Heatmap: Cluster_73 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000073.1 (tig00000073_g1681.t1)	0.27	0.18	0.32	0.4	0.58	0.56	1.0	0.8	0.65	0.38	0.34	0.16	0.1	0.22	0.28	0.43	0.4	0.58	0.4	0.43	0.21	0.14	0.59	0.34	0.7	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000093.27 (tig00000093_g3462.t1)	0.48	0.17	0.07	0.4	0.52	0.53	1.0	0.63	0.26	0.12	0.06	0.07	0.06	0.27	0.28	0.0	0.27	0.65	0.54	0.15	0.05	0.26	0.49	0.1	1.0	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000140.1 (tig00000140_g8458.t1)	0.08	0.03	0.05	0.14	0.3	0.49	0.45	0.25	0.36	0.17	0.17	0.11	0.1	0.26	0.25	0.18	0.06	0.15	0.1	0.04	0.11	0.49	0.56	0.41	1.0	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000144.23 (tig00000144_g9012.t1)	0.14	0.14	0.19	0.37	0.36	0.33	0.66	0.56	0.51	0.31	0.24	0.17	0.09	0.27	0.28	0.36	0.4	0.41	0.41	0.27	0.19	0.71	0.54	0.43	1.0	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000145.28 (tig00000145_g8825.t1)	0.29	0.26	0.36	0.49	0.61	0.65	1.0	0.75	0.76	0.37	0.29	0.31	0.37	0.27	0.33	0.39	0.36	0.65	0.43	0.43	0.14	0.46	0.78	0.55	0.89	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000241.112 (tig00000241_g20978.t1)	0.08	0.12	0.25	0.43	0.39	0.44	0.92	0.76	0.66	0.27	0.2	0.1	0.04	0.28	0.24	0.4	0.27	0.35	0.4	0.26	0.06	0.89	0.47	0.18	1.0	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000241.119 (tig00000241_g20985.t1)	0.15	0.15	0.27	0.46	0.59	0.73	1.0	0.88	0.94	0.52	0.36	0.26	0.11	0.28	0.17	0.41	0.22	0.43	0.35	0.32	0.18	0.54	0.35	0.28	0.51	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000241.129 (tig00000241_g20995.t1)	0.03	0.06	0.16	0.21	0.18	0.27	0.59	0.47	0.41	0.26	0.09	0.05	0.04	0.14	0.2	0.26	0.25	0.48	0.34	0.26	0.14	0.45	0.28	0.38	1.0	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000241.163 (tig00000241_g21028.t1)	0.08	0.16	0.27	0.36	0.48	0.72	1.0	0.72	0.89	0.45	0.37	0.28	0.05	0.26	0.35	0.34	0.35	0.47	0.39	0.3	0.1	0.38	0.73	0.61	0.68	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000254.126 (tig00000254_g22586.t1)	0.06	0.11	0.15	0.34	0.36	0.54	0.55	0.44	0.48	0.2	0.2	0.17	0.03	0.19	0.12	0.16	0.21	0.18	0.24	0.18	0.15	0.56	0.37	0.3	1.0	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000293.17 (tig00000293_g23884.t1)	0.4	0.44	0.48	0.79	0.75	0.64	0.73	0.59	0.62	0.77	0.78	0.85	0.41	0.25	0.39	0.19	0.37	0.55	0.35	0.42	0.03	0.25	0.76	1.0	0.6	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000350.13 (tig00000350_g24313.t1)	0.34	0.34	0.38	0.54	0.41	0.52	0.8	0.74	0.81	0.64	0.54	0.41	0.31	0.57	0.47	0.71	0.39	0.74	0.47	0.35	0.28	0.61	0.44	0.34	1.0	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000350.49 (tig00000350_g24347.t1)	0.14	0.2	0.23	0.49	0.51	0.57	0.4	0.44	0.3	0.34	0.26	0.18	0.09	0.15	0.24	0.14	0.19	0.3	0.57	0.18	0.33	0.25	0.21	0.2	1.0	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000402.54 (tig00000402_g233.t1)	0.2	0.13	0.27	0.63	0.66	0.73	0.92	1.0	0.75	0.47	0.31	0.16	0.16	0.13	0.27	0.28	0.37	0.46	0.54	0.41	0.25	0.59	0.97	0.15	0.87	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000459.34 (tig00000459_g1101.t1)	0.5	0.28	0.33	0.35	0.63	0.59	0.78	