Heatmap: Cluster_144 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10057 (10057)	0.2	0.09	0.22	0.3	0.05	0.13	0.21	0.02	1.0	0.34	0.35
Transcript_contig_10654 (10654)	1.0	0.26	0.93	0.41	0.64	0.0	0.14	0.21	0.0	0.69	0.73
Transcript_contig_15314 (15314)	1.0	0.55	0.7	0.93	0.59	0.07	0.77	0.94	0.32	0.9	0.63
Transcript_contig_1738 (1738)	0.09	0.0	0.92	0.45	0.25	0.24	1.0	0.0	0.0	0.18	0.71
Transcript_contig_17447 (17447)	0.53	0.12	0.05	0.01	0.03	0.77	0.21	0.02	0.94	1.0	0.85
Transcript_contig_1829 (1829)	0.92	0.88	0.43	0.34	0.27	0.53	0.44	0.49	0.09	1.0	0.86
Transcript_contig_2181 (2181)	0.43	0.44	0.22	0.47	0.54	0.29	0.44	0.35	1.0	0.41	0.46
Transcript_contig_22819 (22819)	0.41	0.31	1.0	0.39	0.02	0.07	0.1	0.26	0.77	0.45	0.51
Transcript_contig_2541 (2541)	0.69	0.47	0.15	0.12	0.01	0.14	0.66	0.38	1.0	0.48	0.58
Transcript_contig_2634 (2634)	1.0	0.92	0.21	0.63	0.82	0.4	0.71	0.98	0.23	0.99	0.9
Transcript_contig_2659 (2659)	0.72	0.69	0.45	0.47	0.55	0.49	0.58	0.49	0.51	1.0	0.58
Transcript_contig_3331 (3331)	0.3	0.12	0.09	0.11	0.03	0.05	0.08	0.05	1.0	0.58	0.35
Transcript_contig_334 (334)	0.34	0.22	0.6	0.35	0.4	0.39	0.53	0.38	1.0	0.36	0.52
Transcript_contig_4486 (4486)	0.53	0.74	0.25	0.26	0.18	0.46	1.0	0.27	0.01	0.65	0.26
Transcript_contig_4646 (4646)	1.0	0.97	0.78	0.57	0.13	0.3	0.5	0.63	0.75	0.52	0.41
Transcript_contig_54498 (54498)	0.73	0.55	1.0	0.61	0.3	0.41	0.8	0.33	0.7	0.71	0.58
Transcript_contig_54681 (54681)	0.45	0.0	0.31	0.5	0.78	0.63	0.67	0.0	1.0	0.76	0.74
Transcript_contig_54699 (54699)	1.0	0.68	0.57	0.36	0.11	0.35	0.91	0.43	0.27	0.84	0.66
Transcript_contig_54833 (54833)	0.58	0.29	0.74	0.79	0.54	0.48	0.98	0.33	0.26	1.0	0.75
Transcript_contig_55345 (55345)	0.78	0.54	0.67	0.38	0.02	0.43	1.0	0.32	0.44	0.71	0.59
Transcript_contig_55379 (55379)	1.0	0.73	0.11	0.04	0.0	0.2	0.01	0.43	0.52	0.78	0.96
Transcript_contig_55531 (55531)	0.31	0.18	0.4	0.31	0.36	0.39	0.35	0.17	1.0	0.46	0.43
Transcript_contig_56211 (56211)	0.64	0.47	0.27	0.49	0.65	0.23	0.37	0.21	0.33	1.0	0.89
Transcript_contig_56366 (56366)	0.98	0.5	0.56	0.38	0.35	0.23	0.51	0.36	0.56	1.0	0.94
Transcript_contig_56596 (56596)	0.24	0.12	0.11	0.26	0.35	0.17	0.22	0.15	1.0	0.3	0.29
Transcript_contig_56684 (56684)	0.36	0.26	0.25	0.33	0.38	0.22	0.29	0.22	1.0	0.34	0.41
Transcript_contig_57246 (57246)	0.18	0.12	0.18	0.22	0.14	0.3	0.18	0.09	1.0	0.13	0.14
Transcript_contig_57355 (57355)	0.52	0.1	0.8	0.34	0.03	0.25	0.27	0.11	1.0	0.65	0.72
Transcript_contig_57563 (57563)	0.68	0.02	0.11	0.04	0.02	0.12	0.02	0.0	0.08	1.0	1.0
Transcript_contig_57648 (57648)	0.58	0.69	0.62	0.37	0.4	0.41	0.58	1.0	0.25	0.51	0.6
Transcript_contig_57712 (57712)	0.61	0.46	0.44	0.64	0.72	0.44	0.56	0.41	1.0	0.85	0.79
Transcript_contig_57942 (57942)	0.94	0.9	0.32	0.34	0.47	0.42	0.59	0.93	0.64	1.0	0.66
