Heatmap: Cluster_195 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1111 (1111)	0.32	0.21	0.57	0.68	0.95	0.33	0.83	0.14	1.0	0.42	0.29
Transcript_contig_11374 (11374)	0.29	0.0	0.12	0.04	0.15	0.21	1.0	0.0	0.16	0.38	0.14
Transcript_contig_16559 (16559)	0.3	0.27	0.47	0.72	0.69	0.39	1.0	0.24	0.05	0.32	0.06
Transcript_contig_19 (19)	0.25	0.14	0.42	0.85	1.0	0.57	0.72	0.11	0.03	0.27	0.18
Transcript_contig_2028 (2028)	0.37	0.26	0.59	0.65	0.55	0.47	0.92	0.39	1.0	0.25	0.2
Transcript_contig_2163 (2163)	0.22	0.13	0.76	0.74	0.57	0.24	0.66	0.08	1.0	0.09	0.15
Transcript_contig_2608 (2608)	0.65	0.27	0.67	0.77	0.59	0.49	1.0	0.09	0.34	0.24	0.33
Transcript_contig_273 (273)	0.12	0.15	0.52	0.65	1.0	0.35	0.75	0.0	0.0	0.23	0.25
Transcript_contig_3359 (3359)	0.34	0.12	0.6	1.0	0.95	0.51	0.97	0.07	0.13	0.42	0.24
Transcript_contig_4249 (4249)	0.41	0.26	0.29	0.85	0.67	0.63	1.0	0.17	0.03	0.17	0.2
Transcript_contig_4260 (4260)	0.21	0.0	0.22	0.34	0.17	0.27	1.0	0.0	0.0	0.06	0.04
Transcript_contig_53703 (53703)	0.53	0.45	0.69	0.72	0.64	0.5	1.0	0.53	0.65	0.21	0.2
Transcript_contig_53735 (53735)	0.19	0.0	0.73	0.52	0.51	0.4	1.0	0.0	0.0	0.01	0.08
Transcript_contig_53824 (53824)	0.39	0.22	0.38	0.6	0.63	0.45	1.0	0.12	0.66	0.31	0.26
Transcript_contig_53997 (53997)	0.31	0.11	0.83	0.88	0.42	0.33	1.0	0.06	0.04	0.1	0.1
Transcript_contig_55003 (55003)	0.24	0.0	0.6	0.59	0.35	0.4	1.0	0.0	0.01	0.04	0.14
Transcript_contig_55099 (55099)	0.34	0.15	0.7	0.82	0.8	0.46	0.91	0.13	1.0	0.37	0.3
Transcript_contig_55290 (55290)	0.34	0.23	0.62	0.75	0.72	0.43	1.0	0.14	0.07	0.07	0.06
Transcript_contig_55529 (55529)	0.42	0.33	0.47	0.75	1.0	0.41	0.85	0.25	0.71	0.19	0.24
Transcript_contig_55652 (55652)	0.42	0.18	0.49	0.78	0.93	0.42	1.0	0.2	0.23	0.2	0.23
Transcript_contig_55868 (55868)	0.06	0.0	0.4	0.7	1.0	0.31	0.56	0.0	0.02	0.35	0.22
Transcript_contig_56660 (56660)	0.15	0.0	0.84	1.0	0.65	0.34	0.83	0.0	0.0	0.05	0.17
Transcript_contig_56690 (56690)	0.3	0.22	0.63	0.73	1.0	0.49	0.82	0.28	0.25	0.2	0.25
Transcript_contig_57029 (57029)	0.35	0.23	0.5	1.0	0.92	0.45	0.87	0.13	0.04	0.31	0.17
Transcript_contig_57244 (57244)	0.5	0.34	0.57	0.78	0.91	0.57	1.0	0.45	0.9	0.35	0.32
Transcript_contig_57408 (57408)	0.24	0.06	0.67	0.6	0.51	0.4	1.0	0.02	0.08	0.13	0.14
Transcript_contig_58041 (58041)	0.37	0.09	0.35	0.73	0.91	0.39	1.0	0.04	0.34	0.05	0.05
Transcript_contig_58625 (58625)	0.29	0.09	0.44	0.99	0.78	0.42	1.0	0.01	0.01	0.18	0.15
Transcript_contig_58770 (58770)	0.29	0.0	0.72	0.78	0.69	0.41	1.0	0.0	0.0	0.2	0.26
Transcript_contig_59035 (59035)	0.15	0.0	0.78	0.9	0.72	0.45	1.0	0.0	0.0	0.18	0.13
