Heatmap: Cluster_122 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10881 (10881)	0.61	1.0	0.11	0.12	0.39	0.12	0.15	0.48	0.03	0.13	0.08
Transcript_contig_150 (150)	0.7	0.95	0.06	0.07	0.05	0.15	0.09	1.0	0.01	0.28	0.15
Transcript_contig_1884 (1884)	0.68	1.0	0.13	0.17	0.15	0.21	0.3	0.92	0.07	0.27	0.14
Transcript_contig_1899 (1899)	0.64	1.0	0.05	0.15	0.11	0.15	0.21	0.58	0.02	0.19	0.1
Transcript_contig_1988 (1988)	0.67	1.0	0.18	0.19	0.29	0.2	0.23	1.0	0.03	0.24	0.17
Transcript_contig_215 (215)	0.62	1.0	0.11	0.12	0.19	0.11	0.11	0.6	0.06	0.21	0.12
Transcript_contig_2337 (2337)	0.67	1.0	0.05	0.15	0.09	0.12	0.12	0.47	0.01	0.24	0.09
Transcript_contig_2386 (2386)	0.62	0.95	0.08	0.1	0.16	0.16	0.3	1.0	0.04	0.15	0.04
Transcript_contig_2397 (2397)	0.64	1.0	0.14	0.17	0.28	0.16	0.18	0.86	0.08	0.3	0.17
Transcript_contig_2830 (2830)	0.62	1.0	0.06	0.12	0.15	0.13	0.16	0.74	0.26	0.26	0.14
Transcript_contig_2895 (2895)	0.63	1.0	0.01	0.02	0.02	0.2	0.13	0.98	0.02	0.19	0.06
Transcript_contig_3389 (3389)	0.72	1.0	0.02	0.03	0.02	0.0	0.06	0.82	0.0	0.02	0.01
Transcript_contig_4327 (4327)	0.64	1.0	0.12	0.06	0.05	0.09	0.05	0.94	0.28	0.04	0.04
Transcript_contig_4741 (4741)	0.64	1.0	0.18	0.11	0.11	0.08	0.13	0.67	0.04	0.15	0.06
Transcript_contig_53804 (53804)	0.72	1.0	0.08	0.17	0.16	0.12	0.14	0.77	0.15	0.23	0.11
Transcript_contig_53844 (53844)	0.53	0.88	0.08	0.11	0.13	0.19	0.21	1.0	0.11	0.15	0.11
Transcript_contig_53865 (53865)	0.62	0.88	0.08	0.14	0.17	0.1	0.17	1.0	0.14	0.21	0.12
Transcript_contig_53939 (53939)	0.77	1.0	0.04	0.08	0.13	0.11	0.14	0.65	0.03	0.2	0.1
Transcript_contig_54135 (54135)	0.73	1.0	0.09	0.09	0.04	0.31	0.32	0.77	0.38	0.15	0.15
Transcript_contig_54152 (54152)	0.67	0.93	0.1	0.13	0.21	0.18	0.26	1.0	0.25	0.25	0.15
Transcript_contig_54178 (54178)	0.67	1.0	0.13	0.13	0.13	0.2	0.32	0.94	0.02	0.11	0.07
Transcript_contig_54192 (54192)	0.74	1.0	0.13	0.18	0.18	0.22	0.21	0.94	0.21	0.36	0.26
Transcript_contig_54244 (54244)	0.73	1.0	0.06	0.08	0.15	0.1	0.12	0.72	0.21	0.23	0.1
Transcript_contig_54341 (54341)	0.62	0.94	0.12	0.17	0.25	0.18	0.27	1.0	0.04	0.22	0.15
Transcript_contig_54423 (54423)	0.64	1.0	0.05	0.13	0.15	0.12	0.13	0.76	0.11	0.37	0.13
Transcript_contig_54601 (54601)	0.73	1.0	0.15	0.22	0.29	0.21	0.26	0.74	0.06	0.3	0.21
Transcript_contig_54705 (54705)	0.63	1.0	0.02	0.03	0.05	0.06	0.03	0.79	0.01	0.17	0.04
Transcript_contig_54732 (54732)	0.67	0.94	0.17	0.2	0.3	0.13	0.22	1.0	0.1	0.2	0.12
Transcript_contig_54815 (54815)	0.59	0.86	0.12	0.15	0.24	0.17	0.21	1.0	0.12	0.19	0.12
Transcript_contig_54860 (54860)	0.66	1.0	0.06	0.11	0.12	0.14	0.14	0.55	0.02	0.21	0.08
