Heatmap: Cluster_165 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10918 (10918)	0.22	0.21	0.85	0.53	0.91	1.0	0.8	0.0	0.14	0.71	0.4
Transcript_contig_1099 (1099)	0.83	1.0	0.25	0.36	0.25	0.45	0.55	0.81	1.0	0.71	0.53
Transcript_contig_255 (255)	0.85	1.0	0.61	0.45	0.54	0.3	0.53	0.9	0.08	0.33	0.25
Transcript_contig_2618 (2618)	0.79	1.0	0.37	0.52	0.42	0.44	0.93	0.83	0.05	0.41	0.24
Transcript_contig_3534 (3534)	0.46	0.79	0.18	0.52	0.35	0.15	0.09	1.0	0.01	0.18	0.12
Transcript_contig_53714 (53714)	0.48	0.71	0.26	0.41	0.49	0.35	0.37	1.0	0.41	0.5	0.37
Transcript_contig_53752 (53752)	0.89	1.0	0.43	0.68	0.73	0.44	0.64	0.85	0.35	0.47	0.42
Transcript_contig_53782 (53782)	0.56	0.79	0.55	0.4	0.54	0.15	0.36	1.0	0.71	0.29	0.2
Transcript_contig_53812 (53812)	0.87	1.0	0.43	0.59	0.65	0.41	0.54	0.94	0.29	0.55	0.31
Transcript_contig_53834 (53834)	0.59	0.95	0.12	0.13	0.16	0.19	0.17	1.0	0.24	0.34	0.2
Transcript_contig_53982 (53982)	0.43	0.44	0.3	0.38	0.39	0.45	0.38	0.36	1.0	0.57	0.44
Transcript_contig_54054 (54054)	0.77	1.0	0.32	0.27	0.31	0.15	0.46	0.93	0.15	0.27	0.16
Transcript_contig_54183 (54183)	0.65	0.89	0.04	0.25	0.32	0.55	0.38	1.0	0.48	0.9	0.52
Transcript_contig_54291 (54291)	0.73	1.0	0.39	0.48	0.79	0.33	0.57	0.99	0.03	0.3	0.21
Transcript_contig_54370 (54370)	0.85	1.0	0.54	0.66	0.93	0.38	0.43	0.87	0.57	0.72	0.53
Transcript_contig_54463 (54463)	0.9	1.0	0.28	0.17	0.1	0.25	0.32	0.99	0.43	0.58	0.57
Transcript_contig_54481 (54481)	0.8	0.92	0.63	0.7	0.58	0.53	1.0	0.76	0.11	0.68	0.39
Transcript_contig_54630 (54630)	0.62	0.85	0.21	0.19	0.21	0.22	0.39	1.0	0.08	0.26	0.19
Transcript_contig_54641 (54641)	0.84	1.0	0.3	0.3	0.18	0.49	0.46	0.74	0.69	0.63	0.39
Transcript_contig_54680 (54680)	0.79	1.0	0.51	0.31	0.15	0.2	0.38	0.92	0.35	0.37	0.29
Transcript_contig_54711 (54711)	0.85	1.0	0.44	0.62	0.66	0.51	0.48	0.82	0.48	0.77	0.52
Transcript_contig_55010 (55010)	0.71	0.99	0.05	0.17	0.26	0.35	0.5	1.0	0.2	0.31	0.16
Transcript_contig_55220 (55220)	0.62	0.65	0.5	0.77	0.97	0.44	0.81	0.72	0.6	1.0	0.67
Transcript_contig_55301 (55301)	0.75	0.94	0.27	0.28	0.35	0.2	0.51	1.0	0.21	0.2	0.12
Transcript_contig_55572 (55572)	0.94	1.0	0.56	0.43	0.49	0.27	0.41	0.46	0.92	0.57	0.43
Transcript_contig_55702 (55702)	0.75	1.0	0.23	0.61	0.7	0.53	0.68	0.86	0.17	0.7	0.42
Transcript_contig_55878 (55878)	0.68	0.91	0.13	0.18	0.31	0.18	0.27	1.0	0.95	0.39	0.3
Transcript_contig_56062 (56062)	0.84	0.98	0.22	0.31	0.39	0.52	0.81	1.0	0.21	0.84	0.49
Transcript_contig_56096 (56096)	0.69	0.97	0.46	0.29	0.11	0.21	0.55	1.0	0.08	0.03	0.06
Transcript_contig_56321 (56321)	0.69	1.0	0.32	0.44	0.44	0.52	0.45	0.91	0.25	0.55	0.36
