Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.159 (tig00000042_g15556.t1)	1.0	0.88	0.83	0.71	0.44	0.42	0.61	0.92	0.72	0.72	0.66	0.59	0.71	0.12	0.28	0.13	0.37	0.56	0.55	0.65	0.0	0.06	0.09	0.18	0.47	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000056.32 (tig00000056_g24079.t1)	0.89	0.53	0.36	0.25	0.23	0.37	0.65	0.74	0.85	1.0	0.77	0.66	0.53	0.18	0.14	0.09	0.34	0.63	0.47	0.56	0.0	0.03	0.23	0.34	0.33	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000093.240 (tig00000093_g3664.t1)	0.82	0.5	0.34	0.62	0.76	0.53	0.72	0.69	0.67	0.69	0.68	0.52	0.41	0.41	0.34	0.31	0.28	0.76	0.46	0.15	0.0	0.07	0.4	0.43	1.0	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000113.95 (tig00000113_g5677.t1)	0.66	0.33	0.4	0.36	0.16	0.2	0.55	1.0	0.67	0.72	0.64	0.55	0.45	0.13	0.12	0.05	0.18	0.97	0.57	0.58	0.05	0.29	0.2	0.33	0.27	0.22
Cpa\|evm.model.tig00000128.7 (tig00000128_g7207.t1)	0.77	0.54	0.74	0.56	0.35	0.36	0.65	1.0	0.78	0.59	0.49	0.34	0.48	0.11	0.18	0.15	0.27	0.53	0.49	0.63	0.01	0.07	0.03	0.05	0.25	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000140.10 (tig00000140_g8469.t1)	0.92	0.86	0.52	0.3	0.32	0.47	0.89	1.0	0.94	0.93	0.84	0.69	0.67	0.1	0.23	0.15	0.47	0.75	0.47	0.69	0.02	0.13	0.48	0.44	0.41	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000140.11 (tig00000140_g8469.t1)	0.94	0.93	0.56	0.31	0.4	0.64	0.9	1.0	0.98	1.0	0.87	0.7	0.65	0.11	0.28	0.15	0.51	0.71	0.62	0.79	0.02	0.07	0.32	0.38	0.29	0.2
Cpa\|evm.model.tig00000157.41 (tig00000157_g9631.t1)	0.41	0.52	0.43	0.41	0.5	0.62	0.54	0.74	1.0	0.98	0.86	0.78	0.23	0.33	0.63	0.35	0.57	0.9	0.84	0.69	0.04	0.04	0.62	0.73	0.45	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000178.19 (tig00000178_g12729.t1)	0.37	0.55	0.48	0.51	0.54	0.44	0.67	0.74	0.84	1.0	0.87	0.73	0.46	0.61	0.42	0.33	0.59	0.58	0.5	0.61	0.06	0.38	0.31	0.34	0.5	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000194.35 (tig00000194_g14763.t1)	0.69	1.0	0.52	0.26	0.17	0.29	0.51	0.68	0.71	0.72	0.66	0.61	0.54	0.02	0.07	0.01	0.16	0.39	0.26	0.27	0.01	0.08	0.25	0.26	0.28	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000217.41 (tig00000217_g19172.t1)	0.7	0.69	0.6	0.69	0.54	0.54	0.66	0.68	0.54	0.47	0.52	0.55	0.79	0.38	0.46	0.48	0.37	1.0	0.49	0.48	0.05	0.18	0.48	0.49	0.63	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000241.153 (tig00000241_g21018.t1)	0.19	0.45	0.65	0.73	0.7	0.55	0.83	0.7	0.94	1.0	0.86	0.83	0.25	0.64	0.58	0.53	0.51	0.77	0.61	0.76	0.15	0.58	0.58	0.86	0.48	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000241.50 (tig00000241_g20912.t1)	0.74	1.0	0.57	0.34	0.22	0.29	0.34	0.42	0.39	0.38	0.41	0.46	0.52	0.05	0.12	0.04	0.21	0.29	0.25	0.31	0.0	0.1	0.06	0.15	0.13	0.08