Transcript_contig_59301 (59301)	0.16	0.0	0.65	0.78	1.0	0.42	0.81	0.0	0.15	0.29	0.25
Transcript_contig_59381 (59381)	0.44	0.47	0.45	1.0	0.92	0.35	0.86	0.43	0.06	0.31	0.16
Transcript_contig_59532 (59532)	0.15	0.0	0.58	0.86	1.0	0.41	0.85	0.0	0.0	0.06	0.19
Transcript_contig_59599 (59599)	0.48	0.28	0.41	0.54	0.31	0.58	1.0	0.12	0.84	0.05	0.08
Transcript_contig_59635 (59635)	0.21	0.13	1.0	0.98	0.73	0.35	0.87	0.13	0.0	0.03	0.06
Transcript_contig_60002 (60002)	0.16	0.0	0.65	0.78	0.63	0.51	1.0	0.0	0.07	0.1	0.15
Transcript_contig_60789 (60789)	0.37	0.17	0.93	0.68	0.53	0.31	0.81	0.12	1.0	0.33	0.27
Transcript_contig_61825 (61825)	0.48	0.28	0.36	0.56	0.56	0.32	1.0	0.03	0.0	0.25	0.23
Transcript_contig_62010 (62010)	0.28	0.19	0.38	0.67	1.0	0.33	0.76	0.17	0.05	0.09	0.08
Transcript_contig_62906 (62906)	0.18	0.0	0.58	0.82	1.0	0.29	0.79	0.0	0.0	0.19	0.19
Transcript_contig_6411 (6411)	0.27	0.11	0.79	1.0	0.82	0.44	0.87	0.19	0.0	0.27	0.25
Transcript_contig_6593 (6593)	0.37	0.32	0.59	0.84	1.0	0.4	0.76	0.54	0.65	0.34	0.27
Transcript_contig_68093 (68093)	0.58	0.44	0.55	0.74	0.48	0.36	1.0	0.28	0.88	0.29	0.3
Transcript_contig_68803 (68803)	0.38	0.21	0.57	0.9	0.78	0.47	1.0	0.15	0.0	0.23	0.14
Transcript_contig_68836 (68836)	0.23	0.0	0.48	0.5	0.41	0.32	1.0	0.0	0.0	0.05	0.04
Transcript_contig_68895 (68895)	0.45	0.49	0.49	0.78	1.0	0.3	0.68	0.37	0.91	0.19	0.16
Transcript_contig_69238 (69238)	0.25	0.0	1.0	0.7	0.38	0.51	0.95	0.0	0.11	0.04	0.0
Transcript_contig_69554 (69554)	0.19	0.11	0.65	1.0	0.68	0.41	0.62	0.09	0.2	0.42	0.26
Transcript_contig_70520 (70520)	0.3	0.13	0.37	0.77	1.0	0.56	0.73	0.0	0.28	0.16	0.23
Transcript_contig_70596 (70596)	0.33	0.18	0.53	0.77	1.0	0.54	0.89	0.39	0.59	0.3	0.22
Transcript_contig_71277 (71277)	0.15	0.02	0.61	0.95	1.0	0.25	0.74	0.03	0.0	0.27	0.15
Transcript_contig_71581 (71581)	0.42	0.34	0.3	0.56	0.64	0.5	1.0	0.06	0.14	0.17	0.26
Transcript_contig_78081 (78081)	0.26	0.02	1.0	0.94	0.58	0.37	0.96	0.0	0.15	0.1	0.12
Transcript_contig_78253 (78253)	0.26	0.15	0.61	0.71	0.45	0.37	1.0	0.13	0.0	0.12	0.08
Transcript_contig_78259 (78259)	0.2	0.14	0.62	0.92	1.0	0.31	0.71	0.08	0.05	0.32	0.18
Transcript_contig_78317 (78317)	0.39	0.26	0.44	0.88	1.0	0.55	0.93	0.12	0.23	0.34	0.25
Transcript_contig_78319 (78319)	0.52	0.37	0.61	0.87	0.7	0.39	1.0	0.3	0.77	0.29	0.23
Transcript_contig_78557 (78557)	0.37	0.16	0.97	1.0	0.38	0.29	0.8	0.07	0.35	0.19	0.22
Transcript_contig_78690 (78690)	0.28	0.12	0.57	1.0	0.79	0.36	0.88	0.02	0.05	0.51	0.27
Transcript_contig_78859 (78859)	0.26	0.09	0.82	1.0	0.92	0.24	0.8	0.04	0.22	0.13	0.13
