Heatmap: Cluster_196 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10329 (10329)	0.0	0.32	0.0	0.12	0.0	0.1	0.33	1.0	0.45	0.0	0.0
Transcript_contig_11977 (11977)	0.36	0.5	0.07	0.31	0.36	0.11	0.56	1.0	0.0	0.04	0.0
Transcript_contig_12756 (12756)	0.51	1.0	0.34	0.08	0.0	0.0	0.21	0.85	0.0	0.38	0.0
Transcript_contig_13563 (13563)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_14937 (14937)	0.27	0.91	0.5	0.09	0.0	0.19	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_15253 (15253)	0.32	0.47	0.0	0.39	0.0	0.05	0.4	0.37	1.0	0.24	0.0
Transcript_contig_15781 (15781)	0.46	1.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_19674 (19674)	0.22	0.6	0.0	0.74	0.58	0.27	0.66	1.0	0.67	0.0	0.0
Transcript_contig_2106 (2106)	0.56	1.0	0.51	0.33	0.45	0.26	0.64	0.98	0.02	0.12	0.05
Transcript_contig_26031 (26031)	0.7	1.0	0.0	0.17	0.0	0.16	0.0	0.6	0.0	0.5	0.0
Transcript_contig_26271 (26271)	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2952 (2952)	0.77	1.0	0.45	0.47	0.65	0.28	0.8	0.78	0.05	0.19	0.15
Transcript_contig_31421 (31421)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5047 (5047)	0.19	0.62	0.15	0.32	0.47	0.09	0.57	1.0	0.03	0.04	0.04
Transcript_contig_5210 (5210)	0.09	1.0	0.0	0.44	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_53762 (53762)	0.21	0.48	0.0	0.02	0.02	0.02	0.04	1.0	0.0	0.23	0.13
Transcript_contig_53911 (53911)	0.13	0.37	0.19	0.29	0.34	0.06	0.3	1.0	0.2	0.03	0.02
Transcript_contig_55100 (55100)	0.28	0.79	0.45	0.4	0.41	0.16	0.22	1.0	0.23	0.07	0.06
Transcript_contig_55445 (55445)	0.48	0.76	0.43	0.34	0.51	0.34	0.54	1.0	0.15	0.31	0.2
Transcript_contig_56169 (56169)	0.25	0.54	0.22	0.26	0.48	0.04	0.16	1.0	0.09	0.1	0.07
Transcript_contig_56296 (56296)	0.53	0.74	0.35	0.38	0.68	0.24	0.58	1.0	0.18	0.27	0.18
Transcript_contig_56306 (56306)	0.17	0.48	0.15	0.17	0.2	0.09	0.35	1.0	0.08	0.05	0.04
Transcript_contig_5725 (5725)	0.54	1.0	0.57	0.27	0.26	0.32	0.6	0.93	0.29	0.0	0.0
Transcript_contig_57389 (57389)	0.5	0.69	0.28	0.32	0.61	0.29	0.55	1.0	0.53	0.3	0.2
Transcript_contig_57882 (57882)	0.43	0.76	0.28	0.44	0.45	0.24	0.47	1.0	0.11	0.18	0.08
Transcript_contig_58176 (58176)	0.44	0.84	0.36	0.44	0.39	0.12	0.37	1.0	0.11	0.11	0.08
Transcript_contig_58402 (58402)	0.36	0.59	0.02	0.17	0.26	0.07	0.23	1.0	0.01	0.15	0.14
Transcript_contig_58939 (58939)	0.38	0.65	0.45	0.44	0.55	0.43	0.7	1.0	0.67	0.13	0.25
Transcript_contig_59152 (59152)	0.23	0.51	0.24	0.38	0.4	0.26	0.45	1.0	0.33	0.14	0.24
Transcript_contig_60434 (60434)	0.3	0.55	0.17	0.33	0.13	0.37	0.39	1.0	0.45	0.03	0.0
Transcript_contig_60774 (60774)	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.32
Transcript_contig_61274 (61274)	0.6	0.76	0.4	0.24	0.31	0.24	0.53	1.0	0.24	0.3	0.26