Transcript_contig_54879 (54879)	0.6	0.92	0.06	0.08	0.12	0.15	0.11	1.0	0.22	0.16	0.11
Transcript_contig_55284 (55284)	0.63	1.0	0.05	0.08	0.08	0.14	0.24	0.85	0.03	0.15	0.09
Transcript_contig_55426 (55426)	0.67	1.0	0.03	0.06	0.09	0.11	0.07	0.89	0.15	0.14	0.06
Transcript_contig_55541 (55541)	0.66	1.0	0.14	0.18	0.22	0.25	0.38	0.83	0.08	0.33	0.2
Transcript_contig_55741 (55741)	0.67	1.0	0.05	0.04	0.04	0.17	0.21	0.69	0.12	0.11	0.1
Transcript_contig_55854 (55854)	0.7	1.0	0.08	0.1	0.12	0.16	0.15	0.95	0.08	0.3	0.16
Transcript_contig_55890 (55890)	0.72	1.0	0.05	0.06	0.13	0.08	0.15	0.94	0.13	0.13	0.07
Transcript_contig_55917 (55917)	0.7	1.0	0.17	0.16	0.24	0.25	0.25	0.9	0.03	0.36	0.19
Transcript_contig_56057 (56057)	0.72	0.95	0.05	0.1	0.18	0.18	0.19	1.0	0.05	0.27	0.16
Transcript_contig_56274 (56274)	0.67	1.0	0.11	0.18	0.25	0.18	0.2	0.88	0.05	0.31	0.16
Transcript_contig_56304 (56304)	0.69	1.0	0.02	0.03	0.04	0.1	0.07	0.92	0.02	0.07	0.04
Transcript_contig_56316 (56316)	0.66	1.0	0.05	0.06	0.08	0.17	0.23	0.91	0.06	0.2	0.14
Transcript_contig_56434 (56434)	0.73	1.0	0.05	0.13	0.28	0.09	0.09	0.75	0.05	0.29	0.12
Transcript_contig_56435 (56435)	0.65	1.0	0.03	0.1	0.17	0.17	0.15	0.87	0.07	0.27	0.13
Transcript_contig_56476 (56476)	0.58	0.91	0.18	0.15	0.16	0.18	0.15	1.0	0.04	0.21	0.13
Transcript_contig_56481 (56481)	0.69	1.0	0.02	0.05	0.05	0.17	0.22	0.95	0.1	0.17	0.07
Transcript_contig_56562 (56562)	0.67	1.0	0.08	0.14	0.18	0.24	0.2	0.99	0.11	0.16	0.09
Transcript_contig_56614 (56614)	0.72	1.0	0.26	0.18	0.26	0.21	0.25	0.95	0.07	0.27	0.19
Transcript_contig_56740 (56740)	0.72	1.0	0.09	0.04	0.03	0.06	0.16	0.93	0.26	0.07	0.06
Transcript_contig_57221 (57221)	0.71	1.0	0.12	0.13	0.08	0.16	0.14	0.78	0.05	0.29	0.16
Transcript_contig_57498 (57498)	0.58	0.94	0.05	0.05	0.1	0.03	0.06	1.0	0.09	0.12	0.1
Transcript_contig_57950 (57950)	0.68	1.0	0.08	0.16	0.22	0.16	0.15	0.88	0.01	0.28	0.13
Transcript_contig_58071 (58071)	0.58	1.0	0.06	0.08	0.13	0.16	0.14	0.98	0.05	0.25	0.12
Transcript_contig_58088 (58088)	0.69	1.0	0.1	0.1	0.18	0.1	0.21	0.94	0.07	0.2	0.13
Transcript_contig_58173 (58173)	0.7	1.0	0.09	0.14	0.19	0.18	0.23	0.88	0.08	0.3	0.12
Transcript_contig_58503 (58503)	0.7	1.0	0.13	0.13	0.14	0.26	0.22	0.72	0.02	0.33	0.17
Transcript_contig_58527 (58527)	0.66	1.0	0.16	0.22	0.31	0.26	0.32	0.93	0.05	0.33	0.19
Transcript_contig_58767 (58767)	0.69	1.0	0.08	0.15	0.19	0.14	0.19	0.77	0.14	0.29	0.14
Transcript_contig_58861 (58861)	0.66	1.0	0.12	0.11	0.14	0.13	0.17	0.73	0.04	0.29	0.14
Transcript_contig_59004 (59004)	0.64	0.92	0.14	0.19	0.19	0.21	0.16	1.0	0.07	0.32	0.24
Transcript_contig_59066 (59066)	0.66	1.0	0.04	0.08	0.08	0.13	0.13	0.92	0.03	0.21	0.13
