Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.159 (tig00000042_g15556.t1)
1.0 0.88 0.83 0.71 0.44 0.42 0.61 0.92 0.72 0.72 0.66 0.59 0.71 0.12 0.28 0.13 0.37 0.56 0.55 0.65 0.0 0.06 0.09 0.18 0.47 0.39
Cpa|evm.model.tig00000056.32 (tig00000056_g24079.t1)
0.89 0.53 0.36 0.25 0.23 0.37 0.65 0.74 0.85 1.0 0.77 0.66 0.53 0.18 0.14 0.09 0.34 0.63 0.47 0.56 0.0 0.03 0.23 0.34 0.33 0.28
Cpa|evm.model.tig00000093.240 (tig00000093_g3664.t1)
0.82 0.5 0.34 0.62 0.76 0.53 0.72 0.69 0.67 0.69 0.68 0.52 0.41 0.41 0.34 0.31 0.28 0.76 0.46 0.15 0.0 0.07 0.4 0.43 1.0 0.41
Cpa|evm.model.tig00000113.95 (tig00000113_g5677.t1)
0.66 0.33 0.4 0.36 0.16 0.2 0.55 1.0 0.67 0.72 0.64 0.55 0.45 0.13 0.12 0.05 0.18 0.97 0.57 0.58 0.05 0.29 0.2 0.33 0.27 0.22
Cpa|evm.model.tig00000128.7 (tig00000128_g7207.t1)
0.77 0.54 0.74 0.56 0.35 0.36 0.65 1.0 0.78 0.59 0.49 0.34 0.48 0.11 0.18 0.15 0.27 0.53 0.49 0.63 0.01 0.07 0.03 0.05 0.25 0.3
Cpa|evm.model.tig00000140.10 (tig00000140_g8469.t1)
0.92 0.86 0.52 0.3 0.32 0.47 0.89 1.0 0.94 0.93 0.84 0.69 0.67 0.1 0.23 0.15 0.47 0.75 0.47 0.69 0.02 0.13 0.48 0.44 0.41 0.23
Cpa|evm.model.tig00000140.11 (tig00000140_g8469.t1)
0.94 0.93 0.56 0.31 0.4 0.64 0.9 1.0 0.98 1.0 0.87 0.7 0.65 0.11 0.28 0.15 0.51 0.71 0.62 0.79 0.02 0.07 0.32 0.38 0.29 0.2
Cpa|evm.model.tig00000157.41 (tig00000157_g9631.t1)
0.41 0.52 0.43 0.41 0.5 0.62 0.54 0.74 1.0 0.98 0.86 0.78 0.23 0.33 0.63 0.35 0.57 0.9 0.84 0.69 0.04 0.04 0.62 0.73 0.45 0.42
Cpa|evm.model.tig00000178.19 (tig00000178_g12729.t1)
0.37 0.55 0.48 0.51 0.54 0.44 0.67 0.74 0.84 1.0 0.87 0.73 0.46 0.61 0.42 0.33 0.59 0.58 0.5 0.61 0.06 0.38 0.31 0.34 0.5 0.51
Cpa|evm.model.tig00000194.35 (tig00000194_g14763.t1)
0.69 1.0 0.52 0.26 0.17 0.29 0.51 0.68 0.71 0.72 0.66 0.61 0.54 0.02 0.07 0.01 0.16 0.39 0.26 0.27 0.01 0.08 0.25 0.26 0.28 0.14
Cpa|evm.model.tig00000217.41 (tig00000217_g19172.t1)
0.7 0.69 0.6 0.69 0.54 0.54 0.66 0.68 0.54 0.47 0.52 0.55 0.79 0.38 0.46 0.48 0.37 1.0 0.49 0.48 0.05 0.18 0.48 0.49 0.63 0.54
Cpa|evm.model.tig00000241.153 (tig00000241_g21018.t1)
0.19 0.45 0.65 0.73 0.7 0.55 0.83 0.7 0.94 1.0 0.86 0.83 0.25 0.64 0.58 0.53 0.51 0.77 0.61 0.76 0.15 0.58 0.58 0.86 0.48 0.55
Cpa|evm.model.tig00000241.50 (tig00000241_g20912.t1)