Cpa\|evm.model.tig00000254.121 (tig00000254_g22581.t1)	0.79	0.54	0.56	0.59	0.53	0.47	0.72	0.84	0.78	0.91	0.94	0.98	0.89	0.35	0.47	0.41	0.58	1.0	0.67	0.84	0.03	0.74	0.48	0.73	0.76	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000342.59 (tig00000342_g24244.t1)	0.81	0.95	0.53	0.46	0.54	0.54	0.79	0.96	0.87	0.98	0.94	0.7	0.35	0.07	0.18	0.07	0.44	1.0	0.55	0.66	0.03	0.3	0.58	0.62	0.43	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000367.42 (tig00000367_g24479.t1)	0.67	1.0	0.43	0.16	0.09	0.16	0.32	0.43	0.48	0.46	0.43	0.4	0.47	0.05	0.12	0.02	0.19	0.23	0.21	0.28	0.0	0.03	0.07	0.1	0.13	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000402.25 (tig00000402_g203.t1)	0.63	0.74	0.71	0.73	0.81	0.73	0.68	0.74	0.74	0.84	0.93	1.0	0.87	0.54	0.49	0.52	0.5	0.88	0.65	0.61	0.1	0.71	0.44	0.48	0.64	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000402.30 (tig00000402_g208.t1)	1.0	0.77	0.64	0.89	0.87	0.67	0.79	0.77	0.73	0.73	0.96	0.87	1.0	0.5	0.38	0.44	0.53	0.8	0.59	0.37	0.42	0.45	0.75	0.69	0.76	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000402.36 (tig00000402_g214.t1)	0.79	1.0	0.81	0.48	0.28	0.16	0.39	0.53	0.48	0.54	0.62	0.65	0.61	0.35	0.25	0.25	0.43	0.73	0.35	0.42	0.06	0.4	0.41	0.67	0.62	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000411.24 (tig00000411_g525.t1)	0.35	1.0	0.62	0.34	0.19	0.1	0.26	0.48	0.34	0.69	0.62	0.67	0.59	0.25	0.25	0.24	0.32	0.65	0.5	0.34	0.01	0.21	0.32	0.42	0.82	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000441.27 (tig00000441_g720.t1)	0.18	0.69	0.36	0.44	0.44	0.57	0.58	0.6	0.78	0.84	0.72	0.6	0.15	0.4	0.58	0.47	0.57	0.99	0.9	0.51	0.09	0.36	0.65	1.0	0.36	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000448.49 (tig00000448_g880.t1)	0.98	0.9	0.93	0.91	0.87	0.94	0.97	0.85	0.78	0.81	0.74	0.95	1.0	0.48	0.69	0.64	0.42	0.82	0.58	0.53	0.22	0.24	0.89	0.57	0.53	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000471.12 (tig00000471_g1187.t1)	0.65	1.0	0.53	0.29	0.24	0.28	0.47	0.61	0.62	0.65	0.57	0.51	0.57	0.1	0.11	0.06	0.2	0.21	0.18	0.33	0.02	0.06	0.12	0.14	0.29	0.2
