Heatmap: Cluster_167 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_100 (100)	0.7	0.5	0.66	0.91	1.0	0.57	0.82	0.33	0.18	0.55	0.49
Transcript_contig_1050 (1050)	0.27	0.01	0.37	0.21	0.27	0.62	0.63	0.0	0.04	1.0	0.95
Transcript_contig_12182 (12182)	0.15	0.0	0.42	0.21	0.04	0.34	0.44	0.0	0.0	1.0	0.49
Transcript_contig_12435 (12435)	0.36	0.13	0.09	0.11	0.0	0.0	0.05	0.18	0.24	1.0	0.54
Transcript_contig_138 (138)	0.24	0.09	0.05	0.49	0.93	0.2	0.12	0.06	0.02	1.0	0.73
Transcript_contig_16934 (16934)	0.45	0.36	0.38	1.0	0.66	0.41	0.59	0.09	0.57	0.94	0.77
Transcript_contig_19305 (19305)	0.7	0.15	1.0	0.29	0.08	0.33	0.4	0.24	0.0	0.51	0.73
Transcript_contig_2876 (2876)	0.63	0.62	1.0	0.85	0.66	0.64	0.96	0.44	0.64	0.43	0.64
Transcript_contig_2888 (2888)	0.29	0.0	0.92	1.0	0.91	0.34	0.95	0.0	0.0	0.45	0.5
Transcript_contig_4104 (4104)	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	1.0	0.13
Transcript_contig_54510 (54510)	0.36	0.34	0.53	1.0	0.71	0.4	0.87	0.31	0.0	0.23	0.09
Transcript_contig_55456 (55456)	0.71	0.71	0.4	0.71	0.78	0.55	0.79	0.64	1.0	0.66	0.48
Transcript_contig_56814 (56814)	0.31	0.2	0.81	1.0	0.71	0.38	0.63	0.1	0.07	0.37	0.37
Transcript_contig_58351 (58351)	0.47	0.27	0.41	0.94	1.0	0.48	0.87	0.22	0.72	0.5	0.31
Transcript_contig_58477 (58477)	0.44	0.53	0.26	0.57	0.74	0.21	0.59	1.0	0.22	0.22	0.22
Transcript_contig_58912 (58912)	0.36	0.39	0.01	0.83	0.9	0.51	1.0	0.55	0.01	0.23	0.14
Transcript_contig_59139 (59139)	0.35	0.4	0.46	1.0	0.88	0.67	0.7	0.15	0.01	0.56	0.35
Transcript_contig_59162 (59162)	0.25	0.0	0.45	0.66	1.0	0.45	0.83	0.0	0.0	0.81	0.77
Transcript_contig_59213 (59213)	0.2	0.11	0.45	0.35	1.0	0.41	0.48	0.09	0.0	0.32	0.44
Transcript_contig_60547 (60547)	0.49	0.39	0.01	0.73	0.94	0.74	1.0	0.37	0.35	0.57	0.28
Transcript_contig_60559 (60559)	0.56	0.48	1.0	0.87	0.57	0.59	0.75	0.82	0.0	0.3	0.4
Transcript_contig_60715 (60715)	0.28	0.25	0.52	1.0	0.79	0.51	0.65	0.17	0.0	0.32	0.22
Transcript_contig_60771 (60771)	0.19	0.09	0.48	0.38	0.19	0.41	1.0	0.0	0.76	0.18	0.12
Transcript_contig_61954 (61954)	0.18	0.0	0.34	0.44	1.0	0.56	0.74	0.0	0.0	0.33	0.4
Transcript_contig_62864 (62864)	0.4	0.76	0.36	0.18	0.05	0.28	0.26	0.45	0.12	1.0	0.78
Transcript_contig_63615 (63615)	0.23	0.15	0.79	1.0	0.21	0.28	0.73	0.12	0.0	0.85	0.73
Transcript_contig_64535 (64535)	0.25	0.11	0.71	0.42	0.65	0.53	1.0	0.0	0.81	0.14	0.39
Transcript_contig_65585 (65585)	0.5	0.4	1.0	0.59	0.0	0.42	0.36	0.45	0.3	0.49	0.78
Transcript_contig_66269 (66269)	0.26	0.05	0.66	0.94	1.0	0.31	0.58	0.0	0.02	0.17	0.22
Transcript_contig_6700 (6700)	0.03	0.0	0.08	0.34	1.0	0.43	0.31	0.0	0.11	0.3	0.21
Transcript_contig_67818 (67818)	0.77	0.64	0.18	1.0	0.0	0.32	0.37	0.0	0.0	0.1	0.0
Transcript_contig_68068 (68068)	0.67	0.5	0.5	1.0	0.99	0.67	0.89	0.37	0.05	0.55	0.55