Transcript_contig_57965 (57965)	0.21	0.24	0.38	0.49	0.42	0.21	0.28	0.09	1.0	0.27	0.3
Transcript_contig_58255 (58255)	0.73	0.52	0.6	1.0	0.96	0.51	0.94	0.41	0.79	0.57	0.79
Transcript_contig_58259 (58259)	0.35	0.07	0.26	0.21	0.35	0.28	0.57	0.06	1.0	0.65	0.6
Transcript_contig_58476 (58476)	0.42	0.26	0.34	0.41	0.5	0.22	0.38	0.12	1.0	0.59	0.46
Transcript_contig_58644 (58644)	0.47	0.16	0.29	0.24	0.23	0.26	0.42	0.15	0.46	1.0	0.85
Transcript_contig_59131 (59131)	1.0	0.6	0.85	0.42	0.11	0.19	0.25	0.41	0.71	0.76	0.86
Transcript_contig_59317 (59317)	0.91	0.86	0.53	0.82	0.81	0.72	0.79	1.0	0.9	0.96	0.8
Transcript_contig_59427 (59427)	0.89	0.86	0.72	0.47	0.58	0.58	0.99	0.55	0.62	1.0	0.74
Transcript_contig_59464 (59464)	0.22	0.17	0.18	0.08	0.0	0.36	0.03	0.14	1.0	0.26	0.26
Transcript_contig_59706 (59706)	0.29	0.27	0.39	0.28	0.36	0.15	0.31	0.38	1.0	0.44	0.34
Transcript_contig_59752 (59752)	0.51	0.39	0.5	0.43	0.48	0.23	0.45	0.4	1.0	0.57	0.51
Transcript_contig_60492 (60492)	0.3	0.07	0.22	0.57	0.35	0.35	0.34	0.02	1.0	0.49	0.46
Transcript_contig_6053 (6053)	0.6	0.43	0.54	0.47	0.47	0.45	0.32	0.54	0.35	1.0	0.95
Transcript_contig_60634 (60634)	0.27	0.19	0.31	0.28	0.18	0.5	0.5	0.14	1.0	0.18	0.26
Transcript_contig_61480 (61480)	0.79	1.0	0.43	0.7	0.96	0.6	0.95	0.73	0.51	0.49	0.38
Transcript_contig_6173 (6173)	0.29	0.11	0.15	0.71	0.6	0.25	0.41	0.11	1.0	0.21	0.53
Transcript_contig_61838 (61838)	0.37	0.13	0.73	1.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.28	1.0	0.76
Transcript_contig_62135 (62135)	0.45	0.27	0.34	0.44	0.39	0.4	0.37	0.15	1.0	0.63	0.52
Transcript_contig_62711 (62711)	0.49	0.44	0.34	0.39	0.37	0.49	0.6	0.29	1.0	0.43	0.45
Transcript_contig_62763 (62763)	0.34	0.03	0.18	0.18	0.41	0.18	0.06	0.0	0.62	1.0	0.58
Transcript_contig_6784 (6784)	0.3	0.2	0.03	0.1	0.31	0.1	0.16	0.15	1.0	0.2	0.34
Transcript_contig_68051 (68051)	0.65	0.66	0.13	0.29	0.22	0.27	1.0	0.15	0.0	0.76	0.86
Transcript_contig_68430 (68430)	0.36	0.28	0.63	0.61	0.6	0.32	0.54	0.11	1.0	0.78	0.75
Transcript_contig_69389 (69389)	0.18	0.09	0.14	0.23	0.2	0.16	0.21	0.04	1.0	0.28	0.21
Transcript_contig_69738 (69738)	0.98	1.0	0.28	0.46	0.65	0.45	0.81	0.56	0.67	0.8	0.71
Transcript_contig_70087 (70087)	0.82	0.73	0.27	0.48	0.67	0.53	0.53	0.46	1.0	0.44	0.41
Transcript_contig_7123 (7123)	0.22	0.05	0.07	0.56	0.67	1.0	0.65	0.05	0.38	0.42	0.62
Transcript_contig_7485 (7485)	0.38	0.02	0.27	0.24	0.62	0.28	0.4	0.0	0.31	1.0	0.8
Transcript_contig_78289 (78289)	0.44	0.03	0.18	0.15	0.05	0.51	0.18	0.05	0.99	1.0	0.98
Transcript_contig_78355 (78355)	0.48	0.46	0.29	0.27	0.22	0.2	0.32	0.32	1.0	0.48	0.36
Transcript_contig_78402 (78402)	0.54	0.28	0.52	1.0	1.0	0.6	0.97	0.12	0.46	0.99	0.7