0.66	0.62	0.5	0.48	0.48	0.22	0.4	0.28	0.3	0.35	0.56	0.52	0.51	0.05	0.27	1.0	0.85	0.36	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000704.14 (tig00000704_g3304.t1)	0.25	0.2	0.18	0.49	0.46	0.49	0.95	0.75	0.8	0.37	0.27	0.35	0.23	0.22	0.2	0.36	0.25	0.45	0.3	0.27	0.08	0.16	0.83	0.3	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000806.11 (tig00000806_g4338.t1)	0.03	0.16	0.2	0.43	0.72	0.73	1.0	0.83	0.92	0.56	0.43	0.38	0.04	0.27	0.34	0.33	0.47	0.57	0.54	0.62	0.09	0.64	0.74	0.61	0.55	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000821.41 (tig00000821_g4499.t1)	0.22	0.32	0.43	0.55	0.7	0.93	0.95	0.88	0.74	0.41	0.4	0.32	0.2	0.43	0.47	0.51	0.5	0.47	0.57	0.42	0.13	1.0	0.39	0.45	0.89	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000828.13 (tig00000828_g4613.t1)	0.58	0.44	0.39	0.68	0.67	0.77	0.64	0.8	0.59	0.37	0.55	0.47	0.39	0.29	0.36	0.21	0.37	0.66	0.58	0.42	0.05	0.46	0.94	0.84	1.0	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000949.21 (tig00000692_g3238.t1)	0.25	0.35	0.34	0.82	0.51	0.7	0.53	0.73	0.47	0.41	0.47	0.36	0.16	0.2	0.24	0.54	0.39	0.74	0.44	0.17	0.39	0.13	0.85	0.78	1.0	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000970.34 (tig00000970_g5852.t1)	0.1	0.16	0.22	0.31	0.32	0.42	0.73	0.55	0.52	0.27	0.25	0.18	0.07	0.23	0.26	0.35	0.34	0.51	0.45	0.36	0.11	0.87	0.61	0.58	1.0	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000970.36 (tig00000970_g5854.t1)	0.58	0.65	0.51	0.55	0.53	0.65	0.82	0.88	0.74	0.56	0.64	0.63	0.47	0.34	0.26	0.32	0.36	0.49	0.52	0.36	0.07	0.62	1.0	0.69	0.79	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000983.29 (tig00000983_g5918.t1)	0.04	0.04	0.17	0.34	0.54	0.44	1.0	0.8	0.77	0.35	0.21	0.06	0.02	0.11	0.11	0.29	0.23	0.3	0.26	0.22	0.06	0.5	0.26	0.04	0.46	0.18
Cpa\|evm.model.tig00001000.1 (tig00001000_g6162.t1)	0.0	0.0	0.0	0.94	0.13	0.0	0.26	0.21	0.22	0.1	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.34	0.1	1.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00001056.21 (tig00001056_g6644.t1)	0.17	0.07	0.05	0.6	0.34	0.25	0.65	0.58	0.68	0.6	0.43	0.08	0.12	0.0	0.07	0.13	0.0	0.24	0.13	0.02	0.35	0.39	0.33	0.44	1.0	0.45
Cpa\|evm.model.tig00001094.17 (tig00001094_g6988.t1)	0.28	0.28	0.39	0.53	0.57	0.75	0.81	0.87	0.86	0.54	0.58	0.42	0.29	0.65	0.47	0.66	0.59	0.64	0.64	0.35	0.16	0.57	0.57	0.4	1.0	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001107.26 (tig00001107_g7109.t1)	0.61	0.68	0.4	0.49	0.39	0.43	0.72	0.83	0.82	0.73	0.73	0.6	0.59	0.4	0.41	0.41	0.36	0.62	0.57	0.44	0.32	0.71	1.0	0.57	0.84	0.56
Cpa\|evm.model.tig00001154.37 (tig00001154_g7301.t1)	0.08	0.12	0.31	0.23	0.47	0.71	1.0	0.68	0.71	0.23	0.1	0.09	0.05	0.18	0.2	0.53	0.4	0.28	0.47	0.37	0.14	0.13	0.18	0.33	0.82	0.35
Cpa\|evm.model.tig00001155.12 (tig00001155_g7319.t1)	0.04	0.06	0.26	0.37	0.39	0.45	1.0	0.83	0.82	0.46	0.32	0.25	0.05	0.31	0.26	0.51	0.43	0.52	0.39	0.4	0.1	0.87	0.3	0.29	0.92	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001302.15 (tig00001302_g8101.t1)	0.11	0.05	0.13	0.35	0.4	0.6	1.0	0.74	0.76	0.45	0.22	0.19	0.05	0.13	0.17	0.22	0.24	0.42	0.35	0.3	0.09	0.18	0.9	0.68	0.62	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001374.16 (tig00001374_g8506.t1)	0.11	0.26	0.32	0.56	0.55	0.44	1.0	0.77	0.67	0.37	0.34	0.25	0.03	0.23	0.29	0.32	0.27	0.87	0.37	0.27	0.13	0.22	0.78	0.33	0.7	0.36
