Heatmap: Cluster_200 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.14 (tig00000042_g15401.t1)	0.39	0.27	0.26	0.41	0.4	0.29	0.31	0.39	0.39	0.44	0.5	0.39	0.36	0.33	0.31	0.66	0.29	0.37	0.3	0.27	0.14	0.42	1.0	0.64	0.68	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000057.36 (tig00000057_g53.t1)	0.45	0.39	0.35	0.51	0.56	0.42	0.56	0.53	0.46	0.49	0.51	0.44	0.43	0.39	0.39	0.44	0.53	0.71	0.45	0.46	0.17	1.0	0.85	0.68	0.69	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000093.30 (tig00000093_g3466.t1)	0.64	0.53	0.45	0.63	0.68	0.57	0.79	0.77	0.73	0.62	0.57	0.42	0.52	0.44	0.41	0.45	0.47	0.64	0.49	0.39	0.14	0.73	1.0	0.53	0.94	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000145.25 (tig00000145_g8821.t1)	0.55	0.32	0.26	0.28	0.31	0.29	0.47	0.52	0.54	0.57	0.68	0.52	0.55	0.55	0.29	0.46	0.29	0.53	0.36	0.28	0.25	0.77	1.0	0.58	0.68	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000147.17 (tig00000147_g9454.t1)	0.21	0.15	0.1	0.29	0.33	0.19	0.3	0.27	0.31	0.3	0.4	0.26	0.26	0.28	0.16	0.34	0.13	0.25	0.19	0.12	0.42	0.51	1.0	0.32	0.51	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000157.84 (tig00000157_g9673.t1)	0.46	0.32	0.29	0.53	0.3	0.25	0.38	0.51	0.46	0.57	0.7	0.49	0.42	0.51	0.27	0.51	0.22	0.45	0.29	0.25	0.18	0.46	0.98	0.52	1.0	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000204.87 (tig00000204_g17754.t1)	0.4	0.44	0.47	0.61	0.64	0.52	0.68	0.74	0.66	0.66	0.74	0.7	0.49	0.74	0.54	0.68	0.55	0.6	0.47	0.39	0.42	1.0	0.85	0.64	0.95	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000227.55 (tig00000227_g19853.t1)	0.61	0.43	0.46	0.54	0.57	0.47	0.61	0.66	0.58	0.58	0.67	0.64	0.67	0.62	0.63	0.86	0.43	0.74	0.5	0.37	0.46	0.87	1.0	0.72	0.67	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000237.19 (tig00000237_g20468.t1)	0.32	0.26	0.25	0.32	0.36	0.27	0.4	0.45	0.31	0.38	0.4	0.32	0.3	0.49	0.37	0.48	0.36	0.5	0.42	0.4	0.58	0.5	1.0	0.57	0.63	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000254.130 (tig00000254_g22590.t1)	0.21	0.14	0.16	0.28	0.33	0.35	0.4	0.39	0.46	0.6	0.61	0.52	0.25	0.7	0.34	0.54	0.25	0.29	0.29	0.26	0.11	0.69	0.83	0.66	1.0	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000254.56 (tig00000254_g22509.t1)	0.51	0.33	0.47	0.5	0.51	0.44	0.64	0.63	0.68	0.71	0.89	1.0	0.66	0.64	0.33	0.7	0.41	0.53	0.41	0.56	0.22	0.82	0.92	0.69	0.78	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000383.45 (tig00000383_g24658.t1)	0.34	0.43	0.42	0.53	0.65	0.64	0.57	0.53	0.38	0.44	0.44	0.4	0.33	0.42	0.45	0.47	0.44	0.57	0.48	0.43	0.2	1.0	0.69	0.67	0.72	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000403.63 (tig00000403_g322.t1)	0.44	0.25	0.27	0.41	0.36	0.24	0.37	0.45	0.47	0.53	0.71	0.68	0.47	0.38	0.24	0.44	0.15	0.3	0.22	0.19	0.36	0.5	1.0	0.54	0.58	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000492.85 (tig00000492_g1479.t1)	0.36	0.32	0.35	0.49	0.59	0.42	0.55	0.59	0.79	0.7	0.83	0.74	0.35	0.5	0.42	0.54	0.39	0.51	0.41	0.31	0.2	0.69	1.0	0.81	0.77	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000615.50 (tig00000615_g2580.t1)	0.31	0.53	0.45	0.74	0.74	0.54	0.72	0.83	0.76	0.71	0.91	0.8	0.21	0.77	0.88	0.56	0.4	0.46	0.46	0.32	