Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10001 (10001)	0.08	0.08	0.73	0.97	0.44	0.76	1.0	0.04	0.11	0.18	0.18
Transcript_contig_1707 (1707)	0.05	0.0	0.34	1.0	0.29	0.2	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_18210 (18210)	0.04	0.0	0.47	0.36	0.16	0.76	1.0	0.0	0.05	0.54	0.37
Transcript_contig_2137 (2137)	0.1	0.0	0.73	0.5	0.51	0.53	1.0	0.0	0.14	0.45	0.43
Transcript_contig_2223 (2223)	0.11	0.01	0.37	0.25	0.29	0.46	1.0	0.02	0.07	0.15	0.27
Transcript_contig_28443 (28443)	0.08	0.03	1.0	0.48	0.27	0.76	0.95	0.0	0.0	0.03	0.11
Transcript_contig_3015 (3015)	0.11	0.07	0.42	0.57	0.62	0.46	1.0	0.09	0.0	0.19	0.19
Transcript_contig_3532 (3532)	0.07	0.1	1.0	0.41	0.48	0.47	0.96	0.0	0.06	0.35	0.69
Transcript_contig_3905 (3905)	0.15	0.1	0.4	0.44	0.33	0.63	1.0	0.17	0.16	0.19	0.34
Transcript_contig_3933 (3933)	0.15	0.04	0.3	0.33	0.36	0.63	1.0	0.0	0.0	0.25	0.12
Transcript_contig_4048 (4048)	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.23	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4213 (4213)	0.02	0.0	0.1	0.09	0.08	0.45	0.53	0.0	1.0	0.05	0.05
Transcript_contig_4672 (4672)	0.19	0.01	0.49	0.21	0.32	0.52	1.0	0.0	0.06	0.41	0.29
Transcript_contig_4827 (4827)	0.04	0.0	1.0	0.31	0.25	0.37	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_53712 (53712)	0.18	0.08	0.21	0.18	0.13	0.52	1.0	0.09	0.03	0.08	0.09
Transcript_contig_53721 (53721)	0.12	0.03	0.81	0.44	0.27	0.5	1.0	0.04	0.04	0.19	0.15
Transcript_contig_54851 (54851)	0.19	0.14	0.47	0.58	0.83	0.7	1.0	0.22	0.18	0.47	0.43
Transcript_contig_55024 (55024)	0.23	0.19	0.3	0.45	0.41	0.64	1.0	0.12	0.04	0.36	0.23
Transcript_contig_55438 (55438)	0.05	0.02	0.43	0.46	0.34	0.69	1.0	0.03	0.03	0.26	0.26
Transcript_contig_56085 (56085)	0.2	0.08	0.79	0.57	0.28	0.59	1.0	0.03	0.24	0.27	0.34
Transcript_contig_56280 (56280)	0.17	0.2	0.33	0.49	0.68	0.65	1.0	0.26	0.11	0.24	0.25
Transcript_contig_56924 (56924)	0.16	0.12	0.27	0.33	0.36	0.7	1.0	0.11	0.1	0.28	0.21
Transcript_contig_56928 (56928)	0.03	0.05	0.3	0.63	0.62	0.87	1.0	0.14	0.05	0.26	0.15
Transcript_contig_57153 (57153)	0.1	0.01	0.54	0.47	0.47	0.54	1.0	0.02	0.23	0.14	0.11
Transcript_contig_57497 (57497)	0.18	0.05	0.27	0.31	0.35	0.61	1.0	0.03	0.02	0.24	0.14
Transcript_contig_57698 (57698)	0.12	0.0	0.7	0.32	0.17	0.3	0.55	0.0	1.0	0.02	0.1
Transcript_contig_57859 (57859)	0.04	0.01	0.45	0.31	0.25	0.61	1.0	0.03	0.06	0.16	0.27
Transcript_contig_57986 (57986)	0.19	0.04	0.58	0.49	0.47	0.72	1.0	0.03	0.24	0.44	0.28
Transcript_contig_58026 (58026)	0.05	0.0	0.37	0.22	0.14	1.0	0.85	0.0	0.54	0.0	0.15
Transcript_contig_58210 (58210)	0.13	0.04	0.32	0.35	0.36	0.49	1.0	0.03	0.0	0.19	0.17
Transcript_contig_58570 (58570)	0.15	0.06	0.87	0.62	0.47	0.53	1.0	0.04	0.05	0.27	0.28
Transcript_contig_5916 (5916)	0.01	0.04	1.0	0.34	0.46	0.61	0.83	0.0	0.0	0.06	0.14
Transcript_contig_59858 (59858)	0.12	0.03	0.45	0.44	0.4	0.68	1.0	0.07	0.06	0.26	0.27
Transcript_contig_60056 (60056)	0.06	0.08	0.31	0.37	0.4	0.51	1.0	0.1	0.05	0.28	0.17
Transcript_contig_60164 (60164)	0.11	0.11	0.4	0.69	0.66	0.49	1.0	0.16	0.04	0.22	0.06
Transcript_contig_60866 (60866)	0.01	0.01	1.0	0.28	0.11	0.51	0.75	0.03	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_61005 (61005)	0.14	0.07	0.83	0.51	0.18	0.62	1.0	0.0	0.1	0.16	0.22
Transcript_contig_61456 (61456)	0.06	0.0	0.78	0.42	0.22	0.51	1.0	0.0	0.2	0.13	0.22
Transcript_contig_62208 (62208)	0.03	0.0	0.67	0.46	0.37	0.43	1.0	0.0	0.07	0.14	0.13
