Heatmap: Cluster_107 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000057.120 (tig00000057_g144.t1)	0.3	0.39	0.41	0.45	0.49	0.51	0.51	0.48	0.44	0.38	0.33	0.3	0.33	0.29	0.33	0.29	0.34	0.52	0.38	0.35	0.02	1.0	0.16	0.16	0.28	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000093.182 (tig00000093_g3608.t1)	0.31	0.23	0.31	0.35	0.53	1.0	0.8	0.58	0.63	0.39	0.35	0.32	0.27	0.24	0.23	0.4	0.16	0.26	0.26	0.25	0.04	0.88	0.16	0.11	0.4	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000145.8 (tig00000145_g8800.t1)	0.2	0.38	0.49	0.49	0.66	0.93	0.98	0.83	0.94	0.65	0.61	0.55	0.16	0.33	0.54	0.7	0.7	1.0	0.8	0.79	0.1	0.79	0.32	0.49	0.83	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000189.49 (tig00000189_g14347.t1)	0.62	0.62	0.58	0.63	0.55	1.0	0.8	0.85	0.92	0.52	0.5	0.4	0.52	0.38	0.34	0.5	0.59	0.36	0.53	0.72	0.19	0.58	0.22	0.25	0.82	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000241.173 (tig00000241_g21042.t1)	0.22	0.47	0.65	0.8	1.0	0.9	0.94	0.84	0.56	0.42	0.29	0.2	0.22	0.2	0.46	0.4	0.5	0.81	0.71	0.59	0.03	0.89	0.49	0.31	0.79	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000241.94 (tig00000241_g20958.t1)	0.48	0.65	0.52	0.66	0.93	1.0	0.81	0.75	0.43	0.51	0.48	0.42	0.42	0.58	0.43	0.53	0.55	0.86	0.79	0.61	0.03	0.86	0.37	0.46	0.76	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000269.28 (tig00000403_g257.t1)	0.07	0.09	0.2	0.33	0.51	1.0	0.71	0.7	0.77	0.39	0.22	0.14	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.16	0.02	0.01	0.03
Cpa\|evm.model.tig00000334.14 (tig00000334_g24110.t1)	0.14	0.26	0.32	0.45	0.55	0.41	0.37	0.38	0.35	0.43	0.43	0.36	0.21	0.25	0.42	0.46	0.21	0.46	0.39	0.25	0.06	1.0	0.17	0.31	0.2	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000396.25 (tig00000396_g24896.t1)	0.67	0.54	0.52	0.6	0.71	0.86	0.73	0.74	0.75	0.75	0.65	0.65	0.76	0.49	0.63	0.48	0.51	0.63	0.7	0.46	0.1	1.0	0.38	0.32	0.44	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000403.54 (tig00000403_g311.t1)	0.14	0.2	0.23	0.32	0.61	1.0	0.67	0.56	0.64	0.52	0.53	0.4	0.17	0.25	0.16	0.26	0.13	0.25	0.31	0.32	0.24	0.17	0.33	0.17	0.27	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000448.1 (tig00000448_g836.t1)	0.17	0.21	0.4	0.63	0.67	0.93	1.0	1.0	0.54	0.28	0.26	0.2	0.1	0.18	0.24	0.37	0.42	0.38	0.38	0.37	0.08	0.9	0.62	0.13	0.6	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000448.2 (tig00000448_g836.t1)	0.1	0.16	0.28	0.47	0.55	0.7	0.94	0.85	0.53	0.17	0.17	0.15	0.1	0.2	0.32	0.44	0.49	0.55	0.57	0.29	0.16	1.0	0.33	0.12	0.97	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000663.27 (tig00000663_g2959.t1)	0.07	0.23	0.36	0.45	0.78	1.0	1.0	0.7	0.27	0.14	0.07	0.04	0.02	0.07	0.2	0.21	0.36	0.55	0.6	0.63	0.02	0.74	0.19	0.01	0.27	0.2