0.74 1.0 0.57 0.34 0.22 0.29 0.34 0.42 0.39 0.38 0.41 0.46 0.52 0.05 0.12 0.04 0.21 0.29 0.25 0.31 0.0 0.1 0.06 0.15 0.13 0.08
Cpa|evm.model.tig00000254.121 (tig00000254_g22581.t1)
0.79 0.54 0.56 0.59 0.53 0.47 0.72 0.84 0.78 0.91 0.94 0.98 0.89 0.35 0.47 0.41 0.58 1.0 0.67 0.84 0.03 0.74 0.48 0.73 0.76 0.64
Cpa|evm.model.tig00000342.59 (tig00000342_g24244.t1)
0.81 0.95 0.53 0.46 0.54 0.54 0.79 0.96 0.87 0.98 0.94 0.7 0.35 0.07 0.18 0.07 0.44 1.0 0.55 0.66 0.03 0.3 0.58 0.62 0.43 0.29
Cpa|evm.model.tig00000367.42 (tig00000367_g24479.t1)
0.67 1.0 0.43 0.16 0.09 0.16 0.32 0.43 0.48 0.46 0.43 0.4 0.47 0.05 0.12 0.02 0.19 0.23 0.21 0.28 0.0 0.03 0.07 0.1 0.13 0.07
Cpa|evm.model.tig00000402.25 (tig00000402_g203.t1)
0.63 0.74 0.71 0.73 0.81 0.73 0.68 0.74 0.74 0.84 0.93 1.0 0.87 0.54 0.49 0.52 0.5 0.88 0.65 0.61 0.1 0.71 0.44 0.48 0.64 0.66
Cpa|evm.model.tig00000402.30 (tig00000402_g208.t1)
1.0 0.77 0.64 0.89 0.87 0.67 0.79 0.77 0.73 0.73 0.96 0.87 1.0 0.5 0.38 0.44 0.53 0.8 0.59 0.37 0.42 0.45 0.75 0.69 0.76 0.54
Cpa|evm.model.tig00000402.36 (tig00000402_g214.t1)
0.79 1.0 0.81 0.48 0.28 0.16 0.39 0.53 0.48 0.54 0.62 0.65 0.61 0.35 0.25 0.25 0.43 0.73 0.35 0.42 0.06 0.4 0.41 0.67 0.62 0.54
Cpa|evm.model.tig00000411.24 (tig00000411_g525.t1)
0.35 1.0 0.62 0.34 0.19 0.1 0.26 0.48 0.34 0.69 0.62 0.67 0.59 0.25 0.25 0.24 0.32 0.65 0.5 0.34 0.01 0.21 0.32 0.42 0.82 0.35
Cpa|evm.model.tig00000441.27 (tig00000441_g720.t1)
0.18 0.69 0.36 0.44 0.44 0.57 0.58 0.6 0.78 0.84 0.72 0.6 0.15 0.4 0.58 0.47 0.57 0.99 0.9 0.51 0.09 0.36 0.65 1.0 0.36 0.4
Cpa|evm.model.tig00000448.49 (tig00000448_g880.t1)
0.98 0.9 0.93 0.91 0.87 0.94 0.97 0.85 0.78 0.81 0.74 0.95 1.0 0.48 0.69 0.64 0.42 0.82 0.58 0.53 0.22 0.24 0.89 0.57 0.53 0.59
Cpa|evm.model.tig00000471.12 (tig00000471_g1187.t1)
0.65 1.0 0.53 0.29 0.24 0.28 0.47 0.61 0.62 0.65 0.57 0.51 0.57 0.1 0.11 0.06 0.2 0.21 0.18 0.33 0.02 0.06 0.12 0.14 0.29 0.2
Cpa|evm.model.tig00000523.20 (tig00000523_g1839.t1)
0.85 0.6 0.51 0.45 0.41 0.49 0.75 0.84 0.91 1.0 0.88 0.78 0.68 0.36 0.41 0.3 0.54 1.0 0.72 0.65 0.04 0.2 0.58 0.52 0.37 0.33
Cpa|evm.model.tig00000711.7 (tig00000711_g3368.t1)
1.0 0.85 0.38 0.18 0.23 0.49 0.77 0.87 0.77 0.73 0.61 0.52 0.73 0.14 0.21 0.08 0.34 0.48 0.42 0.42 0.02 0.22 0.29 0.31 0.32 0.19