0.1	0.95	0.94	0.8	1.0	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000718.14 (tig00000718_g3690.t1)	0.58	0.47	0.5	0.67	0.71	0.65	0.82	0.84	1.0	1.0	0.98	0.86	0.61	0.97	0.58	0.83	0.47	0.57	0.52	0.44	0.6	0.82	0.9	0.87	0.9	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000718.19 (tig00000718_g3695.t1)	0.19	0.17	0.21	0.32	0.37	0.28	0.37	0.44	0.33	0.43	0.56	0.51	0.24	0.75	0.37	0.63	0.4	0.37	0.28	0.22	0.35	0.87	0.9	0.61	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000788.1 (tig00000788_g4063.t1)	0.56	0.32	0.32	0.51	0.62	0.43	0.52	0.63	0.52	0.47	0.72	0.69	0.29	0.75	0.56	0.5	0.21	0.47	0.36	0.25	0.27	0.91	1.0	0.44	1.0	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000789.57 (tig00000789_g4149.t1)	0.56	0.43	0.46	0.54	0.51	0.44	0.67	0.7	0.72	0.66	0.73	0.7	0.53	0.79	0.48	0.64	0.42	0.53	0.44	0.39	0.31	1.0	0.89	0.66	0.59	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000826.18 (tig00000826_g4585.t1)	0.49	0.51	0.44	0.51	0.54	0.4	0.57	0.59	0.63	0.79	0.88	0.83	0.59	0.71	0.54	0.62	0.52	0.77	0.57	0.45	0.21	0.98	1.0	0.71	0.96	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000880.54 (tig00000880_g5213.t1)	0.53	0.45	0.42	0.59	0.52	0.47	0.57	0.61	0.68	0.71	0.69	0.65	0.54	0.48	0.43	0.54	0.41	0.59	0.39	0.32	0.24	0.74	0.89	0.53	1.0	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000882.10 (tig00000882_g5254.t1)	0.46	0.33	0.29	0.47	0.34	0.27	0.37	0.44	0.4	0.44	0.56	0.53	0.5	0.51	0.32	0.32	0.34	0.28	0.31	0.27	0.26	0.48	1.0	0.73	0.65	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000949.20 (tig00000949_g5732.t1)	0.35	0.24	0.22	0.3	0.33	0.24	0.36	0.43	0.4	0.53	0.68	0.63	0.4	0.37	0.16	0.34	0.2	0.16	0.17	0.21	0.3	0.71	1.0	0.64	0.7	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000983.14 (tig00000983_g5906.t1)	0.41	0.29	0.31	0.38	0.31	0.27	0.53	0.64	0.57	0.63	0.66	0.59	0.44	0.78	0.38	0.8	0.46	0.91	0.44	0.42	0.39	0.93	0.97	0.86	1.0	0.77
Cpa\|evm.model.tig00001215.1 (tig00001215_g7566.t1)	0.44	0.34	0.29	0.46	0.55	0.37	0.51	0.53	0.43	0.48	0.42	0.35	0.39	0.44	0.38	0.53	0.39	0.53	0.55	0.36	0.42	1.0	0.75	0.57	0.57	0.56
Cpa\|evm.model.tig00001265.3 (tig00001265_g7889.t1)	0.34	0.3	0.34	0.31	0.34	0.28	0.33	0.34	0.31	0.28	0.3	0.32	0.29	0.41	0.43	0.47	0.34	0.31	0.3	0.3	0.12	0.27	1.0	0.45	0.65	0.45
Cpa\|evm.model.tig00001339.17 (tig00001339_g8272.t1)	0.61	0.51	0.43	0.53	0.61	0.48	0.72	0.88	0.76	0.7	0.62	0.44	0.5	0.49	0.47	0.72	0.57	0.88	0.57	0.52	0.24	1.0	0.95	0.6	0.99	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020554.101 (tig00020554_g10878.t1)	0.44	0.41	0.33	0.55	0.62	0.46	0.58	0.64	0.67	0.64	0.7	0.54	0.41	0.61	0.56	0.64	0.6	0.85	0.61	0.35	0.3	0.94	1.0	0.82	0.76	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020572.38 (tig00020572_g11558.t1)	0.7	0.32	0.24	0.47	0.52	0.45	0.8	0.94	0.71	0.66	0.68	0.44	0.59	0.42	0.38	0.83	0.3	0.46	0.5	0.3	0.28	0.92	1.0	0.75	0.98	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020610.112 (tig00020610_g12058.t1)	0.25	0.19	0.19	0.3	0.3	0.31	0.35	0.35	0.37	0.38	0.38	0.52	0.33	0.72	0.42	0.61	0.32	0.45	0.29	0.29	0.48	0.53	1.0	0.35	0.55	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020610.85 (tig00020610_g12032.t1)	0.32	0.24	0.36	0.52	0.46	0.37	0.75	0.69	0.53	0.38	0.36	0.29	0.28	0.3	0.37	0.46	0.42	0.58	0.5	0.39	0.29	1.0	0.7	0.41	0.69	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020629.22 (tig00020629_g12341.t1)	0.53	0.43	0.46	0.52	0.53	0.35	0.47	0.55	0.56	0.56	0.69	0.58	0.42	0.5	0.4	0.38	0.36	0.61	0.48	0.36	0.14	0.5	1.0	0.47	0.93	0.86