Cpa\|evm.model.tig00000792.4 (tig00000792_g4153.t1)	0.05	0.13	0.16	0.53	0.82	1.0	0.81	0.72	0.15	0.09	0.05	0.01	0.01	0.03	0.14	0.14	0.17	0.26	0.19	0.22	0.07	0.61	0.13	0.01	0.23	0.12
Cpa\|evm.model.tig00000802.52 (tig00000802_g4301.t1)	0.29	0.42	0.38	0.52	0.52	0.49	0.43	0.42	0.45	0.35	0.41	0.26	0.2	0.13	0.23	0.15	0.24	0.33	0.36	0.23	0.01	1.0	0.17	0.11	0.48	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000806.44 (tig00000806_g4372.t1)	0.25	0.46	0.49	0.56	0.63	0.53	0.56	0.5	0.45	0.59	0.44	0.38	0.26	0.12	0.31	0.08	0.39	0.4	0.42	0.51	0.04	1.0	0.07	0.18	0.44	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000821.20 (tig00000821_g4478.t1)	0.45	0.24	0.32	0.55	0.57	0.69	0.83	0.77	0.69	0.52	0.38	0.28	0.43	0.38	0.31	0.48	0.28	0.67	0.47	0.44	0.15	0.99	0.26	0.33	1.0	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000849.10 (tig00000849_g4752.t1)	0.12	0.43	0.58	0.77	1.0	0.93	0.98	0.85	0.46	0.36	0.27	0.21	0.07	0.31	0.31	0.39	0.55	0.8	0.86	0.71	0.05	0.99	0.25	0.17	0.69	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000851.16 (tig00000851_g4901.t1)	0.09	0.05	0.17	0.32	0.37	0.43	0.97	0.9	0.79	0.46	0.19	0.09	0.05	0.1	0.23	0.22	0.32	0.53	0.48	0.43	0.25	1.0	0.11	0.06	0.76	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000870.3 (tig00000870_g5121.t1)	0.46	0.41	0.47	0.57	0.69	0.65	0.61	0.57	0.56	0.57	0.57	0.51	0.42	0.32	0.35	0.31	0.33	0.53	0.54	0.45	0.19	1.0	0.19	0.28	0.34	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000881.6 (tig00000881_g5220.t1)	0.2	0.3	0.5	0.58	0.76	1.0	0.79	0.67	0.82	0.72	0.59	0.45	0.24	0.26	0.41	0.24	0.41	0.42	0.5	0.61	0.25	0.19	0.44	0.42	0.27	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000903.13 (tig00000903_g5511.t1)	0.08	0.14	0.22	0.38	0.48	0.72	1.0	0.83	0.55	0.32	0.19	0.16	0.06	0.41	0.36	0.82	0.49	0.63	0.56	0.47	0.25	0.92	0.24	0.16	0.48	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000903.14 (tig00000903_g5511.t1)	0.11	0.17	0.27	0.47	0.72	1.0	0.99	0.86	0.7	0.37	0.3	0.18	0.1	0.4	0.38	0.69	0.45	0.37	0.53	0.44	0.19	0.63	0.21	0.22	0.3	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000985.4 (tig00000985_g6012.t1)	0.39	0.41	0.46	0.56	0.66	1.0	0.59	0.63	0.59	0.35	0.46	0.39	0.33	0.25	0.27	0.33	0.23	0.42	0.48	0.33	0.06	0.7	0.24	0.29	0.26	0.35