Cpa|evm.model.tig00000718.40 (tig00000718_g3715.t1)
1.0 0.77 0.51 0.32 0.37 0.51 0.66 0.71 0.64 0.61 0.57 0.57 0.84 0.07 0.15 0.08 0.33 0.63 0.48 0.61 0.01 0.05 0.2 0.22 0.28 0.18
Cpa|evm.model.tig00000737.17 (tig00000737_g3796.t1)
0.67 0.8 0.71 0.41 0.26 0.33 0.63 0.81 0.84 1.0 0.9 0.89 0.67 0.17 0.29 0.21 0.37 0.61 0.5 0.55 0.01 0.12 0.21 0.19 0.36 0.29
Cpa|evm.model.tig00000737.25 (tig00000737_g3806.t1)
0.2 0.29 0.39 0.48 0.4 0.4 0.6 0.59 0.6 1.0 0.89 0.64 0.21 0.31 0.23 0.2 0.4 0.6 0.63 0.63 0.01 0.56 0.27 0.27 0.74 0.4
Cpa|evm.model.tig00000737.26 (tig00000737_g3807.t1)
0.14 0.28 0.36 0.54 0.44 0.33 0.7 0.63 0.57 1.0 0.86 0.67 0.21 0.42 0.33 0.32 0.66 0.65 0.6 0.9 0.0 0.27 0.18 0.23 0.37 0.27
Cpa|evm.model.tig00000737.27 (tig00000737_g3807.t1)
0.2 0.26 0.35 0.55 0.34 0.29 0.74 0.68 0.65 0.95 1.0 0.76 0.19 0.34 0.23 0.26 0.52 0.64 0.47 0.76 0.0 0.49 0.15 0.42 0.48 0.39
Cpa|evm.model.tig00000821.15 (tig00000821_g4474.t1)
0.7 0.59 0.45 0.41 0.48 0.52 0.7 0.63 0.7 0.89 0.9 1.0 0.69 0.46 0.53 0.45 0.58 0.77 0.62 0.59 0.08 0.88 0.5 0.77 0.59 0.73
Cpa|evm.model.tig00000841.10 (tig00000841_g4735.t1)
0.27 0.43 0.58 0.61 0.36 0.47 0.52 0.66 0.95 1.0 0.91 0.79 0.17 0.26 0.55 0.28 0.57 0.65 0.74 0.61 0.02 0.13 0.46 0.56 0.43 0.42
Cpa|evm.model.tig00001071.13 (tig00001071_g6804.t1)
0.68 0.64 0.6 0.56 0.53 0.49 0.78 0.86 0.93 1.0 0.93 0.9 0.78 0.41 0.6 0.62 0.59 0.85 0.77 0.57 0.11 0.85 0.61 0.56 0.64 0.62
Cpa|evm.model.tig00001333.23 (tig00001333_g8193.t1)
0.75 0.98 1.0 0.69 0.44 0.38 0.51 0.9 0.73 0.67 0.67 0.55 0.68 0.16 0.27 0.04 0.44 0.69 0.64 0.76 0.0 0.1 0.2 0.17 0.81 0.34
Cpa|evm.model.tig00001542.20 (tig00001542_g9327.t1)
0.22 0.13 0.25 0.37 0.26 0.31 0.44 0.4 0.49 0.94 0.67 0.94 0.21 0.33 0.49 0.43 0.38 0.63 1.0 0.52 0.02 0.02 0.49 0.48 0.15 0.23
Cpa|evm.model.tig00020554.34 (tig00020554_g10819.t1)
1.0 0.93 0.52 0.28 0.23 0.29 0.6 0.76 0.8 0.86 0.73 0.63 0.75 0.23 0.44 0.25 0.47 0.54 0.52 0.57 0.01 0.06 0.25 0.28 0.36 0.22
Cpa|evm.model.tig00020554.35 (tig00020554_g10819.t1)
1.0 0.94 0.53 0.28 0.19 0.18 0.64 0.81 0.79 0.94 0.75 0.58 0.6 0.22 0.47 0.29 0.54 0.85 0.53 0.53 0.02 0.07 0.49 0.44 0.5 0.3
Cpa|evm.model.tig00020562.40 (tig00020562_g11165.t1)