Cpa\|evm.model.tig00020693.28 (tig00020693_g13035.t1)	0.29	0.31	0.36	0.56	0.47	0.24	0.44	0.64	0.54	0.46	0.62	0.47	0.33	0.66	0.52	0.6	0.42	0.63	0.35	0.24	0.36	0.54	0.97	0.45	1.0	0.82
Cpa\|evm.model.tig00020746.5 (tig00020746_g13654.t1)	0.44	0.35	0.37	0.45	0.5	0.48	0.63	0.68	0.65	0.76	0.7	0.58	0.46	0.37	0.34	0.35	0.29	0.51	0.44	0.42	0.38	0.88	1.0	0.71	0.9	0.92
Cpa\|evm.model.tig00020816.62 (tig00020816_g14149.t1)	0.35	0.17	0.1	0.21	0.18	0.15	0.25	0.38	0.37	0.56	0.77	0.51	0.37	0.06	0.02	0.04	0.04	0.1	0.04	0.08	0.28	0.54	1.0	0.67	0.59	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020830.124 (tig00020830_g14513.t1)	0.31	0.25	0.27	0.44	0.43	0.39	0.5	0.46	0.69	0.59	0.66	0.44	0.34	0.44	0.31	0.33	0.23	0.28	0.3	0.19	0.12	0.88	1.0	0.59	0.76	0.81
Cpa\|evm.model.tig00020902.14 (tig00020902_g14958.t1)	0.15	0.16	0.17	0.22	0.15	0.14	0.18	0.3	0.21	0.34	0.38	0.41	0.16	0.32	0.12	0.22	0.1	0.22	0.12	0.1	0.09	0.34	1.0	0.58	0.65	0.57
Cpa\|evm.model.tig00020904.43 (tig00020904_g15176.t1)	0.25	0.23	0.33	0.43	0.45	0.48	0.59	0.55	0.71	0.77	0.92	1.0	0.39	0.69	0.35	0.55	0.34	0.44	0.34	0.34	0.4	0.81	0.77	0.86	0.67	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020944.34 (tig00020944_g16380.t1)	0.41	0.28	0.33	0.42	0.41	0.37	0.53	0.58	0.62	0.71	0.65	0.61	0.52	0.92	0.52	0.82	0.45	0.66	0.44	0.45	0.38	0.68	1.0	0.59	0.88	0.78
Cpa\|evm.model.tig00021127.114 (tig00021127_g18794.t1)	0.22	0.25	0.29	0.37	0.45	0.35	0.49	0.58	0.63	0.5	0.52	0.38	0.15	0.32	0.39	0.49	0.29	0.53	0.34	0.26	0.03	0.62	1.0	0.63	0.76	0.56
Cpa\|evm.model.tig00021246.10 (tig00021246_g19610.t1)	0.34	0.21	0.25	0.28	0.25	0.31	0.4	0.57	0.51	0.55	0.64	0.62	0.29	0.44	0.24	0.45	0.31	0.31	0.23	0.26	0.21	0.34	1.0	0.61	0.77	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021281.14 (tig00021281_g19916.t1)	0.36	0.4	0.47	0.71	0.69	0.47	0.6	0.71	0.55	0.6	0.66	0.59	0.32	0.59	0.64	0.67	0.48	0.66	0.59	0.33	0.36	1.0	0.79	0.58	0.86	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021326.41 (tig00021326_g20304.t1)	0.48	0.28	0.21	0.36	0.3	0.18	0.26	0.34	0.33	0.43	0.53	0.53	0.51	0.44	0.42	0.39	0.26	0.29	0.16	0.17	0.25	0.56	1.0	0.41	0.86	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021463.22 (tig00021463_g21630.t1)	0.24	0.18	0.13	0.38	0.29	0.3	0.32	0.35	0.41	0.47	0.46	0.52	0.26	0.38	0.3	0.4	0.12	0.33	0.3	0.18	0.31	0.77	1.0	0.56	0.68	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021493.3 (tig00021493_g21845.t1)	0.3	0.29	0.25	0.3	0.33	0.27	0.43	0.46	0.41	0.3	0.36	0.24	0.27	0.28	0.27	0.32	0.3	0.73	0.39	0.29	0.34	0.92	0.77	0.32	1.0	0.56
Cpa\|evm.model.tig00021537.21 (tig00021537_g22277.t1)	0.49	0.45	0.47	0.56	0.53	0.52	0.7	0.69	0.69	0.73	0.73	0.77	0.52	0.71	0.49	0.68	0.48	0.54	0.49	0.4	0.28	0.79	1.0	0.59	0.82	0.83

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)