Transcript_contig_56431 (56431)	0.85	0.87	0.59	0.26	0.13	0.4	1.0	0.73	0.43	0.23	0.22
Transcript_contig_56694 (56694)	0.73	1.0	0.28	0.31	0.42	0.25	0.5	0.84	0.38	0.49	0.27
Transcript_contig_56730 (56730)	0.8	0.99	0.41	0.51	0.5	0.52	1.0	0.96	0.29	0.47	0.38
Transcript_contig_56804 (56804)	0.84	1.0	0.25	0.16	0.09	0.1	0.29	0.64	0.03	0.1	0.09
Transcript_contig_57217 (57217)	0.79	1.0	0.68	0.31	0.24	0.49	0.67	0.86	0.15	0.37	0.3
Transcript_contig_57359 (57359)	0.72	1.0	0.27	0.23	0.27	0.15	0.31	0.95	0.11	0.25	0.18
Transcript_contig_57597 (57597)	0.77	0.99	0.62	0.83	1.0	0.62	0.86	0.95	0.3	0.88	0.46
Transcript_contig_58075 (58075)	0.73	0.88	0.36	0.6	0.74	0.33	0.72	1.0	0.39	0.43	0.3
Transcript_contig_58971 (58971)	0.78	1.0	0.29	0.24	0.2	0.17	0.2	0.77	0.04	0.71	0.5
Transcript_contig_59006 (59006)	0.86	1.0	0.58	0.32	0.26	0.3	0.58	0.84	0.07	0.25	0.15
Transcript_contig_59072 (59072)	0.77	1.0	0.33	0.62	0.79	0.45	0.39	0.69	0.25	0.52	0.42
Transcript_contig_59252 (59252)	0.59	0.9	0.16	0.23	0.52	0.12	0.2	1.0	0.21	0.21	0.12
Transcript_contig_59303 (59303)	0.81	0.86	0.43	0.43	0.61	0.57	0.73	1.0	0.63	0.78	0.58
Transcript_contig_59439 (59439)	0.65	0.85	0.28	0.38	0.56	0.36	0.71	1.0	0.33	0.29	0.18
Transcript_contig_59475 (59475)	0.68	0.91	0.25	0.33	0.38	0.25	0.42	1.0	0.0	0.25	0.14
Transcript_contig_59488 (59488)	0.56	0.81	0.32	0.29	0.5	0.2	0.4	1.0	0.39	0.14	0.13
Transcript_contig_59525 (59525)	0.71	1.0	0.28	0.19	0.06	0.16	0.11	0.51	0.29	0.47	0.26
Transcript_contig_59746 (59746)	0.73	0.78	0.2	0.25	0.37	0.31	0.45	0.71	1.0	0.41	0.39
Transcript_contig_60031 (60031)	0.57	1.0	0.19	0.28	0.34	0.33	0.49	0.8	0.16	0.49	0.23
Transcript_contig_60354 (60354)	0.5	0.75	0.25	0.51	0.64	0.32	0.3	1.0	0.26	0.33	0.27
Transcript_contig_60660 (60660)	0.54	0.49	0.58	0.61	0.66	0.59	1.0	0.38	0.03	0.33	0.17
Transcript_contig_60694 (60694)	1.0	0.92	0.21	0.17	0.13	0.14	0.29	0.2	0.0	0.31	0.35
Transcript_contig_61058 (61058)	0.37	0.18	0.89	1.0	0.82	0.44	0.86	0.03	0.25	0.12	0.22
Transcript_contig_61400 (61400)	0.64	1.0	0.15	0.18	0.19	0.1	0.24	0.76	0.19	0.21	0.09
Transcript_contig_61437 (61437)	0.32	0.05	0.21	0.32	0.09	0.33	0.56	0.07	0.09	1.0	0.41
Transcript_contig_64869 (64869)	0.1	0.0	1.0	0.98	0.56	0.31	0.54	0.0	0.0	0.02	0.0
Transcript_contig_67561 (67561)	0.63	1.0	0.3	0.32	0.09	0.11	0.19	0.97	0.1	0.41	0.16
Transcript_contig_67588 (67588)	1.0	1.0	0.36	0.4	0.11	0.3	0.65	0.8	0.13	0.53	0.36
Transcript_contig_67620 (67620)	0.52	0.74	0.04	0.26	0.07	0.03	0.15	1.0	0.09	0.05	0.06
Transcript_contig_67715 (67715)	1.0	0.9	0.33	0.56	0.64	0.35	0.48	0.67	0.95	0.64	0.61
Transcript_contig_67864 (67864)	0.85	1.0	0.61	0.62	0.5	0.29	0.68	0.44	0.03	0.17	0.14