0.92 1.0 0.54 0.32 0.22 0.27 0.4 0.44 0.44 0.41 0.45 0.44 0.71 0.11 0.09 0.05 0.34 0.22 0.2 0.19 0.03 0.11 0.14 0.19 0.24 0.11
Cpa|evm.model.tig00020562.9 (tig00020562_g11138.t1)
0.89 0.52 0.4 0.66 0.64 0.52 0.9 1.0 0.96 0.93 0.99 0.72 0.63 0.22 0.46 0.2 0.53 0.83 0.72 0.5 0.16 0.15 0.62 0.56 0.53 0.53
Cpa|evm.model.tig00020563.150 (tig00020563_g11352.t1)
0.86 0.4 0.38 0.38 0.5 0.49 0.9 0.9 0.93 1.0 0.87 0.77 0.82 0.32 0.42 0.36 0.47 0.83 0.72 0.71 0.02 0.04 0.65 0.33 0.54 0.47
Cpa|evm.model.tig00020563.32 (tig00020563_g11215.t1)
0.5 0.61 0.58 0.51 0.41 0.43 0.59 0.76 0.81 1.0 0.89 0.81 0.53 0.21 0.43 0.47 0.44 0.8 0.69 0.63 0.03 0.1 0.42 0.49 0.28 0.21
Cpa|evm.model.tig00020603.6 (tig00020603_g11739.t1)
0.64 0.52 0.17 0.3 0.53 0.51 0.76 0.62 1.0 0.95 0.98 0.71 0.35 0.09 0.2 0.07 0.21 0.41 0.34 0.26 0.0 0.46 0.09 0.27 0.14 0.08
Cpa|evm.model.tig00020614.63 (tig00020614_g12175.t1)
0.87 1.0 0.48 0.25 0.22 0.33 0.58 0.79 0.67 0.6 0.49 0.36 0.71 0.09 0.11 0.06 0.27 0.52 0.35 0.41 0.01 0.06 0.21 0.14 0.36 0.22
0.9 0.62 0.45 0.56 0.86 0.82 0.87 0.94 1.0 0.99 0.92 0.96 0.84 0.63 0.51 0.56 0.55 0.95 0.77 0.5 0.05 0.73 0.57 0.51 0.58 0.58
Cpa|evm.model.tig00020660.7 (tig00020660_g12504.t1)
0.83 0.75 0.51 0.52 0.63 0.7 0.94 0.95 1.0 0.93 0.87 0.76 0.91 0.44 0.68 0.48 0.7 0.89 0.73 0.73 0.09 0.28 0.83 0.62 0.59 0.47
Cpa|evm.model.tig00020734.28 (tig00020734_g13584.t1)
0.57 0.72 0.49 0.48 0.53 0.53 0.5 0.62 1.0 1.0 0.96 0.94 0.4 0.13 0.32 0.1 0.41 0.66 0.49 0.68 0.09 0.54 0.47 0.57 0.24 0.31
Cpa|evm.model.tig00020780.25 (tig00020780_g13778.t1)
0.8 0.68 0.61 0.66 0.6 0.58 0.87 0.88 0.94 0.97 0.99 1.0 0.74 0.53 0.58 0.68 0.51 0.99 0.92 0.59 0.21 0.94 0.4 0.8 0.76 0.58
Cpa|evm.model.tig00020903.38 (tig00020903_g15106.t1)
0.89 0.7 0.7 0.78 0.8 0.78 0.83 0.85 0.81 0.75 0.84 0.99 1.0 0.53 0.51 0.59 0.57 0.79 0.57 0.62 0.31 0.64 0.61 0.56 0.67 0.58
Cpa|evm.model.tig00020927.27 (tig00020927_g15956.t1)
0.71 0.66 0.39 0.5 0.61 0.65 0.76 0.96 0.91 0.86 1.0 0.74 0.62 0.4 0.46 0.42 0.59 0.93 0.7 0.54 0.03 0.17 0.72 0.47 0.57 0.43
Cpa|evm.model.tig00020943.97 (tig00020943_g16338.t1)
0.92 0.81 0.61 0.6 0.65 0.48 0.83 1.0 0.82 0.81 0.78 0.69 0.99 0.41 0.36 0.66 0.55 0.87 0.68 0.72 0.15 0.06 0.74 0.62 0.45 0.62
0.53 0.62 0.36 0.72 0.93 0.44 0.77 0.81 0.69 0.69 0.95 0.82 1.0 0.32 0.15 0.18 0.16 0.43 0.11 0.11 0.27 0.53 0.75 0.44 0.65 0.47