Transcript_contig_59075 (59075)	0.66	0.95	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	1.0	0.03	0.02	0.01
Transcript_contig_59114 (59114)	0.69	1.0	0.06	0.1	0.13	0.14	0.17	0.96	0.06	0.29	0.13
Transcript_contig_59119 (59119)	0.59	0.91	0.02	0.05	0.1	0.12	0.03	1.0	0.09	0.31	0.13
Transcript_contig_59125 (59125)	0.6	0.89	0.13	0.16	0.17	0.13	0.23	1.0	0.14	0.12	0.08
Transcript_contig_59203 (59203)	0.61	1.0	0.07	0.12	0.15	0.2	0.19	0.87	0.16	0.14	0.08
Transcript_contig_59732 (59732)	0.77	1.0	0.09	0.2	0.23	0.13	0.17	0.82	0.07	0.17	0.14
Transcript_contig_60028 (60028)	0.55	0.91	0.02	0.03	0.02	0.0	0.07	1.0	0.0	0.04	0.02
Transcript_contig_60117 (60117)	0.68	1.0	0.08	0.07	0.07	0.15	0.09	0.98	0.11	0.33	0.16
Transcript_contig_60336 (60336)	0.67	1.0	0.07	0.09	0.13	0.14	0.12	0.8	0.0	0.4	0.16
Transcript_contig_60719 (60719)	0.6	0.91	0.1	0.17	0.17	0.19	0.27	1.0	0.01	0.13	0.09
Transcript_contig_61135 (61135)	0.66	1.0	0.0	0.02	0.0	0.07	0.0	0.95	0.0	0.26	0.09
Transcript_contig_61334 (61334)	0.71	1.0	0.1	0.11	0.06	0.05	0.12	0.76	0.0	0.1	0.06
Transcript_contig_61342 (61342)	0.68	1.0	0.02	0.06	0.09	0.1	0.02	0.7	0.18	0.2	0.1
Transcript_contig_61355 (61355)	0.6	0.99	0.06	0.03	0.06	0.13	0.22	1.0	0.03	0.09	0.07
Transcript_contig_62605 (62605)	0.66	1.0	0.17	0.28	0.25	0.2	0.25	0.84	0.08	0.31	0.18
Transcript_contig_64468 (64468)	0.61	0.94	0.0	0.01	0.01	0.01	0.07	1.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_6522 (6522)	0.75	1.0	0.01	0.04	0.03	0.18	0.09	0.97	0.02	0.36	0.17
Transcript_contig_66174 (66174)	0.52	0.79	0.11	0.08	0.08	0.06	0.1	1.0	0.13	0.09	0.1
Transcript_contig_6780 (6780)	0.61	0.95	0.0	0.02	0.08	0.09	0.04	1.0	0.12	0.23	0.03
Transcript_contig_67942 (67942)	0.68	1.0	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.62	0.05	0.25	0.06
Transcript_contig_68187 (68187)	0.58	1.0	0.01	0.03	0.02	0.11	0.02	0.77	0.01	0.31	0.09
Transcript_contig_68237 (68237)	0.59	1.0	0.04	0.09	0.03	0.15	0.1	0.96	0.0	0.25	0.08
Transcript_contig_69154 (69154)	0.55	0.92	0.0	0.03	0.04	0.12	0.02	1.0	0.0	0.25	0.08
Transcript_contig_6963 (6963)	0.55	1.0	0.04	0.03	0.06	0.02	0.04	0.9	0.0	0.03	0.03
Transcript_contig_70847 (70847)	0.64	1.0	0.05	0.11	0.05	0.12	0.16	0.88	0.01	0.23	0.15
Transcript_contig_70899 (70899)	0.68	1.0	0.15	0.06	0.1	0.12	0.24	0.82	0.06	0.05	0.05
Transcript_contig_727 (727)	0.61	1.0	0.03	0.14	0.41	0.13	0.19	0.71	0.02	0.2	0.09
Transcript_contig_7361 (7361)	0.6	0.96	0.06	0.06	0.07	0.05	0.07	1.0	0.01	0.04	0.03
Transcript_contig_78058 (78058)	0.62	1.0	0.04	0.08	0.2	0.12	0.14	0.8	0.01	0.21	0.07
Transcript_contig_78077 (78077)	0.72	1.0	0.04	0.04	0.06	0.07	0.14	0.86	0.22	0.19	0.11