Transcript_contig_78976 (78976)	0.22	0.03	0.91	1.0	0.53	0.3	0.86	0.03	0.06	0.01	0.04
Transcript_contig_792 (792)	0.22	0.03	0.62	0.72	1.0	0.45	0.76	0.05	0.03	0.26	0.22
Transcript_contig_79681 (79681)	0.38	0.16	0.5	1.0	0.85	0.4	1.0	0.1	0.82	0.19	0.24
Transcript_contig_79701 (79701)	0.43	0.28	0.91	1.0	0.59	0.44	0.97	0.12	0.21	0.21	0.18
Transcript_contig_79911 (79911)	0.21	0.0	0.8	0.83	0.79	0.47	1.0	0.0	0.0	0.16	0.21
Transcript_contig_79917 (79917)	0.27	0.04	0.58	0.82	1.0	0.44	0.99	0.05	0.23	0.14	0.22
Transcript_contig_80175 (80175)	0.31	0.05	0.79	0.65	0.24	0.37	1.0	0.02	0.06	0.19	0.15
Transcript_contig_80203 (80203)	0.22	0.09	1.0	0.95	0.6	0.29	0.74	0.04	0.0	0.05	0.05
Transcript_contig_80266 (80266)	0.34	0.15	0.54	0.87	0.6	0.42	1.0	0.07	0.11	0.25	0.15
Transcript_contig_80417 (80417)	0.18	0.0	1.0	0.76	0.83	0.45	0.8	0.0	0.0	0.0	0.15
Transcript_contig_80517 (80517)	0.25	0.01	0.56	0.85	0.9	0.38	1.0	0.01	0.2	0.26	0.18
Transcript_contig_80574 (80574)	0.23	0.22	0.69	0.8	1.0	0.46	0.8	0.24	0.07	0.12	0.2
Transcript_contig_81053 (81053)	0.25	0.05	0.7	0.93	0.72	0.39	1.0	0.01	0.0	0.15	0.09
Transcript_contig_81963 (81963)	0.26	0.11	0.95	0.98	0.81	0.45	1.0	0.19	0.02	0.25	0.33
Transcript_contig_81987 (81987)	0.41	0.18	0.71	0.98	0.7	0.47	1.0	0.26	0.08	0.21	0.08
Transcript_contig_82080 (82080)	0.16	0.0	0.66	0.68	0.52	0.26	1.0	0.0	0.0	0.16	0.13
Transcript_contig_82406 (82406)	0.28	0.05	0.87	1.0	0.45	0.28	0.81	0.0	0.0	0.28	0.15
Transcript_contig_89301 (89301)	0.28	0.11	1.0	0.87	0.43	0.34	0.85	0.05	0.01	0.07	0.07
Transcript_contig_89312 (89312)	0.32	0.19	0.62	0.98	1.0	0.4	0.91	0.11	0.6	0.41	0.25
Transcript_contig_89367 (89367)	0.3	0.16	0.6	0.65	0.48	0.44	1.0	0.18	0.01	0.14	0.11
Transcript_contig_89524 (89524)	0.32	0.15	0.82	1.0	0.41	0.33	0.83	0.07	0.21	0.23	0.12
Transcript_contig_89751 (89751)	0.36	0.31	0.55	0.72	0.91	0.35	0.84	0.38	1.0	0.27	0.17
Transcript_contig_89822 (89822)	0.42	0.3	0.45	0.9	1.0	0.54	0.9	0.35	0.34	0.29	0.3
Transcript_contig_89981 (89981)	0.18	0.12	1.0	0.98	0.63	0.32	0.8	0.15	0.03	0.08	0.09
Transcript_contig_90201 (90201)	0.28	0.2	0.54	0.83	1.0	0.42	0.73	0.27	0.01	0.23	0.19
Transcript_contig_90356 (90356)	0.13	0.03	0.61	1.0	0.65	0.67	0.55	0.0	0.02	0.36	0.27
Transcript_contig_90597 (90597)	0.13	0.0	0.54	0.68	1.0	0.36	0.79	0.0	0.04	0.04	0.09
Transcript_contig_90657 (90657)	0.28	0.16	0.39	0.84	1.0	0.44	0.72	0.14	0.09	0.36	0.26
Transcript_contig_90886 (90886)	0.32	0.32	0.24	0.86	0.96	0.42	1.0	0.1	0.08	0.1	0.15
Transcript_contig_9738 (9738)	0.23	0.12	0.73	0.75	1.0	0.5	0.96	0.07	0.25	0.14	0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)