Heatmap: Cluster_200 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1153 (1153)	0.42	0.4	0.97	0.69	0.51	0.78	0.7	0.46	1.0	0.72	0.45
Transcript_contig_1194 (1194)	0.62	0.82	0.61	0.52	0.83	1.0	0.74	0.65	0.44	0.57	0.57
Transcript_contig_1662 (1662)	0.33	0.38	0.25	0.29	0.21	0.39	0.36	0.25	1.0	0.29	0.21
Transcript_contig_2322 (2322)	0.04	0.06	0.02	0.07	0.08	0.17	0.05	0.0	1.0	0.27	0.12
Transcript_contig_3320 (3320)	0.13	0.0	0.2	0.58	0.53	0.5	0.45	0.0	1.0	0.7	0.5
Transcript_contig_4897 (4897)	0.25	0.22	0.21	0.33	0.4	0.19	0.21	0.14	1.0	0.4	0.29
Transcript_contig_510 (510)	0.32	0.02	0.38	0.27	0.22	0.58	0.3	0.0	1.0	0.54	0.7
Transcript_contig_53919 (53919)	0.72	0.69	0.75	0.64	0.43	0.81	0.94	0.6	1.0	0.74	0.55
Transcript_contig_54191 (54191)	0.78	0.65	0.26	0.55	0.55	0.6	0.56	0.3	0.86	1.0	0.72
Transcript_contig_5492 (5492)	0.42	0.52	0.44	0.6	0.62	1.0	0.57	0.15	0.95	0.44	0.33
Transcript_contig_55655 (55655)	0.2	0.15	0.24	0.26	0.25	0.41	0.21	0.04	1.0	0.57	0.37
Transcript_contig_55739 (55739)	0.38	0.39	0.27	0.19	0.17	0.43	0.31	0.2	1.0	0.52	0.38
Transcript_contig_55851 (55851)	0.4	0.3	0.16	0.56	0.76	0.34	0.33	0.22	0.28	1.0	0.65
Transcript_contig_56175 (56175)	0.43	0.39	0.39	0.39	0.39	0.56	0.57	0.22	1.0	0.51	0.34
Transcript_contig_56255 (56255)	0.58	0.51	0.89	0.77	0.59	0.88	1.0	0.51	0.99	0.81	0.58
Transcript_contig_56607 (56607)	0.4	0.32	0.65	0.72	0.66	0.66	0.69	0.34	1.0	0.76	0.55
Transcript_contig_56689 (56689)	0.57	0.76	0.97	1.0	0.41	0.9	0.69	0.24	0.65	0.63	0.58
Transcript_contig_56709 (56709)	0.37	0.41	0.29	0.55	0.41	0.46	0.48	0.32	1.0	0.59	0.36
Transcript_contig_57013 (57013)	0.27	0.2	0.29	0.54	0.45	0.53	0.4	0.12	1.0	0.33	0.3
Transcript_contig_57080 (57080)	0.46	0.36	0.51	0.62	0.56	0.88	0.76	0.18	1.0	0.58	0.36
Transcript_contig_57467 (57467)	0.57	0.58	0.45	0.66	0.27	0.69	0.56	0.68	1.0	0.64	0.34
Transcript_contig_57650 (57650)	0.65	0.6	0.88	0.69	0.89	1.0	0.71	0.6	0.93	0.64	0.44
Transcript_contig_57674 (57674)	0.29	0.24	0.29	0.5	0.33	0.18	0.28	0.04	1.0	0.24	0.24
Transcript_contig_58798 (58798)	0.17	0.14	0.21	0.21	0.21	0.19	0.29	0.07	1.0	0.26	0.15
Transcript_contig_59340 (59340)	0.45	0.43	0.96	0.73	0.23	1.0	0.63	0.1	0.39	0.73	0.45
Transcript_contig_60520 (60520)	0.39	0.36	1.0	0.48	0.19	0.32	0.32	0.28	0.98	0.73	0.6
Transcript_contig_60807 (60807)	0.35	0.15	0.51	0.66	0.46	0.55	0.64	0.09	0.35	1.0	0.67
Transcript_contig_61292 (61292)	0.49	0.35	0.49	0.44	0.35	0.68	0.69	0.2	1.0	0.56	0.37
Transcript_contig_61368 (61368)	0.64	0.54	0.35	0.62	0.86	0.45	0.62	0.4	1.0	0.96	0.76
Transcript_contig_61721 (61721)	0.37	0.32	0.56	0.49	0.32	0.54	0.34	0.07	1.0	0.71	0.46