Transcript_contig_62349 (62349)	0.57	0.91	0.42	0.46	0.54	0.29	0.68	1.0	0.13	0.2	0.14
Transcript_contig_62858 (62858)	0.27	0.71	0.33	0.12	0.0	0.29	0.0	1.0	0.0	0.26	0.0
Transcript_contig_63741 (63741)	0.36	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_65173 (65173)	0.42	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_6771 (6771)	0.25	0.53	0.0	0.35	0.0	0.28	0.67	1.0	0.67	0.09	0.11
Transcript_contig_67741 (67741)	0.43	0.89	0.89	0.07	0.0	0.22	0.11	1.0	0.54	0.09	0.18
Transcript_contig_67866 (67866)	0.37	0.86	0.23	0.35	0.2	0.12	0.29	1.0	0.01	0.12	0.07
Transcript_contig_6842 (6842)	0.24	0.5	0.22	0.13	0.24	0.09	0.15	1.0	0.0	0.02	0.0
Transcript_contig_69568 (69568)	0.48	1.0	0.66	0.37	0.23	0.19	0.4	0.26	0.0	0.35	0.1
Transcript_contig_70429 (70429)	0.29	0.57	0.07	0.19	0.2	0.1	0.29	1.0	0.1	0.03	0.07
Transcript_contig_70629 (70629)	0.51	0.81	0.12	0.28	0.13	0.26	0.4	1.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_7083 (7083)	0.23	0.45	0.2	0.09	0.37	0.26	0.28	1.0	0.0	0.0	0.16
Transcript_contig_71490 (71490)	0.31	0.54	0.0	0.05	0.17	0.04	0.1	1.0	0.0	0.16	0.0
Transcript_contig_72342 (72342)	0.74	1.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.16	0.51	0.0	0.4	0.12
Transcript_contig_73381 (73381)	0.06	0.73	0.79	0.2	0.0	0.11	0.25	1.0	0.0	0.11	0.0
Transcript_contig_7637 (7637)	0.52	0.72	0.36	0.25	0.23	0.15	0.41	1.0	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_78207 (78207)	0.48	0.7	0.3	0.45	0.59	0.29	0.58	1.0	0.35	0.25	0.15
Transcript_contig_78663 (78663)	0.64	0.92	0.5	0.53	0.55	0.49	0.68	1.0	0.63	0.58	0.32
Transcript_contig_79373 (79373)	0.37	0.71	0.27	0.35	0.41	0.17	0.38	1.0	0.0	0.15	0.12
Transcript_contig_80386 (80386)	0.58	0.75	0.48	0.39	0.44	0.35	0.59	1.0	0.35	0.55	0.46
Transcript_contig_8044 (8044)	0.34	0.7	0.17	0.21	0.18	0.24	0.39	1.0	0.0	0.02	0.05
Transcript_contig_82539 (82539)	0.25	0.53	0.21	0.05	0.26	0.24	0.49	1.0	0.0	0.05	0.07
Transcript_contig_8345 (8345)	0.48	1.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_84438 (84438)	0.31	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_84600 (84600)	0.23	0.41	0.09	0.17	0.0	0.05	0.14	0.0	1.0	0.05	0.04
Transcript_contig_90317 (90317)	0.44	0.98	0.34	0.34	0.58	0.22	0.39	1.0	0.0	0.08	0.08
Transcript_contig_90688 (90688)	0.26	0.6	0.44	0.5	0.61	0.19	0.59	1.0	0.18	0.14	0.2
Transcript_contig_90858 (90858)	0.47	1.0	0.35	0.41	0.3	0.25	0.51	0.7	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_9364 (9364)	0.48	1.0	0.52	0.48	0.0	0.13	0.38	0.83	0.0	0.02	0.02
Transcript_contig_9965 (9965)	0.31	0.6	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	1.0	0.0	0.14	0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)