Heatmap: Cluster_153 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10014 (10014)	0.14	0.25	0.66	0.42	0.29	0.3	1.0	0.18	0.08	0.06	0.2
Transcript_contig_10150 (10150)	0.2	0.2	0.4	0.4	0.28	0.68	1.0	0.1	0.33	0.47	0.31
Transcript_contig_10916 (10916)	0.16	0.28	0.66	1.0	0.32	0.67	0.87	0.09	0.06	0.44	0.35
Transcript_contig_14223 (14223)	0.2	0.0	1.0	0.48	0.12	0.35	0.69	0.0	0.0	0.25	0.25
Transcript_contig_1821 (1821)	0.18	0.22	0.25	0.2	0.32	0.48	1.0	0.36	0.03	0.09	0.11
Transcript_contig_2257 (2257)	0.16	0.0	0.76	0.99	0.66	0.44	1.0	0.0	0.0	0.16	0.18
Transcript_contig_25435 (25435)	0.17	0.0	0.28	0.58	0.3	0.31	1.0	0.0	0.12	0.05	0.07
Transcript_contig_3634 (3634)	0.17	0.24	0.48	0.38	0.48	0.38	1.0	0.51	0.02	0.09	0.05
Transcript_contig_3814 (3814)	0.32	0.23	0.39	0.61	0.42	0.41	1.0	0.09	0.11	0.43	0.43
Transcript_contig_5134 (5134)	0.18	0.29	0.32	0.52	0.47	0.44	1.0	0.38	0.27	0.25	0.18
Transcript_contig_54785 (54785)	0.29	0.33	0.47	0.34	0.43	0.43	1.0	0.54	0.08	0.21	0.21
Transcript_contig_54907 (54907)	0.2	0.14	0.34	0.46	0.46	0.42	1.0	0.14	0.2	0.17	0.13
Transcript_contig_54994 (54994)	0.24	0.37	0.4	0.27	0.52	0.4	1.0	0.44	0.21	0.23	0.18
Transcript_contig_55026 (55026)	0.23	0.08	0.38	0.3	0.39	0.5	1.0	0.13	0.22	0.42	0.33
Transcript_contig_55062 (55062)	0.33	0.43	0.53	0.54	0.67	0.42	1.0	0.88	0.17	0.22	0.17
Transcript_contig_55388 (55388)	0.3	0.19	1.0	0.49	0.13	0.41	0.86	0.08	0.4	0.15	0.15
Transcript_contig_55401 (55401)	0.34	0.37	0.56	0.49	0.38	0.45	1.0	0.3	0.05	0.14	0.08
Transcript_contig_56123 (56123)	0.27	0.21	0.63	0.37	0.41	0.41	1.0	0.2	0.15	0.23	0.17
Transcript_contig_56196 (56196)	0.38	0.28	0.54	0.47	0.64	0.49	1.0	0.2	0.48	0.36	0.3
Transcript_contig_56207 (56207)	0.33	0.33	0.46	0.29	0.18	0.51	1.0	0.19	0.24	0.46	0.25
Transcript_contig_56649 (56649)	0.36	0.26	0.29	0.5	0.42	0.7	1.0	0.1	0.52	0.61	0.38
Transcript_contig_56754 (56754)	0.27	0.11	0.35	0.37	0.33	0.34	1.0	0.14	0.05	0.22	0.21
Transcript_contig_56904 (56904)	0.32	0.24	0.78	0.55	0.26	0.59	1.0	0.18	0.21	0.46	0.43
Transcript_contig_57288 (57288)	0.4	0.31	0.52	0.46	0.42	0.49	1.0	0.08	0.18	0.15	0.17
Transcript_contig_57334 (57334)	0.24	0.12	0.68	0.43	0.54	0.45	1.0	0.15	0.5	0.57	0.38
Transcript_contig_57822 (57822)	0.29	0.26	0.54	0.53	0.38	0.64	1.0	0.15	0.69	0.7	0.53
Transcript_contig_57956 (57956)	0.27	0.34	0.54	0.43	0.19	0.67	1.0	0.13	0.13	0.42	0.27
Transcript_contig_58206 (58206)	0.25	0.32	0.55	0.5	1.0	0.33	0.94	0.36	0.22	0.28	0.17
Transcript_contig_59366 (59366)	0.15	0.05	0.51	0.49	0.35	0.73	1.0	0.07	0.46	0.47	0.42
Transcript_contig_60025 (60025)	0.14	0.01	0.58	0.61	0.79	0.48	1.0	0.0	0.01	0.58	0.26
Transcript_contig_60169 (60169)	0.31	0.37	0.58	0.41	1.0	0.36	0.91	0.39	0.31	0.09	0.08
Transcript_contig_60491 (60491)	0.29	0.21	1.0	0.32	0.07	0.22	0.32	0.0	0.0	0.14	0.19
Transcript_contig_61245 (61245)	0.32	0.41	0.36	0.5	1.0	0.42	1.0	0.3	0.13	0.24	0.15
Transcript_contig_61423 (61423)	0.24	0.04	0.26	0.45	0.49	0.57	1.0	0.07	0.19	0.59	0.53
Transcript_contig_62214 (62214)	0.32	0.33	0.53	0.46	0.39	0.4	1.0	0.27	0.07	0.14	0.09
Transcript_contig_625 (625)	0.16	0.07	0.68	0.34	0.4	0.54	1.0	0.04	0.34	0.33	0.35