Transcript_contig_68208 (68208)	0.93	0.49	1.0	0.68	0.0	0.67	0.81	0.45	0.6	0.29	0.05
Transcript_contig_68253 (68253)	0.34	0.16	0.98	1.0	0.7	0.37	0.55	0.02	0.32	0.18	0.25
Transcript_contig_68701 (68701)	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_7020 (7020)	0.37	0.71	0.17	0.06	0.28	0.06	0.08	1.0	0.0	0.52	0.56
Transcript_contig_70618 (70618)	0.24	0.33	1.0	0.95	0.74	0.34	0.94	0.29	0.14	0.28	0.17
Transcript_contig_70893 (70893)	0.47	0.47	0.2	0.5	1.0	0.21	0.13	0.4	0.0	0.81	0.07
Transcript_contig_71883 (71883)	0.33	0.4	0.1	0.18	0.0	0.16	0.24	1.0	0.0	0.3	0.02
Transcript_contig_72909 (72909)	0.2	0.0	0.08	0.43	0.7	0.5	0.61	0.0	0.27	0.79	1.0
Transcript_contig_75822 (75822)	0.81	0.6	0.1	0.84	0.78	0.94	0.58	0.62	0.0	1.0	0.7
Transcript_contig_78909 (78909)	0.3	0.0	0.52	1.0	0.79	0.53	0.73	0.0	0.0	0.58	0.44
Transcript_contig_79602 (79602)	0.41	0.29	0.79	1.0	0.45	0.54	0.98	0.24	0.15	0.66	0.35
Transcript_contig_80378 (80378)	0.03	0.01	0.15	0.56	1.0	0.44	0.25	0.0	0.07	0.16	0.35
Transcript_contig_80458 (80458)	0.18	0.0	0.58	0.4	0.27	0.73	0.76	0.0	0.0	1.0	0.75
Transcript_contig_80476 (80476)	0.75	0.86	0.78	0.71	0.78	0.37	1.0	0.68	0.0	0.38	0.1
Transcript_contig_80539 (80539)	0.29	0.21	0.05	0.48	1.0	0.41	0.34	0.36	0.0	0.18	0.24
Transcript_contig_80802 (80802)	0.49	0.44	0.19	0.46	1.0	0.18	0.37	0.67	0.26	0.34	0.21
Transcript_contig_80846 (80846)	0.18	0.1	0.73	0.89	0.42	0.23	0.81	0.05	0.03	1.0	0.44
Transcript_contig_81219 (81219)	0.76	0.49	0.0	0.0	0.0	0.76	0.77	0.0	0.0	1.0	0.92
Transcript_contig_81650 (81650)	0.05	0.0	0.16	0.57	1.0	0.63	0.3	0.0	0.05	0.24	0.48
Transcript_contig_82302 (82302)	0.2	0.06	0.88	1.0	0.62	0.35	0.46	0.02	0.2	0.15	0.18
Transcript_contig_82513 (82513)	0.32	0.1	0.42	1.0	0.24	0.71	0.54	0.0	0.38	0.22	0.53
Transcript_contig_82727 (82727)	0.19	0.0	0.86	0.9	0.74	0.27	1.0	0.0	0.13	0.58	0.23
Transcript_contig_83049 (83049)	0.03	0.01	0.13	0.63	1.0	0.81	0.25	0.01	0.1	0.23	0.51
Transcript_contig_8874 (8874)	0.25	0.11	0.37	0.35	1.0	0.4	0.51	0.1	0.33	0.58	0.62
Transcript_contig_89418 (89418)	0.5	0.3	0.62	0.46	0.39	0.43	1.0	0.07	0.24	0.54	0.43
Transcript_contig_89798 (89798)	0.18	0.09	0.23	0.39	1.0	0.4	0.57	0.1	0.02	0.06	0.2
Transcript_contig_90106 (90106)	0.13	0.13	0.39	0.36	0.46	0.22	0.77	0.0	0.0	1.0	0.51
Transcript_contig_90118 (90118)	0.58	0.57	0.83	0.89	0.61	0.48	1.0	0.12	0.2	0.39	0.23
Transcript_contig_90495 (90495)	0.25	0.34	0.04	0.52	1.0	0.48	0.31	0.0	0.0	0.48	0.21
Transcript_contig_90512 (90512)	0.57	0.66	0.47	1.0	0.76	0.34	0.99	0.91	0.06	0.42	0.41
Transcript_contig_90535 (90535)	0.35	0.24	0.31	1.0	0.66	0.44	0.82	0.16	0.21	0.34	0.31
Transcript_contig_91163 (91163)	0.39	0.18	0.16	0.42	0.4	0.83	0.34	0.0	0.43	1.0	0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)