Heatmap: Cluster_184 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11286 (11286)	0.23	0.22	0.21	0.74	1.0	0.19	0.47	0.07	0.0	0.42	0.38
Transcript_contig_14522 (14522)	0.09	0.05	0.07	0.53	1.0	0.13	0.13	0.0	0.07	0.45	0.32
Transcript_contig_14787 (14787)	0.18	0.17	0.27	0.79	1.0	0.33	0.75	0.19	0.02	0.63	0.24
Transcript_contig_1572 (1572)	0.2	0.21	0.15	0.57	1.0	0.36	0.35	0.23	0.06	0.27	0.21
Transcript_contig_15830 (15830)	0.11	0.23	0.27	0.57	1.0	0.16	0.39	0.24	0.02	0.26	0.25
Transcript_contig_1868 (1868)	0.25	0.28	0.32	0.54	1.0	0.42	0.28	0.22	0.07	0.53	0.34
Transcript_contig_4845 (4845)	0.14	0.1	0.16	0.48	1.0	0.35	0.35	0.05	0.0	0.38	0.31
Transcript_contig_53884 (53884)	0.28	0.26	0.41	0.7	1.0	0.37	0.3	0.15	0.12	0.56	0.43
Transcript_contig_54091 (54091)	0.19	0.15	0.17	0.61	1.0	0.22	0.4	0.11	0.16	0.43	0.29
Transcript_contig_54139 (54139)	0.25	0.18	0.26	0.72	1.0	0.41	0.52	0.17	0.08	0.38	0.25
Transcript_contig_54919 (54919)	0.23	0.15	0.18	0.79	1.0	0.39	0.54	0.18	0.07	0.5	0.31
Transcript_contig_55352 (55352)	0.19	0.18	0.27	0.69	1.0	0.21	0.31	0.11	0.09	0.49	0.36
Transcript_contig_56124 (56124)	0.21	0.2	0.26	0.67	1.0	0.42	0.35	0.09	0.25	0.56	0.4
Transcript_contig_56126 (56126)	0.14	0.07	0.14	0.42	1.0	0.21	0.27	0.05	0.14	0.57	0.32
Transcript_contig_56606 (56606)	0.13	0.12	0.11	0.55	1.0	0.34	0.35	0.16	0.02	0.38	0.25
Transcript_contig_57047 (57047)	0.18	0.17	0.34	0.7	1.0	0.27	0.33	0.21	0.05	0.37	0.25
Transcript_contig_57231 (57231)	0.12	0.09	0.14	0.61	1.0	0.21	0.27	0.09	0.12	0.33	0.27
Transcript_contig_57256 (57256)	0.3	0.31	0.35	0.76	1.0	0.41	0.4	0.25	0.11	0.61	0.39
Transcript_contig_57318 (57318)	0.17	0.14	0.18	0.61	1.0	0.16	0.21	0.11	0.22	0.4	0.35
Transcript_contig_57322 (57322)	0.29	0.32	0.42	0.79	1.0	0.55	0.29	0.26	0.09	0.62	0.42
Transcript_contig_57651 (57651)	0.21	0.15	0.2	0.75	1.0	0.31	0.44	0.13	0.04	0.51	0.36
Transcript_contig_57752 (57752)	0.21	0.23	0.11	0.59	1.0	0.41	0.4	0.24	0.06	0.36	0.25
Transcript_contig_57756 (57756)	0.12	0.14	0.21	0.7	1.0	0.2	0.34	0.14	0.02	0.4	0.26
Transcript_contig_57762 (57762)	0.18	0.23	0.23	0.78	1.0	0.46	0.31	0.21	0.01	0.4	0.4
Transcript_contig_58473 (58473)	0.25	0.28	0.19	0.67	1.0	0.31	0.42	0.29	0.13	0.34	0.27
Transcript_contig_58520 (58520)	0.16	0.15	0.23	0.64	1.0	0.24	0.28	0.22	0.03	0.24	0.27
Transcript_contig_58763 (58763)	0.14	0.1	0.3	0.63	1.0	0.34	0.35	0.14	0.1	0.43	0.3