Transcript_contig_78104 (78104)	0.71	1.0	0.03	0.04	0.07	0.1	0.05	0.9	0.08	0.19	0.08
Transcript_contig_78399 (78399)	0.69	1.0	0.04	0.08	0.11	0.14	0.18	1.0	0.13	0.19	0.13
Transcript_contig_78539 (78539)	0.62	1.0	0.01	0.01	0.01	0.11	0.05	0.87	0.1	0.33	0.16
Transcript_contig_78694 (78694)	0.65	0.98	0.1	0.1	0.11	0.08	0.11	1.0	0.02	0.05	0.05
Transcript_contig_78953 (78953)	0.65	0.96	0.1	0.1	0.18	0.04	0.09	1.0	0.21	0.04	0.04
Transcript_contig_79087 (79087)	0.67	0.99	0.08	0.1	0.21	0.1	0.16	1.0	0.11	0.19	0.12
Transcript_contig_79228 (79228)	0.7	1.0	0.03	0.04	0.05	0.07	0.15	0.59	0.01	0.12	0.04
Transcript_contig_79286 (79286)	0.69	1.0	0.03	0.07	0.12	0.11	0.02	0.88	0.1	0.29	0.12
Transcript_contig_79309 (79309)	0.69	1.0	0.07	0.11	0.12	0.1	0.19	0.92	0.13	0.1	0.04
Transcript_contig_79992 (79992)	0.66	1.0	0.04	0.07	0.14	0.09	0.08	1.0	0.13	0.22	0.17
Transcript_contig_80439 (80439)	0.55	0.81	0.11	0.12	0.12	0.1	0.14	1.0	0.0	0.18	0.09
Transcript_contig_80668 (80668)	0.65	0.91	0.06	0.13	0.14	0.26	0.23	1.0	0.24	0.29	0.16
Transcript_contig_80836 (80836)	0.56	0.89	0.06	0.09	0.09	0.1	0.08	1.0	0.16	0.01	0.02
Transcript_contig_80928 (80928)	0.67	1.0	0.05	0.12	0.12	0.11	0.18	0.91	0.0	0.16	0.07
Transcript_contig_82299 (82299)	0.66	1.0	0.16	0.18	0.29	0.18	0.24	0.88	0.06	0.27	0.22
Transcript_contig_82637 (82637)	0.74	1.0	0.04	0.03	0.01	0.11	0.04	0.93	0.12	0.32	0.12
Transcript_contig_82925 (82925)	0.6	1.0	0.03	0.05	0.06	0.15	0.18	0.84	0.17	0.28	0.18
Transcript_contig_847 (847)	0.6	0.9	0.05	0.05	0.03	0.06	0.03	1.0	0.08	0.22	0.13
Transcript_contig_8535 (8535)	0.7	1.0	0.06	0.02	0.02	0.14	0.09	0.88	0.01	0.13	0.09
Transcript_contig_872 (872)	0.71	1.0	0.09	0.24	0.3	0.19	0.23	0.82	0.01	0.31	0.17
Transcript_contig_8883 (8883)	0.76	1.0	0.06	0.07	0.24	0.11	0.2	0.74	0.29	0.23	0.15
Transcript_contig_89198 (89198)	0.73	1.0	0.09	0.17	0.24	0.15	0.19	0.86	0.01	0.19	0.09
Transcript_contig_89337 (89337)	0.63	1.0	0.03	0.06	0.12	0.08	0.1	0.85	0.02	0.24	0.11
Transcript_contig_8937 (8937)	0.66	1.0	0.07	0.07	0.06	0.02	0.13	0.94	0.0	0.05	0.03
Transcript_contig_90014 (90014)	0.72	0.99	0.06	0.05	0.06	0.16	0.13	1.0	0.07	0.23	0.16
Transcript_contig_90031 (90031)	0.75	1.0	0.11	0.16	0.2	0.23	0.23	0.69	0.1	0.33	0.17
Transcript_contig_90120 (90120)	0.68	0.97	0.09	0.08	0.11	0.12	0.15	1.0	0.13	0.14	0.12
Transcript_contig_90685 (90685)	0.61	1.0	0.12	0.05	0.05	0.02	0.07	0.95	0.01	0.07	0.06
Transcript_contig_9254 (9254)	0.78	1.0	0.06	0.06	0.05	0.23	0.3	0.88	0.02	0.13	0.15
Transcript_contig_9399 (9399)	0.58	1.0	0.04	0.06	0.08	0.11	0.2	0.82	0.01	0.22	0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)