Cpa\|evm.model.tig00001057.11 (tig00001057_g6692.t1)	0.64	0.55	0.54	0.68	0.77	1.0	0.66	0.82	0.89	0.53	0.58	0.4	0.39	0.28	0.22	0.61	0.25	0.48	0.67	0.56	0.37	0.49	0.39	0.25	0.48	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001094.18 (tig00001094_g6989.t1)	0.22	0.47	0.33	0.49	0.83	1.0	0.65	0.51	0.22	0.25	0.2	0.14	0.1	0.29	0.5	0.38	0.44	0.49	0.66	0.59	0.06	0.99	0.37	0.18	0.59	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001181.30 (tig00001181_g7443.t1)	0.45	0.41	0.39	0.6	0.85	0.97	1.0	0.96	0.9	0.78	0.6	0.5	0.43	0.61	0.57	0.76	0.51	0.71	0.7	0.66	0.09	0.92	0.38	0.43	0.81	0.58
Cpa\|evm.model.tig00001208.19 (tig00001208_g7537.t1)	0.17	0.49	0.47	0.71	0.82	1.0	0.91	0.92	0.76	0.63	0.62	0.52	0.23	0.44	0.4	0.49	0.66	0.7	0.81	0.73	0.08	0.71	0.53	0.77	0.81	0.49
Cpa\|evm.model.tig00001292.21 (tig00001292_g8054.t1)	0.2	0.27	0.41	0.59	0.77	0.89	1.0	0.76	0.64	0.49	0.44	0.41	0.19	0.44	0.44	0.51	0.44	0.63	0.59	0.44	0.46	0.69	0.37	0.26	0.61	0.39
Cpa\|evm.model.tig00001331.9 (tig00001331_g8172.t1)	0.08	0.15	0.23	0.42	0.52	0.62	0.67	0.58	0.3	0.23	0.16	0.11	0.04	0.14	0.15	0.32	0.3	0.43	0.36	0.32	0.1	1.0	0.13	0.13	0.37	0.29
Cpa\|evm.model.tig00001335.6 (tig00001335_g8211.t1)	0.17	0.18	0.17	0.34	0.62	0.47	0.42	0.35	0.34	0.22	0.3	0.14	0.15	0.15	0.17	0.56	0.1	0.27	0.26	0.11	0.04	1.0	0.14	0.17	0.2	0.23
Cpa\|evm.model.tig00001365.6	0.23	0.27	0.31	0.53	0.58	0.77	0.69	0.67	0.58	0.59	0.48	0.4	0.25	0.37	0.31	0.33	0.24	0.53	0.48	0.62	0.02	1.0	0.39	0.36	0.97	0.59
Cpa\|evm.model.tig00001466.2 (tig00001466_g8779.t1)	0.25	0.44	0.42	0.65	0.99	1.0	0.62	0.78	0.29	0.25	0.28	0.23	0.26	0.21	0.23	0.32	0.43	0.92	0.86	0.59	0.05	0.57	0.2	0.16	0.5	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001487.4 (tig00001487_g8932.t1)	0.22	0.24	0.29	0.62	0.91	0.87	1.0	0.91	0.8	0.45	0.42	0.36	0.17	0.27	0.37	0.33	0.42	0.62	0.67	0.43	0.06	0.65	0.54	0.29	0.88	0.4
Cpa\|evm.model.tig00001501.12 (tig00021493_g21856.t1)	0.36	0.42	0.47	0.45	0.43	1.0	0.56	0.52	0.68	0.42	0.3	0.39	0.25	0.23	0.47	0.36	0.37	0.26	0.5	0.38	0.01	0.07	0.04	0.15	0.01	0.11
Cpa\|evm.model.tig00001527.3 (tig00001527_g9253.t1)	0.32	0.11	0.24	0.47	0.52	0.82	0.69	0.81	1.0	0.52	0.52	0.35	0.13	0.14	0.41	0.39	0.64	0.47	0.52	0.36	0.43	0.04	0.54	0.22	0.26	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020553.188 (tig00020553_g10677.t1)	0.22	0.34	0.36	0.56	0.75	0.65	0.54	0.52	0.23	0.32	0.26	0.24	0.1	0.3	0.35	0.44	0.37	0.6	0.51	0.55	0.09	1.0	0.26	0.31	0.46	0.48
Cpa\|evm.model.tig00020553.189 (tig00020553_g10677.t1)	0.23	0.38	0.37	0.53	0.86	1.0	0.57	0.46	0.2	0.31	0.31	0.26	0.12	0.32	0.34	0.41	0.35	0.53	0.49	0.56	0.06	0.74	0.27	0.52	0.36	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020556.69 (tig00020556_g11037.t1)	0.13	0.24	0.34	0.49	0.72	1.0	0.78	0.64	0.35	0.21	0.16	0.13	0.08	0.23	0.21	0.34	0.31	0.39	0.4	0.41	0.05	0.73	0.17	0.13	0.36	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020610.42 (tig00020610_g11982.t1)	0.61	