Transcript_contig_62849 (62849)	0.35	0.4	0.7	0.57	0.77	0.38	1.0	0.6	0.51	0.13	0.13
Transcript_contig_62862 (62862)	0.36	0.28	0.67	0.35	0.4	0.57	1.0	0.58	0.26	0.18	0.2
Transcript_contig_66116 (66116)	0.41	0.41	0.8	0.51	0.89	0.47	1.0	0.13	0.53	0.94	0.58
Transcript_contig_66176 (66176)	0.3	0.26	0.47	0.47	0.44	0.46	1.0	0.17	0.1	0.24	0.16
Transcript_contig_66231 (66231)	0.53	0.47	0.2	0.13	0.19	0.34	1.0	0.33	0.04	0.22	0.13
Transcript_contig_67547 (67547)	0.1	0.11	0.53	0.44	0.26	0.64	1.0	0.15	0.28	0.61	0.37
Transcript_contig_70447 (70447)	0.17	0.0	0.27	0.55	0.34	0.3	1.0	0.0	0.34	0.02	0.04
Transcript_contig_70662 (70662)	0.32	0.6	1.0	0.05	0.0	0.05	0.16	0.17	0.0	0.05	0.11
Transcript_contig_7175 (7175)	0.16	0.12	0.3	0.4	0.54	0.43	1.0	0.17	0.7	0.37	0.22
Transcript_contig_7234 (7234)	0.1	0.09	0.62	0.21	0.5	0.65	1.0	0.11	0.22	0.35	0.31
Transcript_contig_7372 (7372)	0.33	0.33	0.58	0.6	0.31	0.5	0.89	0.03	0.33	1.0	0.34
Transcript_contig_78116 (78116)	0.37	0.3	0.46	0.38	0.34	0.46	1.0	0.21	0.21	0.27	0.2
Transcript_contig_78405 (78405)	0.29	0.3	0.4	0.41	0.56	0.55	1.0	0.42	0.17	0.47	0.33
Transcript_contig_78487 (78487)	0.16	0.01	0.35	0.55	0.74	0.95	1.0	0.0	0.1	0.74	0.81
Transcript_contig_78723 (78723)	0.33	0.29	0.56	0.42	0.34	0.39	1.0	0.24	0.02	0.08	0.05
Transcript_contig_78880 (78880)	0.25	0.1	0.41	0.49	0.49	0.46	1.0	0.02	0.5	0.27	0.21
Transcript_contig_78920 (78920)	0.23	0.1	1.0	0.41	0.03	0.6	0.96	0.13	0.46	0.31	0.29
Transcript_contig_78951 (78951)	0.24	0.16	0.34	0.32	0.24	0.67	1.0	0.11	0.35	0.46	0.42
Transcript_contig_79019 (79019)	0.56	0.54	0.71	0.69	0.35	0.56	1.0	0.34	0.22	0.2	0.24
Transcript_contig_79310 (79310)	0.35	0.35	0.11	0.16	0.22	0.5	1.0	0.51	0.03	0.25	0.19
Transcript_contig_79699 (79699)	0.06	0.16	0.56	0.33	0.16	0.49	1.0	0.06	0.09	0.3	0.21
Transcript_contig_79889 (79889)	0.45	0.53	0.69	0.49	0.46	0.43	1.0	0.38	0.17	0.59	0.25
Transcript_contig_80709 (80709)	0.04	0.0	1.0	0.55	0.2	0.3	0.7	0.0	0.0	0.14	0.03
Transcript_contig_81655 (81655)	0.18	0.0	0.65	0.67	0.37	0.67	1.0	0.0	0.0	0.85	0.89
Transcript_contig_82572 (82572)	0.42	0.3	0.64	0.45	0.32	0.66	1.0	0.09	0.27	0.61	0.39
Transcript_contig_83151 (83151)	0.23	0.19	0.64	0.53	0.33	0.64	1.0	0.06	0.31	0.59	0.41
Transcript_contig_8758 (8758)	0.09	0.0	1.0	0.42	0.18	0.2	0.56	0.0	0.23	0.18	0.1
Transcript_contig_89139 (89139)	0.41	0.35	0.42	0.48	0.75	0.45	1.0	0.48	0.3	0.36	0.3
Transcript_contig_89163 (89163)	0.26	0.19	0.78	0.51	0.37	0.58	1.0	0.1	0.37	0.27	0.37
Transcript_contig_89257 (89257)	0.26	0.0	0.39	0.51	0.22	0.53	1.0	0.0	0.02	0.43	0.35
Transcript_contig_89444 (89444)	0.27	0.21	0.2	0.57	0.61	0.86	1.0	0.12	0.13	0.5	0.44
Transcript_contig_89623 (89623)	0.3	0.27	0.45	0.41	0.46	0.5	1.0	0.34	0.49	0.24	0.23
Transcript_contig_90015 (90015)	0.43	0.41	0.77	0.59	0.41	0.35	1.0	0.57	0.06	0.08	0.05
Transcript_contig_90259 (90259)	0.47	0.41	0.38	0.38	0.38	0.5	1.0	0.46	0.45	0.47	0.33
Transcript_contig_90339 (90339)	0.31	0.4	0.29	0.4	0.44	0.84	1.0	0.22	0.04	0.6	0.32
Transcript_contig_90842 (90842)	0.37	0.0	0.59	0.72	0.64	0.53	1.0	0.0	0.0	0.77	0.66
Transcript_contig_968 (968)	0.16	0.1	0.73	0.62	0.17	0.72	1.0	0.25	0.0	0.36	0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)