Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11236 (11236)	0.31	0.09	0.63	0.64	0.66	0.28	1.0	0.11	0.0	0.29	0.12
Transcript_contig_15535 (15535)	0.31	0.02	0.27	0.46	0.12	0.15	1.0	0.0	0.0	0.39	0.11
Transcript_contig_18995 (18995)	0.59	0.04	0.39	0.34	0.34	0.25	1.0	0.0	0.0	0.08	0.12
Transcript_contig_3151 (3151)	0.5	0.21	0.48	0.61	0.28	0.6	1.0	0.05	0.01	0.14	0.15
Transcript_contig_3444 (3444)	0.77	0.96	0.53	0.57	0.49	0.38	1.0	0.35	0.31	0.55	0.46
Transcript_contig_4188 (4188)	0.21	0.1	0.04	0.13	0.1	0.32	1.0	0.01	0.0	0.03	0.01
Transcript_contig_4887 (4887)	0.58	0.69	0.17	0.47	0.36	0.59	1.0	0.51	0.06	0.35	0.33
Transcript_contig_53887 (53887)	0.78	0.71	0.15	0.44	0.5	0.37	1.0	0.8	0.24	0.34	0.21
Transcript_contig_53942 (53942)	0.8	0.98	0.37	0.64	0.53	0.25	0.8	1.0	0.0	0.27	0.09
Transcript_contig_54501 (54501)	0.51	0.34	0.65	0.56	0.29	0.3	1.0	0.32	0.05	0.16	0.11
Transcript_contig_54831 (54831)	0.43	0.32	0.2	0.43	0.64	0.7	0.96	0.43	1.0	0.42	0.34
Transcript_contig_54951 (54951)	0.22	0.0	0.87	0.31	0.34	0.55	1.0	0.0	0.07	0.33	0.19
Transcript_contig_55459 (55459)	0.76	0.56	0.47	0.67	0.38	0.39	1.0	0.31	0.01	0.27	0.2
Transcript_contig_55557 (55557)	0.6	0.35	0.34	0.49	0.4	0.43	1.0	0.22	0.25	0.56	0.39
Transcript_contig_56850 (56850)	0.55	0.28	0.38	0.5	0.38	0.28	1.0	0.17	0.15	0.29	0.15
Transcript_contig_56906 (56906)	0.35	0.15	0.36	0.34	0.3	0.36	1.0	0.11	0.04	0.16	0.13
Transcript_contig_57132 (57132)	0.87	0.61	0.23	0.53	0.66	0.56	1.0	0.35	0.21	0.55	0.37
Transcript_contig_57755 (57755)	0.44	0.16	0.65	1.0	0.39	0.33	1.0	0.07	0.09	0.09	0.09
Transcript_contig_57980 (57980)	0.52	0.01	0.53	0.83	0.5	0.23	1.0	0.01	0.04	0.02	0.05
Transcript_contig_58832 (58832)	0.6	0.43	0.6	0.62	0.34	0.39	1.0	0.54	0.01	0.16	0.14
Transcript_contig_59199 (59199)	0.55	0.5	0.32	0.28	0.22	0.5	1.0	0.34	0.22	0.22	0.13
Transcript_contig_59369 (59369)	0.41	0.23	0.1	0.17	0.12	0.4	1.0	0.19	0.01	0.12	0.09
Transcript_contig_60209 (60209)	0.33	0.09	0.55	0.34	0.25	0.37	1.0	0.22	0.02	0.12	0.09
Transcript_contig_60272 (60272)	0.37	0.16	0.43	0.29	0.12	0.4	1.0	0.26	0.01	0.15	0.11
Transcript_contig_60429 (60429)	0.18	0.0	0.57	0.31	0.25	0.23	1.0	0.03	0.0	0.09	0.04
Transcript_contig_606 (606)	0.5	0.42	0.32	0.45	0.35	0.67	1.0	0.32	0.07	0.49	0.44
Transcript_contig_61025 (61025)	0.46	0.4	0.37	0.54	0.45	0.21	1.0	0.31	0.0	0.01	0.01
Transcript_contig_61339 (61339)	0.35	0.18	0.53	0.52	0.76	0.41	1.0	0.28	0.25	0.35	0.27
