Heatmap: Cluster_241 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1164 (1164)	0.38	0.27	1.0	0.71	0.74	0.29	0.76	0.38	0.23	0.23	0.2
Transcript_contig_1321 (1321)	0.26	0.1	0.29	0.85	1.0	0.24	0.52	0.04	0.1	0.22	0.18
Transcript_contig_13310 (13310)	0.25	0.2	0.17	0.94	1.0	0.05	0.11	0.17	0.46	0.22	0.41
Transcript_contig_144 (144)	0.15	0.05	0.45	0.36	0.6	0.44	1.0	0.03	0.17	0.2	0.17
Transcript_contig_1653 (1653)	0.41	0.37	0.81	1.0	0.85	0.53	0.97	0.21	0.29	0.31	0.32
Transcript_contig_2278 (2278)	0.0	0.0	0.21	0.75	1.0	0.2	0.21	0.0	0.0	0.07	0.13
Transcript_contig_2846 (2846)	0.4	0.28	0.53	0.54	0.67	0.39	1.0	0.18	0.54	0.25	0.24
Transcript_contig_2980 (2980)	0.32	0.33	0.88	1.0	0.9	0.46	0.81	0.05	0.02	0.33	0.24
Transcript_contig_53932 (53932)	0.5	0.4	0.92	0.83	0.64	0.88	1.0	0.16	0.28	0.42	0.26
Transcript_contig_54312 (54312)	0.19	0.14	1.0	0.94	0.67	0.24	0.63	0.19	0.05	0.19	0.11
Transcript_contig_54320 (54320)	0.55	0.46	0.93	0.95	0.73	0.29	0.75	0.26	1.0	0.73	0.46
Transcript_contig_54672 (54672)	0.37	0.19	0.81	1.0	0.8	0.37	0.76	0.11	0.5	0.52	0.41
Transcript_contig_54698 (54698)	0.5	0.42	0.92	0.9	0.52	0.53	1.0	0.25	0.18	0.44	0.28
Transcript_contig_54805 (54805)	0.14	0.05	0.43	0.59	1.0	0.26	0.57	0.01	0.13	0.19	0.11
Transcript_contig_54863 (54863)	0.28	0.18	0.72	1.0	0.84	0.39	0.59	0.1	0.66	0.34	0.2
Transcript_contig_54884 (54884)	0.24	0.16	0.42	0.67	0.43	0.67	1.0	0.21	0.0	0.5	0.35
Transcript_contig_55053 (55053)	0.5	0.24	0.85	0.92	0.53	0.55	1.0	0.17	0.18	0.68	0.43
Transcript_contig_55154 (55154)	0.37	0.12	0.59	1.0	0.87	0.5	0.72	0.07	0.41	0.42	0.45
Transcript_contig_55427 (55427)	0.25	0.12	0.76	0.61	0.52	0.42	1.0	0.12	0.05	0.24	0.12
Transcript_contig_55452 (55452)	0.23	0.05	0.63	0.82	0.83	0.52	1.0	0.06	0.32	0.38	0.37
Transcript_contig_55660 (55660)	0.45	0.27	0.75	1.0	0.76	0.44	0.85	0.18	0.14	0.35	0.31
Transcript_contig_55932 (55932)	0.23	0.13	0.88	1.0	0.65	0.19	0.4	0.07	0.2	0.19	0.24
Transcript_contig_56055 (56055)	0.42	0.21	0.6	0.52	0.21	0.44	1.0	0.07	0.64	0.25	0.26
Transcript_contig_56245 (56245)	0.32	0.23	0.79	0.87	1.0	0.31	0.55	0.16	0.15	0.32	0.24
Transcript_contig_56772 (56772)	0.25	0.19	0.52	0.37	0.25	0.39	1.0	0.03	0.08	0.37	0.19
Transcript_contig_56852 (56852)	0.39	0.24	1.0	0.88	1.0	0.45	0.85	0.28	0.36	0.35	0.23
Transcript_contig_57027 (57027)	0.51	0.29	0.76	0.66	0.44	0.52	1.0	0.38	0.14	0.4	0.3
Transcript_contig_57046 (57046)	0.35	0.14	0.5	0.57	0.15	0.36	1.0	0.04	0.04	0.09	0.05
Transcript_contig_57541 (57541)	0.37	0.22	0.72	0.72	0.6	0.45	1.0	0.18	0.12	0.34	0.34
Transcript_contig_57884 (57884)	0.37	0.33	0.64	1.0	0.8	0.55	0.98	0.4	0.17	0.86	0.31
Transcript_contig_58006 (58006)	0.33	0.19	1.0	0.77	0.25	0.32	0.83	0.11	0.04	0.07	0.06