0.58	0.67	0.79	0.9	1.0	0.96	0.9	0.77	0.63	0.57	0.56	0.62	0.39	0.47	0.8	0.51	0.68	0.54	0.49	0.4	0.66	0.45	0.47	0.5	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020703.22 (tig00020703_g13124.t1)	0.06	0.17	0.24	0.35	0.52	0.54	0.4	0.28	0.21	0.15	0.12	0.12	0.05	0.22	0.25	0.21	0.23	0.33	0.29	0.23	0.12	1.0	0.2	0.09	0.21	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020780.48 (tig00020780_g13797.t2)	0.27	0.19	0.31	0.41	0.46	0.46	1.0	0.86	0.53	0.4	0.23	0.17	0.31	0.36	0.37	0.63	0.59	0.67	0.6	0.6	0.04	0.85	0.11	0.14	0.37	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020780.49 (tig00020780_g13797.t2)	0.34	0.21	0.31	0.51	0.59	0.74	1.0	0.94	0.69	0.45	0.28	0.21	0.35	0.25	0.29	0.41	0.38	0.4	0.43	0.43	0.05	0.89	0.12	0.09	0.47	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020780.54 (tig00020780_g13803.t1)	0.17	0.28	0.29	0.54	0.62	0.66	0.68	0.73	0.53	0.66	0.44	0.35	0.16	0.49	0.42	0.53	0.27	0.94	0.42	0.39	0.18	1.0	0.12	0.29	0.53	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020824.8 (tig00020824_g14234.t1)	0.39	0.39	0.38	0.46	0.63	0.72	0.66	0.57	0.6	0.57	0.51	0.41	0.37	0.43	0.41	0.49	0.42	0.54	0.51	0.51	0.06	1.0	0.48	0.62	0.73	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020909.29 (tig00020909_g15351.t2)	0.25	0.2	0.22	0.4	0.53	0.56	0.75	0.78	0.61	0.57	0.4	0.27	0.28	0.26	0.28	0.55	0.24	0.4	0.38	0.39	0.07	1.0	0.04	0.23	0.41	0.44
Cpa\|evm.model.tig00020909.5 (tig00020909_g15324.t1)	0.12	0.27	0.45	0.6	0.8	1.0	0.87	0.76	0.73	0.64	0.53	0.35	0.15	0.5	0.46	0.69	0.53	0.79	0.62	0.57	0.1	1.0	0.3	0.39	0.65	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020911.13 (tig00020911_g15714.t1)	0.3	0.52	0.63	0.71	1.0	0.86	0.71	0.72	0.65	0.47	0.48	0.42	0.19	0.41	0.44	0.42	0.57	0.75	0.64	0.72	0.07	0.64	0.37	0.41	0.59	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020911.14 (tig00020911_g15715.t1)	0.38	0.42	0.41	0.53	0.75	0.91	0.85	0.71	0.48	0.45	0.35	0.33	0.28	0.37	0.42	0.54	0.57	0.57	0.59	0.59	0.09	1.0	0.34	0.4	0.44	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020943.31 (tig00020943_g16273.t1)	0.41	0.35	0.35	0.51	0.59	0.72	0.78	0.75	0.85	0.91	0.6	0.5	0.41	0.41	0.32	1.0	0.54	0.89	0.67	0.63	0.04	0.97	0.46	0.56	0.77	0.57
Cpa\|evm.model.tig00020943.75 (tig00020943_g16315.t1)	0.27	0.59	0.5	0.7	0.94	1.0	0.8	0.75	0.59	0.56	0.53	0.4	0.3	0.6	0.49	0.68	0.37	0.52	0.46	0.41	0.42	1.0	0.69	0.5	0.67	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021012.11 (tig00021012_g16993.t1)	0.22	0.52	0.52	0.77	0.84	0.82	1.0	0.84	0.65	0.58	0.6	0.52	0.24	0.65	0.6	0.94	0.67	0.66	0.65	0.44	0.36	0.82	0.46	0.56	0.55	0.47