Cpa\|evm.model.tig00000523.20 (tig00000523_g1839.t1)	0.85	0.6	0.51	0.45	0.41	0.49	0.75	0.84	0.91	1.0	0.88	0.78	0.68	0.36	0.41	0.3	0.54	1.0	0.72	0.65	0.04	0.2	0.58	0.52	0.37	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000711.7 (tig00000711_g3368.t1)	1.0	0.85	0.38	0.18	0.23	0.49	0.77	0.87	0.77	0.73	0.61	0.52	0.73	0.14	0.21	0.08	0.34	0.48	0.42	0.42	0.02	0.22	0.29	0.31	0.32	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000718.40 (tig00000718_g3715.t1)	1.0	0.77	0.51	0.32	0.37	0.51	0.66	0.71	0.64	0.61	0.57	0.57	0.84	0.07	0.15	0.08	0.33	0.63	0.48	0.61	0.01	0.05	0.2	0.22	0.28	0.18
Cpa\|evm.model.tig00000737.17 (tig00000737_g3796.t1)	0.67	0.8	0.71	0.41	0.26	0.33	0.63	0.81	0.84	1.0	0.9	0.89	0.67	0.17	0.29	0.21	0.37	0.61	0.5	0.55	0.01	0.12	0.21	0.19	0.36	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000737.25 (tig00000737_g3806.t1)	0.2	0.29	0.39	0.48	0.4	0.4	0.6	0.59	0.6	1.0	0.89	0.64	0.21	0.31	0.23	0.2	0.4	0.6	0.63	0.63	0.01	0.56	0.27	0.27	0.74	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000737.26 (tig00000737_g3807.t1)	0.14	0.28	0.36	0.54	0.44	0.33	0.7	0.63	0.57	1.0	0.86	0.67	0.21	0.42	0.33	0.32	0.66	0.65	0.6	0.9	0.0	0.27	0.18	0.23	0.37	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000737.27 (tig00000737_g3807.t1)	0.2	0.26	0.35	0.55	0.34	0.29	0.74	0.68	0.65	0.95	1.0	0.76	0.19	0.34	0.23	0.26	0.52	0.64	0.47	0.76	0.0	0.49	0.15	0.42	0.48	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000821.15 (tig00000821_g4474.t1)	0.7	0.59	0.45	0.41	0.48	0.52	0.7	0.63	0.7	0.89	0.9	1.0	0.69	0.46	0.53	0.45	0.58	0.77	0.62	0.59	0.08	0.88	0.5	0.77	0.59	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000841.10 (tig00000841_g4735.t1)	0.27	0.43	0.58	0.61	0.36	0.47	0.52	0.66	0.95	1.0	0.91	0.79	0.17	0.26	0.55	0.28	0.57	0.65	0.74	0.61	0.02	0.13	0.46	0.56	0.43	0.42
Cpa\|evm.model.tig00001071.13 (tig00001071_g6804.t1)	0.68	0.64	0.6	0.56	0.53	0.49	0.78	0.86	0.93	1.0	0.93	0.9	0.78	0.41	0.6	0.62	0.59	0.85	0.77	0.57	0.11	0.85	0.61	0.56	0.64	0.62
Cpa\|evm.model.tig00001333.23 (tig00001333_g8193.t1)	0.75	0.98	1.0	0.69	0.44	0.38	0.51	0.9	0.73	0.67	0.67	0.55	0.68	0.16	0.27	0.04	0.44	0.69	0.64	0.76	0.0	0.1	0.2	0.17	0.81	0.34
Cpa\|evm.model.tig00001542.20 (tig00001542_g9327.t1)	0.22	0.13	0.25	0.37	0.26	0.31	0.44	0.4	0.49	0.94	0.67	0.94	0.21	0.33	0.49	0.43	0.38	0.63	1.0	0.52	0.02	0.02	0.49	0.48	0.15	0.23
Cpa\|evm.model.tig00020554.34 (tig00020554_g10819.t1)	1.0	0.93	0.52	0.28	0.23	0.29	0.6	0.76	0.8	0.86	0.73	0.63	0.75	0.23	0.44	0.25	0.47	0.54	0.52	0.57	0.01	0.06	0.25	0.28	0.36	0.22
Cpa\|evm.model.tig00020554.35 (tig00020554_g10819.t1)	1.0	0.94	0.53	0.28	0.19	0.18	0.64	0.81	0.79	0.94	0.75	0.58	0.6	0.22	0.47	0.29	0.54	0.85	0.53	0.53	0.02	0.07	0.49	0.44	0.5	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020562.40 (tig00020562_g11165.t1)	0.92	1.0	0.54	0.32	0.22	0.27	0.4	0.44	0.44	0.41	0.45	0.44	0.71	0.11	0.09	0.05	0.34	0.22	0.2	0.19	0.03	0.11	0.14	0.19	0.24	0.11
