Heatmap: Cluster_216 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000037.24 (tig00000037_g10093.t1)
0.44 0.45 0.44 0.44 0.48 0.53 0.56 0.52 0.55 0.52 0.47 0.44 0.44 0.9 0.84 1.0 0.88 0.78 0.89 0.85 0.21 0.38 0.41 0.48 0.39 0.41
Cpa|evm.model.tig00000073.39 (tig00000073_g1719.t1)
0.85 0.54 0.59 0.53 0.56 0.49 0.63 0.59 0.45 0.49 0.51 0.69 1.0 0.98 0.9 0.96 0.76 0.76 0.77 0.73 0.27 0.55 0.22 0.36 0.42 0.64
Cpa|evm.model.tig00000157.101 (tig00000157_g9699.t1)
0.69 0.63 0.5 0.4 0.24 0.25 0.24 0.34 0.46 0.43 0.48 0.66 0.75 0.62 0.48 0.94 0.51 1.0 0.88 0.53 0.12 0.55 0.19 0.5 0.46 0.49
Cpa|evm.model.tig00000194.47 (tig00000194_g14775.t1)
0.86 0.59 0.53 0.42 0.35 0.33 0.54 0.57 0.4 0.47 0.41 0.43 0.8 0.97 0.89 0.8 0.71 1.0 0.97 0.8 0.23 0.17 0.3 0.41 0.68 0.83
Cpa|evm.model.tig00000217.30 (tig00000217_g19163.t1)
0.23 0.34 0.45 0.67 0.56 0.73 0.79 0.74 0.77 0.47 0.33 0.3 0.26 0.24 0.37 0.27 0.35 0.88 1.0 0.56 0.03 0.5 0.27 0.3 0.5 0.42
Cpa|evm.model.tig00000227.46 (tig00000227_g19838.t1)
0.07 0.22 0.4 0.4 0.53 0.69 0.7 0.54 0.63 0.6 0.36 0.32 0.08 0.81 0.82 0.94 0.79 0.99 1.0 0.9 0.05 0.2 0.41 0.39 0.46 0.45
Cpa|evm.model.tig00000241.123 (tig00000241_g20989.t1)
0.95 0.66 0.57 0.62 0.57 0.44 0.58 0.59 0.46 0.5 0.5 0.55 1.0 0.71 0.72 0.95 0.67 0.81 0.81 0.6 0.15 0.83 0.44 0.42 0.48 0.59
Cpa|evm.model.tig00000269.24 (tig00000269_g23683.t1)
0.57 0.56 0.6 0.49 0.54 0.74 0.58 0.52 0.6 0.54 0.51 0.54 0.51 1.0 0.84 0.77 0.85 0.56 0.97 0.75 0.41 0.16 0.3 0.65 0.15 0.64
Cpa|evm.model.tig00000319.27 (tig00000319_g24140.t1)
0.13 0.24 0.31 0.33 0.36 0.47 0.5 0.42 0.47 0.52 0.29 0.26 0.1 0.9 0.8 1.0 0.73 0.98 0.85 0.81 0.3 0.13 0.36 0.41 0.32 0.6
Cpa|evm.model.tig00000319.28 (tig00000319_g24141.t1)
0.77 0.75 0.83 0.74 0.79 0.84 0.74 0.72 0.78 0.7 0.76 0.78 0.76 0.95 0.99 0.95 0.87 0.86 1.0 0.91 0.3 0.83 0.83 0.75 0.69 0.82
0.06 0.19 0.24 0.26 0.32 0.39 0.34 0.29 0.3 0.32 0.23 0.23 0.07 0.55 0.68 0.73 0.58 0.83 1.0 0.55 0.19 0.14 0.19 0.24 0.35 0.47
Cpa|evm.model.tig00000388.35 (tig00021094_g18105.t1)
0.36 0.45 0.35 0.3 0.33 0.34 0.4 0.4 0.54 0.53 0.52 0.44 0.3 0.72 0.6 0.7 0.63 1.0 0.98 0.7 0.2 0.28 0.49 0.83 0.52 0.76
Cpa|evm.model.tig00000403.13 (tig00000403_g268.t1)
0.94 0.65 0.32 0.2 0.15 0.1 0.11 0.09 0.16 0.33 0.39 0.5 0.63 1.0 0.38 0.83 0.28 0.28 0.61 0.41 0.15 0.19 0.5 0.41 0.59 0.39
Cpa|evm.model.tig00000403.14 (tig00000403_g271.t1)
