Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10808 (10808)	0.0	0.16	0.6	0.42	0.33	0.3	1.0	0.0	0.16	0.07	0.33
Transcript_contig_1086 (1086)	0.03	0.06	1.0	0.32	0.0	0.05	0.08	0.0	0.19	0.15	0.09
Transcript_contig_11178 (11178)	0.0	0.08	0.11	0.0	0.13	0.06	0.0	0.0	0.0	1.0	0.37
Transcript_contig_11400 (11400)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.51	1.0
Transcript_contig_11782 (11782)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.76	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_1187 (1187)	0.09	0.0	1.0	0.95	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_12432 (12432)	0.62	0.0	0.74	0.79	0.0	0.0	0.79	1.0	0.0	0.53	0.81
Transcript_contig_12838 (12838)	0.46	0.2	1.0	0.36	0.0	0.43	0.71	0.0	0.0	0.56	0.14
Transcript_contig_14533 (14533)	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	1.0	0.49
Transcript_contig_14751 (14751)	0.22	0.0	0.3	0.34	0.0	0.19	0.77	0.0	0.14	1.0	0.53
Transcript_contig_15123 (15123)	0.41	0.43	0.0	0.0	0.0	0.13	0.16	0.0	1.0	0.69	0.32
Transcript_contig_15811 (15811)	0.23	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.65
Transcript_contig_15898 (15898)	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39
Transcript_contig_16027 (16027)	0.27	0.06	1.0	0.64	0.0	0.16	0.07	0.0	0.54	0.44	0.19
Transcript_contig_16463 (16463)	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.2
Transcript_contig_16644 (16644)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	1.0	0.65
Transcript_contig_17371 (17371)	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_17540 (17540)	0.8	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	1.0	0.19
Transcript_contig_17935 (17935)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.49
Transcript_contig_18879 (18879)	0.06	0.17	0.0	0.0	0.0	0.35	0.21	0.0	0.0	1.0	0.87
Transcript_contig_1889 (1889)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_19387 (19387)	0.19	0.18	0.3	0.0	0.0	0.0	0.19	0.6	0.0	1.0	0.19
Transcript_contig_20078 (20078)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97
Transcript_contig_20158 (20158)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.49
Transcript_contig_21237 (21237)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_21670 (21670)	0.74	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_2178 (2178)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_22572 (22572)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_22678 (22678)	0.22	0.0	0.3	0.0	0.0	0.1	0.19	0.0	0.28	1.0	0.88
Transcript_contig_23262 (23262)	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0	1.0	0.97
Transcript_contig_24170 (24170)	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	1.0	0.32
Transcript_contig_25135 (25135)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97
Transcript_contig_2557 (2557)	0.34	0.0	0.17	0.25	0.0	0.7	1.0	0.0	0.0	1.0	0.74
Transcript_contig_28870 (28870)	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_2915 (2915)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.81	1.0	0.0
Transcript_contig_2956 (2956)	0.15	0.08	0.42	0.74	0.0	0.46	0.52	0.28	0.0	0.86	1.0
Transcript_contig_30005 (30005)	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.55	0.0	0.0	1.0	0.24
Transcript_contig_3040 (3040)	0.1	0.27	0.0	0.11	0.0	0.11	0.07	0.39	0.13	1.0	0.44
Transcript_contig_30879 (30879)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_31233 (31233)	0.19	0.0	0.0	0.9	0.18	0.09	0.26	0.0	0.0	1.0	0.57
Transcript_contig_3743 (3743)	0.11	0.13	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	1.0	0.1
Transcript_contig_38 (38)	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_40779 (40779)	0.03	0.07	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.13	1.0	0.87
Transcript_contig_42039 (42039)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97