Transcript_contig_59118 (59118)	0.39	0.34	0.27	1.0	0.87	0.49	0.56	0.54	0.04	0.72	0.51
Transcript_contig_59219 (59219)	0.1	0.04	0.31	0.84	1.0	0.48	0.41	0.02	0.05	0.55	0.34
Transcript_contig_59270 (59270)	0.21	0.21	0.29	0.72	1.0	0.27	0.32	0.12	0.12	0.55	0.36
Transcript_contig_59402 (59402)	0.19	0.24	0.27	0.65	1.0	0.34	0.31	0.39	0.15	0.49	0.34
Transcript_contig_59693 (59693)	0.12	0.08	0.22	0.52	1.0	0.22	0.34	0.04	0.05	0.56	0.3
Transcript_contig_60151 (60151)	0.11	0.09	0.22	0.6	1.0	0.36	0.51	0.05	0.03	0.58	0.35
Transcript_contig_60194 (60194)	0.15	0.09	0.23	0.87	1.0	0.22	0.36	0.14	0.09	0.29	0.31
Transcript_contig_60270 (60270)	0.37	0.31	0.29	1.0	1.0	0.57	0.71	0.13	0.11	0.76	0.48
Transcript_contig_60825 (60825)	0.16	0.11	0.21	0.59	1.0	0.34	0.46	0.11	0.07	0.44	0.32
Transcript_contig_61235 (61235)	0.09	0.08	0.2	0.75	1.0	0.33	0.29	0.06	0.0	0.33	0.18
Transcript_contig_61369 (61369)	0.23	0.17	0.17	0.74	1.0	0.41	0.5	0.09	0.13	0.41	0.38
Transcript_contig_62438 (62438)	0.07	0.09	0.06	0.32	1.0	0.08	0.08	0.09	0.01	0.24	0.21
Transcript_contig_62481 (62481)	0.04	0.02	0.17	0.59	1.0	0.38	0.37	0.02	0.01	0.37	0.22
Transcript_contig_63197 (63197)	0.24	0.34	0.2	0.71	1.0	0.71	0.38	0.75	0.3	0.46	0.31
Transcript_contig_67851 (67851)	0.2	0.18	0.17	0.56	1.0	0.23	0.28	0.21	0.09	0.38	0.27
Transcript_contig_68038 (68038)	0.17	0.06	0.21	0.59	1.0	0.15	0.36	0.04	0.0	0.54	0.36
Transcript_contig_68482 (68482)	0.14	0.03	0.26	0.72	1.0	0.5	0.4	0.04	0.03	0.55	0.32
Transcript_contig_69151 (69151)	0.27	0.21	0.3	1.0	0.99	0.37	0.42	0.04	0.01	0.56	0.3
Transcript_contig_69945 (69945)	0.04	0.0	0.06	0.62	1.0	0.18	0.09	0.0	0.07	0.4	0.3
Transcript_contig_70818 (70818)	0.16	0.17	0.46	0.9	1.0	0.65	0.45	0.18	0.0	0.47	0.31
Transcript_contig_78868 (78868)	0.2	0.16	0.22	0.6	1.0	0.31	0.35	0.19	0.14	0.44	0.33
Transcript_contig_79196 (79196)	0.16	0.13	0.24	0.92	1.0	0.36	0.49	0.23	0.07	0.39	0.23
Transcript_contig_79496 (79496)	0.25	0.21	0.24	0.88	1.0	0.55	0.64	0.32	0.08	0.72	0.42
Transcript_contig_80660 (80660)	0.32	0.39	0.25	0.76	1.0	0.7	0.58	0.28	0.03	0.66	0.5
Transcript_contig_80821 (80821)	0.09	0.05	0.16	0.52	1.0	0.31	0.26	0.03	0.12	0.44	0.33
Transcript_contig_89216 (89216)	0.31	0.28	0.35	0.84	1.0	0.36	0.57	0.29	0.16	0.64	0.44
Transcript_contig_89762 (89762)	0.16	0.13	0.27	0.7	1.0	0.39	0.43	0.11	0.05	0.29	0.23
Transcript_contig_90177 (90177)	0.23	0.19	0.22	0.92	1.0	0.29	0.55	0.24	0.08	0.44	0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)