Transcript_contig_62309 (62309)	0.14	0.05	0.72	0.65	0.4	0.38	1.0	0.08	0.83	0.25	0.27
Transcript_contig_62752 (62752)	0.27	0.24	0.86	0.41	0.28	0.49	1.0	0.26	0.15	0.1	0.15
Transcript_contig_63294 (63294)	0.04	0.05	0.37	0.31	0.33	0.56	1.0	0.0	0.09	0.22	0.06
Transcript_contig_63659 (63659)	0.02	0.0	0.62	0.3	0.21	0.39	1.0	0.0	0.0	0.02	0.02
Transcript_contig_64670 (64670)	0.04	0.05	0.95	0.09	0.17	0.35	1.0	0.0	0.0	0.37	0.27
Transcript_contig_66332 (66332)	0.07	0.13	0.89	0.31	0.13	0.75	1.0	0.0	0.0	0.0	0.21
Transcript_contig_67877 (67877)	0.13	0.02	0.58	0.19	0.23	0.58	1.0	0.0	0.04	0.24	0.22
Transcript_contig_69556 (69556)	0.09	0.14	0.62	0.84	0.62	0.37	1.0	0.04	0.06	0.15	0.13
Transcript_contig_70021 (70021)	0.0	0.0	1.0	0.21	0.06	0.29	0.63	0.0	0.07	0.07	0.17
Transcript_contig_70370 (70370)	0.07	0.0	0.91	0.6	0.24	0.41	1.0	0.0	0.0	0.18	0.38
Transcript_contig_70408 (70408)	0.19	0.18	0.82	0.61	0.34	0.46	1.0	0.05	0.0	0.23	0.18
Transcript_contig_71574 (71574)	0.07	0.05	0.18	0.04	0.08	0.96	1.0	0.3	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_73300 (73300)	0.02	0.02	0.48	0.27	0.11	1.0	0.95	0.03	0.12	0.01	0.16
Transcript_contig_78141 (78141)	0.1	0.0	0.94	0.69	0.26	0.49	1.0	0.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_78267 (78267)	0.11	0.0	0.37	0.46	0.57	0.45	1.0	0.0	0.0	0.32	0.27
Transcript_contig_78452 (78452)	0.35	0.3	0.61	0.46	0.46	0.59	1.0	0.27	0.2	0.29	0.35
Transcript_contig_78623 (78623)	0.04	0.01	0.8	0.59	0.52	0.77	1.0	0.0	0.53	0.12	0.21
Transcript_contig_78964 (78964)	0.16	0.09	0.39	0.45	0.93	0.41	1.0	0.1	0.19	0.48	0.28
Transcript_contig_79034 (79034)	0.09	0.08	1.0	0.5	0.49	0.57	0.98	0.2	0.11	0.23	0.17
Transcript_contig_79440 (79440)	0.11	0.11	0.86	0.4	0.36	0.55	1.0	0.15	0.1	0.29	0.16
Transcript_contig_79659 (79659)	0.04	0.01	0.8	0.54	0.49	0.65	1.0	0.0	0.28	0.09	0.15
Transcript_contig_79876 (79876)	0.15	0.08	0.65	0.46	0.25	0.38	1.0	0.04	0.11	0.11	0.15
Transcript_contig_79985 (79985)	0.19	0.19	0.88	0.77	0.35	0.63	1.0	0.09	0.02	0.4	0.19
Transcript_contig_80430 (80430)	0.09	0.14	0.5	0.37	0.27	0.64	1.0	0.17	0.36	0.45	0.39
Transcript_contig_80837 (80837)	0.24	0.13	0.32	0.4	0.52	0.59	1.0	0.07	0.01	0.33	0.44
Transcript_contig_80860 (80860)	0.05	0.0	0.64	0.45	0.57	0.66	1.0	0.0	0.0	0.2	0.19
Transcript_contig_81339 (81339)	0.11	0.05	0.9	1.0	0.3	0.54	0.92	0.13	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_81718 (81718)	0.1	0.08	0.29	0.24	0.14	0.56	1.0	0.03	0.0	0.32	0.11
Transcript_contig_83336 (83336)	0.11	0.0	1.0	0.45	0.18	0.43	0.81	0.0	0.0	0.08	0.04
Transcript_contig_83446 (83446)	0.08	0.03	0.72	0.55	0.47	0.61	1.0	0.0	0.28	0.17	0.17
Transcript_contig_89289 (89289)	0.21	0.21	0.98	0.72	0.36	0.64	1.0	0.15	0.04	0.31	0.19
Transcript_contig_89628 (89628)	0.11	0.02	0.25	0.24	0.29	0.57	1.0	0.02	0.08	0.11	0.18
Transcript_contig_89806 (89806)	0.17	0.0	0.72	0.44	0.2	0.52	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_89850 (89850)	0.03	0.06	0.33	0.3	0.21	0.52	1.0	0.08	0.01	0.12	0.1
Transcript_contig_90424 (90424)	0.24	0.0	0.43	0.42	0.42	0.75	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_90492 (90492)	0.13	0.12	0.34	0.34	0.39	0.67	1.0	0.07	0.0	0.48	0.25
Transcript_contig_90553 (90553)	0.1	0.12	0.52	0.31	0.28	0.45	1.0	0.04	0.0	0.13	0.14
Transcript_contig_91528 (91528)	0.09	0.0	1.0	0.26	0.45	0.45	0.98	0.0	0.51	0.03	0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)