Transcript_contig_42918 (42918)	0.28	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	1.0
Transcript_contig_4854 (4854)	0.16	0.0	0.0	0.11	1.0	0.08	0.36	0.3	0.0	0.42	0.62
Transcript_contig_4856 (4856)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_4993 (4993)	0.25	0.0	0.48	0.71	0.23	0.11	0.31	0.0	0.0	1.0	0.44
Transcript_contig_55644 (55644)	0.25	0.34	0.48	0.38	0.0	0.81	0.64	0.24	0.0	1.0	0.45
Transcript_contig_560 (560)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.33	0.0	0.0	1.0	0.49
Transcript_contig_5655 (5655)	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0
Transcript_contig_5690 (5690)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.21	0.0	0.0	1.0	0.58
Transcript_contig_5709 (5709)	0.43	0.0	1.0	0.69	0.2	0.0	0.81	0.0	0.0	0.37	0.0
Transcript_contig_59032 (59032)	0.01	0.05	1.0	0.45	0.0	0.04	0.13	0.0	0.03	0.18	0.1
Transcript_contig_59500 (59500)	0.48	0.34	1.0	0.0	0.0	0.48	0.63	0.5	0.0	0.67	0.14
Transcript_contig_60240 (60240)	0.11	0.28	0.5	0.42	0.0	0.07	0.09	0.25	0.08	1.0	0.88
Transcript_contig_60727 (60727)	0.66	0.62	0.17	0.29	0.1	0.38	0.22	0.17	0.0	1.0	0.59
Transcript_contig_60758 (60758)	0.45	0.0	0.77	0.24	1.0	0.3	0.91	0.0	0.0	0.43	0.61
Transcript_contig_60883 (60883)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_61009 (61009)	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.81	1.0	0.33
Transcript_contig_61079 (61079)	0.11	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	1.0	0.15
Transcript_contig_6114 (6114)	0.65	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_61162 (61162)	0.07	0.22	0.0	0.0	0.0	0.1	0.67	1.0	0.0	0.55	0.27
Transcript_contig_62664 (62664)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.65
Transcript_contig_62740 (62740)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.11
Transcript_contig_6277 (6277)	0.24	0.06	0.97	0.24	0.18	0.11	0.6	0.13	0.0	1.0	0.33
Transcript_contig_62779 (62779)	0.18	0.21	0.36	0.14	0.0	0.03	0.08	0.24	0.0	1.0	0.55
Transcript_contig_63091 (63091)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.42
Transcript_contig_63123 (63123)	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.54
Transcript_contig_63299 (63299)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_63344 (63344)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.49
Transcript_contig_63379 (63379)	0.35	0.04	1.0	0.22	0.0	0.06	0.35	0.22	0.0	0.31	0.0
Transcript_contig_63661 (63661)	0.0	0.0	0.42	0.15	0.0	0.11	1.0	0.0	0.57	0.7	0.88
Transcript_contig_63734 (63734)	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	1.0	0.16
Transcript_contig_63956 (63956)	0.0	0.0	0.85	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.8
Transcript_contig_64025 (64025)	0.1	0.0	0.45	0.0	0.62	0.0	1.0	0.0	0.0	0.51	0.0
Transcript_contig_64060 (64060)	0.3	0.0	0.51	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.4
Transcript_contig_64436 (64436)	0.0	0.0	0.0	0.19	0.23	0.1	0.07	0.0	0.0	1.0	0.69
Transcript_contig_64466 (64466)	0.0	0.0	0.0	0.52	0.19	0.09	0.3	0.0	0.0	1.0	0.62
Transcript_contig_6452 (6452)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_64632 (64632)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.21
Transcript_contig_64983 (64983)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_65897 (65897)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	1.0	0.19
Transcript_contig_65912 (65912)	0.29	0.46	0.25	0.14	0.68	0.0	1.0	0.51	0.0	0.69	0.82
Transcript_contig_6598 (6598)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.11
Transcript_contig_66248 (66248)	0.0	0.0	0.28	0.62	0.32	0.0	0.76	0.28	0.0	1.0	0.15
Transcript_contig_66477 (66477)	0.59	1.0	0.78	0.84	0.46	0.44	0.48	0.0	0.0	0.44	0.5
Transcript_contig_66499 (66499)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.56