Cpa\|evm.model.tig00001408.19 (tig00001408_g8613.t1)	0.06	0.06	0.25	0.44	0.45	0.62	0.87	0.7	0.83	0.49	0.44	0.4	0.04	0.19	0.39	0.34	0.33	0.57	0.47	0.35	0.07	0.44	1.0	0.36	0.58	0.35
Cpa\|evm.model.tig00001545.16 (tig00001545_g9346.t1)	0.06	0.0	0.05	0.29	0.28	0.34	0.58	0.56	0.62	0.35	0.18	0.05	0.0	0.0	0.03	0.04	0.11	0.25	0.22	0.09	0.01	0.22	0.01	0.04	1.0	0.21
Cpa\|evm.model.tig00001600.1 (tig00001600_g9385.t1)	0.32	0.44	0.45	0.56	0.72	0.65	0.7	0.92	0.58	0.64	0.77	0.44	0.29	0.44	0.41	0.54	0.33	0.64	0.46	0.33	0.42	0.44	1.0	0.43	0.99	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020539.29 (tig00020539_g10424.t1)	0.12	0.2	0.27	0.36	0.47	0.6	1.0	0.83	0.75	0.39	0.17	0.14	0.07	0.28	0.39	0.48	0.36	0.54	0.57	0.52	0.57	0.67	0.9	0.13	0.3	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020539.31 (tig00020539_g10423.t1)	0.14	0.18	0.2	0.46	0.37	0.77	0.91	1.0	0.87	0.49	0.21	0.17	0.1	0.19	0.29	0.27	0.18	0.62	0.46	0.32	0.41	0.6	0.68	0.08	0.25	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020553.28 (tig00020553_g10518.t1)	0.33	0.22	0.16	0.23	0.27	0.45	0.53	0.68	0.85	0.64	0.42	0.27	0.25	0.13	0.23	0.13	0.23	0.39	0.24	0.26	0.08	0.16	1.0	0.52	0.42	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020554.57 (tig00020554_g10837.t1)	0.26	0.22	0.21	0.4	0.5	0.44	0.93	0.74	0.66	0.35	0.35	0.33	0.29	0.3	0.32	0.34	0.28	0.44	0.35	0.24	0.19	0.99	0.55	0.41	1.0	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020572.19 (tig00000310_g23937.t1)	0.35	0.22	0.4	0.63	0.6	0.8	1.0	0.93	0.62	0.47	0.32	0.31	0.36	0.1	0.11	0.2	0.22	0.42	0.47	0.49	0.21	0.47	0.45	0.24	0.77	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020592.52 (tig00020592_g11683.t1)	0.36	0.38	0.4	0.32	0.64	0.64	0.76	0.82	0.81	0.81	0.63	0.48	0.4	0.98	0.55	0.84	0.47	0.66	0.57	0.42	0.26	0.56	0.89	0.68	1.0	0.69
Cpa\|evm.model.tig00020604.15 (tig00020604_g11850.t1)	0.19	0.13	0.2	0.33	0.37	0.39	0.67	0.64	0.57	0.32	0.22	0.14	0.16	0.2	0.25	0.32	0.32	0.35	0.35	0.29	0.1	0.52	0.38	0.42	1.0	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020610.125 (tig00020610_g12070.t1)	0.09	0.07	0.19	0.41	0.46	0.54	0.96	0.82	0.77	0.47	0.24	0.26	0.08	0.12	0.13	0.15	0.28	0.25	0.25	0.22	0.08	0.04	1.0	0.3	0.62	0.44
Cpa\|evm.model.tig00020610.90 (tig00020610_g12036.t1)	0.12	0.24	0.19	0.28	0.56	1.0	0.94	0.99	0.32	0.26	0.13	0.08	0.14	0.31	0.11	0.16	0.32	0.63	0.54	0.52	0.06	0.7	0.55	0.28	0.43	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020610.92 (tig00020610_g12038.t1)	0.17	0.1	0.2	0.41	0.67	0.52	1.0	0.58	0.37	0.16	0.21	0.02	0.0	0.11	0.18	0.04	0.14	0.68	0.35	0.2	0.17	0.15	0.41	0.47	0.74	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020614.43 (tig00020614_g12156.t1)	0.2	0.06	0.18	0.5	0.51	0.55	0.9	0.94	1.0	0.69	0.48	0.27	0.2	0.27	0.22	0.36	0.38	0.46	0.37	0.38	0.05	0.76	0.23	0.49	0.5	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020944.27 (tig00020944_g16373.t1)	0.08	0.08	0.05	0.15	0.31	0.33	0.42	0.37	0.23	0.21	0.2	0.15	0.07	0.07	0.08	0.08	0.17	0.29	0.31	0.17	0.04	0.37	1.0	0.76	1.0	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020961.107 (tig00020961_g16726.t1)	0.17	0.3	0.37	0.55	0.61	0.5	0.46	0.48	0.63	0.49	0.61	0.54	0.05	0.13	0.22	0.12	0.24	0.45	0.36	0.41	0.02	0.16	0.85	1.0	0.47	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021013.46 (tig00000133_g7720.t1)	0.0	0.0	0.0	0.6	0.91	0.0	0.14	0.14	0.42	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	1.0	0.28
Cpa\|evm.model.tig00021042.12 (tig00021042_g17603.t1)	0.51	0.29	0.22	0.31	0.47	0.54	0.75	0.75	1.0	0.71	0.59	0.55	0.51	0.67	0.46	0.62	0.52	0.69	0.5	0.38	0.25	0.53	0.58	0.71	0.95	0.65
Cpa\|evm.model.tig00021047.30	0.17	0.15	0.24	0.39	0.46	0.62	0.7	0.63	0.68	0.32	0.18	0.12	0.05	0.09	0.17	0.21	0.22	0.32	0.37	0.24	0.17	0.25	0.54	0.34	1.0	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021127.12 (tig00021127_g18688.t1)	0.01	0.03	0.13	0.28	0.34	0.33	0.64	0.53	0.61	0.27	0.1	0.05	0.03	0.02	0.11	0.2	0.19	0.28	0.23	0.2	0.03	0.25	0.15	0.09	1.0	0.16
Cpa\|evm.model.tig00021127.175 (tig00021127_g18858.t1)	0.3	0.38	0.42	0.55	0.61	0.58	0.75	0.69	0.59	0.51	0.46	0.43	0.16	0.47	0.39	0.57	0.4	0.46	0.53	0.43	0.12	0.79	0.21	0.54	1.0	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021312.43 (tig00021312_g20075.t1)	0.17	0.23	0.34	0.46	0.54	0.79	1.0	0.78	0.75	0.43	0.44	0.48	0.21	0.23	0.34	0.39	0.35	0.39	0.49	0.38	0.05	0.14	0.42	0.51	0.65	0.58
Cpa\|evm.model.tig00021348.3 (tig00021348_g20507.t1)	0.03	0.03	0.12	0.4	0.41	0.49	0.95	0.71	0.88	0.42	0.15	0.05	0.0	0.08	0.12	0.22	0.28	0.37	0.52	0.52	0.04	0.16	0.14	0.07	1.0	0.33
Cpa\|evm.model.tig00021432.25 (tig00021432_g21217.t1)	0.32	0.41	0.48	0.74	1.0	0.89	0.82	0.66	0.87	0.63	0.64	0.5	0.21	0.45	0.35	0.45	0.4	0.5	0.52	0.43	0.15	0.34	0.93	0.94	0.6	0.62
Cpa\|evm.model.tig00021432.26 (tig00021432_g21218.t1)	0.09	0.09	0.2	0.43	0.58	0.6	1.0	0.9	0.75	0.51	0.34	0.24	0.04	0.17	0.16	0.2	0.19	0.29	0.35	0.25	0.04	0.74	0.42	0.24	0.55	0.42
Cpa\|evm.model.tig00021433.9 (tig00021433_g21262.t1)	0.12	0.08	0.09	0.3	0.57	0.54	0.7	0.73	0.41	0.25	0.42	0.17	0.0	0.07	0.19	0.19	0.37	0.44	0.53	0.16	0.17	0.39	1.0	0.72	0.94	0.41
Cpa\|evm.model.tig00021525.16 (tig00021525_g22132.t1)	0.17	0.23	0.29	0.51	0.7	0.76	0.81	0.76	0.55	0.38	0.28	0.17	0.11	0.24	0.3	0.34	0.32	0.31	0.42	0.31	0.07	1.0	0.41	0.34	0.76	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021680.20 (tig00021680_g23042.t1)	0.16	0.09	0.19	0.26	0.27	0.25	0.57	0.53	0.43	0.3	0.22	0.16	0.09	0.15	0.2	0.3	0.25	0.28	0.21	0.25	0.18	0.62	0.48	0.53	1.0	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021760.4 (tig00021760_g23433.t1)	0.0	0.02	0.11	0.26	0.24	0.27	0.76	0.77	0.6	0.41	0.13	0.1	0.01	0.06	0.11	0.19	0.26	0.55	0.25	0.28	0.02	0.17	0.26	0.16	1.0	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021796.4 (tig00021796_g23555.t1)	0.45	0.43	0.19	0.47	0.52	0.45	0.59	0.64	0.52	0.53	0.63	0.48	0.45	0.22	0.28	0.3	0.3	0.5	0.35	0.33	0.38	1.0	0.94	0.59	0.7	0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)