Cpa\|evm.model.tig00021036.15 (tig00021036_g17285.t1)	0.51	0.33	0.19	0.37	0.84	1.0	0.63	0.59	0.55	0.43	0.2	0.2	0.53	0.2	0.18	0.13	0.22	0.56	0.41	0.11	0.45	0.36	0.51	0.36	0.4	0.53
Cpa\|evm.model.tig00021127.19 (tig00021127_g18695.t1)	0.24	0.35	0.4	0.5	0.53	0.53	0.56	0.52	0.42	0.35	0.33	0.26	0.18	0.33	0.43	0.43	0.28	0.45	0.44	0.3	0.15	1.0	0.42	0.32	0.34	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021254.25 (tig00021254_g19704.t1)	0.21	0.41	0.24	0.5	0.73	0.92	1.0	0.76	0.4	0.27	0.26	0.19	0.16	0.09	0.19	0.17	0.29	0.37	0.47	0.35	0.08	0.48	0.09	0.12	0.67	0.28
Cpa\|evm.model.tig00021257.8 (tig00021257_g19744.t1)	0.12	0.28	0.3	0.45	0.76	1.0	0.65	0.63	0.29	0.21	0.14	0.13	0.07	0.09	0.16	0.11	0.22	0.31	0.36	0.36	0.0	0.95	0.06	0.07	0.3	0.14
Cpa\|evm.model.tig00021293.31 (tig00021293_g20023.t2)	0.22	0.34	0.44	0.52	0.52	0.51	0.56	0.48	0.43	0.37	0.27	0.25	0.16	0.32	0.43	0.37	0.44	0.48	0.39	0.41	0.02	1.0	0.14	0.15	0.3	0.29
Cpa\|evm.model.tig00021339.55 (tig00001029_g6426.t1)	0.38	0.14	0.5	0.3	0.43	1.0	0.5	0.96	0.73	0.32	0.2	0.13	0.27	0.22	0.15	0.34	0.29	0.69	0.57	0.13	0.37	0.2	0.56	0.18	0.31	0.78
Cpa\|evm.model.tig00021348.76 (tig00020801_g13880.t1)	0.21	0.33	0.3	0.4	0.42	0.45	0.39	0.35	0.34	0.3	0.22	0.21	0.23	0.22	0.34	0.3	0.23	0.51	0.44	0.29	0.25	1.0	0.44	0.2	0.32	0.28
Cpa\|evm.model.tig00021357.65	0.07	0.03	0.25	0.37	0.36	0.52	1.0	0.67	0.8	0.39	0.5	0.32	0.0	0.39	0.81	0.62	0.19	0.2	0.32	0.26	0.47	0.04	0.44	0.29	0.3	0.31
Cpa\|evm.model.tig00021435.22 (tig00021435_g21399.t1)	0.46	0.52	0.61	0.59	0.7	1.0	0.83	0.77	0.69	0.51	0.44	0.38	0.41	0.21	0.35	0.28	0.37	0.29	0.4	0.5	0.23	0.17	0.43	0.34	0.2	0.23
Cpa\|evm.model.tig00021463.13 (tig00021463_g21621.t1)	0.12	0.13	0.26	0.52	0.58	0.71	1.0	0.82	0.66	0.41	0.4	0.31	0.12	0.42	0.26	0.6	0.34	0.36	0.43	0.29	0.31	0.68	0.34	0.31	0.47	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021493.4 (tig00021493_g21846.t1)	0.6	0.53	0.6	0.5	0.68	1.0	0.78	0.72	0.91	0.63	0.65	0.63	0.6	0.5	0.68	0.66	0.42	0.58	0.68	0.59	0.17	0.34	0.26	0.34	0.34	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021617.23 (tig00021617_g22950.t1)	0.17	0.27	0.38	0.56	0.82	0.98	1.0	0.75	0.53	0.39	0.32	0.23	0.12	0.31	0.33	0.4	0.48	0.57	0.61	0.54	0.02	0.73	0.24	0.31	0.72	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021719.9 (tig00021719_g23155.t1)	0.22	0.22	0.24	0.34	0.55	1.0	0.92	0.73	0.61	0.52	0.38	0.29	0.22	0.18	0.11	0.22	0.15	0.13	0.17	0.26	0.01	0.85	0.08	0.16	0.37	0.4
Cpa\|evm.model.tig00021720.22 (tig00021720_g23193.t1)	0.47	0.42	0.51	0.61	0.76	0.93	0.7	0.68	0.69	0.63	0.64	0.65	0.65	0.4	0.41	0.57	0.51	0.42	0.51	0.61	0.25	1.0	0.31	0.39	0.57	0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)