Transcript_contig_66585 (66585)	0.0	0.19	0.0	0.24	0.3	0.0	0.16	0.0	0.0	1.0	0.28
Transcript_contig_66746 (66746)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67552 (67552)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.63	0.46
Transcript_contig_67787 (67787)	0.49	0.51	0.2	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	1.0	0.43
Transcript_contig_68065 (68065)	0.21	0.18	1.0	0.61	0.11	0.05	0.36	0.21	0.25	0.05	0.21
Transcript_contig_68270 (68270)	0.31	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.55	0.55
Transcript_contig_68344 (68344)	0.34	0.32	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.58
Transcript_contig_68418 (68418)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.84
Transcript_contig_68575 (68575)	0.21	0.3	0.0	0.43	0.0	0.81	0.86	0.0	0.0	0.2	1.0
Transcript_contig_68786 (68786)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.84
Transcript_contig_69445 (69445)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.65
Transcript_contig_69832 (69832)	0.22	0.09	0.72	0.38	0.22	0.23	1.0	0.0	0.0	0.53	0.52
Transcript_contig_71506 (71506)	0.1	0.07	0.0	0.18	0.26	0.18	0.0	0.0	0.46	1.0	0.75
Transcript_contig_71894 (71894)	0.16	0.0	0.37	0.13	0.5	0.43	0.27	0.0	0.0	0.62	1.0
Transcript_contig_72858 (72858)	0.18	0.78	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.94
Transcript_contig_73444 (73444)	0.03	0.09	0.0	0.0	0.19	0.08	0.0	0.0	0.0	1.0	0.62
Transcript_contig_73478 (73478)	0.68	0.41	0.0	0.42	1.0	0.4	0.85	0.49	1.0	0.73	0.36
Transcript_contig_7355 (7355)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97
Transcript_contig_7463 (7463)	0.14	0.58	0.0	0.0	0.0	0.36	0.17	0.0	0.61	1.0	0.0
Transcript_contig_74910 (74910)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	1.0	0.51
Transcript_contig_7539 (7539)	0.08	0.23	1.0	0.0	0.0	0.12	0.51	0.4	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_7659 (7659)	0.46	0.16	0.52	0.48	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	1.0	0.95
Transcript_contig_79905 (79905)	0.36	0.5	0.26	0.09	0.04	0.14	0.09	0.13	0.0	1.0	0.82
Transcript_contig_80796 (80796)	0.09	0.14	0.0	0.06	0.0	0.32	0.11	0.17	0.0	1.0	0.19
Transcript_contig_8184 (8184)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_82757 (82757)	0.13	0.0	0.6	0.18	0.44	0.15	0.64	0.0	0.18	1.0	0.4
Transcript_contig_82852 (82852)	0.3	0.14	0.94	0.33	0.27	0.14	1.0	0.0	0.0	0.0	0.41
Transcript_contig_83038 (83038)	0.0	0.0	0.13	0.42	0.0	0.19	0.16	0.0	0.0	1.0	0.14
Transcript_contig_83099 (83099)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97
Transcript_contig_83428 (83428)	0.86	1.0	0.0	0.81	0.16	0.0	0.0	0.27	0.0	0.38	0.84
Transcript_contig_83600 (83600)	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.61	1.0	0.66
Transcript_contig_84136 (84136)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	1.0	0.81
Transcript_contig_84190 (84190)	0.41	0.33	0.0	0.25	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	1.0	0.45
Transcript_contig_84535 (84535)	0.14	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_8783 (8783)	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	1.0	0.32
Transcript_contig_90538 (90538)	0.34	0.16	0.96	0.88	0.36	0.31	1.0	0.0	0.16	0.68	0.42
Transcript_contig_90736 (90736)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.48
Transcript_contig_91013 (91013)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	1.0
Transcript_contig_91493 (91493)	0.26	0.0	0.0	0.34	0.7	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_91575 (91575)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.32
Transcript_contig_9661 (9661)	0.29	0.2	0.84	0.44	0.56	1.0	0.88	0.16	0.6	0.89	0.27
Transcript_contig_9737 (9737)	0.22	0.04	0.21	0.34	0.8	0.06	1.0	0.42	0.0	0.69	0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)