Transcript_contig_61957 (61957)	0.83	0.79	0.31	0.66	0.6	0.27	1.0	0.72	0.05	0.61	0.3
Transcript_contig_66202 (66202)	0.84	0.63	0.61	0.55	0.33	0.36	1.0	0.67	0.18	0.24	0.19
Transcript_contig_67609 (67609)	0.29	0.16	0.61	0.38	0.37	0.39	1.0	0.17	0.0	0.03	0.13
Transcript_contig_69283 (69283)	0.52	0.03	0.28	0.75	0.47	0.66	1.0	0.03	0.11	0.23	0.23
Transcript_contig_71371 (71371)	0.29	0.0	0.46	0.45	0.04	0.37	1.0	0.0	0.0	0.1	0.11
Transcript_contig_72549 (72549)	0.61	0.35	0.77	0.58	0.77	1.0	0.98	0.26	0.22	0.69	0.42
Transcript_contig_78119 (78119)	0.39	0.21	0.0	0.02	0.01	0.64	1.0	0.08	0.03	0.37	0.14
Transcript_contig_78123 (78123)	0.37	0.22	0.32	0.35	0.38	0.38	1.0	0.2	0.1	0.2	0.15
Transcript_contig_78216 (78216)	0.29	0.16	0.25	0.29	0.43	0.35	1.0	0.19	0.0	0.27	0.23
Transcript_contig_78369 (78369)	0.67	0.48	0.24	0.51	0.46	0.58	1.0	0.1	0.19	0.69	0.37
Transcript_contig_78463 (78463)	0.55	0.68	0.19	0.37	0.44	0.35	1.0	0.41	0.11	0.42	0.19
Transcript_contig_78643 (78643)	0.34	0.07	0.15	0.17	0.19	0.37	1.0	0.06	0.09	0.19	0.19
Transcript_contig_78701 (78701)	0.36	0.2	0.5	0.47	0.44	0.43	1.0	0.21	0.05	0.17	0.21
Transcript_contig_78702 (78702)	0.31	0.12	0.47	0.53	0.46	0.68	1.0	0.18	0.24	0.16	0.1
Transcript_contig_79115 (79115)	0.51	0.35	0.44	0.36	0.22	0.4	1.0	0.42	0.42	0.25	0.16
Transcript_contig_79266 (79266)	0.31	0.1	0.3	0.57	0.56	0.44	1.0	0.1	0.06	0.19	0.15
Transcript_contig_79339 (79339)	0.36	0.2	0.44	0.21	0.04	0.38	1.0	0.24	0.24	0.18	0.18
Transcript_contig_79867 (79867)	0.49	0.33	0.48	0.63	0.44	0.23	1.0	0.27	0.0	0.01	0.01
Transcript_contig_80055 (80055)	0.23	0.04	0.48	0.6	0.57	0.44	1.0	0.03	0.02	0.11	0.1
Transcript_contig_80375 (80375)	0.14	0.0	0.4	0.37	0.29	0.26	1.0	0.0	0.0	0.2	0.2
Transcript_contig_80384 (80384)	0.82	0.78	0.56	0.58	0.26	0.44	1.0	0.25	0.0	0.32	0.18
Transcript_contig_80573 (80573)	0.4	0.03	0.02	0.01	0.02	0.48	1.0	0.02	0.0	0.07	0.07
Transcript_contig_85905 (85905)	0.13	0.07	0.06	0.18	0.05	0.41	1.0	0.03	0.05	0.06	0.17
Transcript_contig_89150 (89150)	0.57	0.3	0.45	0.64	0.33	0.5	1.0	0.39	0.33	0.57	0.4
Transcript_contig_89403 (89403)	0.54	0.43	0.23	0.38	0.39	0.48	1.0	0.31	0.24	0.53	0.32
Transcript_contig_89561 (89561)	0.35	0.09	0.47	0.62	0.41	0.74	1.0	0.08	0.92	0.21	0.17
Transcript_contig_90462 (90462)	0.49	0.37	0.12	0.3	0.26	0.36	1.0	0.41	0.02	0.06	0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)