Transcript_contig_58320 (58320)	0.17	0.09	0.65	1.0	0.56	0.32	0.58	0.0	0.05	0.23	0.18
Transcript_contig_58362 (58362)	0.47	0.47	1.0	0.81	0.6	0.49	0.99	0.56	0.15	0.4	0.36
Transcript_contig_59569 (59569)	0.24	0.11	0.42	0.94	1.0	0.24	0.53	0.02	0.0	0.22	0.11
Transcript_contig_60041 (60041)	0.24	0.09	0.62	0.67	1.0	0.5	0.73	0.11	0.33	0.48	0.39
Transcript_contig_60107 (60107)	0.4	0.09	0.89	1.0	0.25	0.34	0.93	0.02	0.9	0.8	0.54
Transcript_contig_60677 (60677)	0.31	0.27	0.76	0.65	0.63	0.53	1.0	0.13	0.53	0.32	0.36
Transcript_contig_61364 (61364)	0.24	0.16	0.79	1.0	0.3	0.38	0.74	0.0	0.25	0.48	0.26
Transcript_contig_61523 (61523)	0.33	0.27	1.0	0.73	0.5	0.32	0.64	0.15	0.25	0.12	0.08
Transcript_contig_61745 (61745)	0.26	0.16	0.99	1.0	0.98	0.37	0.63	0.08	0.24	0.11	0.11
Transcript_contig_62573 (62573)	0.16	0.11	0.5	1.0	0.8	0.63	0.95	0.0	0.06	0.38	0.12
Transcript_contig_63185 (63185)	0.36	0.3	0.65	1.0	0.87	0.54	0.77	0.12	0.01	0.54	0.35
Transcript_contig_63362 (63362)	0.23	0.13	0.77	0.64	0.62	0.45	1.0	0.05	0.03	0.31	0.21
Transcript_contig_67511 (67511)	0.42	0.32	0.98	0.86	0.51	0.57	1.0	0.41	0.08	0.32	0.33
Transcript_contig_67855 (67855)	0.3	0.25	0.79	0.92	0.47	0.44	1.0	0.13	0.08	0.61	0.31
Transcript_contig_70043 (70043)	0.45	0.42	1.0	0.93	0.38	0.46	0.77	0.23	0.1	0.41	0.27
Transcript_contig_7044 (7044)	0.36	0.49	0.9	0.91	1.0	0.67	0.8	0.57	0.3	0.8	0.52
Transcript_contig_70780 (70780)	0.17	0.09	0.73	1.0	0.58	0.59	0.66	0.07	0.06	0.38	0.34
Transcript_contig_71390 (71390)	0.49	0.29	0.58	1.0	0.8	0.51	1.0	0.13	0.46	0.42	0.41
Transcript_contig_723 (723)	0.34	0.18	0.67	1.0	0.46	0.52	0.68	0.09	0.17	0.46	0.35
Transcript_contig_78430 (78430)	0.43	0.29	0.61	0.42	0.22	0.39	1.0	0.14	0.45	0.24	0.17
Transcript_contig_78530 (78530)	0.13	0.0	1.0	0.7	0.39	0.33	0.77	0.0	0.0	0.15	0.14
Transcript_contig_78573 (78573)	0.43	0.19	0.63	1.0	0.91	0.44	0.92	0.14	0.66	0.45	0.38
Transcript_contig_78680 (78680)	0.31	0.13	1.0	0.73	0.54	0.52	0.95	0.08	0.25	0.41	0.35
Transcript_contig_78700 (78700)	0.46	0.29	0.93	0.67	0.41	0.32	1.0	0.38	0.14	0.42	0.29
Transcript_contig_78735 (78735)	0.39	0.2	0.66	0.86	0.35	0.52	1.0	0.0	0.07	0.27	0.16
Transcript_contig_78742 (78742)	0.32	0.26	1.0	0.84	0.44	0.36	0.83	0.09	0.12	0.22	0.19
Transcript_contig_78832 (78832)	0.47	0.29	0.77	0.95	0.58	0.5	1.0	0.29	0.47	0.59	0.29
Transcript_contig_78849 (78849)	0.26	0.21	0.6	0.52	0.67	0.44	1.0	0.16	0.25	0.21	0.17
Transcript_contig_79047 (79047)	0.32	0.17	0.63	0.81	0.61	0.8	1.0	0.11	0.45	0.39	0.35
Transcript_contig_79073 (79073)	0.52	0.44	1.0	0.85	0.44	0.59	0.93	0.34	0.29	0.34	0.34
Transcript_contig_79097 (79097)	0.22	0.09	1.0	0.9	0.52	0.25	0.62	0.03	0.1	0.1	0.09