0.88 0.53 0.56 0.26 0.22 0.0 0.09 0.0 0.31 0.26 0.44 0.66 0.85 0.83 0.14 0.8 0.19 0.25 0.44 0.15 0.22 0.33 1.0 0.41 0.9 0.67
Cpa|evm.model.tig00000488.8 (tig00000488_g1344.t1)
0.29 0.43 0.51 0.61 0.82 1.0 0.78 0.69 0.67 0.7 0.66 0.48 0.24 0.52 0.64 0.51 0.51 0.51 0.84 0.63 0.06 0.97 0.46 0.76 0.59 0.53
Cpa|evm.model.tig00000498.51 (tig00000498_g1628.t2)
0.89 0.61 0.41 0.41 0.57 0.45 0.51 0.46 0.44 0.48 0.5 0.5 0.82 0.81 0.75 0.87 0.71 0.67 1.0 0.63 0.22 0.6 0.59 0.58 0.46 0.55
Cpa|evm.model.tig00000718.28 (tig00000718_g3701.t1)
0.57 0.58 0.51 0.36 0.21 0.17 0.27 0.32 0.34 0.47 0.46 0.54 0.63 0.6 0.58 1.0 0.53 0.7 0.82 0.57 0.01 0.1 0.32 0.32 0.49 0.38
Cpa|evm.model.tig00000764.1 (tig00000764_g3981.t1)
0.05 0.07 0.03 0.05 0.08 0.08 0.02 0.05 0.08 0.08 0.07 0.07 0.03 0.22 0.5 0.32 0.12 0.59 1.0 0.42 0.21 0.1 0.06 0.02 0.06 0.1
0.21 0.28 0.27 0.27 0.27 0.24 0.35 0.27 0.28 0.41 0.26 0.22 0.21 0.73 0.63 0.5 0.66 0.8 1.0 0.65 0.15 0.09 0.22 0.47 0.22 0.63
Cpa|evm.model.tig00000881.9 (tig00000881_g5223.t1)
0.18 0.18 0.21 0.26 0.36 0.36 0.52 0.37 0.51 0.64 0.59 0.5 0.21 0.3 0.37 0.37 0.63 0.88 1.0 0.73 0.1 0.16 0.18 0.48 0.31 0.29
Cpa|evm.model.tig00000912.15 (tig00000912_g5420.t1)
0.44 0.51 0.51 0.46 0.45 0.44 0.56 0.48 0.51 0.53 0.43 0.42 0.38 0.77 0.82 0.7 0.65 1.0 0.98 0.65 0.22 0.35 0.45 0.69 0.43 0.85
Cpa|evm.model.tig00000944.32 (tig00000944_g5956.t1)
0.16 0.37 0.48 0.44 0.46 0.45 0.54 0.48 0.53 0.61 0.55 0.51 0.17 0.82 0.89 0.83 0.76 0.85 1.0 0.8 0.38 0.25 0.43 0.65 0.48 0.72
Cpa|evm.model.tig00000980.7 (tig00000980_g6131.t1)
0.42 0.35 0.32 0.28 0.38 0.56 0.62 0.52 0.56 0.6 0.42 0.33 0.36 0.89 0.84 0.53 0.56 0.86 1.0 0.71 0.15 0.4 0.31 0.38 0.45 0.7
Cpa|evm.model.tig00001029.9 (tig00001029_g6409.t1)
0.5 0.41 0.42 0.43 0.44 0.36 0.41 0.37 0.4 0.57 0.56 0.66 0.55 0.97 1.0 0.87 0.67 0.92 0.88 0.63 0.52 0.43 0.46 1.0 0.48 0.9
Cpa|evm.model.tig00001052.7 (tig00001052_g6612.t1)
0.81 0.5 0.43 0.3 0.29 0.31 0.47 0.63 0.51 0.64 0.53 0.61 0.76 0.84 0.66 0.71 0.76 1.0 0.91 0.74 0.1 0.33 0.38 0.63 0.69 1.0
0.71 0.47 0.48 0.36 0.32 0.28 0.38 0.33 0.35 0.39 0.39 0.43 0.62 0.8 0.71 0.8 0.48 0.86 1.0 0.6 0.22 0.39 0.17 0.34 0.32 0.47
Cpa|evm.model.tig00001107.5 (tig00001107_g7093.t1)
0.07 0.28 0.43 0.43 0.5 0.52 0.68 0.56 0.55 0.55 0.36 0.31 0.08 0.75 0.84 0.81 0.73 0.92 1.0 0.84 0.09 0.15 0.26 0.27 0.36 0.44
Cpa|evm.model.tig00001164.22 (tig00001164_g7410.t1)