Transcript_contig_67924 (67924)	0.49	0.8	0.27	0.14	0.2	0.21	0.55	1.0	0.03	0.05	0.05
Transcript_contig_68421 (68421)	1.0	0.7	0.32	0.29	0.26	0.19	0.45	0.18	0.01	0.46	0.49
Transcript_contig_68422 (68422)	0.84	1.0	0.26	0.52	0.49	0.31	0.56	0.73	0.28	0.38	0.23
Transcript_contig_68826 (68826)	0.87	1.0	0.22	0.26	0.31	0.19	0.34	0.88	0.6	0.54	0.43
Transcript_contig_68962 (68962)	0.64	0.93	0.26	0.22	0.22	0.33	0.21	1.0	0.16	0.56	0.33
Transcript_contig_69125 (69125)	0.75	1.0	0.1	0.09	0.06	0.33	0.35	0.41	0.0	0.87	0.21
Transcript_contig_69437 (69437)	0.6	0.87	0.2	0.38	0.47	0.29	0.47	1.0	0.1	0.24	0.16
Transcript_contig_69750 (69750)	0.71	0.97	0.4	0.41	0.51	0.39	0.56	1.0	0.01	0.34	0.21
Transcript_contig_78062 (78062)	0.95	1.0	0.49	0.47	0.61	0.44	0.75	0.97	0.77	0.76	0.59
Transcript_contig_78102 (78102)	0.78	1.0	0.41	0.93	0.87	0.43	0.79	0.95	0.06	0.43	0.26
Transcript_contig_78115 (78115)	0.94	1.0	0.64	0.85	0.83	0.45	0.9	0.93	0.94	0.87	0.68
Transcript_contig_78545 (78545)	0.78	0.8	0.49	0.72	0.87	0.64	1.0	0.76	0.69	0.69	0.43
Transcript_contig_78815 (78815)	0.43	0.26	0.43	0.7	0.74	0.7	1.0	0.22	0.43	0.96	0.77
Transcript_contig_79082 (79082)	0.81	1.0	0.51	0.78	1.0	0.49	0.68	0.75	0.22	0.49	0.3
Transcript_contig_79155 (79155)	0.73	0.85	0.71	0.78	0.72	0.6	1.0	0.48	0.09	0.88	0.43
Transcript_contig_79224 (79224)	0.87	1.0	0.26	0.18	0.16	0.27	0.27	0.74	0.74	0.31	0.35
Transcript_contig_79279 (79279)	0.63	1.0	0.11	0.22	0.21	0.34	0.26	0.88	0.18	0.48	0.22
Transcript_contig_79794 (79794)	0.2	0.27	0.87	1.0	0.96	0.2	0.29	0.25	0.57	0.13	0.12
Transcript_contig_80889 (80889)	0.64	1.0	0.07	0.12	0.16	0.7	0.2	0.64	0.13	0.45	0.16
Transcript_contig_89172 (89172)	0.61	0.84	0.38	0.43	0.53	0.31	0.58	1.0	0.2	0.37	0.24
Transcript_contig_89265 (89265)	0.65	0.92	0.2	0.22	0.28	0.29	0.47	1.0	0.18	0.3	0.2
Transcript_contig_89349 (89349)	0.82	1.0	0.33	0.44	0.53	0.32	0.44	0.86	0.31	0.43	0.35
Transcript_contig_89365 (89365)	0.73	0.93	0.3	0.33	0.46	0.41	0.52	1.0	0.57	0.6	0.41
Transcript_contig_89581 (89581)	0.74	1.0	0.41	0.35	0.33	0.16	0.4	0.88	0.1	0.18	0.11
Transcript_contig_89601 (89601)	0.8	1.0	0.46	0.68	0.69	0.45	0.46	0.97	0.21	0.66	0.45
Transcript_contig_90039 (90039)	0.73	0.85	0.44	0.41	0.35	0.6	0.75	1.0	0.85	0.85	0.78
Transcript_contig_90358 (90358)	0.89	1.0	0.44	0.25	0.07	0.22	0.47	0.72	0.21	0.38	0.27
Transcript_contig_90395 (90395)	0.38	0.11	0.15	0.69	1.0	0.33	0.59	0.0	0.14	0.37	0.39
Transcript_contig_90541 (90541)	0.52	1.0	0.06	0.23	0.15	0.29	0.29	0.6	0.0	0.65	0.3
Transcript_contig_9848 (9848)	1.0	0.93	0.2	0.35	0.44	0.16	0.35	0.63	0.26	0.58	0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)