Cpa\|evm.model.tig00020562.9 (tig00020562_g11138.t1)	0.89	0.52	0.4	0.66	0.64	0.52	0.9	1.0	0.96	0.93	0.99	0.72	0.63	0.22	0.46	0.2	0.53	0.83	0.72	0.5	0.16	0.15	0.62	0.56	0.53	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020563.150 (tig00020563_g11352.t1)	0.86	0.4	0.38	0.38	0.5	0.49	0.9	0.9	0.93	1.0	0.87	0.77	0.82	0.32	0.42	0.36	0.47	0.83	0.72	0.71	0.02	0.04	0.65	0.33	0.54	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020563.32 (tig00020563_g11215.t1)	0.5	0.61	0.58	0.51	0.41	0.43	0.59	0.76	0.81	1.0	0.89	0.81	0.53	0.21	0.43	0.47	0.44	0.8	0.69	0.63	0.03	0.1	0.42	0.49	0.28	0.21
Cpa\|evm.model.tig00020603.6 (tig00020603_g11739.t1)	0.64	0.52	0.17	0.3	0.53	0.51	0.76	0.62	1.0	0.95	0.98	0.71	0.35	0.09	0.2	0.07	0.21	0.41	0.34	0.26	0.0	0.46	0.09	0.27	0.14	0.08
Cpa\|evm.model.tig00020614.63 (tig00020614_g12175.t1)	0.87	1.0	0.48	0.25	0.22	0.33	0.58	0.79	0.67	0.6	0.49	0.36	0.71	0.09	0.11	0.06	0.27	0.52	0.35	0.41	0.01	0.06	0.21	0.14	0.36	0.22
Cpa\|evm.model.tig00020629.138	0.9	0.62	0.45	0.56	0.86	0.82	0.87	0.94	1.0	0.99	0.92	0.96	0.84	0.63	0.51	0.56	0.55	0.95	0.77	0.5	0.05	0.73	0.57	0.51	0.58	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020660.7 (tig00020660_g12504.t1)	0.83	0.75	0.51	0.52	0.63	0.7	0.94	0.95	1.0	0.93	0.87	0.76	0.91	0.44	0.68	0.48	0.7	0.89	0.73	0.73	0.09	0.28	0.83	0.62	0.59	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020734.28 (tig00020734_g13584.t1)	0.57	0.72	0.49	0.48	0.53	0.53	0.5	0.62	1.0	1.0	0.96	0.94	0.4	0.13	0.32	0.1	0.41	0.66	0.49	0.68	0.09	0.54	0.47	0.57	0.24	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020780.25 (tig00020780_g13778.t1)	0.8	0.68	0.61	0.66	0.6	0.58	0.87	0.88	0.94	0.97	0.99	1.0	0.74	0.53	0.58	0.68	0.51	0.99	0.92	0.59	0.21	0.94	0.4	0.8	0.76	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020903.38 (tig00020903_g15106.t1)	0.89	0.7	0.7	0.78	0.8	0.78	0.83	0.85	0.81	0.75	0.84	0.99	1.0	0.53	0.51	0.59	0.57	0.79	0.57	0.62	0.31	0.64	0.61	0.56	0.67	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020927.27 (tig00020927_g15956.t1)	0.71	0.66	0.39	0.5	0.61	0.65	0.76	0.96	0.91	0.86	1.0	0.74	0.62	0.4	0.46	0.42	0.59	0.93	0.7	0.54	0.03	0.17	0.72	0.47	0.57	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020943.97 (tig00020943_g16338.t1)	0.92	0.81	0.61	0.6	0.65	0.48	0.83	1.0	0.82	0.81	0.78	0.69	0.99	0.41	0.36	0.66	0.55	0.87	0.68	0.72	0.15	0.06	0.74	0.62	0.45	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020965.19	0.53	0.62	0.36	0.72	0.93	0.44	0.77	0.81	0.69	0.69	0.95	0.82	1.0	0.32	0.15	0.18	0.16	0.43	0.11	0.11	0.27	0.53	0.75	0.44	0.65	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020965.56 (tig00020965_g16868.t1)	0.74	0.53	0.34	0.26	0.37	0.52	0.87	1.0	0.95	0.98	0.94	0.74	0.53	0.19	0.38	0.23	0.48	0.83	0.63	0.68	0.18	0.14	0.5	0.89	0.41	0.25