Transcript_contig_78418 (78418)	0.51	0.48	0.41	0.41	0.36	0.48	0.46	0.53	1.0	0.65	0.62
Transcript_contig_78497 (78497)	0.49	0.19	0.37	0.37	0.36	0.2	0.33	0.15	0.83	1.0	0.87
Transcript_contig_78608 (78608)	0.88	0.65	0.28	0.56	0.68	0.44	0.49	0.46	1.0	0.94	0.69
Transcript_contig_79195 (79195)	0.84	1.0	0.3	0.5	0.69	0.35	0.58	0.92	0.85	0.73	0.54
Transcript_contig_79219 (79219)	0.85	0.74	0.31	0.76	0.41	0.39	0.55	0.94	0.46	1.0	0.79
Transcript_contig_79478 (79478)	0.75	0.61	0.33	0.67	0.79	0.34	0.69	0.53	0.12	1.0	0.79
Transcript_contig_79528 (79528)	0.44	0.46	0.21	0.28	0.57	0.16	0.41	0.6	1.0	0.85	0.57
Transcript_contig_79561 (79561)	0.44	0.0	0.22	0.11	0.26	0.56	0.5	0.0	1.0	0.46	0.51
Transcript_contig_79743 (79743)	0.21	0.0	0.12	0.85	0.0	1.0	0.6	0.0	0.0	0.4	0.79
Transcript_contig_79846 (79846)	0.65	0.28	0.46	0.85	0.96	0.52	1.0	0.32	0.72	0.92	0.73
Transcript_contig_80368 (80368)	0.67	0.25	0.56	0.47	0.21	0.19	0.35	0.11	1.0	0.62	0.77
Transcript_contig_80977 (80977)	0.09	0.0	0.27	0.24	0.24	0.17	0.22	0.0	1.0	0.15	0.09
Transcript_contig_82087 (82087)	0.66	0.54	0.67	0.51	0.56	0.54	0.8	0.38	0.3	1.0	0.71
Transcript_contig_82130 (82130)	0.66	0.62	0.33	0.47	0.65	0.45	0.44	0.45	1.0	0.67	0.63
Transcript_contig_84880 (84880)	1.0	0.48	0.22	0.21	0.05	0.26	0.87	0.39	0.59	0.62	0.86
Transcript_contig_865 (865)	0.6	0.31	0.47	0.4	0.3	0.43	1.0	0.22	0.78	0.35	0.46
Transcript_contig_8887 (8887)	0.48	0.61	0.04	0.05	0.03	0.1	0.28	0.5	1.0	0.12	0.12
Transcript_contig_89182 (89182)	1.0	0.91	0.77	0.43	0.22	0.31	0.6	0.73	0.59	0.94	0.88
Transcript_contig_89259 (89259)	0.55	0.25	0.36	0.65	0.53	0.47	0.64	0.12	0.89	1.0	0.81
Transcript_contig_89497 (89497)	0.63	0.02	0.98	0.63	0.26	0.24	0.52	0.01	0.03	1.0	0.99
Transcript_contig_89659 (89659)	0.76	0.7	0.63	0.54	0.57	0.35	0.71	0.52	0.77	1.0	0.62
Transcript_contig_89739 (89739)	0.41	0.01	0.08	0.07	0.13	0.02	0.02	0.0	0.17	0.9	1.0
Transcript_contig_89790 (89790)	0.99	0.92	0.47	0.81	0.73	0.58	0.79	0.53	0.52	1.0	0.72
Transcript_contig_89950 (89950)	0.5	0.27	0.51	0.67	0.73	0.33	0.51	0.22	1.0	0.86	0.71
Transcript_contig_90068 (90068)	0.65	0.78	0.36	0.44	0.46	0.41	0.37	1.0	0.55	0.77	0.71
Transcript_contig_90351 (90351)	0.65	0.78	0.41	0.41	0.23	0.42	0.49	1.0	0.61	0.52	0.36
Transcript_contig_90916 (90916)	0.84	0.6	0.8	0.35	0.0	0.38	0.64	0.6	1.0	0.68	0.83
Transcript_contig_90946 (90946)	0.73	0.44	0.62	0.44	0.38	0.29	0.43	0.55	0.87	0.94	1.0
Transcript_contig_91451 (91451)	0.24	0.07	0.5	0.25	0.11	0.32	0.5	0.0	1.0	0.36	0.52
Transcript_contig_916 (916)	0.46	0.01	0.3	0.28	0.08	0.05	0.11	0.0	1.0	0.53	0.51
Transcript_contig_9534 (9534)	0.21	0.04	0.0	0.24	0.53	0.13	0.44	0.0	1.0	0.03	0.13
Transcript_contig_96 (96)	0.66	0.53	0.26	0.34	0.49	0.21	0.2	0.38	1.0	0.83	0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)