Transcript_contig_61765 (61765)	0.29	0.16	0.58	0.83	0.36	1.0	0.64	0.06	0.02	0.72	0.3
Transcript_contig_6195 (6195)	0.4	0.33	0.14	0.26	0.21	0.46	0.29	0.22	1.0	0.71	0.5
Transcript_contig_64264 (64264)	0.31	0.23	0.27	0.61	1.0	0.45	0.57	0.17	0.02	0.75	0.56
Transcript_contig_68802 (68802)	0.69	0.74	1.0	0.74	0.34	0.63	0.97	0.31	0.83	0.76	0.58
Transcript_contig_68957 (68957)	0.55	0.52	0.47	0.65	1.0	0.82	0.68	0.47	0.28	0.81	0.48
Transcript_contig_69505 (69505)	0.36	0.28	0.51	0.53	0.51	1.0	0.69	0.26	0.88	0.73	0.39
Transcript_contig_70148 (70148)	0.15	0.1	0.18	0.3	0.42	0.13	0.29	0.08	1.0	0.06	0.08
Transcript_contig_71950 (71950)	0.24	0.07	0.31	0.32	0.36	0.65	0.44	0.05	0.88	1.0	0.82
Transcript_contig_72887 (72887)	0.45	0.29	0.49	0.56	0.74	0.62	0.56	0.11	0.67	1.0	0.85
Transcript_contig_73986 (73986)	0.49	0.45	0.5	0.54	0.55	0.91	0.62	0.35	0.88	1.0	0.76
Transcript_contig_78156 (78156)	0.41	0.49	0.41	0.87	1.0	0.93	0.71	0.41	0.63	0.93	0.55
Transcript_contig_78372 (78372)	0.27	0.23	0.37	0.35	0.24	0.32	0.33	0.12	1.0	0.23	0.22
Transcript_contig_78587 (78587)	0.54	0.39	0.18	0.42	0.5	0.38	0.57	0.29	0.38	1.0	0.54
Transcript_contig_78625 (78625)	0.23	0.25	0.39	0.3	0.14	0.25	0.18	0.12	1.0	0.44	0.23
Transcript_contig_78717 (78717)	0.63	0.67	0.45	0.91	0.93	1.0	0.52	0.34	0.76	0.85	0.61
Transcript_contig_78965 (78965)	0.37	0.25	0.17	0.19	0.29	0.4	0.29	0.14	1.0	0.38	0.29
Transcript_contig_79223 (79223)	0.21	0.09	0.27	0.3	0.17	0.27	0.3	0.09	1.0	0.22	0.2
Transcript_contig_8054 (8054)	0.46	0.59	0.43	0.37	0.72	1.0	0.97	0.52	0.39	0.67	0.31
Transcript_contig_80592 (80592)	0.34	0.19	0.56	0.76	1.0	0.43	0.41	0.05	0.58	0.85	0.41
Transcript_contig_80715 (80715)	0.12	0.03	0.17	0.17	0.05	0.34	0.25	0.01	1.0	0.3	0.15
Transcript_contig_80716 (80716)	0.28	0.23	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.22	1.0	0.71	0.43
Transcript_contig_80816 (80816)	0.42	0.45	1.0	0.63	0.98	0.64	0.61	0.4	0.63	0.46	0.24
Transcript_contig_81976 (81976)	0.41	0.3	0.37	0.66	0.48	1.0	0.62	0.13	0.77	0.77	0.65
Transcript_contig_82053 (82053)	0.46	0.43	0.28	0.34	0.36	0.4	0.44	0.28	1.0	0.35	0.24
Transcript_contig_82320 (82320)	0.26	0.18	0.79	0.5	0.39	1.0	0.57	0.09	0.83	0.88	0.75
Transcript_contig_89458 (89458)	0.24	0.21	0.25	0.45	0.47	0.39	0.39	0.13	1.0	0.44	0.21
Transcript_contig_89567 (89567)	0.28	0.25	0.19	0.65	0.58	0.54	0.89	0.1	0.24	1.0	0.69
Transcript_contig_89701 (89701)	0.3	0.2	0.64	0.75	0.64	0.74	0.69	0.09	1.0	0.66	0.32
Transcript_contig_90022 (90022)	0.38	0.42	0.81	0.95	0.49	1.0	0.46	0.37	0.67	0.28	0.45
Transcript_contig_90168 (90168)	0.23	0.22	0.39	0.4	0.46	0.54	0.36	0.24	1.0	0.28	0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)