Transcript_contig_79242 (79242)	0.33	0.09	0.32	0.31	0.21	0.37	1.0	0.08	0.02	0.14	0.14
Transcript_contig_79327 (79327)	0.34	0.18	0.75	0.69	0.48	0.46	1.0	0.1	0.06	0.12	0.16
Transcript_contig_79565 (79565)	0.32	0.21	0.54	0.57	0.55	0.53	1.0	0.13	0.14	0.38	0.28
Transcript_contig_79579 (79579)	0.56	0.46	0.68	0.98	0.37	0.71	1.0	0.08	0.0	0.79	0.37
Transcript_contig_79782 (79782)	0.35	0.15	0.63	0.63	0.69	0.52	1.0	0.16	0.83	0.42	0.35
Transcript_contig_79828 (79828)	0.42	0.19	0.73	0.77	0.93	0.48	1.0	0.16	0.1	0.55	0.49
Transcript_contig_80304 (80304)	0.16	0.05	0.67	1.0	0.45	0.71	0.86	0.0	0.09	0.31	0.49
Transcript_contig_80624 (80624)	0.45	0.31	0.57	0.44	0.26	0.31	1.0	0.26	0.08	0.39	0.17
Transcript_contig_80627 (80627)	0.23	0.03	0.96	0.9	0.45	0.79	1.0	0.03	0.07	0.1	0.13
Transcript_contig_80880 (80880)	0.43	0.29	0.45	1.0	0.71	0.8	0.75	0.16	0.36	0.38	0.3
Transcript_contig_82266 (82266)	0.33	0.22	0.82	0.79	0.42	0.34	1.0	0.14	0.05	0.31	0.17
Transcript_contig_82499 (82499)	0.32	0.17	0.73	1.0	0.64	0.25	0.71	0.04	0.08	0.54	0.38
Transcript_contig_8715 (8715)	0.23	0.14	0.55	0.64	1.0	0.26	0.79	0.0	0.0	0.06	0.18
Transcript_contig_89188 (89188)	0.29	0.12	0.53	0.48	0.27	0.44	1.0	0.11	0.06	0.28	0.2
Transcript_contig_89204 (89204)	0.51	0.39	0.92	1.0	0.99	0.43	0.9	0.3	0.18	0.34	0.27
Transcript_contig_89212 (89212)	0.46	0.46	0.88	0.78	0.53	0.66	1.0	0.53	0.16	0.4	0.46
Transcript_contig_89217 (89217)	0.38	0.21	0.89	0.99	0.5	0.54	1.0	0.12	0.13	0.45	0.35
Transcript_contig_89615 (89615)	0.37	0.21	0.62	0.67	1.0	0.41	0.95	0.24	0.57	0.64	0.4
Transcript_contig_89940 (89940)	0.09	0.01	0.34	0.76	1.0	0.16	0.37	0.01	0.02	0.11	0.11
Transcript_contig_90008 (90008)	0.34	0.19	1.0	0.91	0.7	0.32	0.99	0.08	0.07	0.26	0.22
Transcript_contig_90059 (90059)	0.31	0.2	0.7	0.85	0.49	0.49	1.0	0.02	0.23	0.22	0.2
Transcript_contig_90060 (90060)	0.35	0.21	0.9	0.91	0.46	0.48	1.0	0.06	0.06	0.47	0.3
Transcript_contig_90080 (90080)	0.17	0.0	0.46	1.0	0.71	0.47	0.74	0.0	0.05	0.67	0.37
Transcript_contig_90123 (90123)	0.25	0.08	0.91	0.72	0.22	0.55	1.0	0.02	0.0	0.07	0.11
Transcript_contig_90326 (90326)	0.15	0.07	1.0	0.84	0.88	0.24	0.67	0.03	0.19	0.4	0.11
Transcript_contig_90472 (90472)	0.6	0.38	0.76	0.85	1.0	0.45	0.98	0.24	0.43	0.4	0.2
Transcript_contig_90473 (90473)	0.49	0.35	0.88	0.81	0.58	0.64	1.0	0.36	0.08	0.44	0.35
Transcript_contig_90682 (90682)	0.35	0.25	0.89	1.0	0.64	0.6	0.77	0.48	0.56	0.63	0.25
Transcript_contig_90759 (90759)	0.35	0.19	0.59	0.86	1.0	0.7	0.87	0.08	0.31	0.55	0.51
Transcript_contig_91464 (91464)	0.27	0.15	1.0	0.57	0.2	0.25	0.73	0.12	0.02	0.0	0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)