0.25 0.28 0.37 0.38 0.47 0.5 0.6 0.47 0.54 0.58 0.39 0.33 0.28 1.0 0.95 0.94 0.88 1.0 0.95 0.95 0.04 0.05 0.18 0.31 0.24 0.44
0.28 0.44 0.46 0.34 0.53 0.49 0.34 0.27 0.34 0.34 0.37 0.35 0.21 0.47 0.53 0.68 0.77 0.92 1.0 0.68 0.28 0.15 0.31 0.21 0.27 0.32
Cpa|evm.model.tig00001206.17 (tig00001206_g7502.t1)
0.27 0.37 0.46 0.53 0.62 0.58 0.76 0.68 0.67 0.73 0.57 0.45 0.3 0.55 0.46 0.67 0.54 1.0 0.99 0.81 0.09 0.58 0.24 0.34 0.41 0.5
Cpa|evm.model.tig00001229.13 (tig00001229_g7845.t1)
0.21 0.25 0.34 0.33 0.35 0.46 0.57 0.46 0.48 0.49 0.32 0.28 0.17 0.73 0.72 0.86 0.72 1.0 0.87 0.87 0.05 0.09 0.23 0.29 0.31 0.41
0.24 0.28 0.27 0.29 0.29 0.22 0.36 0.31 0.28 0.44 0.32 0.31 0.28 0.82 0.63 0.61 0.61 0.66 0.68 0.63 0.24 0.24 0.2 0.7 0.33 1.0
0.39 0.36 0.36 0.25 0.38 0.3 0.34 0.24 0.3 0.35 0.37 0.34 0.32 0.75 0.79 0.84 0.84 0.76 1.0 0.77 0.04 0.08 0.02 0.31 0.09 0.35
0.37 0.41 0.44 0.42 0.41 0.41 0.51 0.42 0.43 0.64 0.46 0.42 0.33 0.87 0.71 0.69 0.76 0.8 0.89 0.68 0.24 0.32 0.36 0.66 0.44 1.0
0.4 0.43 0.46 0.38 0.41 0.34 0.58 0.46 0.44 0.63 0.43 0.45 0.37 0.98 0.83 0.82 0.84 0.8 1.0 0.81 0.16 0.22 0.25 0.68 0.28 0.96
Cpa|evm.model.tig00001375.3 (tig00001375_g8517.t1)
0.29 0.3 0.28 0.26 0.25 0.25 0.33 0.28 0.26 0.31 0.28 0.29 0.28 1.0 0.52 0.77 0.6 0.59 0.75 0.49 0.48 0.33 0.18 0.56 0.4 0.86
Cpa|evm.model.tig00001387.8 (tig00001387_g8570.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.63 0.46 0.41 0.26 0.65 1.0 0.33 0.6 0.12 0.04 0.64 0.36 0.74
Cpa|evm.model.tig00001525.2 (tig00001525_g9231.t1)
0.83 0.71 0.59 0.35 0.2 0.18 0.25 0.36 0.18 0.28 0.25 0.3 0.78 0.79 0.81 1.0 0.71 0.78 0.69 0.57 0.02 0.04 0.1 0.19 0.38 0.33
Cpa|evm.model.tig00001636.2 (tig00001636_g9525.t1)
0.32 0.47 0.47 0.6 0.69 0.66 0.6 0.62 0.69 0.49 0.52 0.38 0.16 0.35 0.5 0.37 0.43 0.69 1.0 0.46 0.01 0.67 0.27 0.39 0.65 0.4
Cpa|evm.model.tig00020531.31 (tig00020531_g10032.t1)
0.49 0.46 0.4 0.48 0.59 0.74 0.66 0.53 0.62 0.55 0.55 0.52 0.45 0.86 0.85 0.79 0.73 0.63 1.0 0.92 0.19 0.45 0.34 0.32 0.43 0.62
Cpa|evm.model.tig00020531.40 (tig00020531_g10043.t1)
0.29 0.36 0.39 0.42 0.51 0.59 0.55 0.43 0.49 0.56 0.45 0.42 0.31 1.0 0.88 0.96 0.7 0.73 0.93 0.67 0.3 0.38 0.41 0.52 0.44 0.53
Cpa|evm.model.tig00020538.35 (tig00020538_g10341.t1)
0.84 0.31 0.18 0.19 0.14 0.11 0.2 0.22 0.35 0.67 0.73 0.83 0.67 1.0 0.39 0.79 0.12 0.54 0.44 0.42 0.22 0.19 0.76 0.49 0.6 0.32
Cpa|evm.model.tig00020544.1 (tig00020544_g10483.t1)
