0.28 0.28 0.18 0.57 0.18 0.17 0.23 0.19 0.24 0.25 0.09 0.08 0.2 0.07 0.14 0.12 0.08 0.1 0.34 0.15 1.0 0.86 0.43 0.72 0.9 0.78 0.56
0.15 0.3 0.47 0.57 0.43 0.24 0.1 0.13 0.21 0.36 0.2 0.04 0.08 0.07 0.07 0.11 0.13 0.1 0.06 0.06 0.08 0.14 0.2 0.15 0.41 0.04 0.05 0.09 0.09 0.14 0.18 0.06 0.04 0.06 0.03 0.03 0.05 0.03 0.04 0.18 0.01 1.0 0.69 0.28 0.69 0.73 0.61 0.5
0.04 0.19 0.35 0.45 0.4 0.23 0.2 0.24 0.18 0.37 0.19 0.0 0.1 0.08 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.06 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.33 0.01 1.0 0.67 0.18 0.53 0.8 0.65 0.57
0.14 0.17 0.2 0.19 0.18 0.08 0.17 0.13 0.08 0.07 0.05 0.13 0.14 0.1 0.07 0.08 0.11 0.1 0.17 0.15 0.12 0.1 0.12 0.11 0.23 0.14 0.11 0.11 0.09 0.05 0.09 0.09 0.08 0.19 0.07 0.14 0.03 0.06 0.06 0.14 0.14 1.0 0.86 0.16 0.4 0.74 0.5 0.43
0.13 0.14 0.16 0.15 0.19 0.04 0.1 0.07 0.05 0.06 0.03 0.11 0.1 0.09 0.05 0.06 0.08 0.13 0.13 0.13 0.08 0.08 0.07 0.05 0.2 0.11 0.1 0.09 0.07 0.04 0.07 0.06 0.04 0.14 0.03 0.08 0.01 0.04 0.03 0.24 0.06 1.0 0.85 0.2 0.54 0.75 0.53 0.49
0.26 0.34 0.35 0.38 0.38 0.34 0.26 0.25 0.16 0.21 0.17 0.14 0.21 0.14 0.08 0.07 0.13 0.16 0.15 0.13 0.1 0.13 0.19 0.19 0.67 0.14 0.15 0.13 0.09 0.09 0.13 0.15 0.2 0.15 0.19 0.31 0.1 0.18 0.25 0.62 0.33 1.0 0.9 0.33 0.74 0.94 0.82 0.7
0.13 0.17 0.23 0.27 0.23 0.04 0.09 0.08 0.06 0.07 0.06 0.09 0.1 0.09 0.06 0.08 0.1 0.13 0.1 0.1 0.1 0.09 0.1 0.04 0.32 0.1 0.1 0.12 0.1 0.09 0.11 0.05 0.08 0.13 0.08 0.07 0.06 0.08 0.05 0.26 0.08 1.0 0.74 0.28 0.57 0.86 0.63 0.62
0.22 0.43 0.55 0.59 0.52 0.32 0.31 0.26 0.27 0.42 0.31 0.12 0.23 0.18 0.14 0.16 0.16 0.11 0.11 0.14 0.15 0.21 0.24 0.23 0.39 0.12 0.13 0.18 0.17 0.17 0.17 0.11 0.07 0.11 0.06 0.11 0.16 0.08 0.06 0.72 0.05 1.0 0.74 0.36 0.7 0.86 0.61 0.58
0.21 0.35 0.5 0.47 0.49 0.28 0.25 0.24 0.24 0.43 0.34 0.11 0.22 0.16 0.11 0.14 0.15 0.1 0.1 0.11 0.12 0.15 0.21 0.27 0.34 0.1 0.14 0.16 0.13 0.15 0.16 0.14 0.09 0.12 0.07 0.11 0.26 0.17 0.1 0.28 0.06 1.0 0.67 0.3 0.63 0.85 0.62 0.51
0.18 0.26 0.4 0.44 0.48 0.22 0.23 0.32 0.27 0.37 0.24 0.09 0.16 0.16 0.16 0.15 0.15 0.11 0.08 0.11 0.12 0.22 0.19 0.15 0.41 0.1 0.09 0.15 0.15 0.18 0.18 0.06 0.07 0.12 0.06 0.06 0.12 0.05 0.1 0.28 0.08 1.0 0.77 0.34 0.68 0.85 0.65 0.58
0.12 0.18 0.22 0.27 0.24 0.17 0.18 0.23 0.19 0.29 0.19 0.07 0.12 0.12 0.1 0.11 0.1 0.09 0.07 0.08 0.07 0.14 0.12 0.09 0.41 0.06 0.07 0.09 0.09 0.1 0.13 0.04 0.04 0.05 0.04 0.02 0.07 0.04 0.07 0.28 0.05 1.0 0.68 0.34 0.6 0.83 0.61 0.6
0.06 0.15 0.3 0.49 0.48 0.27 0.17 0.2 0.21 0.35 0.3 0.01 0.11 0.08 0.05 0.05 0.03 0.05 0.02 0.02 0.03 0.07 0.09 0.15 0.75 0.01 0.02 0.03 0.04 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.01 0.01 0.34 0.01 1.0 0.75 0.26 0.78 1.0 0.93 0.52