Cpa\|evm.model.tig00021179.44 (tig00021179_g19258.t1)	0.86	1.0	0.7	0.55	0.38	0.47	0.6	0.77	0.86	0.7	0.83	0.85	0.81	0.25	0.06	0.23	0.16	0.54	0.39	0.26	0.11	0.25	0.13	0.17	0.49	0.26
Cpa\|evm.model.tig00021221.10 (tig00021221_g19352.t1)	0.79	0.88	0.52	0.48	0.3	0.28	0.67	0.75	0.75	0.77	0.87	0.89	0.7	0.3	0.3	0.37	0.43	1.0	0.55	0.52	0.06	0.19	0.62	0.71	0.65	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021244.19 (tig00021244_g19576.t1)	0.69	0.64	0.39	0.33	0.35	0.45	0.74	0.81	0.84	1.0	0.98	0.84	0.66	0.36	0.38	0.34	0.71	0.86	0.73	0.63	0.02	0.18	0.27	0.36	0.42	0.28
Cpa\|evm.model.tig00021244.20 (tig00021244_g19576.t1)	0.79	0.61	0.33	0.31	0.35	0.51	0.69	0.81	0.91	0.95	1.0	0.7	0.6	0.33	0.37	0.31	0.63	0.56	0.7	0.56	0.02	0.15	0.18	0.35	0.36	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021319.44 (tig00021319_g20238.t1)	0.81	0.85	0.58	0.52	0.65	0.86	1.0	0.95	0.92	0.82	0.69	0.61	0.63	0.13	0.25	0.24	0.51	0.75	0.59	0.75	0.03	0.25	0.54	0.31	0.44	0.26
Cpa\|evm.model.tig00021319.48 (tig00021319_g20242.t1)	0.84	1.0	0.63	0.44	0.38	0.32	0.35	0.44	0.43	0.56	0.63	0.66	0.68	0.07	0.23	0.08	0.35	0.62	0.51	0.61	0.03	0.25	0.26	0.45	0.23	0.19
Cpa\|evm.model.tig00021464.39 (tig00021464_g21745.t1)	0.76	0.73	0.39	0.29	0.41	0.61	0.97	1.0	0.92	0.96	0.79	0.62	0.69	0.37	0.48	0.31	0.69	0.91	0.66	0.63	0.16	0.29	0.68	0.61	0.55	0.33
Cpa\|evm.model.tig00021464.56 (tig00021464_g21759.t1)	0.79	0.84	0.49	0.31	0.34	0.56	0.81	0.93	0.83	0.84	0.73	0.57	0.48	0.08	0.15	0.08	0.42	1.0	0.61	0.69	0.06	0.11	0.6	0.34	0.42	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021464.7 (tig00021464_g21714.t1)	1.0	0.93	0.44	0.25	0.25	0.38	0.68	0.8	0.75	0.77	0.77	0.73	0.79	0.2	0.21	0.19	0.46	0.62	0.46	0.55	0.24	0.18	0.49	0.58	0.49	0.32
Cpa\|evm.model.tig00021489.35 (tig00021489_g21687.t1)	0.59	0.51	0.44	0.58	0.41	0.44	0.74	0.56	0.43	0.56	0.76	0.75	0.37	0.35	0.22	0.4	0.2	1.0	0.64	0.59	0.05	0.39	0.23	0.22	0.25	0.54
Cpa\|evm.model.tig00021525.9 (tig00021525_g22126.t1)	0.78	0.55	0.45	0.68	0.73	0.57	0.99	0.95	1.0	0.95	0.85	0.74	0.76	0.42	0.43	0.36	0.67	0.83	0.73	0.53	0.14	0.24	0.62	0.7	0.75	0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)