0.06 0.16 0.3 0.35 0.39 0.38 0.54 0.47 0.49 0.58 0.35 0.3 0.07 0.83 0.66 1.0 0.72 0.81 0.97 0.78 0.12 0.12 0.26 0.27 0.29 0.45
Cpa|evm.model.tig00020554.40 (tig00020554_g10823.t1)
0.93 0.48 0.44 0.47 0.3 0.25 0.5 0.63 0.43 0.43 0.47 0.45 1.0 0.46 0.24 0.47 0.31 0.91 0.47 0.53 0.23 0.2 0.08 0.13 0.97 0.76
Cpa|evm.model.tig00020554.41 (tig00020554_g10823.t1)
0.73 0.45 0.46 0.43 0.3 0.28 0.46 0.48 0.32 0.41 0.33 0.39 0.75 0.64 0.35 0.57 0.44 1.0 0.85 0.76 0.21 0.14 0.05 0.09 0.51 0.88
Cpa|evm.model.tig00020554.9 (tig00020554_g10794.t1)
0.15 0.18 0.27 0.3 0.32 0.4 0.6 0.66 0.64 0.92 0.6 0.66 0.23 0.75 0.43 0.66 0.49 0.75 0.66 0.47 0.06 0.43 0.73 0.63 0.88 1.0
Cpa|evm.model.tig00020614.124 (tig00020554_g10794.t1)
0.2 0.17 0.23 0.34 0.25 0.22 0.48 0.4 0.51 0.58 0.52 0.39 0.21 0.56 0.35 0.46 0.46 0.78 0.57 0.52 0.09 0.43 0.6 0.67 0.47 1.0
Cpa|evm.model.tig00020614.87 (tig00020614_g12202.t1)
0.83 0.69 0.72 0.77 0.72 0.69 0.6 0.54 0.43 0.49 0.43 0.42 0.65 0.98 0.81 0.97 0.65 1.0 0.8 0.65 0.35 0.39 0.36 0.53 0.65 0.91
Cpa|evm.model.tig00020660.26 (tig00020660_g12523.t1)
0.62 0.41 0.35 0.3 0.32 0.36 0.46 0.43 0.32 0.34 0.31 0.3 0.71 1.0 0.76 0.92 0.58 0.55 0.66 0.42 0.02 0.09 0.45 0.35 0.78 0.59
Cpa|evm.model.tig00020734.18 (tig00020734_g13574.t1)
0.18 0.58 0.39 0.68 0.67 0.67 0.52 0.57 0.41 0.65 0.42 0.33 0.08 0.27 0.37 0.24 0.33 0.85 1.0 0.52 0.01 0.37 0.32 0.55 0.38 0.58
Cpa|evm.model.tig00020848.18 (tig00020848_g14545.t1)
0.22 0.24 0.23 0.25 0.27 0.29 0.3 0.3 0.31 0.38 0.38 0.39 0.25 0.37 0.53 0.49 0.44 0.86 1.0 0.7 0.18 0.22 0.18 0.3 0.22 0.28
Cpa|evm.model.tig00020903.32 (tig00020903_g15099.t1)
1.0 0.7 0.61 0.53 0.39 0.3 0.57 0.55 0.35 0.34 0.29 0.26 0.8 0.69 0.77 0.55 0.62 0.87 0.75 0.66 0.11 0.17 0.24 0.26 0.84 0.84
Cpa|evm.model.tig00020903.39 (tig00020903_g15107.t1)
0.02 0.18 0.3 0.29 0.39 0.39 0.48 0.36 0.34 0.44 0.28 0.27 0.02 0.67 0.76 0.67 0.82 1.0 0.95 0.83 0.07 0.15 0.17 0.41 0.22 0.52
Cpa|evm.model.tig00020903.43 (tig00020903_g15112.t1)
0.39 0.51 0.55 0.57 0.57 0.55 0.75 0.68 0.66 0.7 0.63 0.55 0.36 1.0 0.96 0.87 0.74 0.9 0.91 0.81 0.22 0.54 0.6 0.67 0.4 0.73
Cpa|evm.model.tig00020918.1 (tig00020918_g15878.t1)
0.3 0.31 0.39 0.44 0.55 0.55 0.51 0.42 0.56 0.7 0.61 0.49 0.31 0.29 0.55 0.49 0.47 0.89 1.0 0.81 0.24 0.4 0.37 0.4 0.38 0.43
0.16 0.04 0.04 0.04 0.01 0.03 0.03 0.04 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.16 0.17 0.24 0.2 0.69 1.0 0.37 0.0 0.12 0.01 0.04 0.01 0.0