0.19 0.24 0.29 0.34 0.39 0.26 0.39 0.29 0.27 0.23 0.2 0.15 0.25 0.22 0.18 0.18 0.18 0.17 0.14 0.19 0.19 0.21 0.2 0.28 0.55 0.15 0.18 0.2 0.2 0.18 0.19 0.11 0.1 0.19 0.09 0.08 0.14 0.11 0.21 0.33 0.14 1.0 0.69 0.62 0.87 0.79 0.69 0.74
0.29 0.43 0.46 0.51 0.38 0.3 0.27 0.36 0.26 0.4 0.2 0.15 0.21 0.21 0.19 0.13 0.17 0.16 0.15 0.18 0.19 0.19 0.19 0.23 0.54 0.14 0.15 0.18 0.16 0.13 0.17 0.14 0.15 0.14 0.1 0.21 0.27 0.14 0.12 0.39 0.07 0.97 0.83 0.54 0.77 1.0 0.84 0.65
0.15 0.2 0.3 0.38 0.3 0.08 0.1 0.13 0.17 0.15 0.14 0.1 0.12 0.14 0.13 0.14 0.12 0.17 0.09 0.11 0.17 0.11 0.14 0.08 0.49 0.1 0.11 0.16 0.19 0.14 0.14 0.09 0.11 0.11 0.09 0.08 0.13 0.13 0.05 0.3 0.06 1.0 0.72 0.39 0.65 0.95 0.79 0.56
0.25 0.3 0.27 0.28 0.29 0.14 0.15 0.17 0.16 0.19 0.12 0.06 0.11 0.12 0.1 0.12 0.12 0.15 0.07 0.09 0.09 0.13 0.13 0.12 0.4 0.06 0.06 0.12 0.09 0.11 0.12 0.1 0.06 0.08 0.06 0.13 0.11 0.07 0.06 0.47 0.05 1.0 0.81 0.37 0.71 0.97 0.73 0.61
0.08 0.15 0.25 0.22 0.23 0.13 0.14 0.15 0.14 0.2 0.12 0.04 0.07 0.08 0.05 0.04 0.05 0.06 0.03 0.04 0.04 0.07 0.06 0.06 0.4 0.05 0.03 0.06 0.04 0.05 0.04 0.02 0.02 0.06 0.03 0.05 0.05 0.04 0.02 0.24 0.02 1.0 0.84 0.37 0.81 0.96 0.73 0.53
0.13 0.18 0.23 0.21 0.23 0.27 0.23 0.21 0.16 0.27 0.13 0.07 0.13 0.1 0.07 0.06 0.07 0.09 0.06 0.08 0.06 0.12 0.15 0.21 0.55 0.07 0.06 0.07 0.05 0.04 0.08 0.15 0.04 0.09 0.07 0.29 0.09 0.07 0.09 0.2 0.16 1.0 0.78 0.24 0.64 0.84 0.73 0.56
0.12 0.19 0.17 0.2 0.23 0.13 0.21 0.13 0.13 0.21 0.09 0.04 0.1 0.08 0.08 0.08 0.06 0.1 0.05 0.04 0.05 0.07 0.1 0.16 0.5 0.04 0.04 0.06 0.05 0.05 0.05 0.12 0.02 0.04 0.02 0.04 0.08 0.02 0.04 0.29 0.02 1.0 0.66 0.41 0.84 0.92 0.68 0.7
0.12 0.2 0.28 0.34 0.33 0.14 0.07 0.08 0.13 0.26 0.21 0.05 0.07 0.09 0.11 0.11 0.09 0.13 0.04 0.07 0.11 0.14 0.12 0.11 0.46 0.05 0.06 0.13 0.13 0.16 0.12 0.06 0.06 0.06 0.07 0.05 0.11 0.08 0.03 0.45 0.03 1.0 0.72 0.43 0.8 0.99 0.78 0.57
0.21 0.25 0.32 0.36 0.25 0.14 0.19 0.22 0.21 0.21 0.13 0.1 0.15 0.12 0.11 0.08 0.1 0.13 0.09 0.09 0.1 0.1 0.1 0.04 0.45 0.1 0.1 0.1 0.14 0.08 0.1 0.1 0.1 0.1 0.14 0.07 0.1 0.09 0.03 0.38 0.14 1.0 0.67 0.49 0.66 0.83 0.67 0.69
0.18 0.27 0.33 0.42 0.42 0.22 0.13 0.22 0.28 0.39 0.27 0.15 0.14 0.18 0.19 0.17 0.18 0.16 0.14 0.16 0.16 0.19 0.21 0.14 0.48 0.16 0.14 0.21 0.19 0.2 0.21 0.11 0.11 0.17 0.13 0.1 0.18 0.13 0.08 0.27 0.06 1.0 0.77 0.39 0.77 0.88 0.7 0.54
0.04 0.09 0.21 0.22 0.19 0.06 0.05 0.06 0.07 0.08 0.05 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.02 0.06 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.28 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.06 0.01 0.01 0.15 0.01 1.0 0.65 0.36 0.73 0.8 0.56 0.61
0.27 0.49 0.66 0.6 0.56 0.27 0.24 0.28 0.23 0.43 0.23 0.11 0.17 0.16 0.14 0.15 0.16 0.18 0.1 0.13 0.16 0.21 0.23 0.15 0.36 0.12 0.11 0.16 0.15 0.17 0.17 0.09 0.1 0.13 0.12 0.1 0.09 0.06 0.06 0.91 0.07 1.0 0.68 0.47 0.84 0.9 0.61 0.63