Cpa|evm.model.tig00020965.56 (tig00020965_g16868.t1)
0.74 0.53 0.34 0.26 0.37 0.52 0.87 1.0 0.95 0.98 0.94 0.74 0.53 0.19 0.38 0.23 0.48 0.83 0.63 0.68 0.18 0.14 0.5 0.89 0.41 0.25
Cpa|evm.model.tig00021179.44 (tig00021179_g19258.t1)
0.86 1.0 0.7 0.55 0.38 0.47 0.6 0.77 0.86 0.7 0.83 0.85 0.81 0.25 0.06 0.23 0.16 0.54 0.39 0.26 0.11 0.25 0.13 0.17 0.49 0.26
Cpa|evm.model.tig00021221.10 (tig00021221_g19352.t1)
0.79 0.88 0.52 0.48 0.3 0.28 0.67 0.75 0.75 0.77 0.87 0.89 0.7 0.3 0.3 0.37 0.43 1.0 0.55 0.52 0.06 0.19 0.62 0.71 0.65 0.57
Cpa|evm.model.tig00021244.19 (tig00021244_g19576.t1)
0.69 0.64 0.39 0.33 0.35 0.45 0.74 0.81 0.84 1.0 0.98 0.84 0.66 0.36 0.38 0.34 0.71 0.86 0.73 0.63 0.02 0.18 0.27 0.36 0.42 0.28
Cpa|evm.model.tig00021244.20 (tig00021244_g19576.t1)
0.79 0.61 0.33 0.31 0.35 0.51 0.69 0.81 0.91 0.95 1.0 0.7 0.6 0.33 0.37 0.31 0.63 0.56 0.7 0.56 0.02 0.15 0.18 0.35 0.36 0.24
Cpa|evm.model.tig00021319.44 (tig00021319_g20238.t1)
0.81 0.85 0.58 0.52 0.65 0.86 1.0 0.95 0.92 0.82 0.69 0.61 0.63 0.13 0.25 0.24 0.51 0.75 0.59 0.75 0.03 0.25 0.54 0.31 0.44 0.26
Cpa|evm.model.tig00021319.48 (tig00021319_g20242.t1)
0.84 1.0 0.63 0.44 0.38 0.32 0.35 0.44 0.43 0.56 0.63 0.66 0.68 0.07 0.23 0.08 0.35 0.62 0.51 0.61 0.03 0.25 0.26 0.45 0.23 0.19
Cpa|evm.model.tig00021464.39 (tig00021464_g21745.t1)
0.76 0.73 0.39 0.29 0.41 0.61 0.97 1.0 0.92 0.96 0.79 0.62 0.69 0.37 0.48 0.31 0.69 0.91 0.66 0.63 0.16 0.29 0.68 0.61 0.55 0.33
Cpa|evm.model.tig00021464.56 (tig00021464_g21759.t1)
0.79 0.84 0.49 0.31 0.34 0.56 0.81 0.93 0.83 0.84 0.73 0.57 0.48 0.08 0.15 0.08 0.42 1.0 0.61 0.69 0.06 0.11 0.6 0.34 0.42 0.24
Cpa|evm.model.tig00021464.7 (tig00021464_g21714.t1)
1.0 0.93 0.44 0.25 0.25 0.38 0.68 0.8 0.75 0.77 0.77 0.73 0.79 0.2 0.21 0.19 0.46 0.62 0.46 0.55 0.24 0.18 0.49 0.58 0.49 0.32
Cpa|evm.model.tig00021489.35 (tig00021489_g21687.t1)
0.59 0.51 0.44 0.58 0.41 0.44 0.74 0.56 0.43 0.56 0.76 0.75 0.37 0.35 0.22 0.4 0.2 1.0 0.64 0.59 0.05 0.39 0.23 0.22 0.25 0.54
Cpa|evm.model.tig00021525.9 (tig00021525_g22126.t1)
0.78 0.55 0.45 0.68 0.73 0.57 0.99 0.95 1.0 0.95 0.85 0.74 0.76 0.42 0.43 0.36 0.67 0.83 0.73 0.53 0.14 0.24 0.62 0.7 0.75 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)