Cpa|evm.model.tig00021105.61 (tig00021105_g18280.t1)
0.29 0.32 0.15 0.28 0.34 0.24 0.34 0.28 0.36 0.46 0.26 0.25 0.25 0.58 0.66 0.64 0.62 0.74 1.0 0.7 0.02 0.11 0.3 0.69 0.11 0.75
Cpa|evm.model.tig00021123.30 (tig00021123_g18514.t1)
0.36 0.33 0.26 0.28 0.33 0.34 0.37 0.29 0.34 0.48 0.43 0.44 0.32 1.0 0.84 0.89 0.61 0.99 0.95 0.73 0.43 0.19 0.33 0.7 0.5 0.8
Cpa|evm.model.tig00021234.20 (tig00021234_g19394.t1)
0.15 0.3 0.32 0.27 0.3 0.31 0.28 0.31 0.32 0.35 0.31 0.32 0.18 0.25 0.41 0.28 0.44 0.69 1.0 0.56 0.06 0.13 0.15 0.3 0.19 0.26
Cpa|evm.model.tig00021348.84 (tig00021348_g20593.t1)
0.27 0.37 0.46 0.25 0.37 0.64 0.63 0.37 0.36 0.41 0.61 0.31 0.15 0.46 0.43 0.46 0.2 0.6 1.0 0.46 0.06 0.51 0.15 0.31 0.45 0.33
Cpa|evm.model.tig00021348.96 (tig00021348_g20603.t1)
0.4 0.38 0.34 0.3 0.28 0.22 0.36 0.32 0.28 0.33 0.25 0.26 0.36 0.59 0.78 0.62 0.49 0.91 1.0 0.52 0.21 0.2 0.33 0.31 0.39 0.51
Cpa|evm.model.tig00021352.42 (tig00021352_g20711.t1)
0.47 0.51 0.51 0.41 0.55 0.49 0.54 0.43 0.4 0.5 0.42 0.48 0.43 0.56 0.7 0.54 0.68 1.0 0.87 0.81 0.33 0.12 0.26 0.47 0.29 0.6
Cpa|evm.model.tig00021464.46 (tig00021464_g21750.t1)
0.97 0.74 0.77 0.59 0.45 0.38 0.51 0.59 0.48 0.59 0.6 0.62 1.0 0.82 0.94 0.95 0.76 0.92 0.92 0.82 0.16 0.2 0.35 0.45 0.83 0.84
Cpa|evm.model.tig00021489.46 (tig00021489_g21697.t1)
0.16 0.2 0.3 0.31 0.36 0.36 0.35 0.4 0.38 0.38 0.53 0.48 0.16 1.0 0.34 0.6 0.44 0.39 0.5 0.39 0.2 0.24 0.27 0.58 0.22 0.58
Cpa|evm.model.tig00021525.8 (tig00021525_g22124.t1)
0.21 0.38 0.48 0.61 0.6 0.57 0.52 0.45 0.61 0.54 0.66 0.6 0.24 0.3 0.45 0.35 0.51 0.92 1.0 0.74 0.05 0.27 0.32 0.64 0.35 0.44
Cpa|evm.model.tig00021537.45 (tig00021537_g22297.t1)
0.22 0.24 0.37 0.41 0.39 0.51 0.67 0.55 0.61 0.5 0.3 0.24 0.2 0.93 0.74 0.85 0.77 1.0 0.71 0.75 0.16 0.1 0.46 0.26 0.47 0.57
Cpa|evm.model.tig00021589.31 (tig00021589_g22738.t1)
0.16 0.29 0.41 0.46 0.57 0.7 0.69 0.58 0.82 0.68 0.64 0.5 0.17 0.54 0.55 0.55 0.66 1.0 0.99 0.88 0.22 0.42 0.46 0.43 0.37 0.55
Cpa|evm.model.tig00021612.26 (tig00021612_g22871.t1)
0.91 0.59 0.57 0.47 0.38 0.4 0.55 0.55 0.42 0.42 0.43 0.41 1.0 0.71 0.74 0.66 0.48 0.41 0.66 0.44 0.08 0.37 0.14 0.31 0.32 0.4
Cpa|evm.model.tig00021612.40 (tig00021612_g22882.t1)
0.81 0.89 0.88 0.74 0.66 0.46 0.5 0.56 0.51 0.51 0.56 0.65 0.67 0.49 0.63 1.0 0.75 0.97 0.83 0.69 0.17 0.68 0.21 0.54 0.45 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)