0.26 0.33 0.28 0.26 0.25 0.21 0.36 0.29 0.14 0.18 0.17 0.08 0.21 0.13 0.08 0.08 0.11 0.17 0.09 0.09 0.08 0.11 0.1 0.09 0.36 0.07 0.09 0.09 0.08 0.08 0.1 0.04 0.06 0.05 0.04 0.1 0.08 0.09 0.11 0.37 0.19 1.0 0.76 0.39 0.63 0.87 0.68 0.49
0.05 0.09 0.2 0.31 0.36 0.33 0.26 0.29 0.26 0.36 0.35 0.01 0.15 0.12 0.1 0.08 0.05 0.08 0.01 0.01 0.02 0.08 0.13 0.22 0.86 0.01 0.01 0.02 0.02 0.04 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.01 0.01 0.28 0.01 1.0 0.72 0.34 0.86 0.91 0.9 0.52
0.07 0.14 0.22 0.19 0.15 0.03 0.03 0.03 0.03 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.06 0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.01 0.27 0.01 0.03 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.05 0.06 0.04 0.02 0.28 0.02 1.0 0.57 0.36 0.77 0.93 0.54 0.77
0.12 0.15 0.24 0.24 0.24 0.16 0.17 0.21 0.15 0.2 0.14 0.11 0.14 0.12 0.09 0.1 0.09 0.14 0.1 0.11 0.12 0.11 0.12 0.11 0.33 0.11 0.09 0.12 0.08 0.1 0.1 0.06 0.07 0.14 0.06 0.09 0.13 0.1 0.04 0.25 0.1 1.0 0.77 0.34 0.6 0.72 0.61 0.42
0.18 0.23 0.32 0.31 0.28 0.16 0.3 0.24 0.2 0.19 0.12 0.06 0.19 0.15 0.08 0.08 0.08 0.08 0.06 0.09 0.09 0.13 0.12 0.09 0.52 0.06 0.1 0.09 0.09 0.1 0.09 0.07 0.1 0.06 0.05 0.1 0.07 0.06 0.04 0.57 0.04 1.0 0.69 0.32 0.62 0.87 0.75 0.68
0.03 0.07 0.14 0.14 0.1 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.27 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.34 0.01 1.0 0.63 0.3 0.61 0.83 0.58 0.61
0.17 0.3 0.38 0.47 0.37 0.19 0.25 0.23 0.19 0.27 0.16 0.12 0.18 0.16 0.13 0.17 0.16 0.13 0.11 0.13 0.14 0.21 0.21 0.14 0.7 0.12 0.11 0.15 0.16 0.2 0.19 0.1 0.11 0.16 0.07 0.11 0.14 0.07 0.06 0.24 0.04 0.74 0.57 0.38 0.86 1.0 0.77 0.56
0.17 0.2 0.26 0.25 0.26 0.05 0.09 0.07 0.05 0.06 0.04 0.08 0.08 0.07 0.05 0.06 0.08 0.14 0.06 0.08 0.08 0.08 0.09 0.09 0.31 0.09 0.08 0.09 0.08 0.07 0.09 0.06 0.08 0.11 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.49 0.1 1.0 0.77 0.38 0.69 0.75 0.52 0.6
0.18 0.24 0.27 0.31 0.17 0.04 0.06 0.05 0.06 0.05 0.03 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.03 0.05 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.34 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.32 0.02 1.0 0.74 0.39 0.73 0.88 0.68 0.5
0.14 0.2 0.22 0.24 0.14 0.03 0.05 0.04 0.04 0.04 0.02 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.4 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.31 0.01 1.0 0.77 0.26 0.61 0.86 0.66 0.52
0.12 0.19 0.36 0.43 0.37 0.18 0.17 0.15 0.18 0.27 0.17 0.11 0.14 0.1 0.08 0.08 0.09 0.09 0.1 0.1 0.11 0.12 0.12 0.17 0.76 0.11 0.11 0.12 0.11 0.11 0.1 0.04 0.08 0.1 0.06 0.02 0.16 0.08 0.01 0.35 0.04 0.91 0.65 0.53 0.87 1.0 0.84 0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)